气调包装生鲜冷却牛肉贮藏的微生物种类变化

在冷却牛肉的贮藏过程中,微生物的生长繁殖是导致其腐败变质的主要原因。在低温冷藏条件下,大多数微生物的生长受到抑制,但仍有一些嗜冷菌可以生长繁殖,从而对冷却肉的品质及人类健康安全造成威胁。因此,研究和分析生鲜冷却牛肉中菌群构成及其演替规律,不但具有重要的     

两种包装市售冷却牛肉中微生物多样性的比较分析

本文比较分析了相同销售条件下的未包装冷却牛肉与保鲜膜包装冷却牛肉中的微生物群落结构。采用16S rDNA的V3区片段进行PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳), 同时利用16S rDNA全长序列, 通过克隆文库技术对两个样品的微生物群落结构进行研究。研究发现: 微生物群落结构表现出较大的差异。保鲜膜包装冷却牛肉共有6个OTU (Operational taxonomic unit), 主要为Lactococcus(乳球菌属, 28%), Lactobacillus(乳杆菌属, 26%), Carnobacterium(肉品杆菌属, 18%)和Brochothrix(索丝菌属, 10%); 未包装冷却牛肉则共得到18个OTU, 主要是Lactococcus(乳球菌属, 28%), Brochothrix(索丝菌属, 18%)和Acinetobacter(不动杆菌属, 11%)。结果表明, 保鲜膜包装对于葡萄球菌属以及冷杆菌属等一些细菌都起到了一定的抑制作用。本研究为肉类加工生产中微生物的控制提供一定的理论依据。     

铜尾矿废弃地生物土壤结皮固氮微生物多样性

生物土壤结皮能够有效提高矿业废弃地有机质和氮的积累,促进植被的恢复.本研究基于固氮微生物的nifH基因多样性,以铜陵铜尾矿废弃地3种类型的生物土壤结皮(藻结皮、藓结皮和藻-藓混合结皮)为对象,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术研究生物土壤结皮中固氮微生物的多样性以及废弃地植物群落发育对其产生的影响.结果表明： 尾矿库裸地表面的藻结皮的固氮微生物多样性最高,其次为维管植物群落下的藻-藓混合结皮,苔藓结皮的固氮蓝藻多样性最低;随着维管植物群落高度和盖度的增加,固氮微生物多样性降低,铜尾矿废弃地的pH、水分、有机质、养分含量(氮和磷)以及有效态和总重金属浓度对固氮微生物多样性的影响均不显著.测序和系统发育分析表明,废弃地结皮中固氮微生物以蓝藻为主,主要为不具有异形胞的丝状蓝藻.
     

T-RFLP技术分析油藏微生物多样性

应用T-RFLP(末端限制性片段长度多态性)技术分析和比较了胜利油田单12区块的一口注水井(S12-zhu)和三口采油井(S12-4、S12-5和S12-19)的油藏微生物多样性。基于T-RFLP图谱的多样性指数表明注入水样品具有更丰富的细菌和古菌多样性。相似性指数表明,样品间细菌群落结构的相似性介于22.4%～30.8%之间,古菌群落结构的相似性介于20.8%～34.5%之间。查询RDP数据库推测这4个油藏样品所共有的优势微生物可能为Pseudomonas属,Marinobacter属和产甲烷微生物。T-RFLP技术能方便快捷的分析微生物多样性,其在油藏微生物多样性研究上的应用可以为MEOR提供有用的信息。     

杉木连栽土壤微生物多样性的比较研究

分析了位于湖南会同广坪镇1～4代人工杉木林根际土壤微生物数量变化情况,结果表明,随杉木连栽代数的增加,根际土壤中三大类群微生物数量发生显著变化,细菌和放线菌数量明显减少,真菌数量显著增加.利用PCR和DGGE技术分析了1～4代杉木林根际土壤细菌区系和真菌区系.结果表明,细菌生物多样性在不同连栽代数杉木根际土壤中变化不明显,各代杉木土壤之间细菌的遗传相似性为87%.而真菌随连栽代数的增加,DGGE图谱带逐渐减少,真菌生物多样性降低,各代杉木土壤之间真菌的遗传相似性也较低,仅为45%.对各代杉木土壤主要真菌类群的分析表明,随连栽代数的增加,病原真菌及产毒真菌增加显著.     

长期不同耕作措施对土壤团聚体特征及微生物多样性的影响

以豫西丘陵地区15年的保护性耕作试验为平台,研究了不同耕作措施对土壤水稳性团聚体分布及稳定性和土壤细菌、古菌及真菌多样性的影响.结果表明: 与传统耕作相比,免耕、深松覆盖和小麦-花生两茬耕作处理增加了>2000 μm粒级团聚体的相对含量,减少了<53 μm粒级团聚体的相对含量;显著提高了土壤团聚体平均质量直径(MWD),提高幅度分别为18.0%、12.2%和50.4%.免耕、深松覆盖和两茬耕作处理均可提高细菌、古菌和真菌的Shannon指数(H),细菌分别提高0.3%、0.3%和0.6%,古菌分别提高20.2%、40.5%和49.1%,真菌分别提高23.7%、19.5%和25.8%.土壤细菌和古菌的H指数与大团聚体含量(R_0.25)和MWD显著相关,而真菌的H指数与R_0.25和MWD相关性不显著.综上,采用免耕、深松结合小麦秸秆覆盖以及小麦-花生轮作等措施均可改善土壤团聚体状况,提高土壤微生物多样性指数.
     

蓖麻连作土壤中微生物代谢多样性分析

目的 探究蓖麻连作对根际微生物多样性的影响。方法 以两年连作蓖麻根际土壤（蓖2）、一年生蓖麻根际土壤（蓖1）和相邻的未种植过蓖麻的大麦根际土壤（大麦）为研究对象,利用Biolog技术对样品进行检测,通过SPSS数据分析软件对测得的数据进行分析。结果 随着培养时间的延长,平均每孔颜色变化率（AWCD）值不断增加,在72~108 h变化最快,在120 h后,蓖1与蓖2的AWCD值均趋向平稳;香浓指数的比较说明各个样品之间差异存在统计学意义（P蓖2>大麦;主成分分析显示蓖1根际微生物多样性最强,蓖2次之,大麦根际微生物多样性最差。结论 本研究所得结果为提高蓖麻的质量与产量提供理论依据。     

重金属污染土壤中微生物的多样性

<正>土壤重金属污染是指人类活动将重金属混入到土壤中,致使土壤中重金属含量明显高于原有含量,并造成生态环境质量恶化的现象[1]。污染土壤的重金属主要包括汞(Hg)、镉(Cd)、铅(Pb)、铬(Cr)和类金属砷(As)等生物毒性显著的元素,以及有一定毒性的锌(Zn)、铜(Cu)、镍(Ni)等元素。除了来自农药、废水、污泥和     

市售冷却牛肉中主要细菌的常规分离与鉴定

利用常用纯培养的方法, 根据细菌的菌落形态、菌落颜色、革兰氏染色等常见特征, 从市售冷却牛肉中, 选取菌落形态差别比较明显的菌株共32株, 其中保鲜膜包装冷却牛肉样品共12株, 未包装冷却牛肉样品共20株; 同时选取两样品中的优势菌株各4株进行进一步的研究(8株细菌编号为：S01~S08, 其中S01~S04为未包装冷却牛肉样品; S05~S08为保鲜膜包装冷却牛肉样品), 通过ARDRA(Amplified ribosomal DNA restriction analysis) 以及16S rDNA 序列等进行分类研究, 确定该细菌的分类地位, 并结合形态、常规生理生化特性进行鉴定, 确定各细菌所属种。实验表明：S01为假单胞菌属中的恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida), S02为希瓦氏菌属下的(Shewanella cincia sp.), 而S03和S05为希瓦氏菌属下的腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens), S04为窄食单胞菌属中的嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia), S06为嗜冷杆菌(Psychrobacter sp.), S07为葡萄球菌属中的松鼠葡萄球菌(Staphylococcu sciuri), S08为微杆菌属中的产左聚糖微杆菌(Microbacterium laevaniformans)。证明两样品的共有优势菌为希瓦氏菌属。通过对样品可培养微生物情况进行初步的调查分析, 为冷却肉加工工艺提供一定的理论基础。     

青藏高原微生物多样性研究

正青藏高原被誉为世界屋脊,其内部除平原外还有许多山峰、冰川、高山湖泊和高山沼泽,是生态环境最为奇特、生物资源最为丰富的自然资源宝库之一。同时,青藏高原的微生物群落结构及其多样性与其他区域存在巨大差异,因而具有极高的科学研究价值,并逐渐被人们所关注。研究发现气候变化对青藏高原高寒草地生态系统草丛-地境界面微生物会产生重要的影响[1]。冰川雪藻的研究主要在南部的Yala冰川开展,     

Soil Microbial Community Response to Nitrobenzene Exposure for a Spartina Wetland

To explore the response of the soil microbial community to nitrobenzene (NB) exposure in a Spartina marsh, a short-term (45 d) mesocosm study was conducted at three NB concentrations of (10, 50, and 100) mg kg^?1. Dry soil, sterile and unsterile controls were also compared. The ability of the microbes to biodegrade NB was studied in an effort to predict the outcome of NB in the mesocosm. The results indicated that a microbial community is capable of doing so. Microbial enumeration and enzyme assays showed that the fluctuations in microbial communities and polyphenol oxidase activities are related to the initial NB concentration. Moreover, cluster analyses through denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) revealed very similar patterns (95.5%) throughout the 45 d term, indicating that the microbial community regenerates when NB is exhausted. Although volatilization and photolysis were the major processes responsible for the reduction in NB in contaminated mesocosms and the microbial community regenerated at the end of incubation, the data indicate potential ecological risks in outfall areas even if the discharged wastewater complies with the national wastewater discharge standards.     

微生物分子生态学技术在湖泊微生物多样性研究中的应用

微生物是湖泊生物圈物质循环和能量流动的主要参与者,在湖泊的生态系统中起着重要的作用。但是,湖泊中存在着大量不可培养的细菌,利用传统的培养技术,无法对湖泊微生物的多样性进行深入而全面的研究,而不依赖培养的分子生物学技术的发展为此方面研究开辟了新的路径。微生物分子生态学作为分子生物学与微生物生态学交叉产生的学科,在研究湖泊微生物多样性方面已经得到了广泛的应用。主要综述了变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,末端限制性酶切片段长度多态性技术(T-RFLP),16SrDNA克隆文库技术等微生物分子生态学技术在研究湖泊微生物多样性方面的应用情况。     

Thermophilic co-digestion of organic fraction of municipal solid wastes with FOG wastes from a sewage treatment plant: reactor performance and microbial community monitoring

Working at thermophilic conditions instead of mesophilic, and also the addition of a co-substrate, are both the ways to intend to improve the anaerobic digestion of the source-collected organic fraction of municipal solid wastes (SC-OFMSW). Addition of sewage treatment plant fat, oil and grease wastes (STP-FOGW), that are nowadays sent to landfill, would represent an opportunity to recover a wasted methane potential and, moreover, improve the whole process. In this study, after a first period feeding only SC-OFMSW, a co-digestion step was performed maintaining thermophilic conditions. During the co-digestion period enhancements in biogas production (52%) and methane yield (36%) were achieved. In addition, monitoring of microbial structure by using PCR-DGGE and cloning techniques showed that bacterial community profiles clustered in two distinct groups, before and after the extended contact with STP-FOGW, being more affected by the STP-FOGW addition than the archaeal one.     

不同pH条件下除臭生物滤池微生物种群结构的分子生态分析

采用分子生物学方法研究生物滤池中不同pH环境下的微生物种群的基因多样性,通过扩增细菌16SrRNA基因的V3可变区,结合应用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析除臭生物滤池的生物种群的结构变化,并回收主要的DNA片段,采用PCR测序及T载体克隆测序,明确优势菌群的系统发育地位。结果表明,除臭生物滤池在不同的pH条件下,微生物的多样性及其丰度存在较大差别,强酸性对微生物具有较高的选择作用,与中性条件相比,微生物种群多样性相对较低。同时在滤池的不同层次上也表现出明显的空间分布多样性差异,序列比对显示硫氧化细菌在除臭过程中占有优势地位。为更好的处理恶臭气体提供可靠的科学依据,同时也为生物除臭的应用提供一定的理论基础     

Statistical differences between relative quantitative molecular fingerprints from microbial communities

Molecular fingerprints of microbial communities are a common method for the analysis and comparison of environmental samples. The significance of differences between microbial community fingerprints was analyzed considering the presence of different phylotypes and their relative abundance. A method is proposed by simulating coverage of the analyzed communities as a function of sampling size applying a Cramér-von Mises statistic. Comparisons were performed by a Monte Carlo testing procedure. As an example, this procedure was used to compare several sediment samples from freshwater ponds using a relative quantitative PCR-DGGE profiling technique. The method was able to discriminate among different samples based on their molecular fingerprints, and confirmed the lack of differences between aliquots from a single sample.     

Sustainable power production in a membrane-less and mediator-less synthetic wastewater microbial fuel cell

Microbial fuel cells (MFCs) fed with wastewater are currently considered a feasible strategy for production of renewable electricity.     

基于16S rRNA基因和细菌基因组间重复序列的DNA指纹图谱技术对肝硬化大鼠肝移植后肠道菌群多样性的研究

目的应用PCR-DGGE和rep-PCR技术对肝硬化大鼠肝移植后肠道菌群多样性进行研究,探讨肠道菌群多样性的变化,并比较这两种方法在菌群分析中的作用。方法首先建立CCL4诱导肝硬化大鼠的肝移植模型,收取对照组、肝硬化成模时、肝移植后7 d和肝移植后30 d的大鼠粪便,提取细菌基因组DNA,采用PCR-DGGE和rep-PCR[BOX-PCR,ERIC-PCR,ERIC2-PCR,(GTG)5-PCR,REP-PCR]进行DNA指纹图谱分析。结果PCR-DGGE可明确将正常大鼠、肝硬化大鼠、肝移植大鼠分为3个簇,并显示出肝硬化、肝移植大鼠肠道菌群多样性明显增多。rep-PCR技术也可将各组分开,其中ERIC-PCR、ERIC2-PCR及REP-PCR三者扩增条带各组差异有显著性,鉴别效果更好。结论应用基于16S rRNA基因和细菌基因组间重复序列的指纹图谱技术对肝硬化大鼠肝移植后肠道微生态的研究具有重要价值,可对临床肝硬化、肝移植患者肠道微生态制剂的使用起到指导作用。