河北地区临床实验室丝状真菌分离鉴定情况分析

目的开展一项由河北地区多所医院参与的临床实验室丝状真菌检测研究,促进实验室丝状真菌检测能力提升。方法共收集丝状真菌菌株,采用沙堡弱培养基和乳酸酚棉兰染色直接镜检进行菌种常规鉴定;中心实验室采用Vitek MS质谱进行复核鉴定,对MS不能有效鉴定的菌种进行核糖体DNA内转录间隔区ITS和/或钙调蛋白CaM测序分析。结果参与研究的15家三级医院2016～2017年共收集到丝状真菌225株。其中烟曲霉133株(59.11%)、黄曲霉/米曲霉28株(12.44%)、黑曲霉复合群18株(8.00%)、聚多曲霉6株(2.67%)、构巢曲霉6株(2.67%)、其他丝状真菌34株(15.11%)。样本类型包括下呼吸道痰标本203株(90.22%),耳道分泌物10株(4.44%),肺泡灌洗液4株(1.78%),其他样本8株(3.56%)。菌株鉴定正确率(148/225)65.78%,错误率(77/225)34.22%。结论丝状真菌感染中最常见的是曲霉菌属,主要以烟曲霉菌、黄曲霉菌和黑曲霉菌为主。传统的鉴定方法错误率高达30%以上,采用微生物质谱鉴定结合ITS/CaM区测序方法可以有效提高丝状真菌的鉴定正确率,为临床丝状真菌的治疗提供病原学依据。     

MALDI-TOF MS对临床侵袭性丝状真菌的快速鉴定技术的研究

目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术在临床常见丝状真菌鉴定中的应用价值。方法收集2017年4月—2019年7月本院各种类型临床标本中分离培养的65株丝状真菌,以及某三甲医院惠赠的26株丝状真菌。这91株丝状真菌通过传统形态学鉴定、DNA测序及MALDI-TOF MS鉴定方法后,以DNA测序结果为标准,与另外2种方法的鉴定结果进行统计学比较,评价MALDI-TOF MS在临床丝状真菌鉴定上的应用。结果在28℃和35℃条件下培养的菌株经质谱仪鉴定后,χ~2检验显示P0.05,提示培养温度差异对结果的影响无统计学意义;以DNA测序结果为金标准,传统形态学方法的正确鉴定率为81.3%(74/91),而基于MALDI-TOF MS技术的正确鉴定率可达97.8%(89/91);研究中,使用"甲酸乙腈提取法"提取蛋白后,丝状真菌质谱鉴定的正确率为90.1%(82/91),而"磁珠研磨法"提取蛋白后的质谱鉴定率则为97.8%(89/91)。结论临床常规工作中使用质谱仪鉴定常见丝状真菌时,培养温度不会影响质谱鉴定结果;改良"磁珠研磨法"提取蛋白后质谱仪鉴定的正确率优于质谱仪推荐"甲酸乙腈提取法";MALDI-TOF MS技术在常见丝状真菌的鉴定上,相比于传统形态学鉴定,该技术更快速、客观、高效及准确。     

真菌通用引物Its1和Its4在丝状真菌鉴定中的价值评价

目的 对真菌通用引物Its1和Its4在丝状真菌鉴定中的价值进行评价.方法 收集中山大学附属第一医院2012年1月至2012年8月间分离的丝状真菌11株,使用真菌通用引物Its1和Its4采用PCR法扩增核糖体基因,对PCR产物进行序列测定,将测序结果与GenBank中已知标准或临床菌株DNA序列比对,确定丝状真菌的菌种;同时与传统形态学鉴定方法进行比较,从而对真菌通用引物Its1和Its4在丝状真菌鉴定中的价值进行评价.结果 从DNA提取到序列测定结束,在2个工作日内即可完成.所有菌株均测序成功,测序结果与GenBank中的序列比对,烟曲霉、杂色曲霉、橘青霉、溜曲霉可以鉴定到种;黄曲霉和米曲霉、阿姆斯特丹散囊菌和冠突散囊菌由于高度同源性无法区分鉴定到种.结论 利用真菌通用引物Its1和Its4结合PCR技术和测序技术,可快速、准确将大部分丝状真菌鉴定到种.     

Biolog微生物鉴定系统中接种液的替代

目的：采用市售试剂自行配制Biolog菌种鉴定接种液,代替Biolog公司的原装接种液,用以降低菌种鉴定成本。方法：用实验室自行配制的接种液和Biolog公司的接种液,对120株细菌和50株丝状真菌进行Biolog微生物系统鉴定,对比鉴定结果。结果：用2种接种液进行菌种鉴定时,鉴定板上部分孔的颜色反应不同,但鉴定结果一致。结论：自行配制的接种液可以满足菌株鉴定的要求,具有推广意义。     

PCR-RFLP和多重PCR技术检测常见病原性丝状真菌的实验研究

目的建立检测常见丝状真菌感染病原菌的PCR-RFLP和多重PCR方法。方法建立以PCR技术为基础的限制片段长度多态性(RFLP)方法 ,首先用真菌通用引物扩增丝状真菌的ITS区,然后用限制性核酸内切酶对PCR产物进行酶切。用4种丝状真菌的特异性引物建立多重PCR体系,用该体系检测单模板、双模板和三模板的扩增情况,并测定该体系的特异性和敏感性。结果用PCR-RFLP技术能够鉴别5种常见丝状真菌,多重PCR能够根据扩增片段的不同鉴别菌种,在合适的反应条件下,对单模板、双模板和三模板均能扩增出目的片段。结论 PCR-RFLP和多重PCR技术能够快速鉴定丝状真菌感染病原菌,有临床应用的良好前景。     

纳木措可培养丝状真菌多样性及其与理化因子关系

微生物多样性在评估水体生态环境方面发挥着重要作用。本研究以青藏高原纳木措湖为研究对象, 开展水体可培养丝状真菌多样性及影响因子研究。通过膜过滤平置培养法、经典分类法和rRNA转录间隔区(ITS)序列分析对纳木措湖20个采样点的丝状真菌进行分离、纯化及鉴定, 测定水体理化指标, 综合分析丝状真菌空间分布格局与理化因子的相关性。菌种鉴定结果显示, 从纳木措水体样品中共分离纯化出1,412株丝状真菌, 隶属22属47种, 其中链格孢属(Alternaria)、青霉属(Penicillium)和毛霉属(Mucor)为优势属, 链格孢(Alternaria chlamydosporigena)和冻土毛霉(Mucor hiemalis)为优势种; Pearson相关性分析显示, 丝状真菌总丰度与温度、铵态氮、全磷呈显著正相关; 冗余分析显示, 铵态氮、温度、全磷、全氮、盐度及电导率是影响纳木措湖丝状真菌群落组成与分布的主要理化因子。综上所述, 纳木措水体可培养丝状真菌具有较高的物种多样性和空间异质性, 而且水体环境因子影响其分布。     

丝状真菌遗传转化体系的研究进展

随着现代测序技术的飞速发展,主要丝状真菌的基因组序列相继公布,对丝状真菌基因水平的研究也不断深入,发展高效的遗传转化技术是真菌基因功能研究以及定向改良菌种的前提。近年来,尽管研究者不断优化并开发新的遗传转化方法,然而在丝状真菌中仍然存在转化效率较低、阳性转化子筛选困难等问题。适宜的转化方法和筛选标记对丝状真菌的遗传转化有至关重要的作用。该文综述了丝状真菌遗传转化系统的研究进展,主要从受体细胞的处理、外源基因的整合与表达、常用转化方法和阳性转化子的筛选鉴定等方面进行概述,旨在为今后丝状真菌遗传转化体系的构建提供思路。     

黑龙江省菌种保藏中心

正黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所菌种保藏研究室(成立于1971年)。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物菌种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤菌、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽孢杆菌等,为黑龙江省内最大的公益性专业菌种保藏机构。中心具备完善的工作流程和科学管理制度,人才队伍齐备,技术手段先进,开展微生物种质资源保藏、鉴定及生物学评价等工作,可满足保藏微生物资源的安全性、溯源性和便捷性等要求。     

黑龙江省菌种保藏中心

正黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所菌种保藏研究室(成立于1971年)。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物菌种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤菌、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽袍杆菌等,为黑龙江省内最大的     

黑龙江省菌种保藏中心

黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所菌种保藏研究室（成立于1971年）。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物茼种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤菌、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽孢杆菌等,为黑龙江省内最大的公益性专业菌种保藏机构。中心具备完善的工作流程和科学管理制度,人才队伍齐备,技术手段先进,开展微生物种质资源保藏、鉴定及生物学评价等工作,可满足保藏微生物资源的安全性、溯源性和便捷性等要求。     

黑龙江省菌种保藏中心

黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所茵种保藏研究室（成立于1971年）。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物菌种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤茵、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽孢杆菌等,为黑龙江省内最大的公益性专业菌种保藏机构。中心具备完善的工作流程和科学管理制度,人才队伍齐备,技术手段先进,开展微生物种质资源保藏、鉴定及生物学评价等工作,可满足保藏微生物资源的安全性、溯源性和便捷性等要求。     

黑龙江省菌种保藏中心

<正>黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所菌种保藏研究室(成立于1971年)。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物菌种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤菌、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽孢杆菌等,为黑龙江省内最大的     

黑龙江省菌种保藏中心

<正>黑龙江省菌种保藏中心成立于1984年,前身是黑龙江省科学院微生物研究所菌种保藏研究室(成立于1971年)。从事微生物种质资源收集、分离、鉴定、保藏及相关应用研究。设有普通微生物菌种库和专业微生物菌种库,保藏有各类微生物种质5000余株,遗传物质、代谢产物近千份,涵盖了农业、医药、食品与发酵、环保、林业等行业。保藏种类包括食药用真菌、铜绿假单胞菌、大豆根瘤菌、小型丝状真菌、放线菌、枯草芽袍杆菌等,为黑龙江省内最大的     

ITS序列分析与MALDI-TOF MS质谱技术在丝状真菌鉴定中的应用

丝状真菌常用的鉴定方法为形态方法和基因鉴定方法,前者限于检验人员的知识和技能,后者操作繁琐,费用略昂贵,不适合常规开展。因此,寻找丝状真菌快速鉴定方法势在必行。本文采用VITEK MALDI-TOF MS（基质辅助激光解析电离时间飞行质谱）IVD数据库（3.0版本）对临床分离的254株丝状真菌进行鉴定,并以ITS（internal transcribed spacer 内转录间隔区）序列分析为标准,验证MALDI-TOF MS质谱技术鉴定丝状真菌的准确性。结果表明MALDI-TOF MS质谱技术可以对大部分丝状真菌实现快速、准确的鉴定,其中对毛癣菌属（100%）、毛孢子菌属（100%）、毛霉菌属（100%）、曲霉菌属（96.5%）准确率很高,对犬小孢子菌（75%）、镰刀菌属（50%）、新月弯孢霉（46.2%）准确率较低,对丝状真菌鉴定的总体准确率为86.36%,与ITS测序分析符合率为83.97%。     

香山黄栌枯萎病叶片真菌的分离与鉴定

利用微生物培养方法及多相分类鉴定技术,对分离自香山黄栌枯萎病叶片样品的真菌菌株进行分离与鉴定,共分离到丝状真菌22株,分属细极链格孢(Alternaria tenuissima)、草酸青霉(Penicillium oxalicum)、腊梅拟茎点霉(Phomopsis chimonanthi)和葡萄茎枯病菌(Phoma glomerata)4个菌种,并保藏于中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)。其中细极链格孢(11株)和腊梅拟茎点霉(7株)为优势菌种。细极链格孢、腊梅拟茎点霉、葡萄茎枯病菌均为已报道的植物病原菌,可能为香山黄栌枯萎病潜在病原菌。     

一种快速高效获取丝状真菌PCR反应模板的方法

建立一种快速高效获取丝状真菌PCR反应模板的方法,提高丝状真菌PCR鉴定效率。通过单因素法对机械破壁联合微波法进行条件优化,利用优化后的方法获取13株不同种属丝状真菌的PCR反应模板,同时与Chelex-100法、机械破壁法作对比,以试剂盒抽提法作为阳性对照,进行ITS序列扩增,琼脂糖凝胶电泳检测扩增结果。机械破壁联合微波法获取丝状真菌PCR反应模板的最佳条件为40 Hz机械破壁1 min、微波700 W高温裂解3 min,采取该法与试剂盒抽提法获得的模板均成功扩增13株不同种属丝状真菌ITS序列,且PCR鉴定结果一致;Chelex-100法获得的模板成功扩增6株丝状真菌ITS序列;机械破壁法获得的模板虽成功扩增9株丝状真菌ITS序列,但扩增效果欠佳。机械破壁联合微波法能够有效获取丝状真菌PCR反应模板,与试剂盒抽提法相比具有操作简便、快速高效的优点,提高丝状真菌PCR鉴定效率。     

MALDI-TOF MS技术在侵袭性丝状真菌快速鉴定中的应用

目的 探索不同培养基、不同培养时间和不同蛋白质提取方法对侵袭性丝状真菌质谱鉴定准确率的影响,旨在提高基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术鉴定侵袭性丝状真菌的准确率。方法 采用分子生物学方法为金标准,同时运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术对所收集临床丝状真菌进行鉴定。根据分子生物学的鉴定结果,去除VITEK-MS v3.0数据库中没有的菌株,其余菌株接种在沙氏葡萄糖琼脂(SDA)、马铃薯葡萄糖琼脂(PDA)和察氏培养基(CA)3种不同的培养基中,采用2种不同的蛋白质提取方法(甲酸乙腈法和磁珠法),获得了不同培养时间点(2、3、5、7和9 d)的特异性质谱指纹图谱。结果 不同丝状真菌蛋白质提取方法进行比较,甲酸乙腈法总鉴定准确率为79.8%,磁珠法总鉴定准确率为77.5%,2种丝状真菌蛋白质提取方法的质谱鉴定准确率差异无统计学意义(χ²=1.040,P=0.308)。不同培养基进行比较,SDA培养基总鉴定准确率为90.7%,PDA培养基总鉴定准确率为81.4%,CA培养基总鉴定准确率为67.4%,3种不同培养基的丝状真菌质谱鉴定准确率差异有统计学意义(χ     

产二十二碳六烯酸等多不饱和脂肪酸真菌的筛选*

从土壤中筛选出一株产二十二碳六烯酸（DHA）的丝状真菌,菌丝含油21.23％,DHA占总脂肪酸2.51％;同时含二十碳五烯酸（EPA）,占总脂肪酸的0．41％;不饱和脂肪酸占总脂肪酸的80％。经鉴定为头孢霉属（Caphalosporiumsp．）真菌。同时发现两株菌含EPA,经鉴定为小克银汉霉（Cunninghamellasp.）和毛霉（Mucorsp．）。在这几个属中发现DHA和EPA尚属首次。头孢霉菌DHA产量及百分含量和斜面菌种在不同温度下储藏有关。菌种在20℃储藏10天,在液体PDA培养基上发酵,DHA可占总脂肪酸11．27％,产量达63．35mg／L。     

一种便于丝状真菌显微观察的培养方法

在真菌培养过程中,对其个体形态与群体（菌落）形态进行实时观察与鉴定是很必要的。本文利用半培养基培养法结合显微操作技术,对丝状真菌个体与群体进行形态学观察。结果表明,该方法无需染色与制片,不破坏菌丝正常生长状态,可实时进行形态学检测,对多个菌种在自然生长状态下的菌丝与菌落特征进行观察,操作简单、方便、快捷,从而降低了成本及工作量。     

福建地区94例女性阴道念珠菌感染分离株分型研究

目的 对福建地区临床阴道分泌物分离出的（94株）念珠菌菌株进行分类鉴定,并通过分子生物学及API试验分析传统科玛嘉分类方法的准确性.方法 ①通过科玛嘉显色培养基鉴定菌种,并观察菌株显微镜下形态学表现.②通过ITS区段分子生物学序列分析进行菌种鉴定.③将科玛嘉试验与ITS区段序列分析结果与化验室检验报告结果对比,将鉴定差别菌株进一步行API试验及LSU区段序列分析.结果 ①94株念珠菌经鉴定结果为白念珠菌78株、光滑念珠菌10株、近平滑念珠菌3株、热带念珠菌1株、酿酒假丝酵母菌1株及其中1株为光滑念珠菌及近平滑念珠菌混合感染.②科玛嘉试验可良好的鉴定念珠菌,但对于少见菌种（如酿酒假丝酵母菌）仍缺乏特异性.③一般化验室通过简单菌落形态学及简易科玛嘉检测鉴定仍存在一定误差率（10/94）.④分子生物学方法鉴定菌种准确性高,且可从基因序列分析中鉴定包含C.parapsilosis sensu strico,Candida metapsilosis以及Candida orthopsilosis的近平滑念珠菌复合体菌种.结论 福建地区女性外阴感染的菌种仍以白念珠菌为主,但非白念珠菌的感染也占据相当的比例（16/94）,而在检测方法上,分子生物学技术较科玛嘉试验更能准确的鉴定念珠菌菌种.