小鼠肝脏蛋白质组数据门户

肝脏是哺乳动物体内的代谢中枢,系统性研究肝脏蛋白质组在不同的生理和病理状态下的表达情况有助于我们理解肝脏的功能机理。随着高精度质谱技术的不断发展,众多小鼠肝脏生理病理研究产生了大量蛋白质组学数据。文中系统性整理了834例小鼠肝脏的蛋白质组学实验,建立了小鼠肝脏蛋白质组数据门户(Mouse Liver Portal,http://mouseliver.com),该门户中包含了肝脏在不同生理和病理状态下的蛋白质组学数据,如不同性别、年龄、昼夜节律、细胞类型和不同时间阶段的部分肝切除、非酒精性脂肪肝等状态。该门户能够提供肝脏在不同状态下蛋白的表达变化情况、差异显著的蛋白质和它们参与的生物学过程以及潜在的信号转导和调控网络。作为目前最全面的小鼠肝脏蛋白质组数据门户,该数据库能够给肝脏生物学研究提供重要的资源和参考。     

军事医学科学院蛋白质组学研究进展

蛋白质组学是后基因组时代生命科学研究的热点和前沿领域.军事医学科学院是国内最早开展蛋白质组研究的单位之一,其蛋白质组学研究的发展不仅对中国蛋白质组研究起到重要的引领作用,也对国际蛋白质组学的发展做出了重要贡献.本文将重点介绍军事医学科学院的科学家在国际人类肝脏蛋白质组计划以及疾病蛋白质组、病原微生物蛋白质组等领域的研究成果.     

2014蛋白质组学专刊序言

蛋白质组学研究是后基因组学时代最重要的功能基因组学研究之一,与医学生物学、化学、物理学、信息学以及现代技术等关系十分密切。为了检阅近年来国内外蛋白质组学某些重要研究进展,探索其可能的应用范围,讨论其存在的问题,展望其发展前景,特组织出版"蛋白质组学专刊"。本期专刊包括综述和研究论文两部分,内容主要涉及不同物种(包括人类、哺乳类动物、原核生物、放线菌等)蛋白质组学研究、蛋白质组学重要方法学与技术研究(包括串联质谱分析、尿蛋白膜保存法、定量蛋白质组学分折、meta分析等)和蛋白质组功能与应用研究(包括蜘蛛毒素蛋白质组、磷酸化蛋白质组、卵母细胞和早期胚胎蛋白质组、肝脏纤维化蛋白质组、分枝杆菌耐药的蛋白质组等)。     

钉螺肝脏表达蛋白质鉴定结果分析

钉螺是日本血吸虫的唯一中间寄主, 消灭钉螺是防治血吸虫病的关键。 开展钉螺蛋白质组学的研究, 对了解湖北钉螺的生长发育、营养和代谢状况具有重要的意义, 也为有效控制和杀灭钉螺提供参考依据。 国内有灭螺药物对钉螺肝脏超微结构及过氧化物酶同工酶影响的研究1, 但国内外尚无湖北钉螺肝脏蛋白质组学研究的报道。本研究用蛋白质组学方法初步分析了钉螺肝脏蛋白质的表达, 以建立大钉螺肝脏蛋白质组数据库, 为人们在蛋白质水平认识钉螺肝脏提供有利的参考。       

大连化物所磷酸化蛋白质组分析技术获得新进展

中科院大连化学物理研究所邹汉法研究员带领的研究团队(1809组)与荷兰蛋白质组学研究中心主任Heck教授领导的团队合作,对该研究组发展的用于磷酸肽富集的新一代固定化金属离子亲和色谱技术进行了系统评价,相关结果发表在Nature     

Nature:靶向攻击p53和c-MYC可选择性清除白血病干细胞

正在一项新的研究中,来自英国格拉斯哥大学、曼彻斯特大学和澳大利亚墨尔本大学的一个跨学科研究团队揭示出慢性粒细胞白血病(chronicmyeloidleukaemia,CML)的阿喀琉斯之踵(即致命弱点),并且发现在小鼠体内成功地靶向攻击这种弱点和根除这种疾病的药物。相关研究结果发表在Nature期刊上。该团队在6年多的时间里一直在开展这项研究。这项研究分析了慢性粒细胞白血病干细胞(CML干细胞,是一种肿瘤干细胞)和正常的造血干细胞,发现两种蛋白是CML干细胞存活的关键。研究人员     

一种结合生物医学知识的蛋白质组非标记定量分析方法及其应用

基于质谱的非标记定量方法能够对复杂蛋白质组进行规模化分析,同时,在定量分析的基础上理解和解释蛋白质组的功能和相互作用关系更有意义.这需要建立一种有效的兼容定量和定性分析结果的方法.针对这一需求,本文首先借鉴了NSAF(normalized spectral abundance factor)算法采用肽段计数对蛋白质组数据进行定量,进一步结合共享肽对该方法进行优化.以此为基础,通过g:Profiler获取海量蛋白质组的功能注释信息,在定量分析的过程中,同步实现了对蛋白质组数据的功能性分析.本文选择来自人心脏、小鼠心脏、小鼠肝脏的三组线粒体蛋白质组数据对该方法进行验证,按照功能性分析将三组数据划分为若干功能组或信号通路,并进行相关性、功能聚类以及电子传递链分析.结果表明,结合共享肽的优化算法克服了对低丰度蛋白质的错误估计,提高了非标记定量的准确性.同时,结合生物医学知识的分析方法解释了蛋白质组的功能和相互作用关系,为差异比较蛋白质组学、疾病蛋白质组学以及功能蛋白质组学等组学研究提供了新的方法.     

中国染色体蛋白质组计划研究进展

人类染色体蛋白质组计划(Chromosome-Centric Human Proteome Project,C-HPP)是由人类蛋白质组组织(Human Proteome Organization,HUPO)于2010年9月在悉尼召开的第九届国际蛋白质组学大会上正式提出的大型国际合作计划。与生理-病理驱动的人类蛋白质组计划(Biology/Disease-driven HPP,B/D-HPP)相同,C-HPP是人类蛋白质组计划(Human Proteome Project,HPP)的主要工作,将由中国、美国、澳大利亚、瑞士、意大利等17个国家的25个研究团队共同合作,旨在10年内(2012.09—2022.09)完成人类24条染色体和线粒体上蛋白质编码基因产物本身及其修饰产物的检测、验证和确认,注销可能过度注释的编码基因,绘制基因图谱并实现人类基因组的重注释。国内军事医学科学院的贺福初院士和徐平教授、复旦大学的杨芃原教授、华大基因的刘斯奇教授和暨南大学的何庆瑜教授,以及台湾地区的陈玉如教授分别领衔承担了人类第1号、8号、20号和第4号染色体上蛋白质编码基因的研究任务。综述了我国承担的C-HPP工作的策略和进展,并提出展望。     

第十届中国蛋白质组学大会成功召开

深秋的广州,依然花团锦簇,气候怡人。2018年11月15至17日,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办,暨南大学生命科学技术学院、中国人民解放军军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、国家蛋白质科学中心、蛋白质组学国家重点实验室、北京蛋白质组研究中心共同承办的第十届中国蛋白质组学大会在广州市白云国际会议中心成功召开。本次大会由军事科学院副院长贺福初院士和复旦大学杨芃原教授担任名誉主席,CNHUPO理事长、国家蛋白质科学中心(北京)秦钧主任和CNHUPO副理事长、暨南大学生命科学技术学院何庆瑜院长担任大会共同主席。     

硒与金属硫蛋白及对小鼠肝损伤的防护作用研究

应用蛋白质芯片和RT-PCR技术研究硒对小鼠肝脏金属硫蛋白（Metallothionein, MT）的诱导表达;以蛋白质芯片技术为主要实验手段研究CCl4诱导的小鼠肝脏损伤后血清及肝脏蛋白质图谱变化,寻找小鼠血清及肝脏组织损伤标志物,同时观察有机硒(麦硒康,Organ-Se)对损伤的防护作用,结果表明与对照组相比给予有机硒后的小鼠肝脏MT表达明显;比较肝损伤组及用药组（Organ-Se）组的血清及组织蛋白质表达图谱变化,发现血清中存在3个具有统计学意义的标志物：5062.5Da 、5566.5Da、6358.5Da;肝脏组织中有4个具有统计学意义的标志物：5449.6Da、7131.5Da、9903.2Da和10767.3Da;与损伤组相比预先保护组（Organ-Se）的血清及肝脏标志物的表达水平接近正常组。本实验表明非金属元素硒,尤其是有机硒同金属元素（如锌）一样,能够有效诱导MT的表达,为今后进一步开展硒代金属硫蛋白的机制研究奠定了基础;同时在对小鼠肝损伤保护的研究中发现,有机硒具有明显的肝损伤保护作用,是一种较有前途的值得开发的肝损伤防护药。     

中国蛋白质组学第四届学术大会赞助及参展单位（第一轮通知）

为了积极促进我国蛋白质组学的研究与发展,由中国生物化学与分子生物学会中国人类蛋白质组组织（CNHUPO）（筹）和蛋白质组学专业委员会主办,第四军医大学、西北大学和北京蛋白质组研究中心共同承办,中国蛋白质组学第四届学术大会定于2006年8月21-23日在西安市召开。大会安排于2006年8月21日全天举办蛋白质组学新技术培训,届时将邀请蛋白质组领域的国内外知名专家、教授讲授。     

科学家研究二硫键蛋白质组学获新突破

我国二硫键蛋白质组学的研究取得新突破。近日出版的《美国科学院院刊》,发表了华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室及药学院教授杨弋、哈佛大学医学院教授Joseph Loscalzo．合作完成的论文《哺乳动物细胞中线粒体对二硫键蛋白质组的调节》。这项研究成果,对了解二硫键的形成及其对生命的调控,以及相关重大疾病机制研究与治疗具有重要意义。据专家介绍．二硫键是指蛋白质内2个半胱氨酸残基之间自然形成的桥键,其形成是细胞内蛋白质合成过程中的一个关键步骤。然而,长期以来人们一直不能直接在细胞内观察二硫键的形成,有关二硫键蛋白质组的形成与细胞功能关系的研究领域进展缓慢。针对这一关键技术的国际空白,杨弋建立了一种灵敏、特异性的荧光标记方法,[第一段]     

《PLoS综合》：研究发现多物种间蛋白质丰度整体分布规律

贺福初院士所领导的军事医学科学院放射与辐射医学研究所、北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室及复旦大学生物医学研究院科研团队近来在多物种间揭示了蛋白质丰度的整体分布与蛋白质的进化、结构和功能存在规律性的相关，     

第六届中国蛋白质组学大会(第一轮通知)

为了积极促进我国蛋白质组学的研究与发展,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办,北京蛋白质组研究中心和新疆医科大学共同承办的第六届中国蛋白质组学大会定于2008年7月26-28日在     

磷酸化蛋白质组学分析和定量技术的研究进展

蛋白质的磷酸化是一种可逆性的蛋白质翻译后修饰,在生物体内起着极为重要的作用.近年来蛋白质翻译后修饰日益成为蛋白质组研究的热点之一.定量磷酸化蛋白质组学方法和技术的快速发展为研究蛋白质磷酸化时空动态变化,更好地了解生物学功能调节网络奠定了坚实的基础.作为蛋白质组学研究的一个重要组成部分,定量磷酸化蛋白质组学因其磷酸化蛋白质所具有的独特特征,在技术和方法研究方面将面临更为严峻的挑战.综述了磷酸化蛋白质组学定量的一些分析技术和方法的发展现状、优缺点以及未来的发展趋势.     

中国蛋白质组学研究进展——以人类肝脏蛋白质组计划和蛋白质组学技术发展为主题

蛋白质组学是对细胞或生物体全部蛋白质的系统鉴定、定量并阐释其生物学功能的学科.自21世纪初期开始,随着高精度、高灵敏度和快速扫描质谱仪的出现和快速发展以及微量蛋白质组样品高效分离技术的进步,蛋白质组学获得了快速发展,并在生理过程与病理机制研究等几乎所有生命科学研究领域得到了广泛的应用.过去10年,中国蛋白质组学研究在政府的支持和广大蛋白质组学研究人员的努力下呈现出腾飞式的发展态势.本文综述了人类肝脏蛋白质组计划和2010~2013年中国蛋白质组学技术的发展.     

研发动态

<正>我国人类蛋白质组计划预计今年通过并实施国际人类蛋白质组计划(HPP)是继国际人类基因组计划(HGP)之后又一项大规模的国际性科技工程。我国人类蛋白质组计划目前已完成项目论证,预计今年通过并实施,将覆盖中国人全部重大疾病,由此我国将成为世界蛋白质组学的领头羊。团队带头人、军事医学科学院院长贺福初院士表示,如果说HGP为人     

异军突起的蛋白质组学

所谓蛋白质组学,就是研究基因组中的各个基因,并翻译成各自的蛋白质,以组合构成蛋白质组的科学。蛋白质组学是生命科学中最新发展的一门学科,为了明确该门学科的概念,首先还得从基因、基因组及其表达的含义和之间的关系等内容谈起。大家都知道“种瓜得瓜,种豆得豆”这个道理,即生命具有遗传性。遗传物质是由4种碱性的化学物质——脱氧核糖核苷酸(DNA)组成。它们的不同组合排列,构成了具有某一种生物学特性     

多肽铬螯合物对糖尿病小鼠肝脏蛋白质表达的影响

目的:研究多肽铬螯合的对糖尿病小鼠肝脏蛋白质表达的影响,探讨其治疗糖尿病的机理.方法:通过腹腔注射四氧嘧啶建立糖尿病小鼠模型.将小鼠分为正常组、模型组和胶铬组,胶铬组以灌胃方式加入多肽铬螯合物;以光镜及HE染色观察三组小鼠肝脏形态及组织学的变化,采用SDS-PAGE实验和非SDS-PAGE检测三组小鼠肝脏蛋白质表达.结果:光镜及组织学观察结果显示多肽铬螫合物可以有效地减轻四氧嘧啶对肝细胞造成的损伤.模型组肝脏25kDa-35kDa之间的某种蛋白表达升高而多肽铬螯舍物可以降低此种蛋白的表达,初步推断这种蛋白质为SOD.结论:多肽铬螯合物能够通过降低四氧嘧啶造成的肝脏中抗氧化有关的蛋白质代偿性升高而祈祷保护肝脏的作用,是一种新型的治疗糖尿病所致的肝损伤的活性物质.     

第五届中国蛋白质组学大会暨首届粤港蛋白质组学学术交流会在广州和香港分别召开

(贺福初院士当选蛋白质组学专业委员会第二届主任,钱小红研究员当选为秘书长)由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会主办,南方医科大学、暨南大学、香港大学、香港中文大学和北京蛋白质组研究中心承办的第五届中国蛋白质组学大会暨首届粤港蛋白质组学学术交流会于2