蛋白质组学在信号转导研究中的应用

新近发展起来的蛋白质组学高通量技术引入到信号转导通路研究中,产生了一个新的研究领域：信号转导蛋白质组学。其作为功能蛋白质组学的一个重要组成部分,以研究信号转导通路以及其中的信号分子改变的蛋白质组学。克服了传统地针对单条信号转导通路以及其中的单个信号分子研究策略的局限性,能够在一次实验中系统地研究多条信号转导通路中的蛋白质一蛋白质间的相互作用、蛋白质磷酸化等翻译后修饰和下游靶蛋白的改变,有助于全面阐述信号转导通路,已成为一个新的研究热点。     

蛋白质组学技术在网络药理学中的应用

蛋白质组学发展至今已日趋成熟,在生物医药相关领域研究中的应用显著增加,与之相关的样品制备技术、蛋白定量方法及先进的质谱仪器也得到了快速发展。网络药理学是近年来提出的新药发现新策略,是药理学的新兴分支学科,它从整体的角度探索药物与疾病的关联性,发现药物靶标,指导新药研发。将蛋白质组学技术应用于网络药理学研究,能使研究人员系统地预测和解释药物的作用,加速药物靶点的确认,从而设计多靶点药物或药物组合。综述了蛋白质组学技术的新近研究进展,并简单概述了其在网络药理学中的应用。     

蛋白质组学技术在精子蛋白研究中的应用

从蛋白质组学研究的技术手段、蛋白质组学在人类不育及精卵相互识别并结合的机理研究、免疫法开展男性避孕方法的研究及蛋白质组学研究方法在家畜繁殖环节中的应用等几个方面阐述了蛋白质组学在人类生殖及动物繁殖环节相关研究中的重要作用。说明蛋白质组学已经成为生命科学未来发展的主要分支之一,为揭示生命个体的蛋白质动态变化提供了技术手段和理论基础,并将在药物开发,生命活动机理研究等方面发挥巨大作用,也必将会在家畜繁殖学领域发挥其应有的作用。     

蛋白质组学在神经科学中的应用

蛋白质组学是指对基因组编码的所有蛋白质进行大规模分析的一门学科,它分为表达蛋白质组学和功能蛋白质组学。新的蛋白质组学工具将为高度复杂的神经科学的研究提供便利。作者简述了表达蛋白质组学和功能蛋白质组学在这一领域的应用。     

蛋白质组学在细胞凋亡研究中的应用

细胞凋亡是一种遗传决定的在多细胞生物生长发育和稳态维持中发挥重要作用的细胞程序性死亡. 正常细胞中细胞凋亡程序受精细调控, 而肿瘤、自身免疫性疾病等多种疾病的发生与细胞凋亡的失调密切相关, 因此对其分子机制的研究备受关注. 在过去的20多年研究中, 发现很多凋亡相关的蛋白质被翻译后机制调控, 包括蛋白质剪切、转位、蛋白质相互作用和各种翻译后修饰等, 这些正是蛋白质组学的研究范畴. 近年来, 蛋白质组学技术飞速发展, 并与遗传学和化学生物学等学科交叉, 推动了功能蛋白质组学和化学/药物蛋白质组学的发展, 并被迅速地应用于细胞凋亡研究领域, 有对细胞凋亡研究产生重要影响的潜力. 本文综述了近年来本实验室及国际上运用蛋白质组学技术和策略研究细胞凋亡的主要进展, 同时展望了蛋白质组学在凋亡研究领域的方向和挑战.     

蛋白质组学技术及其在糖尿病研究中的应用

蛋白质组学是以基因编码蛋白质作为研究对象,并依赖高通量、高自动化的技术对其进行大规模分析的一门学科.其研究方法及手段,已用于糖尿病研究领域.对蛋白质组样品提取技术、蛋白质组分离和分析技术(双向电泳、色谱、质谱分析)、生物信息学以及蛋白质组学技术在研究1型糖尿病(T1DM)、2型糖尿病(T2DM)、胰岛素抵抗等的发病机制以及抗糖尿病药物的开发中的应用等进行了综述.     

临床蛋白质组学———蛋白质组学在临床研究中的应用

临床蛋白质组学是将蛋白质组学技术应用于临床医学研究,它主要围绕疾病的预防、早期诊断和治疗等方面开展研究,其中,恶性肿瘤是临床蛋白质组学研究的一个重点研究对象.由于肿瘤生物标志物对早期诊断具有重要价值,所以临床蛋白质组学的主要目标之一是寻找合适的肿瘤生物标志物,多分子生物标志物已成为寻找肿瘤生物标志物的一个研究趋势.简要介绍了临床蛋白质组学的基本概念,实验设计,临床样本收集与预处理以及蛋白质组学技术在临床研究中的应用与进展.     

蛋白质组学在肝病研究中的应用

蛋白质组学已被广泛应用于疾病相关研究. 综述了最近几年来蛋白质组学在肝脏疾病研究中特别是肝脏肿瘤、肝硬化、毒/药物肝损伤等方面的进展, 其研究结果将对生物标记物和药靶的寻找, 以及致病机理的阐述具有重要意义.     

蛋白质组学分析技术在微生物研究中的应用

随着后基因组时代的到来,蛋白质组学分析为研究微生物的生命活动和细胞功能提供了一个广阔的视角。综述了大规模分析微生物蛋白质组的策略和方法,包括自上而下的蛋白质组学分析、自下而上的蛋白质组学分析、蛋白质组定量分析技术、蛋白质修饰研究方法和蛋白质芯片技术。最后,对沙门氏菌蛋白质组学的研究进展进行了简要介绍。     

数据挖掘在蛋白质组学研究中的应用

介绍蛋白质组学研究的背景;阐述数据挖掘的原理、方法,重点讲述数据挖掘技术在蛋白质组学研究中取得的新的进展。最后,对数据挖掘目前存在的问题作分析,并对它的发展的前景作展望。     

细胞培养稳定同位素标记技术在蛋白质组学中的应用与进展

细胞培养稳定同位素标记技术（SILAC）是在细胞培养过程中,利用稳定同位素标记的氨基酸结合质谱技术,对蛋白表达进行定量分析的一种新技术。它不仅可以对蛋白质进行定性分析,还可通过质谱图上一对轻-重稳定同位素峰的比例来反映对应蛋白在不同状态下的表达水平,实现对蛋白质的精确定量。SILAC结合质谱技术在定量蛋白质组学中发挥了巨大的作用,其应用范围从细胞系扩展到亚细胞器、组织与动物整体水平,具体的应用策略也在不断完善发展。我们总结评述了SILAC技术在差异表达蛋白质组、蛋白质翻译后修饰、药物蛋白质组和蛋白质相互作用等方面的应用与进展。     

蛋白质组学技术在植物类囊体膜蛋白研究中的应用

类囊体作为植物光合作用光反应的重要场所,在植物亚细胞蛋白质组学研究中倍受关注.介绍了植物蛋白质组学相关技术,包括双向凝胶电泳(2DE)、高效液相色谱(HPLC)、高效毛细管电泳(HPCE)、质谱(MS)和蛋白质组学数据库在植物类囊体膜蛋白研究中的应用.同时对类囊体膜蛋白质组学的研究趋势进行了探讨.     

Evidence for separate intermediates in the biosynthesis of 24α- and 24β-alkylsterols in tracheophytes

When mevalonate-[2-¹⁴C] was incubated with seeds of Pinus pinea, 23% of the label in sterols was found in trans-24-ethylidenecholesterol, 12% in a mixture of 24α- and 24β-methylcholesterol, and 65% in 24α-ethylcholesterol. However, when the radioactive substrate was lanosterol-[24-³H], label appeared only in the 24-ethylidene- (85%) and the epimeric 24-methylsterols (15%). From the ratios of labels in the ethylidene- and methyl-sterols it was possible to show that the tritium in the 24-C₁ -mixture was incorporated only into the 24β-methyl epimer. The labelling patterns are consistent with a pathway to 24β-alkylsterols via Δ²⁵⁽²⁷⁾-sterols bypassing 24-ethylidenesterols and to 24α-alkylsterols via Δ²⁴⁽²⁸⁾-sterols which are isomerized to Δ²⁴⁽²⁵⁾-sterols prior to reduction.     

蛋白质组技术及其在胰腺疾病研究中的应用

蛋白质组技术由于具有大通量研究蛋白质组成和蛋白质差异的作用,已有研究将其应用于胰腺疾病的相关研究中,并为胰腺癌、急慢性胰腺炎、胰腺纤维瘤等研究提供了新的思路.介绍了蛋白质组样品提取技术、蛋白质组分离技术、蛋白质组分析技术、生物信息学及其在胰腺疾病的差异表达蛋白、诊断标记物、相关疾病鉴别标记物、发病机制、治疗敏感性研究中的应用.     

串联亲和纯化（TAP）技术在蛋白质组学中的应用

蛋白质是各种生命活动的主要执行者,因此构建蛋白质相互作用的网络图对于准确理解蛋白质功能、揭开各种细胞活动的奥秘十分重要.串联亲和纯化（TAP）,是近年来发展出来的一种能够快速研究在生理条件下蛋白质相互作用,揭示蛋白质复合体相互作用网络的新技术,已成为研究蛋白质组学的一个重要工具.随着该技术的不断完善,TAP技术在认识蛋白质相互作用的过程中必将发挥越来越重要的作用.     

24-脱氢胆固醇还原酶基因转基因小鼠血生化指标分析

目的建立全身表达24-脱氢胆固醇还原酶基因（Dhcr24）转基因小鼠动物模型,研究该基因过表达对小鼠代谢的影响。方法RT-PCR法克隆小鼠Dhcr24基因,把该基因插入CMV启动子下游,构建转基因表达载体,通过显微注射法建立Dhcr24转基因小鼠。PCR鉴定Dhcr24转基因小鼠的基因型,RT-PCR和Western Blot检测基因表达水平,血生化检测仪检测转基因小鼠血生化指标的改变。结果建立了2个不同表达水平的Dhcr24转基因小鼠品系,转入的Dhcr24基因在肝和脾组织中的表达高于内源的Dhcr24。血生化检测证实：乳酸脱氢酶（LDH）、总蛋白（TP）、白蛋白（Alb）和血肌酐（SCr）较野生型小鼠明显降低,而高密度脂蛋白胆固醇（HDL-c）和碱性磷酸酶（ALP）较野生型小鼠明显增加,并且Dhcr24转基因雌鼠的体重比野生型小鼠明显降低,均有显著差异。但Dhcr24转基因雄鼠各项指标与野生型小鼠相比没有显著差异。结论成功建立了全身表达Dhcr24转基因小鼠,并证实Dhcr24基因对雌性小鼠的体重和血生化指标,包括LDH,TP,Alb,SCr,HDL-c and ALP具有明显的影响。     

Oxysterols in the brain of the cholesterol 24-hydroxylase knockout mouse

Oxysterols are oxidised forms of cholesterol or its precursors. In this study we utilised the cholesterol 24-hydroxylase knockout mouse (Cyp46a1−/−) to study the sterol and oxysterol content of brain. Despite a great reduction in the abundance of 24S-hydroxycholesterol, the dominant metabolite of cholesterol in wild type brain, no other cholesterol metabolite was found to quantitatively replace this oxysterol in the Cyp46a1−/− mouse. Only minor amounts of other side-chain oxysterols including 22R-, 24R-, 25- and (25R),26-hydroxycholesterols were detected. In line with earlier studies, levels of cholesterol were similar in Cyp46a1−/− and wild type animals. However, the level of the cholesterol precursor, desomsterol, and its parallel metabolite formed via a shut of the mevalonate pathway, 24S,25-epoxycholesterol, were reduced in the Cyp46a1−/− mouse. The reduction in abundance of 24S,25-epoxycholesterol is interesting in light of a recent report indicating that this oxysterol promotes dopaminergic neurogenesis.