近交系大鼠DNA指纹分析研究

目的建立DNA指纹技术对近交系大鼠遗传监测的方法.方法采用DNA指纹图法对国内已知的7个品系9个近交系大鼠群体进行了分析,并对相同DNA进行了多次DNA指纹图重复实验.结果(1)不同品系之间DNA指纹图差异较大,其平均图带数为16.360±2.178,共有带率为0.061±0.008,相似系数为0.062±0.008,相同DNA指纹图概率为3.691×10-23.(2)同一群体不同个体之间DNA指纹图带的相似系数和共有带率(除SHR(哈)和WKY(哈)小于0.7外),其他均在大于0.9.(3)不同地区同一SHR和同一WKY品系间DNA指纹图也存在不同,其相似系数和共有带率均小于0.6.(4)相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致(P>0.05).结论证实了该方法在近交系大鼠遗传监测中的可行性.     

四个探针产生的家禽 DNA 指纹图谱

对四个多位点小卫星探针 33.6,33.15,α珠蛋白-3’HVR 和 M13用于家禽的DNA 指纹分析的可行性进行了探讨,较详细地报导了用不同探针在鸡、鸭、鹌鹑上产生 DNA 指纹图的方法.结果表明,用我们所采用的方法,四个探针都能在鸡、鸭、鹌鹑上产生信息量大、分辨率较高的 DNA 指纹图.     

DNA指纹图技术分析微生物肥料菌种组成稳定性

目的 分析2种市售微生物肥料在不同生产批次中微生物菌种组成的稳定性。方法 利用ERIC-PCR基因组DNA指纹图技术和16S rDNA V3扩增一温度梯度凝胶电泳（PCR-TGGE）指纹图技术。结果 这2种微生物肥料在同一个生产批次不同包装之间的2种DNA指纹图谱相似性较高,分别在78%～95%和96%～100%,表明同一个批次内的菌种组成比较一致,但其在不同的生产批次之间菌种组成差异存在显著性,反映在2种DNA指纹图谱上,不同生产批次样品间ERIC-PCR指纹图相似性最低只有10%,PCR-TGGE指纹图相似性最低为46%。结论 通过ERIC-PCR和PCR-TGGE DNA指纹图技术可以对微生物肥料中菌种组成的稳定性进行快速、准确的分析,如何保持菌种组成在批次之间的稳定一致,是复合菌种微生物肥料质量控制中面临的难题。     

用DNA指纹图技术分析Wistar大鼠的遗传距离

采用JL-02多位点探针和Southern杂交对Wistar大鼠基因组进行了DNA指纹分析,并对国内最具有典型的6个地区9个Wistar大鼠群体内和群体间进行了DNA指纹分析比较。结果表明,DNA指纹图较好地反映了封闭群动物的遗传本质,具有良好的多态性。同一群体不同个体间Wistar大鼠遗传距离主要为0.2~0.6,将不同群体的Wistar大鼠DNA指纹图带进行分析表明,所有群体间的DNA指纹图的遗传距离在0.2~0.7。 Abstract:DNA fingerprinting of Wistar rat were studied with JL-02 Mulilocus probe and Southern hybridization,and comparing with different individuals of nine groups Wistar rat from six national classical area and different groups.It was indicated that DNA fingerprinting could reflect genetic material of outbred strain rat,and were more polymorphic.The genetic distances of Wistar rat were distributed for 0.2~0.6 among different individuals within same groups,and the genetic distances of Wistar rat were distributed for 0.2~0.7 among different groups．     

(GTG)5探针产生的DNA指纹图在近交系小鼠遗传检测中的应用

目的探讨用非放射性标记的寡聚核苷酸探针(GTG)5进行近交系小鼠的DNA指纹分析。方法用非放射性标记的寡聚核苷酸探针(GTG)5制作BALB/c、C57BL/6J、DBA/2、C3H近交系小鼠的DNA指纹图,对这四个品系的小鼠进行遗传检测,分析各品系内和品系间的遗传变异性。结果(GTG)5探针可产生具有良好多态性的DNA指纹图,平均图带数为8~12条。各品系内的DNA指纹图平均相似系数(-x)在0.96~1.00的范围内,具有相同指纹图的概率(P)均在3.1×10-1以上,极显著地高于品系间的相似系数(0.22~0.39)和相同指纹图的概率(P<1.07×10-4)。结论(GTG)5可用于制作近交系小鼠的DNA指纹图以对其进行遗传检测。     

寡聚核苷酸探针在近交系小鼠遗传检测中的应用

用两个非放射性标记的寡聚核苷酸探针(GGAT)4和(GTG)5制作BALB/c、C57BL/6J、DBA/2、C3H等4种近交系小鼠的DNA指纹图,比较了两种探针在近交系小鼠遗传检测应用中的重复性和稳定性。结果表明,两种探针对上述4种近交系小鼠产生的DNA指纹图的图带数均为8～12条,具有良好的多态性。品系内的平均DNA指纹图相似系数(-x)在0·92～1·00的范围内,具有相同指纹图的概率(P)均在0·31以上,极显著地高于品系间的相似系数(0·22～0·39)和相同指纹图的概率(P<1·07×10-4)。说明(GGAT)4和(GTG)5两种寡聚核苷酸探针均可用于制作近交系小鼠的DNA指纹图,以对其进行遗传检测。用两种不同的探针进行DNA指纹分析,可以检出基因组中更多的个体特异性信息,结果更加可靠。     

幽门螺杆菌临床分离株的随机扩增多态性DNA指纹图分析

目的:建立武汉及周边地区幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染病人胃内分离的Hp的DNA指纹图谱,并进行数理统计分析,探讨Hp基因型与疾病的相互关系,为临床诊断、防治及致病机制提供理论与实践基础.方法:采取随机扩增多态性DNA指纹法(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)对48例病人Hp基因组DNA进行PCR反应,其随机引物为:1290 5'-GTGGATGCGA-3'.反应产物经2%琼脂糖凝胶电泳,成像存盘.用统计分析软件(Statistic analysis software,SAS)对Hp DNA指纹图的相似性以及与疾病的相关性进行分析.结果:每个菌株都有其独特的DNA指纹图,显示其基因的多态性;计算机聚类分析显示:Hp DNA指纹图可分为两大类,其与宿主疾病之间有一定程度的相关性(P＜0.05).结论:(1)RAPD对 Hp DNA扩增结果是稳定、可靠的,是一种较好的分型方法.(2)幽门螺杆菌感染所致疾病可能与其基因型相关.     

辣根过氧化物酶标记DNA探针及光增强检测DNA指纹图在法医应用的研究

本文介绍了用辣根过氧化物酶直接标记DNA探针,光增强检测DNA指纹图的技术,所得图谱清晰易读,分辨率高,灵敏度为0.8μg,接近~(32)P同位素标记的水平。就150名无关个体的DNA指纹图分析表明两个个体图谱完全相同的机率是3.7×10~(-14);方法稳定性测定表明,足以取代同位素标记,用作准确的个人识别和亲子鉴定,为侦破强奸、凶杀等案件提供重要科学依据,该法简便,快速,适用于各实验室,易于推广应用。     

JL-02多位点探针DNA指纹在近交系小鼠遗传监测中的应用

以公安部二所研制的JL-02多位点探针进行了BALB/C、C57、DBA/2、615和ICR5个品系近交系小鼠DNA指纹分析。结果表明,不同近交系小鼠的DNA指纹图差异很大,而同一品系DNA指纹图基本一致,从而证明这一新探针适用于利用DNA指纹技术对近交系小鼠进行遗传监测并具有高度多态性。 Abstract：To explore the possibility of using the probe JL-02 by the Public Safety Bureau of China in monitoring genetic quality of inbred mic e. Fingerprinting of 5 strains of the inbred mice (BALB/c、C57、DBA/2、615、ICR) was conducted using a nonisotopically HRP labeled JL-02 and southern blot hybri dization. The patterns were completely different among the 5 strains of the mice and those of the samples from the same strains were completely identical and th e probe has the high polymorphism.     

不同代龄南方鲶SME-1细胞DNA指纹图的分析

利用荧光素标记LZF-ⅠDNA探针对不同培养代龄南方鲶SME-1细胞简单重复DNA进行了检测,获得了清晰的DNA指纹图谱。发现:随着细胞代龄的增加,同一代龄细胞群体内和不同代龄细胞群体间共有谱带概率、相似系数、最大等位基因频率均明显下降,而突变率则随着代龄增加而增加。利用DNA指纹图技术分析SME-1细胞遗传物质的变化是可行的。为SME-1细胞进一步的培养,并为SME-1细胞的研究利用提供了分子遗传学资料。     

用DNA指纹法研究野生天鹅种群的遗传分化

DNA指纹技术自问世以来,已被广泛地用于法医学上个体识别和亲缘关系的鉴定。此外,人源DNA指纹探针(即多位点型小卫星探针)还被用于动植物等的研究,特别是在研究动物的繁育规律方面成效显著。近一两年来,DNA指纹技术也在分子水平上用来研究种群分化,为物种起源研究开辟了新的途径。本文利用人源多位点型小卫星探针,对分布在英国和美国的四种天鹅(小天鹅、疣鼻天鹅、大天鹅和喇叭天鹅)的种群结构和天鹅小卫星的分化初步进行了研究。用酶HaeIII和探针pSPT19.6分析了分布在英国的疣鼻天鹅种的两个群体(洛锡安群体和阿伯茨伯里群体)的DNA指纹图,结果表明两群体之间的遗传变异性大于群体内的遗传变异性;洛锡安群体内小卫星的变异程度较高。虽然小卫星在基因组中的作用尚不清楚,但某些天鹅小卫星在种间发生了分化,因而同一个种内不同个体的DNA指纹图有一些共同的特征,导致DNA指纹图的物种特异性。DNA指纹分析表明:小天鹅、大天鹅和喇叭天鹅在遗传上比较接近,而疣鼻天鹅与它们在遗传上相距较远,这与原来对天鹅种下分类情况是一致的。就遗传变异程度而言,在英国仕林布里奇的小天鹅为最高,英国卡拉乌尔洛克的大天鹅次之,英国阿伯茨伯里的疣鼻天鹅居第三,美国蒙大拿的喇叭天鹅最低。我们认为,基因迁移和遗传漂变对     

枫泾猪、香猪和长白猪的DNA指纹图分析

本文用M13和3个人源小卫星探针(33.6、 33.15、α-珠蛋白-3’HVR)获得了枫泾猪、香猪及长白猪的DNA指纹图,分析了各品种内和品种间的遗传变异性。结果表明,各品种的平均DNA指纹图相似系数在0.440-0.532的范围内,极显著地高于品种间的相似系数(0.223-0.307)。各品种的DNA指纹图还存在着一些品种特异性图带,这些图带在以后的基因定位中值得重视。 Abstract:This paper demonstrated DNA fingerprints of Fengjing,Xiang and Large White breeds of swine generated by M13 and three human minisatellite probes(33.6,33.15 andα-globin-3’HVR),and determined the intrabreed and interbreed variabilities of swine DNA fingerprints.It was shown that the mean band sharing probability within breeds was 0.440-0.532,significantly higher than that between breeds(0.223-0.307).Some breed-specific bands were noted in each breed,which should draw our attention in the course of gene mapping.     

五指山猪生物学特性、易地繁育及遗传多样性研究

五指山猪是我国濒临灭绝的珍稀品种,为保护和利用这一特有种猪基因资源,我们开展了易地繁育和生物学特性及遗传多样性的研究。通过对其生长发育规律、繁殖生理、血液生理生化、遗传标记、DNA指纹图谱等项的观察和测试,发现五指山猪具有体型小、性成熟早、耐近交繁殖、遗传性较稳定、肉质好等特点。白细胞分类中淋巴细胞占77％,白细胞抗原(SLA) 血清学分型中,与其它品种之间存在有差异性。 用人源小卫星探针33.6和鸡小卫星探针cMS18,对五指山猪及长白猪和枫泾猪进行DNA指纹图比较分析,发现五指山猪的DNA指纹图相似系数,大大高于其它已研究过的正常体型猪种,说明它经历过较高程度的近交;以猪的生长激素（GH）cDNA为探针,用EcoRI、EcoRV、PstI等酶切基因组DNA进行RFLP分析时,五指山猪均出现了一条深色带,而长白猪和枫泾猪未发现。表明五指山猪在生长激素位点上与正常体型猪种亦存在差异。     

DNA指纹技术的应用及局限性

DNA指纹图谱是一种在一单一实验中可检测出大量DNA位点差异性的分子生物学技术。自1985年Jeffeys et al,从人的肌红蛋白位点获得第一个多位点探针并用于检查人类基回的VNTRs以来,由于各种高水平探针如微卫星探针、寡聚核苷酸探针的相继问世,使DNA指纹技术在动植物科学研究、遗传疾病的诊断、基因图谱的绘制,遗传标记的寻找及法医学等方面得到广泛应用,充分表现了此技术的优越性。当然此技术还需进一步完善。     

动物的双亲判别与DNA指纹图谱

在亲缘识别和婚配选择等动物行为学研究中,需要知道动物之间的亲缘关系。通过分析以往的各种双亲判别方法,如蛋白电泳和血清学技术等,其中DNA指纹图谱法被认为是目前最好的。这种方法已在许多种动物(狗、猫、小家鼠、家燕、蓠雀、天鹅等)和人的研究中得到应用。DNA指纹图谱方法的基本原理是这样,两个动物的DNA 片断具有完全相同的碱基排序的情形从理论上讲其可能性极小,所以每个个体(除同卵双生子外)的DNA经提取、酶切、凝胶电泳、RNA或DNA探针杂交和放射性自显影后所形成的条带分布应该是有区别的、具有个体的特异性,这些条带就是DNA指纹图谱。动物个体DNA 指纹图谱中的每一条带,除了偶然发生的基因突变, 都可以从父母双方、或父方、或母方找到。据此,本文介绍了如何使用DNA指纹图谱进行包括父方和母方亲代判别的方法,如条带比较法和相似性系数法。     

纵纹腹小鸮DNA指纹谱探针的筛选和初步应用

以人工合成的微卫星序列 (GTG) 5,(GT) 8,(CAC) 5和人源小卫星 33 1 5作引物 ,扩增纵纹腹小的基因组DNA ,产生多态性DNA片段 ,回收了 8个表现个体特异性的片段。当用小的基因组总DNA探针与它们杂交时 ,其中 2个表现阳性 ,说明PCR方法扩增出的高变异产物含有重复序列。用含重复序列的个体特异性PCR产物作探针 ,与无关个体小基因组DNA的HaeⅢ酶切产物进行DNA印迹 ,获得了变异性较高的DNA指纹图谱。且通过对京白鸡家系分析表明 ,用小基因组DNA的PCR产物分离制备的探针所获得的DNA指纹图带能够稳定的遗传。因此 ,高变异的PCR产物可以有效地用作DNA指纹探针。     

四种小鼠肠道微生物DNA提取方法比较

采用异硫氰酸胍(guandine thiocyanate,GITC)法、Tiangen DNA提取试剂盒、Omega DNA提取试剂盒和广泛应用的十六烷基三甲基溴化铵(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法提取小鼠粪便微生物总DNA,通过比较所提取DNA的浓度和纯度,发现粪便DNA提取试剂盒提取的DNA纯度最高但浓度最低;CTAB法所得的DNA浓度最高但纯度最低;GITC法所得DNA的浓度高于粪便DNA提取试剂盒,纯度高于CTAB法。通过变性梯度凝胶电泳(16S r DNA-PCR-DGGE)指纹图谱分析技术进一步比较了各种提取方法所代表微生物群落的丰富度和多样性。结果表明,GITC法提取得到的DNA所代表细菌的丰富度和多样性显著高于其他3种方法。本实验所建立的GITC法可更全面地反映肠道微生物的多样性和群落结构,是一种较为理想的粪便微生物DNA提取方法。     

α-珠蛋白-3′HVR探针DNA指纹图法医应用的研究

本文用α-珠蛋白-3'HVR探针所建立的杂交方法,获得清晰可辩的DNA指纹图。就北京地区200名无关个体的DNA指纹图分析和统计结果,其相关机率为4.0×10~(-12),对6个家系的32名相关个体的分析,符合孟德尔定律,足以用作准确的个人识别和亲子关系鉴定,并巳用于检案,为侦破强奸、凶杀等案件提供了重要依据。     

纵纹腹小HaoDNA指纹谱探针的筛选和初步应用

以人工合成的微卫星序列（GTG）5,（GT）8,（CAC）5和人源小卫星33.15作引物,扩增纵纹腹小Hao的基因组DNA,产生多态性DNA片段,回收了8个表现个体特异性的片段,当用小Hao的基因组总DNA探针与它们杂交时,其中2个表现阳性,说明PCR方法扩增出的高变异产物含有重复序列,用含重复序列的个体特异性PCR产物作探针,与无关个体小Hao基因组DNA的HaeⅢ酶切产物进行DNA印迹,获得了变性性较高的DNA指纹图谱,且通过对京白鸡家系分析表明,用小Hao基因组DNA 的PCR产物分离制备的探针所获得的DNA指纹图带能够稳定的遗传,因此,高变异的PCR产物可以有效地用作DNA指纹探针。     

荧光素标记JH12.6探针进行的人DNA指纹图分析

采用荧光素标记和鲁米诺化学发光技术,建立了ＤＮＡ指纹图的分析方法。用该方法标记ＪＨ１２．６探针获得了清晰易读、分辨率高的人ＤＮＡ指纹图。经对云南省７８名无关个体进行ＤＮＡ指纹图分析,计算出无关个体的相关机率为７．４×１０（－１１）,平均等位基因频率为０．０９。比较同位素（３２）Ｐ标记方法表明,用荧光素标记ＪＨ１２．６探针进行人ＤＮＡ指纹图分析,具有简便、快速、安全、经济的特点,可在法医学鉴定及其它领域里推广应用。