用基因芯片鉴别诊断四种水泡性疾病

为了对临床上症状非常相似的四种水泡性动物疾病进行大批量、快速准确的检测,我们尝试用基因芯片技术来对这四种水泡性疾病进行快速鉴别诊断。用Qiaquick 96 plate Kit对扩增的39个基因目的片段进行纯化,TE调配浓度至0．36μg/μL,于GMS417点样仪上按预选设计好的布阵方式点样,然后经紫外灯照射进行紫外交联等一系列处理。用Salmon进行非特异性杂交检测芯片点样的质量。大量抽提组织中MDV和细胞上清液中的SVDV的总RNA,随机引物反转录的同时采用随机荧光标记法,标记FMDV和SVDV。标记好的cDNA超声波随机打断后进行特异性杂交,以最佳光扫描强度进行扫描,Imagene软件扫描结果,对两者信号进行对比,结合各病毒相对应的坐标,可鉴别诊断出四种动物的水泡性疾病病毒。本方法不但快速、灵敏、准确性高,而且可实现对大批量货物的集成化检测,满足我国快速通关的要求。     

猪水泡病病毒VP1基因的克隆和表达

以猪水泡病病毒RNA为模板,应用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,扩增了849bp的VP1基因,通过T-A克隆技术,将VP1基因片段克隆至pMD18-T克隆载体质粒中,构建SVDV VP1基因克隆重组质粒,进行核苷酸序列分析.然后亚克隆插入pBAD/Thio TOPO表达载体,经测序鉴定,筛选获得VP1基因正向插入、有正确读码框的阳性克隆,成功构建了猪水泡病病毒VP1基因重组表达载体.经L-Arabinose诱导表达,可稳定、高效地表达VP1蛋白抗原.SDS-PAGE结果表明,以终浓度为0.002%的L-阿拉伯醛糖进行诱导,5h后表达可达到高峰,表达蛋白为融合蛋白,质量约47.13kDa,表达产量约占菌体总蛋白的16%.Western blotting检测表明,诱导的蛋白能与猪水泡病阳性血清发生特异性反应.融合蛋白中含有猪水泡病病毒VP1蛋白抗原,为应用该表达蛋白抗原制备SVD免疫血清学诊断试剂和新型疫苗构建奠定基础.     

猪水泡病病毒全基因组核苷酸序列的测定与分析

猪水泡病是由猪水泡病病毒(Swine vesicular disease virus,SVDV)引起的猪的一种急性传染病,在症状上与口蹄疫极其相似。该病流行性强,发病率高,能造成严重的公共卫生问题。国际兽医局将其列为动物A类传染病,我国农业部列为动物一类传染病。SVDV属于小RNA病毒科肠道病毒属,其核酸类型为单股正链RNA分子,无囊膜,病毒基因组含一个大的开放阅读框,编码一条由2185个氨基酸组成的多聚蛋白。     

猪水泡病病毒VPl基因抗原区的原核表达

利用RT-PCR和nested PCR(nPCR)技术扩增出猪水泡病病毒VPl基因的抗原区,将其克隆到表达载体pProEX-HTb中,获得重组质粒,经PCR、酶切和序列分析鉴定表明,目的基因插入的位置、大小和读码框均正确。将重组质粒导入BL21(DE3),经IPTG诱导表达后SDS-PAGE检测表明,重组菌能表达猪水泡病病毒VPl抗原区蛋白;Western blot检测表明,诱导表达的抗原区蛋白能与猪水泡病阳性血清发生特异性反应。     

猪水泡病病毒VP1基因的克隆和表达

以猪水泡病病毒RNA为模板,应用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,扩增了849bp的VP1基因,通过T-A克隆技术,将VP1基因片段克隆至pMD18-T克隆载体质粒中,构建SVDVVP1基因克隆重组质粒,进行核苷酸序列分析。然后亚克隆插入pBAD/ThioTOPO表达载体,经测序鉴定,筛选获得VP1基因正向插入、有正确读码框的阳性克隆,成功构建了猪水泡病病毒VP1基因重组表达载体。经L-Arabinose诱导表达,可稳定、高效地表达VP1蛋白抗原。SDS-PAGE结果表明,以终浓度为0.002%的L-阿拉伯醛糖进行诱导,5h后表达可达到高峰,表达蛋白为融合蛋白,质量约47.13kDa,表达产量约占菌体总蛋白的16%。Westernblotting检测表明,诱导的蛋白能与猪水泡病阳性血清发生特异性反应。融合蛋白中含有猪水泡病病毒VP1蛋白抗原,为应用该表达蛋白抗原制备SVD免疫血清学诊断试剂和新型疫苗构建奠定基础。     

猪水泡病病毒强致病性毒株主要保护性抗原蛋白基因cDNA的序列测定 …

从猪水泡病病毒细胞培养物的ＰＥＧ浓缩毒中提取病毒ＲＮＡ,经ＲＴ－ＰＣＲ和套式ＰＣＲ扩增病毒主要保护性抗原蛋白基因,将扩增产生１．６ｋｂ插入ｐＵＣ１８载体中,经亚克隆后用双脱氧链终止法测定其序列,与已发表的ＳＶＤＶ分离物该区序列作比较。     

猪博卡病毒的研究进展

猪博卡病毒是细小病毒科细小病毒亚科博卡病毒属的新成员,2009年发现于患仔猪断奶后多系统衰竭综合征的瑞典猪群中。目前,猪博卡病毒作为新发现的病原,已是世界各国科研人员的研究热点。本文结合已发表的文献,对猪博卡病毒的发现、分类、基因组结构与复制、流行病学、与疾病的相关性、培养与检测等方面进行了阐述,为广大科研人员对猪博卡病毒的研究提供一定的理论依据。     

猪水泡病病毒VP1基因抗原区的原核表达

利用RTPCR和nested PCR(nPCR)技术扩增出猪水泡病病毒VP1基因的抗原区，将其克隆到表达载体pProEXHTb中，获得重组质粒，经PCR、酶切和序列分析鉴定表明，目的基因插入的位置、大小和读码框均正确。将重组质粒导入BL21（DE3），经IPTG诱导表达后SDSPAGE检测表明，重组菌能表达猪水泡病病毒VP1抗原区蛋白；Western blot检测表明，诱导表达的抗原区蛋白能与猪水泡病阳性血清发生特异性反应。     

猪水泡病病毒强致病性毒株主要保护性抗原蛋白基因cDNA的序列测定与分析

从猪水泡病病毒（ＳＶＤＶ）细胞培养物的ＰＥＧ浓缩毒中提取病毒ＲＮＡ,经ＲＴ－ＰＣＲ和套式ＰＣＲ扩增病毒主要保护性抗原蛋白基因,将扩增产物１．６ｋｂ插入ｐＵＣ１８载体中,经亚克隆后用双脱氧链终止法测定其序列,与已发表的ＳＶＤＶ分离物该区序列作比较,核苷酸同源性为９６％－９７％,氨基酸同源性为９８％,参与构成ＳＶＤＶ中和性抗原位点的几个氨基酸残基均很保守;与已发表的柯萨奇Ｂ５病毒的对应序列比较,两者核苷酸序列同源性为７７％,而推导的氨基酸顺序同源性竞高达９２％。本文结果有助于ＳＶＤＶ的分子流行病学研究,并为其和柯萨奇Ｂ５病毒的相互关系提供参考数据,为ＳＶＤＶ新型疫苗研究提供了基础材料     

塞内卡病毒通过激活自噬降解FBXW7拮抗宿主的抗病毒应答

【背景】塞内卡病毒(seneca valley virus, SVV)可引起猪严重的水疱性疾病,但目前仍无商业化疫苗,解析其与宿主抗病毒分子的相互作用具有重要意义。【目的】探究E3泛素连接酶(F-box and WD repeat domain containing 7, FBXW7)在抗SVV感染中的作用及其机制。【方法】利用小干扰技术敲低PK-15细胞FBXW7,结合RT-qPCR、组织半数感染量(tissue culture infective dose 50%,TCID50)和Western blotting分析FBXW7对SVV在PK-15细胞中复制及细胞因子的影响。【结果】Western blotting结果显示,SVV感染能够抑制PK-15细胞中FBXW7蛋白表达水平;敲低FBXW7后促进SVV复制,同时炎性细胞因子IL-6、IFN-β、TNF-αmRNA水平均显著降低;进一步研究显示,敲低ATG5抑制自噬后抑制FBXW7蛋白降解,SVV复制水平下降。【结论】本研究发现FBXW7对SVV复制具有抑制作用,SVV通过激活自噬介导FBXW7降解,为研发抗病毒靶点提供了新策略。     

组织蛋白酶S抑制塞内卡病毒在IBRS-2细胞中的复制

[目的] 本研究旨在探究猪源组织蛋白酶S （cathepsin S,CTSS）对塞内卡病毒（Seneca Valley virus,SVV）复制的影响。[方法] SVV感染IBRS-2细胞,采用RT-qPCR在转录水平探究SVV感染对内源性CTSS表达的调控;采用ELISA测定SVV感染对CTSS酶活性的影响;通过Western blotting （WB）和RT-qPCR检测过表达CTSS对SVV复制及SVV诱导的抗病毒细胞因子的调控作用;合成针对CTSS的特异性siRNA,利用WB和RT-qPCR检测siRNA对CTSS的干扰效果以及CTSS被干扰后对SVV复制的影响。[结果] 结果表明SVV感染IBRS-2细胞能显著上调内源性CTSS表达并增强CTSS酶活性;过表达CTSS能显著抑制SVV在IBRS-2细胞中的复制,同时促进宿主抗病毒细胞因子的表达;siRNA-2947下调内源性CTSS表达进而促进SVV复制。[结论] CTSS通过增强宿主抗病毒细胞因子上调表达而抑制SVV复制,本研究为进一步深入探究宿主CTSS在抗SVV免疫应答中的作用及机制提供参考依据。     

球孢子菌病的流行病学、临床表现及诊治进展

球孢子菌病是球孢子菌感染人类所致的疾病。传统认为其流行区域仅限于美洲部分地区,但随着全球人口流动,非疫区的输入性病例报道日渐增多。一些新近研究也对其传统流行病学观念提出了挑战。此外,球孢子菌病的临床表现多样,从轻微的自限性呼吸道感染到严重的全身播散性感染均可发生,给诊断带来了很大的困难。因此,尽管中国并非传统概念上的球孢子菌病疫区,国内感染病工作者仍有必要对其现状有所了解。本文针对球孢子菌病的流行现状及诊疗进展进行综述。     

Asymptomatic dermatophyte scalp carriage: laboratory diagnosis,epidemiology and management

Asymptomatic carrier is defined as an individual who has dermatophyte-positive scalp culture without signs or symptoms of tinea capitis. The prevalence of asymptomatic carriage differs from region to region with a rate of 0.1–49%. Anthropophilic dermatophytes, Trichophyton tonsurans and Trichophyton violaceum, have been generally associated with high rates of asymptomatic carriage. Hence, the presence of dermatophytes on healthy scalp hairs of children may be a potential source of infection for schoolmates, playmates and/or households. Although it was also reported in adults, most carriage has been observed in children especially among those between 4 and 8 years of age, while male to female ratios vary between studies. It is still unclear, whether carriers should be treated with topical antifungal shampoos or oral antifungals or both, as some studies indicate that some untreated cases become culture-negative after 2–12 months. This review provides details on related dermatophyte fungi, laboratory diagnosis, epidemiology, ways of spreading as well as treatment and follow-up results of asymptomatic carriage. An integration into the school health programs is proposed, which will render the possible dealing of the subject in a comprehensive and reasonable manner.     

Expression and immunological analysis of capsid protein precursor of swine vesicular disease virus HK/70

VP1, a capsid protein of swine vesicular disease virus, was cloned from the SVDV HK/70 strain and inserted into retroviral vector pBABE puro, and expressed in PK15 cells by an retroviral expression system. The ability of the VP1 protein to induce an immune response was then evaluated in guinea pigs. Western blot and ELISA results indicated that the VP1 protein can be recognized by SVDV positive serum, Furthermore,anti-SVDV specific antibodies and lymphocyte proliferation were elicited and increased by VP1 protein after vaccination. These results encourage further work towards the development of a vaccine against SVDV infection.     

The epidemiology of fasciolosis in the inter-Andean valley of Cajamarca, Peru

Fasciolosis is recognised as a major problem in dairy cattle in parts of Peru. A longitudinal study of dairy cattle in Cajamarca, Peru was used to determine the annual pattern of infection with Fasciola hepatica. After a gradual increase from January, peak egg production occurred in August/September and then dropped rapidly. Indirect indicators of infection, eosinophil counts and serum liver-enzyme activities, indicated that the major period of new infection in cattle occurred from December to May each year. Examination of snails demonstrated that, although there was no clear annual cycle in snail abundance, the majority of snails infected with cercariae were found between January and March. Climatological data indicated that there was sufficient moisture for development of the parasite during a limited period each year, coinciding with the period of maximum abundance of cercaria-infected snails, but that irrigation could substantially alter the amount of water available. Infections in tracer-calves decreased from December to September, with little or no infection occurring between June and August, but suggesting that there could be significant infection prior to December. Thus a defined annual cycle of infection was observed, where cattle acquired infection from December to May and this infection matured to produce peak egg counts in August/September which were then available to infect the intermediate host for the next cycle of infection.     

猪流感病毒在世界范围内的流行情况及公共卫生意义

猪流感病毒(Swine influenza virus, SIV)是引起猪的急性呼吸道疾病的重要原发病原之一, 常常与其他病原体混合感染造成更严重的损害。目前, 猪流感(Swine influenza, SI)已遍布美洲、亚洲、欧洲和非洲, 是规模化养猪场普遍存在且难以根除的群发性疾病。猪在流感病毒的种间传播和遗传进化中起着重要的作用, 猪可被禽流感病毒和人流感病毒感染, 因此, 猪被认为是人、禽和/或猪流感病毒通过基因重排产生新的亚型流感病毒的“混合器”。SIV不仅危害猪群, 而且同时具有感染人和禽的潜力。目前世界范围内猪群中流行的SIV亚型主要有3种：H1N1、H3N2和H1N2, 其中包括古典H1N1、类禽H1N1、类人H3N2、基因重排的H3N2和多基因型的H1N2亚型。研究表明, 禽流感病毒、人H3N2亚型病毒和古典猪H1N1亚型病毒在我国猪群中共存, 为产生含有禽流感病毒基因片段的重排病毒创造了条件, 这将对养猪业以及人类公共卫生都具有潜在的威胁。