MITF在葡萄膜黑色素瘤细胞中的功能研究

该研究首先通过qRT-PCR和Western blot发现,MITF在人葡萄膜黑色素瘤细胞中的RNA水平及蛋白水平都显著高于葡萄膜黑色素细胞中的水平。通过RNA干扰技术下调葡萄膜黑色素瘤细胞中的MITF的表达,采用MTS实验、细胞平板克隆实验发现,MITF下调后葡萄膜黑色素瘤细胞的增殖能力被显著抑制。利用流式细胞术及Hoechst染色、Caspase 3/7活性检测发现其细胞周期受到阻滞,且凋亡水平增加。通过RTCA xCELLigence DP检测系统定量检测发现,si-MITF能抑制葡萄膜黑色素瘤细胞的迁移及侵袭能力。Western blot检测发现,MITF下调后葡萄膜黑色素瘤细胞中细胞周期相关蛋白p-Rb(retinoblastoma)、CDK2(cyclin-dependent kinase 2)、CDK6、细胞周期蛋白D2(Cyclin D2)以及CyclinE2的表达水平下调,与增殖及迁移侵袭密切相关的FAK(focal adhesion kinase)及ERK(extracellular signal-regulated protein kinases)蛋白的磷酸化水平降低。该研究表明,在葡萄膜黑色素瘤细胞中下调MITF的表达后,细胞内部分周期相关蛋白、细胞增殖及迁移侵袭相关蛋白的表达均有下调,导致细胞发生G_1期阻滞,使细胞的增殖、迁移及侵袭能力受到抑制,同时也促使细胞发生凋亡。     

溶瘤腺病毒靶向杀灭葡萄膜黑色素瘤的实验研究

葡萄膜黑色素瘤是成人最严重的原发性恶性肿瘤之一.传统的治疗方法,包括手术、放射治疗和化学治疗效果都不是很理想.溶瘤腺病毒H101,能够特异性地在p53突变的肿瘤细胞中复制并杀伤肿瘤细胞,同时对正常细胞影响较少,且已由中国国家食品药品监督管理总局批准上市.为了研究H101对葡萄膜黑色素瘤的治疗效果,通过体外感染葡萄膜黑色素瘤细胞,发现H101能够显著抑制葡萄膜黑色素瘤细胞的增殖并促进细胞凋亡,抑制细胞周期,而对正常的ARPE-19细胞没有影响.在体内实验中,建立了SP6.5细胞的荷瘤小鼠模型,在H101治疗后抑制了肿瘤的生长,延长了动物寿命.上述结果表明,溶瘤腺病毒H101治疗葡萄膜黑色素瘤是一种可行的方法.     

环状RNA与癌症关系的研究进展

随着科学技术的发展,环状RNA越来越受到人们的关注。由于其特殊的环状结构,环状RNA比线性RNA更加稳定,普遍存在于真核细胞中,具有一定的调控功能。研究表明,环状RNA与多种肿瘤的发生、发展及预后相关,可能成为一种新兴的肿瘤生物标志物。简要阐述了环状RNA的特点、功能及其与多种肿瘤间的关系。     

LncRNA-177922靶向MAPK15调节B16-F10黑色素瘤细胞黑色素生成、增殖、迁移和自噬

黑色素瘤是一种预后较差的侵袭性癌症.了解黑色素瘤的分子机制和诊断标志物对黑色素瘤的防治极为重要.LncRNAs在肿瘤的发生发展中发挥重要作用.与正常黑色素细胞相比,LncRNA-177922在B16-F10黑色素瘤中高表达.丝裂源活化蛋白激酶15 (mitogen-activated protein kinase 15...     

黑色素瘤发生发展中的表观遗传学调控

人恶性黑色素瘤(malignant melanoma)是近年来高发病率和高死亡率的肿瘤之一.目前尚缺乏有效的治疗方法.而表观遗传如DNA甲基化(DNA methylation)、组蛋白修饰(histonemodification)、染色质重塑(chromatin remodeling)及RNA干扰(RNA interference,RNAi)等改变在人黑色素瘤的发生、发展和转移中有重要作用.阐明黑色素瘤发生发展的表观遗传学机制已引起了学者的普遍关注.本文综述了人类黑色素瘤发生发展中所特异的表观遗传改变:CpG岛的异常甲基化修饰、组蛋白甲基化和乙酰化修饰、染色质重塑以及microRNA在黑色素瘤发生和转移中的作用,并对应用表观遗传修饰治疗人类黑色素瘤进行了探讨.     

两型肾癌的共同标志物筛选及机制研究

目的 肾细胞癌是一种源发于肾小管上皮系统的恶性肿瘤。在已有肾癌相关mi RNA标志物的研究中,大都忽略了不同亚型肾癌之间样本数据量差距对筛选结果的影响,这会导致mi RNA生物标志物对不同亚型肾癌患者的诊断能力存在较大差异,进而发生漏诊误诊。因此本课题考虑了两种亚型肾癌共同标志物进行研究。方法 对透明肾细胞癌（KIRC）和乳头状肾细胞癌（KIRP）的表达谱数据分别进行统计学和两种机器学习方法筛选并对结果取交集获得两型肾癌共同mi RNA标志物。接着,用ROC方法验证了这些标志物的诊断能力。用机器学习方法对外部数据集KICH进行了验证,进一步证明这些标志物的诊断能力以及避免过拟合。还用已有实验文献验证了这些标志物的合理性。用生物信息学方法对mi RNA标志物分子机制进行研究。结果 获得了6个两型肾癌共同mi RNA标志物（mi R-21、mir-210、mir-185、mir-188、mir-362、mir-199a-2）,其中有4个已有实验报道和肾癌密切相关,而mir-188和mir-199a-2尚未见文献报道其与肾癌相关,可能是新的肾癌相关mi RNA标志物。之后对6个两型肾癌共同m...     

非编码RNA在肿瘤液体活检中的研究进展

液体活检是一种基于分析体液样本中的生物标志物来诊断疾病、监测疾病进展和评估疗效的非侵入性的新型微创诊断技术。液体活检主要包括探查和检测循环肿瘤细胞、ctDNA、非编码RNAs和细胞外囊泡等。非编码RNA之前被认为是一类无功能的RNA,但近年来研究表明它们在肿瘤的发病机制中扮演着重要的角色。它们构成了基因调控的一个重要层面,其表达水平在多种癌种中呈现失调势态,这提示了它们作为肿瘤生物学标志物的临床应用潜力。飞速发展的高通量测序技术使得在泛癌领域建立非编码RNA表达谱的分子表征成为可能。该文系统阐述了非编码RNA作为非侵入性肿瘤标志物的研究进展,评估了其作为肿瘤生物标志物的适用性,同时总结了近期的检测技术突破对肿瘤分子标志物发展的影响。     

microRNA在乳腺癌细胞中的功能研究及其作为乳腺癌生物标志物的评估

乳腺癌是一种由于细胞增殖失控而引发的严重危及人类尤其是女性生命的疾病。目前,寻找稳定有效、非侵入性的生物标志物来准确诊断乳腺癌,以及寻求新的治疗乳腺癌的方法显得至关重要。microRNA(miRNA)是一种内源性非编码小RNA,参与细胞内的多种生理过程,部分miRNA可以促进或抑制肿瘤的发生,具有诊断和治疗癌症的潜在价值。本文梳理了在乳腺癌中发挥作用的一些miRNA,并简述了这些miRNA如何参与乳腺癌的发生及发展,评估了其作为乳腺癌生物标志物的可靠性。     

非编码RNA作为疾病诊断标志物

非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是不具备编码蛋白质功能的基因组转录产物。研究逐步发现,ncRNA的表达失调与人类疾病的发生密切相关。由于ncRNA表达失调具有组织特异性,同时,在人类组织和体液中可被便捷、稳定地检测,许多研究开始关注ncRNA作为临床疾病诊断标志物的应用潜能。现主要围绕微小分子RNA(miRNA)和长非编码RNA(lncRNA)在恶性肿瘤、自身免疫性疾病及神经系统疾病诊断中的作用进行综述;同时,也从ncRNA失调与疾病发生的相互关系的角度展示了ncRNA相较其他生物分子作为疾病诊断标志物的优势。     

环状RNA在胃癌与结直肠癌中的功能和作为临床标志物的潜力

环状RNA（circRNA）是一种广泛存在于生物体内的新型内源性RNA。CircRNA由RNA前体可变剪接产生,比线性RNA有更好的稳定性,是最近几年RNA领域的明星分子。CircRNA来源于内含子或外显子,可充当miRNA海绵或者结合蛋白质来参与基因表达调控,甚至已发现有circRNA能编码蛋白质。越来越多的研究表明,circRNA在肿瘤（如：食管癌、肝癌、胃癌、结直肠癌和膀胱癌等）的发生发展中发挥了重要作用。近年来,circRNA在胃癌、结直肠癌的研究逐渐增加,circRNA可能成为新的生物学标志物发挥诊断和预后的作用。本文将主要介绍circRNA 在胃癌及结直肠癌的功能和作为临床标志物的研究进展。     

环状RNA及其在结直肠癌中的相关研究

环状RNA是长链非编码RNA的一种特殊类型,是首尾共价闭合环化而形成的环状RNA分子,在生理和疾病过程中具有特殊的生物学功能。环状RNA与肿瘤的发生发展关系密切,其高度稳定性及特异性使其有希望成为恶性肿瘤潜在的生物标志物和新的治疗靶点。目前仅有少量关于环状RNA在结直肠癌中的生物学功能及其相关调控机制的研究报道。本文拟从环状RNA的形成、生物学特征、生物学功能以及其结直肠癌中的相关研究等方面进行简要综述。     

miR-338-5P在人类恶性肿瘤等疾病中的作用和应用

微小RNA (microRNA, miRNA)是一类由19～24个核苷酸构成的内源性的非编码单链RNA,通过与靶基因完全或不完全结合降解mRNA或抑制mRNA的翻译,在体内起到转录后调控作用,参与多种生理和病理过程。新近报道发现,miR-338-5P在黑色素瘤、消化系统肿瘤、肺癌等各种类型的癌症中异常表达,其通过结合一系列的靶基因来调控细胞增殖、转移、侵袭和凋亡,在不同肿瘤中发挥抑癌或促癌的不同作用,并可能成为癌症诊断的生物标志物和治疗靶点。在其他炎性相关疾病中,比如病理性心肌肥厚、类风湿性关节炎等,也发现mi R-338-5P可以通过靶向不同基因,参与疾病的发生发展。现综述miR-338-5P在肿瘤、肿瘤放化疗以及其他炎性相关疾病中的作用和其在疾病诊断、预后判断等方面的应用,为肿瘤等疾病相关标志物以及更有效的治疗靶点的开发提供新思路。     

循环长链非编码RNA作为生物标志物在肿瘤分子诊断中的应用

长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)被发现广泛参与基因表达、表观遗传调控和X染色体失活等重要生命过程,还与肿瘤发生和发展密切相关。lncRNA可能以微泡、外泌体或蛋白质复合物形式进入人体循环系统中,形成循环lncRNA稳定而广泛存在于血液、尿液等体液中。文中简要回顾了近来关于循环lncRNA的来源,以及作为生物标志物的检测方法,着重总结分析了循环lncRNA作为潜在肿瘤生物标志物在肺癌、乳腺癌、胃癌、肝癌、结直肠癌和前列腺癌等常见恶性肿瘤中的早期诊断价值。与传统生物标志物相比,循环lncRNA具有作为新型生物标志物的独特优势和临床应用价值。     

加权ceRNA网络筛选乳腺癌生物标志物

竞争性内源RNA (competing endogenous RNA, ceRNA)作为生物标志物和潜在的治疗靶点,在探究肿瘤的发病机制中,表现出了巨大的研究价值和临床应用前景。本文对乳腺癌ceRNA网络进行了系统的分析,首先通过差异分析获得差异miRNA、mRNA和lncRNA,其次利用网络的边聚集系数(edge clustering coefficient,ECC)和皮尔逊相关系数(Pearson correlation coefficient, PCC)计算ceRNA网络节点的权重,最后采用基于随机森林的逐步特征选择(stepwise feature selection based on random forest, SFS-RF)方法筛选出一组可作为乳腺癌生物标志物的RNA——LINC00466、CHL1-AS2和LINC00337,并利用GEO数据库验证了该组RNA对乳腺癌样本的识别情况。此外,通过GO和KEGG通路富集分析探索了该组RNA在乳腺癌中的生物学功能。结果显示:这些RNA作为生物标志物,在识别乳腺癌样本方面具有高精度和高效率等特性,在乳腺肿瘤细胞的增殖及遗传物质的合成等过程中具有重要生物学意义。     

环状RNA作为生物标志物的研究进展

环状RNA(circRNA)是一种共价闭合环状结构的非编码RNA,与线性RNA有显著差别。circRNA通过外显子或内含子的反向剪接进而环化形成完整的环形结构。近年研究已证实circRNA在基因的表达调控和肿瘤等疾病的发生和发展中发挥着重要作用,提示circRNA可能具有巨大的临床诊疗价值。就circRNA的形成、特征、功能,特别是其作为肿瘤生物标志物的研究进展做简要综述。     

tRNA来源的非编码小RNA的生成调控及功能研究前沿进展

转运RNA衍生小RNA(tRNA-derived small RNAs, tsRNAs)是一类来源于tRNAs的新型非编码小RNA,广泛存在于动物、植物的组织细胞以及体液中,在胚胎发育、细胞命运决定、机体免疫调控、获得性遗传以及包括癌症在内的多种人类疾病的发生发展中发挥着不可或缺的作用。然而,由于tsRNAs含有从其tRNAs前体继承而来的多种RNA修饰,这些RNA修饰一方面增加了tsRNAs信息编码的深度,丰富了tsRNAs在细胞内功能和作用机制的多样性,另一方面也增加了其功能研究的复杂性。近年来, tsRNAs的作用机制成为该领域的研究焦点和关键点。该文系统性地综述了tsRNAs的最新研究进展,包括其生成途径、检测方法、作用机制以及生物学功能的多样性,并探讨了tsRNAs作为生物标志物在临床疾病诊断中的应用前景。     

IGF2BP2在癌症中的研究进展

胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(insulin growth factor 2 mRNA binding protein 2,IGF2BP2)是一种调节多种生物过程的RNA结合蛋白,最初作为2型糖尿病的相关基因被发现,随着深入的研究,人们发现它在多种肿瘤的发生发展中也起着重要的生物学作用。IGF2BP2可以作为一种m6A阅读器,通过与不同的非编码RNA(如miRNAs、lncRNAs和circRNAs)相互作用参与癌症的发生发展。本次综述总结了IGF2BP2在多种癌症中的生物学作用、机制以及预后潜力,以期为癌症的诊断及预后提供新的标志物,同时为IGF2BP2作为癌症精准化治疗靶点的相关研究提供新的思路。     

冠心病相关循环miRNA

冠心病诊断中最主要的挑战就是从常规的血液样本中鉴定出可靠的临床生物标志物.循环miRNA是一种可以稳定存在于体液中的小分子RNA,具有较高的组织、疾病特异性及敏感性,具有作为新的冠心病非侵入性生物标志物的潜力.通过综述血液样本（全血、血浆、血清、外周血单核细胞（PBMC）、内皮祖细胞（EPC）及血小板）中冠心病相关循环miRNA,及探讨循环miRNA研究中存在的一些问题,为未来筛选出真正具有临床应用价值的循环miRNA生物标志物奠定基础.     

环状RNA的生物学功能及其在肿瘤发生中的作用

近年来,随着RNA研究技术的进步,研究者们在多种生物中发现了数量众多的环状RNA,且发现它们具有重要的生物学功能。环状RNA来源于内含子或外显子,可以充当微小RNA海绵,还能与蛋白质相结合,从而参与基因表达调控并影响蛋白质的功能,此外,个别环状RNA甚至能编码蛋白质。更重要的是,环状RNA在肿瘤(如:胃癌、肝癌、结直肠癌、乳腺癌、宫颈癌和卵巢癌等)的发生和发展过程中起着重要的调控作用。因此,环状RNA有希望成为肿瘤诊断的标志物和治疗的新靶点。     

血清miRNAs作为食管鳞癌新的生物标志物

食管鳞癌是我国最常见的恶性肿瘤之一。由于缺乏有效的早期诊断方法,大多数食管鳞癌患者在确诊时已到中晚期并预后不良。MicroRNAs(miRNAs)是一类可通过抑制其特异性靶基因表达从而调控食管鳞癌发生发展的非编码内源性小RNA。相比于传统的生物标志物(例如mRNA和蛋白质),miRNAs更加稳定并易于筛选及精确地定量分析,从而成为理想的新一代癌症早期诊断和预后评估的生物标志物。近来的研究结果显示,食管鳞癌病人血清中的一些miRNAs表达水平的变化与病情诊断及预后的结果显著相关。文章综述了食管鳞癌病人血清中miRNAs的变化规律,讨论了检测这些miRNAs的表达水平变化作为一种新的方法应用于食管鳞癌的早期诊断和预后评估的可能性。值得注意的是,不同的血清miRNAs的检测方法所产生的结果是不完全一致的,文章还对这些差异产生的原因进行了讨论。