海洋病毒——海洋生态系统结构与功能的重要调控者

摘要：作为海洋生态系统中的重要成员,海洋病毒在调节海洋生态系统中的群落结构、种群数量、物质循环、生物间遗传物质的转移以及气候变化等方面起着重要的作用。本文概述了近年来对海洋病毒的研究进展,讨论了海洋病毒对海洋生态系统结构和功能的重要调控作用,并对海洋病毒的研究前景进行了展望。     

海洋病毒荧光显微计数法的优化与应用

【目的】建立一种快速、稳定、可靠的海洋病毒计数方法。【方法】海水水样经福尔马林固定后,滤过孔径为0.02μm的Anodisc Al2O3膜。滤膜经SYBR Green I染色后,在相应波长的激发光下进行观察。借助荧光显微镜目镜网格尺,计数视野中的病毒颗粒,换算后获得样品中病毒的浓度。【结果】对具体实验方法进行了优化,可快速、稳定地对海水中的病毒计数。【结论】建立了一种适用于国内实验条件的、可靠的海洋病毒计数方法。     

病毒酶的研究及其进展

病毒的主要生物学特性之一是只有一种类型的核酸为其基因组(RNA或DNA),并必须在活细胞中增殖。虽然病毒复制需要细胞组分参与,但病毒基因编码的酶在病毒复制中的作用已日益受到重视。各种不同的病毒具有不同的病毒酶,包括复制核的酶、整合人细胞染色体的整合酶、引发(priming)DNA     

气候变化对海洋病毒生态特性及其生物地球化学效应的影响

摘要:病毒作为海洋中丰度最高的生命粒子,通过侵染和裂解宿主细胞影响宿主生理生态特性,改变海洋食物网的物质循环和能量流动,在海洋生物地球化学过程中扮演着重要角色。全球气候变化导致海面升温、海洋酸化、营养盐和海水盐度变化、低氧区扩大等海洋环境问题,对海洋病毒生理生态特性产生直接或间接的影响。本文从海洋病毒的生态功能和生物地球化学效应出发,概述了气候变化因子对病毒分布、丰度、生命策略以及与宿主之间相互作用等的影响,提出海洋病毒是全球气候变化研究中不可或缺的对象。     

感染对重型病毒性肝炎预后的影响

重型病毒性肝炎 (重型肝炎 )极易发生细菌感染 ,感染又加重肝损害 ,最终导致多器官功能衰竭 ,预后不良。本文对我院自 1 996年 2月～ 2 0 0 2年 4月间收治的 98例重型肝炎患者进行回顾性分析 ,现总结如下。1　临床资料1 .1　一般资料　 98例重型肝炎中 ,男 69例 ,女 2 9例 ,年龄 1 5～ 67岁 ,平均年龄 35 .4岁 ,符合 1 995年全国传染病与寄生虫病学术会议修订的诊断标准 [1] 。继发感染组 45例中 ,急性重型肝炎 5例 ,亚急性重型肝炎 7例 ,慢性重型肝炎 33例。无继发感染组 5 3例 ,急性重型肝炎 4例 ,亚急性重型肝炎 8例 ,慢性重型肝炎 41例…     

细菌和病毒感染性疾病的基因易感性研究

随着一些已经绝迹的传染性疾病的重新出现以及新的病菌、病毒感染性疾病的流行,对人类感染性疾病致病机制的研究已得到人们的广泛重视,而疾病易感性……     

兔出血症病毒体外复制的研究

在几种动物细胞上,采用同步感染的方法研究了兔出血症病毒(RHDV)的复制特性。病毒感染细胞后(PI)48—72小时可观察到明显的细胞病变,血凝效价可增高5—10倍。病毒对细胞传代代数不同,敏感性也不同。在兔婴肾(RK)和兔婴肺(RL)细胞上以4—8代最为敏感。采用免疫荧光染色法,经病毒感染48—72小时的细胞中可观察到特异性荧光。细胞增殖的病毒经PEG-DS浓缩,Sepharose 4B柱层析提纯后,在电镜下可观察到完整的病毒粒子,将此病毒回接健康实验兔可致100％死亡。免疫双扩散和免疫电泳试验表明,细胞增殖的病毒抗原与来自病兔肝的RHDV抗血清之间产生明显的沉淀带。SDS-PAGE分析病毒获得四条多肽,其分子量大小与病兔肝组织提取的病毒蛋白多肽分子量相比略有差异。     

棉铃虫单粒包埋型核型多角体病毒复制的研究：Ⅰ.细胞病理学和病毒…

本文报道了棉铃虫单粒包埋型核型多角体病毒在棉铃虫及棉铃虫蛹卵巢细胞系ＳＦＥ－ＨＡ－８２１２中的复制。ＨａＳＮＰＶ的复制和其他的核型多角体病毒大体相符,复制过程也可分为形成出芽型病毒与形成包埋型病毒这两个时相。研究了影响病毒在细胞中复制的诸因素,包括毒感染复数、细胞生长阶段等。在适宜的条件下平均每细胞可生产出芽型病毒１４ＰＦＵ,多角体２４个,生成的病毒具有感染力。这些表明ＳＦＥ－ＨＡ－８２１２细胞可     

双链RNA病毒的复制机制

本文对双链ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）病毒复制机制的研究进展进行了综述。根据ｄｓＲＮＡ病毒复制周期,分以下几方面对其复制的有关分子进行分析：转录、转录本释放和“满头”复制模型、（＋）ＲＮＡ转译、病毒包装、（－）ＲＮＡ合成等。此外,还简要分析了宿主基因及其产物在病毒复制中的作用。     

RNA病毒基因组和转录复制多样性的分子基础

自然界中RNA病毒的种类和数量比DNA病毒多得多,根据基因组类型,RNA病毒可分为多种类型,许多研究者认为,存在于古细菌Myxobacteria中,仅仅有一个逆转录酶基因的反转子（Retron)可能是所有病毒的祖先,进化的模式如下,反转子→反座子→反转录转座子→反转录病毒→副反转录病毒→DNA病毒,RNA病毒转录。／复制在很多特征上与DNA病毒迥然不同,依赖于RNA的RNA聚合酶是RNA病转录／复制的主要催化剂,RNA病毒基因组转录和复制都从3'端poly(A)或类tRNA结构或其他结构起始,内部终止是转录,通读到5'末端终止是复制,RNA病毒的模板有正链病毒（RNA模板,负链病毒RNA模板和全长正负链反基因组RNA模板,RNA模板的选择调控机制非常复杂,目前知之甚少,选择模板,RNA聚合酶与转录因子结合形成复制体是两种主要的调控方法,另外,5'UTR和3'UTR也可以调控RNA病毒的转录。     

海洋厌氧氨氧化细菌分子生态学研究进展

厌氧氨氧化细菌是能在厌氧的条件下将氨氧化为氮气的一类细菌,这类细菌执行着以前未被人们所认知的一个独特的过程--氧氨氧化过程,据估计厌氧氨氧化过程对于海洋氮气的形成有30%～50%的贡献率;海洋厌氧氨氧化细菌能与氨氧化细菌及氨氧化古菌存在潜在的耦合作用,对于海洋氮循环复杂机制的阐述有着非常重要的意义;同时海洋厌氧氨氧化细菌独特的细胞和基因组结构,也成为了解海洋细菌进化重要的模式微生物之一.本文综述了近年来国内外厌氧氨氧化细菌分子生态学方面的进展,并结合作者的工作对未来的研究进行展望.     

海洋微生物抗肿瘤天然产物研究进展

近年来,海洋微生物已成为抗肿瘤天然产物研究的热点,目前从海洋微生物中发现了大量新的抗肿瘤天然产物。文章综述了近几年从海洋微生物(海洋放线菌、真菌和细菌)中分离得到的抗肿瘤活性天然产物的研究进展。     

基于CiteSpace中国海洋生态经济的文献计量分析

以CNKI和CSSCI数据库中1980—2017年的1779篇文献为原始数据,基于文献计量分析方法和文献可视化工具,对海洋生态经济领域的研究成果进行信息挖掘。研究发现:(1)海洋生态经济的研究始于1982年,2009年论文发表数量激增成为学术界的研究热点。(2)狄乾斌、高强、殷克东等在海洋生态经济方面做出了大量研究,中国海洋大学、国家海洋局和辽宁师范大学为主要研究机构,研究机构之间合作联系主要以部门和地域联系为主,跨区域和跨部门的合作有待增强。(3)海洋生态经济的研究热点指向"蓝色经济"、"海洋生态系统协调"、"人海可持续发展"等方向。(4)海洋生态经济研究的综合性不断增强,《海洋开发与管理》是海洋生态经济研究刊文量最多的期刊。     

Laser Impact on Marine Planktonic Diatoms: An Experimental Study Using a Flow Cytometry System

A flow cytometry system was used to evaluate the impact of pulsed laser irradiations from an Nd:YAG laser on two marine coastal water diatoms, Chaetoceros gracilis and Skeletonema costatum. Three flow speeds, i.e. 9, 18 and 27 ml min^{m 1} and three laser fluences, i.e. 0.025, 0.05 and 0.1 J cm^{m 2} pulse^{m 1} were tested during this study. The reduction in cell density and chlorophyll a (chl a) concentrations were monitored by reference to non-irradiated samples as controls. Upon irradiation, the cell density and the chl a concentrations became reduced significantly compared to the control (one way ANOVA p <0.001 for the cell density in both the species and p <0.05 for chl a concentrations in both species). A maximum mortality of 0.77 log₁₀ (about 83%) for C. gracilis and 0.68 log₁₀ (about 78%) for S. costatum was observed at 9 ml min^{m 1} flow speed and 0.1 J cm^{m 2} laser fluence. The maximum reduction observed in the chl a concentration was about 26% (control 0.413 and sample 0.306 mg ml^{m 1}) for C. gracilis and 27% (control 0.222 and sample 0.16 mg ml^{m 1}) for S. costatum, when the flow rate was 9 ml min^{m 1} and the fluence 0.1 J cm^{m 2}. In general, mortality increased with an increase in the laser fluence. The results thus show if the cooling water is laser-irradiated to mitigate biofouling, this could result in significant damage to the planktonic flora of the flowing seawater system, which in turn might reduce algal biofilm formation on industrially important structures. The reduction in the chl a concentration showed that the laser irradiations also could result in a significant reduction in the primary productivity of the cooling water.     

海洋微生物中二酮哌嗪类化合物的研究进展

二酮哌嗪类化合物的基本结构是由两个氨基酸缩合而成的环二肽, 因其骨架具有稳定的六元环结构, 且有两个氢键给体和两个氢键受体, 使得DKPs具有较强的生物活性和药理活性, 在药物化学中成为一个重要的药效团。近年来从海洋微生物中发现一系列环二肽类化合物, 研究表明其功能不局限于抗菌、细胞毒活性等方面,在群体感应调控机制中也充当着信号分子的重要角色, 已成为化学生态学的研究热点。本文综述了近年来二酮哌嗪类化合物在海洋微生物代谢产物中的研究进展, 并对其研究方向进行了讨论和展望。     

Stabilization of the population of a parasite on fruit by the population of a cleptoparasite

When there exist two species such that one is a parasite on fruit and the other exploits the parasitized fruits, they must compete for a limited resource with each other. The relation between Dacus cucurbitae and Atherigona orientalis is an example of such a situation. We raise a question whether the population of a parasite on fruit can be stabilized by the existence of the cleptoparasite of the parasite on fruit. The changes in their population densities are represented as a differential equation with time delayed parameters, which is deduced from the context of life histories of the two species. An index representing degree of overlapping of generations (g) is defined as an average oviposition period devided by the average preoviposition period, and the value is assumed to be the same in the two species. The stability of the system is classified by three parameters: the reproductive rate of the parasite on fruits (R), the survival probability of it through competition against the cleptoparasite (p), and the generation overlapping index (g). For small values of g, e.g. less than some 0.5, the stability is determined mainly by a product of Rp: the values larger than 1 result in no equilibrium and infinite increase of both species, the values near 0 lead to large amplitude oscillations, and the intermediate values make stable equilibria or regular small oscillations. As g takes the larger values, the stability region in the space (p, R) occupies the larger area. The model presented here is well adjusted to the fluctuating pattern of the population of D. cucurbitae on Okinawa Is., and would also be applied to analysis of both hyperparasitisms and inquilin.     

青岛3种海藻元素变迁的同步辐射X射线荧光研究

为了研究海藻体内元素的变迁在监测海洋环境污染状况方面的应用,作者利用同步辐射X射线荧光,对分别在1985年7月和1999年7月采自中国山东省青岛海滨的浒苔（Enteroinorpha prolifera)、海蒿子（Sargassum pallidum) 和鸭毛藻（Symphyocladia latiuscula)进行了元素的分析。研究结果表明,各种不同的海藻,各自有相当稳定的XRF谱型。同1985年样品的XRF谱相比,在1999年的所有样品中,许多元素的峰强都明显增高了。Br的含量在鸭毛藻中最高,海蒿子次之,浒苔最少。同1985年相比,1999年的鸭毛藻中Br的含量几乎无变化,可能在1985年就已接近饱和。     

The Effect of Mutation and Selection on Codon Adaptation in Escherichia coli Bacteriophage

Studying phage codon adaptation is important not only for understanding the process of translation elongation, but also for reengineering phages for medical and industrial purposes. To evaluate the effect of mutation and selection on phage codon usage, we developed an index to measure selection imposed by host translation machinery, based on the difference in codon usage between all host genes and highly expressed host genes. We developed linear and nonlinear models to estimate the C→T mutation bias in different phage lineages and to evaluate the relative effect of mutation and host selection on phage codon usage. C→T-biased mutations occur more frequently in single-stranded DNA (ssDNA) phages than in double-stranded DNA (dsDNA) phages and affect not only synonymous codon usage, but also nonsynonymous substitutions at second codon positions, especially in ssDNA phages. The host translation machinery affects codon adaptation in both dsDNA and ssDNA phages, with a stronger effect on dsDNA phages than on ssDNA phages. Strand asymmetry with the associated local variation in mutation bias can significantly interfere with codon adaptation in both dsDNA and ssDNA phages.     

中国东海海洋微生物种群多样性初步研究

以东海海洋微生物群落为研究对象,用稀释平板分离法,从海泥和海水中得到542株分离物。随机选取58株发酵培养,将所有发酵菌株的16S rDNA基因扩增,并用限制性内切酶HinfI对PCR产物进行ARDRA(Amplified rDNA restriction analysis)多态性分析,共得到16种不同的操作分类单元(Operational Taxonom ic Un it,OTU)。其中OTU5和OTU7所包含的菌株分别占总分离物的32.7%和19.0%,为优势分离物。优势分离物的ER IC-PCR基因组指纹图分析表明,前者的19株分离物共有12种不同的指纹图类型,而后者的11株分离物有4种。结果显示,东海海域的海水和底泥具有明显的微生物种群多样性特征。     

海洋放线菌124092细胞毒活性和化学成分研究

采用MTT法对海洋放线菌124092正己烷提取物进行细胞毒活性筛选,结果显示对小鼠B16黑色素瘤细胞有一定的生长抑制活性。用硅胶真空柱层析法将正己烷提取物粗分为6个组分（Fr1～Fr6）,细胞毒活性追踪显示Fr6组分为活性部分。为确定其中的活性成分,运用GC／MS对脯组分的化学成分进行了分析,结果显示其主要成分为：棕榈酸（Palmitic acid,11．76％）、油酸（Oleic acid,12．16％）、亚油酸（Linoleic acid．14．77％）和乳杆（菌）酸（Lactobacillic acid,61．31％）。据文献报道棕榈酸、油酸、亚油酸均对小鼠腹水瘤细胞具有细胞毒活性,亚油酸还对人肺腺癌细胞具有抑制作用。