鮰爱德华氏菌外膜微孔蛋白N基因PCR快速检测方法的建立

根据Gen Bank中鮰爱德华氏菌Edwardsiella ictaluri外膜微孔蛋白N(porin N)基因序列(Gen Bank No:NC_012779.2)设计了1对引物,预计目的片段大小为381 bp。通过对反应体系和条件的优化,并进行特异性试验、敏感性试验及人工感染组织样品检测,建立了一种快速检测鮰爱德华氏菌的PCR方法。结果表明,在所检测的鮰爱德华氏菌、迟缓爱德华氏菌、嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、豚鼠气单胞菌、嗜麦芽寡养单胞菌、鲁氏耶尔森氏菌、海豚链球菌、不动杆菌、产气肠杆菌、大肠杆菌、拟态弧菌、荧光假单胞菌、弗氏柠檬酸杆菌15种细菌中仅鮰爱德华氏菌扩增出特异性条带;敏感性试验结果显示,该方法最小核酸检出量为9.35×10-3ng·μL-1;同时对人工感染的病料肝脏、细菌基因组DNA、细菌菌液及菌落进行扩增,结果显示4种材料均能检测出大小为381 bp的基因片段。本研究所建立的方法特异强、灵敏度高,适用于鮰爱德华氏菌感染病例的高效、快速检测。     

用PCR检测细胞培养中支原体污染

细胞培养中支原体污染已经成为严重的问题.为了扩增6种支原体(精氨酸支原体,口腔支原体,人型支原体,猪鼻支原体,发酵支原体及莱氏支原体)核糖体RNA操纵子的16s和23s DNA间区,设计了三个通用PCR引物(F1,F2及R1).当以6种支原体DNA为模板时,引物F1和R1产生340到468bp的片段,引物F2和R1产生145到211bp的片段,当用Hela细胞或E.coli DNA作为模板,用引物F1和R1时,在电泳中未观察到特定区带.此法最小能检出8.5fg精氨酸支原体DNA,相当于13个精氨酸支原体.这说明,当这些支原体污染细胞培养时,能用PCR法检测出来.     

溶藻弧菌HY9901 AcrA基因克隆与序列分析（英文）

Touchdown PCR扩增溶藻弧菌HY9901 AcrA基因部分序列, 得一460 bp片段, 再以反向PCR和巢式PCR联合扩增其侧翼序列, 拼接得一由1101 nt组成, 共编码366 aa的完整基因。该基因演绎的氨基酸序列与几种弧菌的同源性都比较高, 与创伤弧菌YJ016、副溶血弧菌RIMD 2210633、灿烂弧菌12B01、霍乱弧菌O1 N16961同源性分别为76%、73%、71%和70%。     

溶藻弧菌HY9901 AcrA基因克隆与序列分析

Touchdown PCR扩增溶藻弧菌HY9901 AcrA基因部分序列,得一460bp片段,再以反向PCR和巢式PCR联合扩增其侧翼序列,拼接得一由1101 nt组成,共编码366 aa的完整基因.该基因演绎的氨基酸序列与几种弧菌的同源性都比较高,与创伤弧菌YJ016、副溶血弧菌RIMD 2210633、灿烂弧菌12B01、霍乱弧菌O1 N16961同源性分别为76%、73%、71%和70%.     

溶藻弧菌HY9901 ahr基因克隆与序列分析

TouchdownPCR扩增溶藻弧菌依赖ATP的DNA解旋酶rep基因部分序列,得一1．2kb片段,再以反向PCR和巢式PCR联合扩增其侧翼序列,拼接得一由2016bp组成,共编码671aa的完整基因。该基因演绎的氨基酸序列与几种弧菌的同源性都比较高,与副溶血弧菌RIMD2210633、溶藻弧菌12G01、Vibriosp．Ex25、创伤弧菌YJ016、霍乱弧菌RC385、灿烂弧菌12801、费氏弧菌ES114及矿angustumS14分别为96％、95%、95%、94%、92％、91%、89％、86％。     

溶藻弧菌中类霍乱弧菌毒力岛转座酶基因及侧翼序列分子生物学特征分析

[目的]调查类似霍乱弧菌毒力岛(VPI)转座酶(vpiT)的基因是否在溶藻弧菌中分布,并了解其全序列及侧翼序列的分子生物学特征.[方法]对94株溶藻弧菌是否携带类似VPI的vpiT基因进行PCR检测,对阳性株进行了PCR产物直接测序,根据获得的部分已知序列,设计引物,通过反向PCR扩增出全长类似vpiT的基因valT及部分侧翼片段,对反向PCR产物进行克隆测序,然后对获得的valT及侧翼序列进行生物信息学分析.[结果]发现94株溶藻弧菌中只有从粤东对虾池水分离的2个株E06011、E0612在PCR检测中产生了预期扩增片段.测序表明两者序列(valT-S1)完全一致.根据反向PCR及克隆最终获得的溶藻弧菌E0601全长valT基因及部分侧翼序列valT-S3.对valT-S3生物信息学分析表明:valT是一个高度类似于霍乱弧菌毒力岛vpiT的转座酶基因.[结论]根据上述结果及相关文献,有理由相信valT基因及其侧翼片段是异源获得,霍乱弧菌VPI元件或整体很可能在包括溶藻弧菌在内的弧菌种间转移.     

黄颡鱼“裂头病”病原二重PCR检测方法的建立及应用

"裂头病"是黄颡鱼养殖业的主要病害之一,其病原为鮰爱德华氏菌或迟钝爱德华氏菌。以GenBank所收录鮰爱德华氏菌与迟钝爱德华氏菌16S rRNA基因为模板,优化设计两对特异性引物,经多重PCR反应体系优化及特异性与敏感性检测,建立了检测鮰爱德华氏菌和迟钝爱德华氏菌的二重PCR检测方法。结果显示,阳性对照样品的琼脂糖凝胶电泳条带同时检测到鮰爱德华氏菌和迟钝爱德华氏菌,扩增产物大小分别为470 bp及268 bp,灵敏度为1.38 ng/μL。此法用于检测江西南昌地区多个养殖场所患"裂头病"黄颡鱼脑部DNA,11份患病黄颡鱼的脑部组织均检出鮰爱德华氏菌,表明该地区黄颡鱼所患"裂头病"的病原菌为鮰爱德华氏菌,此结果与常规细菌分离鉴定的检测结果一致。所建二重PCR检测法敏感度高,特异性强,检测成本低,对黄颡鱼"裂头病"的快速诊断与流行病学调查有较好的应用价值。     

添加有扩增内标的副溶血弧菌PCR检测方法的建立

摘要：【目的】发掘副溶血弧菌特异性更强的检测靶点,并人工构建扩增内标,建立可以有效避免假阴性的新PCR检测体系。【方法】利用生物信息学方法,从副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）基因组DNA中发掘特异性很高的序列,并设计相应的特异性引物,人工构建扩增内标,建立PCR检测体系。【结果】本研究发掘得到的序列vp1332特异性很强,经检索,该序列是编码ABC转运子接合蛋白组分的基因片段,根据此序列设计一对特异检测引物（vp1332L/vp1332R）,同时,构建了扩增内标,并建立了PCR检测体系。利用该体系对296株副溶血弧菌和33株非副溶血弧菌进行检测,结果显示,所有以副溶血弧菌为模板的PCR反应均可扩增到一条343 bp的特异片段,而模板来源于非副溶血弧菌的则只能扩增到一条499 bp的扩增内标片段。灵敏度实验表明,该PCR反应体系的检测灵敏度为1.6×102 cfu/mL。人工污染实验表明,起始染菌量为1.24 cfu/25 g样品时经8 h增菌,即可检测到副溶血弧菌。实际样品检测结果也证实该方法的有效性。【结论】本研究建立的PCR反应体系能特异地检测副溶血弧菌,并可有效地排除假阴性,提高检测准确率。     

添加有扩增内标的副溶血弧菌PCR检测方法

【目的】发掘副溶血弧菌特异性更强的检测靶点,并人工构建扩增内标,建立可以有效避免假阴性的新PCR检测体系。【方法】利用生物信息学方法,从副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)基因组DNA中发掘特异性很高的序列,并设计相应的特异性引物,人工构建扩增内标,建立PCR检测体系。【结果】本研究发掘得到的序列vp1332特异性很强,经检索,该序列是编码ABC转运子接合蛋白组分的基因片段,根据此序列设计一对特异检测引物(vp1332L/vp1332R),同时,构建了扩增内标,并建立了PCR检测体系。利用该体系对296株副溶血弧菌和33株非副溶血弧菌进行检测,结果显示,所有以副溶血弧菌为模板的PCR反应均可扩增到一条343bp的特异片段,而模板来源于非副溶血弧菌的则只能扩增到一条499bp的扩增内标片段。灵敏度实验表明,该PCR反应体系的检测灵敏度为1.6×102cfu/mL。人工污染实验表明,起始染菌量为1.24cfu/25g样品时经8h增菌,即可检测到副溶血弧菌。实际样品检测结果也证实该方法的有效性。【结论】本研究建立的PCR反应体系能特异地检测副溶血弧菌,并可有效地排除假阴性,提高检测准确率。     

添加扩增内标的沙门氏菌PCR检测方法

通过构建人工扩增内标,建立可以有效指示沙门氏菌检测过程可能出现假阴性情况的PCR检测方法。本研究基于沙门氏菌invA基因设计特异性引物,复合法构建扩增内标,建立PCR检测体系。特异性引物LW,对33株沙门氏菌和6株非沙门氏菌标准株进行检测,结果显示,所有沙门氏菌均扩增出385 bp的目标片段,非沙门氏菌则只能扩增出484 bp的扩增内标片段,特异性良好。灵敏度实验表明,该检测体系的灵敏度可达6.35 fg/μL。人工污染实验表明,起始染菌量为3.2 CFU/25 mL时,仅需8h增菌培养便可检出。大量食品样品检测证明,该检测体系确实可以有效的避免PCR检测过程出现的假阴性,提高检测准确性。     

阿司匹林和复方新诺明对大豆种子萌发及活力的影响

 以大豆(Glycine max)种子为材料,浓度的阿斯匹林和复方新诺明水溶液,在(20±1)℃条件下分种24h和12h, 测定大豆种子萌发过程中的各项生理生化指标以及萌发后的各形态指标实验结果表明：阿斯匹林和复方新诺明水溶液浸种都能有效地提高大豆种子的发芽率和活力指数,还能促进大豆根系的生长。其中以62.5mg·L-1的阿斯匹林和0.5mg·L-1的复方新诺明处理后的效果最为显著。阿斯匹林浸种能使大豆萌芽的相对电导率显著降低,使活性氧清除酶的活性有所提高。复方新诺明浸种则使大豆萌芽的蛋白质含量以及氨基酸总量都有显著的提高。     

SYMMETRY AND DEVELOPMENT OF BUTOMUS UMBELLATUS (BUTOMACEAE) AND LIMNOCHARIS FLAVA (LIMNOCHARITACEAE)

The prostrate rhizome of Butomus umbellatus produces branch primordia of two sorts, inflorescence primordia and nonprecocious vegetative lateral buds. The inflorescence primordia form precociously by the bifurcation of the apical meristem of the rhizome, whereas the non-precocious vegetative buds are formed away from the apical meristem. The rhizome normally produces a branch in the axial of each foliage leaf. However, it is unclear whether the rhizome is a monopodial or a sympodial structure. Lateral buds are produced on the inflorescence of B. umbellatus either by the bifurcation or trifurcation of apical meristems. The inflorescence consists of monochasial units as well as units of greater complexity, and certain of the flower buds lack subtending bracts. The upright vegetative axis of Limnocharis flava has sympodial growth and produces evicted branch primordia solely by meristematic bifurcation. Only certain leaves of the axis are associated with evicted branch primordia and each such primordium gives rise to an inflorescence. The flowers of L. flava are borne in a cincinnus and, although the inflorescence is simpler than that of Butomus umbellatus, the two inflorescences appear to conform to a fundamental body plan. The ultimate bud on the inflorescence of Limnocharis flava always forms a vegetative shoot, and the inflorescence may also produce supernumerary vegetative buds. Butomus umbellatus and Limnocharis flava exhibit a high degree of mirror image symmetry.     

SEXUAL DIMORPHISM OF SHELL SHAPE AND GROWTH OF VILLOSA VILLOSA (WRIGHT) AND ELLIPTIO ICTERINA (CONRAD) (BIVALVIA: UNIONIDAE)

Shell shape and growth of two unionacean species, Villosa villosaand Elliptio icterina, are analyzed with univariate and multivariatetechniques. The relationship of shape variables to size variablesis examined. Under the lognormal assumption, parametric testsof these allometric relationships are valid. Variables describingthe ventro-posterior region of the shell are shown to be thebest of those tested for discriminating between the sexes ofboth species regardless of statistical method. Neither speciesexhibits size sexual dimorphism. Shape sexual dimorphism ofV. villosa is constant during adult growth, but the more subtledimorphism of E. icterina changes as adults continue to grow. (Received 20 January 1986;     

双花木属和壳菜果属(金缕梅科)的核型研究

本文对金缕梅科Hamamelidaceae双花木属Disanthus Maxim．的长柄双花木D．cercidifolius subsp．longipes和单种属壳菜果属Mytilaria Lec.首次进行了染色体计数和核型分析。结果表明：长柄双花木与产自日本的双花木D. cercidifolius subsp．cercidifolius的体细胞染色体数目一致,均为2n＝16,前者无“st”或“t”染色体,表明该亚种可能比较原始;壳菜果Mytilaria laosensis Lec．的染色体数目为2n＝26,x=13。前人报道的金缕梅科染色体基数为x＝8和x＝12,因此x＝13可能是金缕梅科的一个新染色体基数。联系该属的形态特征及其与马蹄荷属Exbucklandia R．W．Brown的关系,作者支持将壳菜果属处理为独立的亚科,即壳菜果亚科Mytilarioideae。     

CHROMOSOMES OF GRAPTOPETALUM AND THOMPSONELLA (CRASSULACEAE)

Chromosome numbers are reported for probably all 11 species of Graptopetalum (x = 30–35) and for both species of Thompsonella (x = 26). Plants of two species of Graptopetalum have gametic numbers from about 240–275, more than have been reported in any other seed plants. In hybrids the 30–35 chromosomes in the basic genome of Graptopetalum and likewise the 26 in Thompsonella apparently do not pair among themselves, and the genomes seem to be no more potent genetically than those of other species in their subfamily having as few as 12 chromosomes. Species with these gametic numbers are therefore considered to be diploid. On the other hand, in hybrids between a diploid and a plant with a very high chromosome number the phenotype of the latter predominates, and most of its chromosomes pair with each other. Many such hybrids are fertile. These facts suggest that the high polyploids arose by autoploidy rather than by alloploidy. Nevertheless, they may store heterozygosity at some gene loci and release it in various dosages and proportions each generation.     

王氏鬃蚤雌性的发现及对两种雄蚤 形态的补充和更正*

我国蠕形蚤科ＶｅｒｍｉｐｓｙｌｉｄａｅＷａｇｎｅｒ,１８８９鬃蚤属ＣｈａｅｔｏｐｓｙｌａＫｏｈａｕｔ,１９０３的蚤类目前有两种缺少配对标本,其中之一是１９９７年根据采自湖北省西北部神农架林区１只雄蚤订立的王氏鬃蚤Ｃｈａｅｔｏｐｓｙｌａ（Ｃｈａｅｔｏｐ...