中国拟缺齿藓属Haplodontium Hampe(真藓科)的分类学研究

报道了中国新记录属--拟缺齿藓属（Haplodontium Hampe）分类学的研究进展。目前本属在中国分布有3种,其中包括1新种：臧氏拟缺齿藓（Haplodontium zangii X.R.Wang&J.C.Zhao）,2个新组合：喜马拉雅拟缺齿藓[H.himalayanum（Mitt.）X.R.Wang&J.C.Zhao]和中华拟缺齿藓[H.sinensis（Dix.）X.R.Wang&J.C.Zhao]。笔者对中国拟缺齿藓属3种植物的形态学特征绘制了墨线图,在光学显微镜和电子显微镜下拍摄显微形态照片,并对每种的主要识别特征、生境和地理分布以及与相似种的形态学比较进行了讨论。     

基于叶绿体rps16基因和核基因ITS片段研究肉苁蓉属系统位置

在前人对列当科系统发育研究的基础上,追加了肉苁蓉属(Cistanche)的基因序列数据,运用最大简约法、最大似然法和贝叶斯推断方法探讨了其在列当科中的系统位置及列当科中属间关系。基于rps16基因序列及rps16+ITS联合序列建立了列当科系统发育树,结果显示,肉苁蓉属、列当属(Orobanche)以及草苁蓉属(Boschniakia)聚在同一进化枝内,肉苁蓉属和列当属表现出最近亲缘关系;列当科中的全寄生类群、半寄生类群和非寄生类群分属在3个不同分支中。     

丛藓科植物叶细胞疣和乳突的光镜观察及其分类学意义

选择中国丛藓科中具有代表性的4亚科、11属、13种,利用光学显微镜对其叶细胞的疣和乳突进行形态、大小、数量、疏密及形成等方面的观察和比较,为探讨并确定丛藓科中部分物种的系统位置提供依据。结果表明:中国丛藓科13个种植物的叶细胞疣和乳突在形态上主要分为圆疣、分叉疣和乳头状突起共3个类型,不同物种的疣和乳突在形态特征和分布上都存在一定程度的差异;通过对不同资料相应物种疣和乳突描述的比较,纠正了一些物种疣和乳突的描述错误,并提出疣和乳突的区分方法:观察叶片横切,疣是细胞壁的局部加厚或凸起,数量变化较大,而乳突是细胞壁和腔整体的膨起,每细胞仅具一个乳突。研究认为,疣和乳突是丛藓科物种叶细胞表面的稳定结构,具有重要的辅助分类功能,可利用其差异对丛藓科属间和种间的物种进行划分。     

裸帽藓属Groutiella Steere的研究I—形态特征和研究概况

裸帽藓属（Groutiella）隶属于木灵藓科的蓑藓亚科。其分布区主要集中在中、南美洲地区。裸帽藓属的显著特征为叶基部有分化边缘;蒴帽仅覆盖孢蒴的1／3,平滑无毛。该属植物与蓑藓属（Macromitrium）和卷叶藓属（Ulota）植物形态上十分相似。自1950年建属以来,对于它的分类学研究很少,且主要集中在地区性研究和形态学研究。根据目前的研究现状,裸帽藓属的概念还存在问题,某些种类存在一定的混淆,因此,该属亟需进行世界范围内的分类学修订。     

基于核核糖体DNA ITS序列的真藓科系统发育新证据

主要是利用核基因组的核糖体DNA内转录间隔区（nrDNA ITS）序列数据探讨了Buck和Goffinet（2000）限定的真藓科内各属间及属内种间的系统发育关系。ITS序列的最大简约法（MP）及贝叶斯推论（BI）分析结果显示：不支持Cox（1999）利用rps4/trnL-trnF数据分析将丝瓜藓属移至提灯藓科的结论。ITS数据分析与Holyoak（2007）利用trnL-F,trnG和atpB-rbcL序列数据分析将Bryum algovicum、B.caespiticium、B.capillare、B.pseudotriquetrum和Plagiobryum zierii划归Ptychostomum的结论一致,同时,为Spence(2005)依据形态学特征将B.pallescen、B.pallens、B.uliginosum、B.amblyodon和B.lonchocaulon划归Ptychostomum提供ITS分子证据支持。基于以上研究,建议将以上提到的真藓属种和平蒴藓移至Ptychostomum。     

基于ITS、rpl16和trnS-trnR DNA序列讨论锥形果属的系统位置

基于核基因ITS和叶绿体基因rpll6、trnS-trnR的DNA序列讨论了锥形果属的系统位置,3个基因片段独立以及联合的分析为锥形果属Gomphogyne的系统进化研究提供了足够的信息.结果表明:(1)锥形果属是一个自然属;(2)雪胆属Hemsleya的短柄雪胆H. delavayi和圆锥果雪胆H. macrocarpa曾经被作为锥形果属的种,分子证据表明它们确实隶属于雪胆属;(3)锥形果属单独构成雪胆属的姊妹群,而并非是与绞股蓝属Gynostemma共同构成.     

我国棘螈属(Echinotriton)和疣螈属(Tylototriton)的研究概况

棘螈属（Echinotriton）和疣螈属（Tylototriton）均属于两栖纲有尾目蝾螈科.两属主要分布于我国西南、亚洲西南部、东南亚及日本.棘螈属在我国已知3种：Echinotriton andersoni（琉球棘螈）、E. Chinhaiensis（镇海棘螈）、E. Asperrimus（细痣棘螈）.疣螈属在我国已知4种：Tylototriton kweichowensis（贵州疣螈）、T. Shanjing（红瘰疣螈）、T.taliangensis（大凉疣螈）、T. Verrucosus（棕黑疣螈）.本文回顾了棘螈属和疣螈属物种的命名史,阐明了两属之间的关系,并从形态学、生态学、细胞遗传学和分子生物学方面对这两属的研究工作进行了综述.     

毛尖连轴藓及其近缘种的比较形态学研究

连轴藓属(Schistidium Brid.)的毛尖连轴藓(S.lancifolium)、圆蒴连轴藓(S.apocarpum)和粗疣连轴藓(S.strictum)在内蒙古贺兰山和黑龙江五大连池均有分布,它们的形态特征较为相似,极易混淆,因此对其分类鉴定较困难。本文利用光学显微镜并结合Blom的形态学和Ignatova的分子系统学分类观点,对采自两个地区的3种连轴藓属植物标本进行了分类研究,并对它们的形态特征进行了详细描述。其形态特征是:圆蒴连轴藓叶中肋背部无疣或上部具分散低疣、叶缘上部微具钝齿,毛尖平滑或具小齿;毛尖连轴藓叶中肋背面中部以上具高疣、叶缘中上部具强烈不规则的齿或锯齿,毛尖具强烈刺状齿;粗疣连轴藓除叶中肋背部具疣外,叶片细胞也具疣。根据以上特征可以区别并确认这3个种是各自独立的种。在此基础上,根据Blom的分类观点,并参照相关文献编制了中国连轴藓属11个种的分种检索表。本研究进一步确认了毛尖连轴藓在中国的地理分布,丰富了中国连轴藓属的研究资料。     

新疆紫萼藓属(Grimmia Hedw.)植物4个新记录种

作者在研究新疆紫萼藓科植物时,发现了紫萼藓属(Grimmia Hedw.)植物4个新记录种,包括Grimmia capillata,紫萼藓(G. plagiopodia),贺兰山紫萼藓(G. crassiuscula)和卷叶紫萼藓(G. incurva),其中G. capillata为中国新分布。该研究对新记录种的形态特征、地理分布进行了详细描述,将其与属内相似种进行了比较分析。     

10种棘豆属植物的trnL-F序列及其分子系统学研究

选择内蒙古27个样地采集的10种棘豆属植物54个单株,提取样品的基因组DNA,对其叶绿体trnL-F序列进行扩增、测序,所得序列利用ClustalX软件进行对位排列,并用MEGA5.0软件采用最大似然法构建系统发育树,以探讨棘豆属的种间关系与系统进化.结果显示:(1)10种棘豆属trnL-F的变异位点54个,信息位点46个,种间碱基差异百分率为1.9％,GC含量变化范围在30.69％～31.50％之间.(2)棘豆属与黄芪属各为一支,自展支持率达99％,支持棘豆属植物为单系起源.(3)系统树中小花棘豆的样本自成一支,为相对独立进化;多叶棘豆、砂珍棘豆和黄毛棘豆的样本相互混杂,表明亲缘关系很近,从而支持《内蒙古植物志》将三者归入真棘豆亚属轮叶棘豆组的观点.(4)刺叶柄棘豆的样本不同样地形成2个分支,对其亚属水平上的分类需进一步探讨.(5)缘毛棘豆与阴山棘豆的样本聚成一支,支持将二者归入矮生棘豆组.研究表明,trnL-F序列可为棘豆属下种间系统发育关系研究提供分子证据.     

基于5个基因片段的野胡麻属系统位置研究

对单种属野胡麻属(原隶属于广义玄参科)及其可能近缘类群广泛取样,选择合适外类群,通过对4个叶绿体基因联合数据(trnL-F、rps16、rbcL、rps2)、核基因ITS片段、叶绿体基因与核基因ITS片段联合数据,进行最大简约法和贝叶斯法分析,探讨野胡麻属在科级系统位置及其与近缘类群系统发育关系。结果表明,所有系统树都支持野胡麻属先和肉果草属构成姐妹群关系,叶绿体基因联合系统树支持率分别为97%[Bootstrap(BS)]和100%[Posterior probability(PP)];ITS系统树支持率分别为99%(BS)和100%(PP);叶绿体基因和ITS联合系统树支持率均为100%(BS和PP)。野胡麻属、肉果草属与通泉草属一起构成一单系群,叶绿体基因联合系统树、ITS系统树、叶绿体基因和ITS联合系统树的支持率均为100%(BS和PP)。形态学证据也支持野胡麻属、肉果草属和通泉草属这3个属的近缘关系。本研究结果支持单种属野胡麻属隶属于透骨草科的通泉草亚科,与肉果草属亲缘关系最近,这两个属进而与通泉草属近缘,可能隶属于通泉草属内,与岩白翠亲缘关系较近,也可能与通泉草属互为姐妹群关系。     

基于cpDNA trnL-F序列的胡黄连保护遗传学研究

胡黄连为特产中国-喜马拉雅特有高山植物,作为常用中、藏药材,受到灭绝性采挖,作为濒危和二级保护植物亟待科学的保护。该研究以云南和西藏7个野生居群91个个体为材料,基于 cpDNA trnL-F 非编码序列测序分析胡黄连的遗传多样性和遗传结构,分析显著进化单元,确立优先保护居群并提出科学的保护策略。结果表明：胡黄连 trnL-F 序列长度为871~876 bp,根据序列的核苷酸变异共鉴定出5个单倍型,西藏占有2个单倍型,云南占有3个单倍型,西藏和云南2个地区的所有单倍型均不共享。胡黄连具有较低的单倍型多样性(Hd ＝0.43419)和核苷酸多样性(Dij ＝0.00466)。种群间分化度(Fst ＝0.864520)和基因流(Nm ＝0.04)、居群间的遗传分化水平(GST ＝0.916)、AMOVA 分析(0.78％的遗传变异发生在居群内,60.97％的遗传变异发生在地区内居群间,38.25％的遗传变异发生在地区间)均表明,胡黄连居群间存在明显遗传分化。多数一致性树将胡黄连划分为3个进化分支(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),这3个分支均与地理相关,分支Ⅰ分布于横断山区的4个居群,分支Ⅱ是分布于东喜马拉雅的一个居群,分支Ⅲ是分布于喜马拉雅中段的2个居群。3个分支分属于3个“进化显著单元(ESU)”。这3个 ESU 中白马雪山、茨中、定日、波密、聂拉木五个居群都需要保护,建议现阶段应优先保护的居群是云南白马雪山和西藏波密居群,以就地保护为主。     

Phylogenetic relationships within Pappophoreae s.l. (Poaceae: Chloridoideae): Additional evidence based on ITS and trnL-F sequence data

Historically, Pappophoreae included the genera Cottea, Enneapogon, Kaokochloa, Pappophorum and Schmidtia. Some authors consider this tribe as a well-supported monophyletic group; while other evidences reveals Pappophoreae as polyphyletic, with Pappophorum separated from the rest of the tribe. When the latter happens, it can form a clade with Tridens flavus. Molecular phylogenetic analyses of the subfamily Chloridoideae have included few species of Pappophoreae; therefore, further research involving more representatives of this tribe is needed. With the aim of providing new evidence to help clarify the phylogenetic position of Pappophorum and its relationships with other genera of the tribe and the subfamily Chloridoideae, eight new sequences of ITS and trnL-F regions of Pappophoreae species were generated. These sequences were analyzed together with other available sequence data obtained from GenBank, using maximum parsimony and Bayesian inference, for individual (trnL-F or ITS) or combined trnL-F/ITS data sets. All analyses reveal that Pappophoreae is polyphyletic, with Pappophorum separated from the rest of the tribe forming a well-supported clade sister to Tridens flavus.     

Molecular Phylogeny of the Chipmunks Inferred from Mitochondrial Cytochrome b and Cytochrome Oxidase II Gene Sequences

There are currently 25 recognized species of the chipmunk genus Tamias. In this study we sequenced the complete mitochondrial cytochrome b (cyt b) gene of 23 Tamias species. We analyzed the cyt b sequence and then analyzed a combined data set of cyt b along with a previous data set of cytochrome oxidase subunit II (COII) sequence. Maximum-likelihood was used to further test the fit of models of evolution to the cyt b data. Other sciurid cyt b sequence was added to examine the evolution of Tamias in the context of other sciurids. Relationships among Tamias species are discussed, particularly the possibility of a current sorting event among taxa of the southwestern United States and the extreme divergences among the three subgenera (Neotamias, Eutamias, and Tamias).     

海南脆蛇蜥的分类地位研究

海南脆蛇蜥（Dopasia hainanensis Yang, 1983）为杨戎生根据1号来自海南吊罗山的标本命名,其形态和分子系统发育关系少有人研究。2018年至2019年间,作者获赠2号来自海南脆蛇蜥模式产地的标本和1号来自脆蛇蜥（D. harti）模式产地的组织样。经过形态特征比较和线粒体Cyt b基因序列分析,发现两地样本Cytb基因序列的遗传距离很近（仅有4.96%）,且形态差异不明显,难以找到典型鉴别特征。本文研究成果支持海南脆蛇蜥和台湾脆蛇蜥（Ophisaurus formosensis）为脆蛇蜥的同物异名,同时认为越南的“海南脆蛇蜥”可能为一未描述的新种或新亚种。鉴于脆蛇蜥种下遗传差异较大,其种下关系亟待进一步研究。     

异角毛藻和平滑角毛藻的分类学修订

为了澄清异角毛藻和平滑角毛藻的分类学疑问,在广东南澳岛海域建立了单克隆培养株系,利用光学显微镜和电子显微镜技术,开展了基于生活史的连续形态学观察,发现粗大角毛的延伸方向易变,是不稳定特征,不宜继续赋予分类学价值。对核糖体大亚基编码基因的D1～D3区序列进行扩增和分析,结果异角毛藻和平滑角毛藻的目标基因序列基本一致,仅有1个平滑角毛藻株系存在2个差异碱基。因此,两者具有一致的系统学位置,属于同一物种,平滑角毛藻应该是异角毛藻的同种异名。     

Evolutionary relationships among aquatic anamorphs and teleomorphs: Lemonniera, Margaritispora, and Goniopila

The hypothesis that similar conidial morphologies in aquatic hyphomycetes are a result of convergent evolution was tested using molecular sequence data. Cladistic analyses were performed on partial sequences of 28S rDNA of seven species of Lemonniera, one species of Margaritispora and one species of Goniopila. Lemonniera has tetraradiate conidia with long arms, whereas Margaritispora and Goniopila have typically globose (isodiametric) conidia, with short conical protuberances in a stellate or quadrangular arrangement. Lemonniera and Margaritispora have phialidic conidiogenesis and both produce dark, minute sclerotia in culture whereas Goniopila has holoblastic conidiogenesis and does not produce sclerotia in culture. Goniopila produces a microconidial phialidic synanamorph in culture. All three genera have schizolytic conidial secession. Molecular analyses demonstrate that Lemonniera species are placed in two distinct clades: one within Leotiomycetes; the other within Pleosporales, Dothideomycetes. Margaritispora is placed with Lemonniera species within Leotiomycetes. Goniopila and Lemonniera pseudofloscula are placed within Dothideomycetes. No morphological character was entirely congruent with the molecular derived phylogeny. This suggests that for the group of species studied, conidial shape is not a reliable indicator of phylogeny but more likely the result of convergent evolution in response to the aquatic environment.     

宽翅菘蓝系统发育关系和分类地位研究

宽翅菘蓝(Isatis violascens)是分布于新疆准噶尔盆地的一种早春短命植物。基于形态的相似性,有人建议将宽翅菘蓝作为Isatis emarginata同义体。目前宽翅菘蓝尚未得到分子水平的研究,其系统发育地位也不清楚。该研究对宽翅菘蓝的ITS区进行测序,结合GenBank数据库中菘蓝属物种的ITS序列对宽翅菘蓝的系统关系和分类地位进行研究。最大简约法,最大似然法和贝叶斯法3种方法分析表明:菘蓝属物种聚为两个分支;宽翅菘蓝与I.emarginata和小果菘蓝具有较近的亲缘关系;基于形态相似性和较近的遗传距离,支持将宽翅菘蓝与I.emarginata合并为一个物种,并把宽翅菘蓝作为I.emarginata的同义种。