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台风灾害下海岸带城市社会-生态系统脆弱性评估——大数据视角 总被引:2,自引:0,他引:2
2016年莫兰蒂台风对厦门城市社会-生态系统造成重创,该系统在灾害影响下的脆弱性成为亟待研究的重要问题。基于新浪微博平台进行大数据挖掘,结合统计年鉴及空间基础数据,建立台风灾害影响下基于暴露-敏感-应对-恢复力体系的海岸带城市社会-生态系统脆弱性指标体系,评估灾前灾后台风对厦门不同地区的影响;同时根据微博大数据的定位信息,对不同受灾信息进行灾情跟踪及分析,结果表明,在本次台风灾害中思明、湖里区表现出的脆弱性较低,而海沧、集美区表现出的脆弱性较高,主要是由于思明、湖里区的应对能力明显高于其他各区,从大数据显示的恢复情况来看,除海沧区外,其他三区在电力方面的恢复速度都较为迅速。研究成果能够为台风灾害背景下的城市脆弱性评价提供新的方法与技术,为灾前防治、灾后恢复提供决策参考。 相似文献
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随着高通量测序技术的迅速发展和食品微生物研究的逐步深入,产生了大量的数据和知识,且以不同的数据格式分布在各种数据库中。为了更好地支持食品微生物的相关研究,从各种分布式、异构的数据和知识中,进行数据提取与转换,并形成一个整合的数据平台显得尤为重要。FoodMicrobes数据库利用语义网技术,建立了一个食品微生物的整合型数据平台。该平台从各种开放的公共数据库,提取了与食品微生物相关的基因、基因组、基因功能、蛋白质序列与结构、代谢途径、文献、专利等信息,利用RDF的方法,对数据进行转换,并建立了数据之间的关联,实现了数据整合,是目前在食品微生物领域以语义网方式建立的第一个数据库。在该平台中,实现了将食品微生物的物种、菌株层面的宏观信息与基因组、蛋白质、代谢与功能等微观层面信息的贯通,并通过友好的数据检索界面,为用户进行食品微生物研究提供了重要的工具。 相似文献
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基因芯片数据分析与处理 总被引:7,自引:1,他引:6
基因芯片技术在基因表达分析等应用过程中产生大量的数据,如何处理和分析这些数据并从中提取出有价值的生物学信息是一个极为重要的问题.其过程包括原始数据的获取及处理、标准化数据的统计学分析、以及数据的存储和交流等. 相似文献
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MATLAB 7.X生物信息工具箱为广大用户提供了一个用于系统发生分析的综合环境,它能利用数据库资源,方便获取DNA/蛋白质序列数据,所有操作简单高效,结果可视化程度高。在工具箱提供的开放环境里,用户还可以根据自己的目标来设计和利用分析工具。本文介绍MATLAB7.X生物信息工具箱在构建系统发生树方面的应用,以人科线粒体基因序列作为分子标记构建一株人科系统发生树为例,说明在MATLAB环境下对系统发生树的分析和处理。 相似文献
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基于Barista软件的高分辨率遥感影像中建筑物3D信息的提取 总被引:2,自引:2,他引:2
城市建筑物空间信息的获取对城市规划、环境保护等社会各行业越来越重要,高分辨率商业卫星的出现为提取建筑物3D信息提供了可能性.本文基于Barista软件,利用QuickBird数据提取了建筑物的3D信息并进行了精度验证.结果表明:基于Barista软件从高分辨率卫星影像中提取建筑物3D信息,具有专业水平要求低、普适性强、操作简单、精度高等优点;当数字高程模型(DEM)和传感器定位模型精度较高、影像偏天底角较理想时,3D信息提取的水平定位精度和高度测量精度可达到1个像素水平. 相似文献
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结合现代植物学、DNA测序与信息等关键技术而产生的新一代智能植物志(iFlora),其研发中最首要和迫切的任务之一就是如何将前沿、准确和完善的植物数据信息进行特色整合及智能化处理,为用户提供一个客观而科学的,具理论和实际应用为一体的植物学知识共享平台,并有效地为国民经济发展提供有价值的植物资源信息渠道。本文简要介绍了与传统植物志和目前常用的电子植物志数据库相区别的iFlora数据信息的分级内容、特点和功能,并强调了作为iFlora的核心数据信息,即用于物种鉴定的植物DNA条形码、关键形态学分类特征、植物图像等识别数据,以及分子系统发育数据等。以杜鹃花科(Ericaceae)白珠树属(Gaultheria)和其属下红粉白珠(G.hookeri)为例,介绍了iFlora采用的三类数据(核心数据、基础数据和拓展数据)构成的三级信息及其功能,同时探讨了信息整合时可能遇到的问题。 相似文献
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《武汉生物工程学院学报》2019,(1)
微博具有传播内容丰富、传播便捷等特点。微博创新了大学生的交往方式、促进了大学生积极参与社会管理,但对当代大学生也有一定消极影响。本文探讨如何引导大学生正确认识和利用微博,并充分发挥微博优势,创建网络思想政治教育的新阵地,推动大学生的自我完善。 相似文献
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正交试验设计是天然产物研究中重要的方法之一,本文介绍了利用Microsoft EXCEL的内部统计函数编制天然产物提取工艺统计分析程序,并以实例说明了该程序的使用方法和应用技巧。结果表明,用户只需输入试验的原始数据,即可快速、准确地进行直观分析和方差分析,并可根据极差值得出最佳工艺条件,所得分析结果与专业统计分析软件DPS对数据进行正交分析相比,二者计算结果基本一致,且该方法不但快捷方便,操作简单,而且结果准确可靠,可大大提高天然产物提取工艺的效率。 相似文献
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定量地层学以生物地层学原理为核心,将地层学信息定量化,运用数学模型进行地层对比,作为传统地层学对比的重要补充。传统的生物地层学根据经验选取标准化石来建立生物地层序列,但同时也丢失了大量的化石信息。定量地层学则能够利用所有的化石信息,在传统生物地层学的基础上得到更高分辨率的地层对比结果。现阶段定量地层对比常用的方法主要有图形对比法、约束最优化法和单元组合法三种,但对于这三种方法各自适应的数据情况方面,目前成果较少。本文对这三种方法的原理进行了简要的介绍和分析,并建立数据模型,从标准化石的可对比性、数据集的物种总数、剖面间共有物种和单延限分子的比例四个方面对三种方法的适用条件进行了讨论。其中图形对比法更适用于单延限分子较少、标准化石可对比性强的数据集。单元组合法对数据集中物种间相互关系的复杂程度较为敏感,共有物种较多的数据集有更好的对比结果,但数据集中物种总数的增加会对其产生一定的负面影响,需要依靠进一步的人工调整。约束最优化法则对数据集各方面的优化均有响应,对物种总数较大的数据集有较好的对比结果,且剖面间共有物种占比越大,对比结果越理想。 相似文献
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高通量微阵列杂交技术和测序技术的快速发展,产生了大量的基因数据,生物信息迅速膨胀成为数据的海洋。为适应这种高通量基因表达数据的不断增长和人们共享数据的需要,各种数据库应用而生,其中,NCBI(national center for biotechnology information)的基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)是世界上最大的储存高通量分子丰度数据的公共数据库,用户可以提交、储存和检索多种形式的数据并免费使用。迄今为止,GEO已收录了300000个样本的数据,涉及16亿个基因表达丰度数据,涵盖500多种生物体,广泛覆盖各种生物学内容。GEO数据库操作简单,数据全面,免费共享的优势为后期数据挖掘和信息推广提供了良好的平台。文章概述了GEO数据库的结构、数据的提交、检索和其在分子生物学领域中的应用前景。登陆GEO数据库的网址为:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo。 相似文献
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高通量技术的广泛应用使得各类组学数据的产出速度越来越快,由此产生的海量数据蕴藏着大量的基因组变异和相关功能信息。如何对这些数据进行深度整合和利用将会是一个长期而艰巨的任务,这需要具备高效的数据存储、分析和挖掘的能力。在过去几年中,本课题组通过与所内外课题组的合作,在多个植物的基因组的组装、注释、比较基因组和群体基因组分析等方面进行了探索,同时也将大量的水稻种质信息和组学数据进行了整合,存储于结构化数据库中并开发了一些相应的网络查询展示和数据挖掘工具。本文对相关的研究成果及其进展进行了概括性介绍,并展望了下一步的目标:构建一个用于支持作物功能基因组学和分子设计育种研究的整合组学知识库。 相似文献
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《生物多样性》2015,(4)
核苷酸序列是生物体遗传信息的载体,是现代生物学和生态学的基础数据。随着测序技术的进步,大量核苷酸序列被提取并存储在公共数据平台中,其中Gen Bank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)是目前最大的核苷酸序列数据平台之一。截至2015年2月,该平台收录核苷酸序列总数已超过1.8亿条、覆盖全球超过30万个物种。但如何从如此海量的数据中准确、快速查找并下载所需数据已成为限制基因数据广泛使用的障碍之一。为此,我们开发了一款可高效、准确下载Gen Bank数据的生物信息学软件NCBIminer。NCBIminer可根据用户提供的核苷酸序列名称、数据类型、一或多条初始化参考序列,查找并下载用户指定的多个物种或类群的特定基因序列数据。该软件下载地址为https://github.com/greengirl/NCBIminer/releases/,可在Windows、Linux和MAC操作系统下免费使用;同时,其操作简单,用户无需生物信息学背景。为方便该软件的使用,本文将介绍该软件的工作流程与算法、安装及使用过程中的参数设置等。 相似文献