《癌细胞》:科学家发现胃癌等肿瘤治疗新途径

<正>中科院上海生科院生化细胞所/国家蛋白质科学中心·上海(筹)周兆才研究组与张雷研究组、季红斌研究组,发现了原癌蛋白质YAP的一个天然拮抗剂蛋白--VGLL4,并在蛋白质晶体结构解析的基础上发展出一个针对YAP的多肽类抑制剂,从而为以胃癌为代表的肿瘤治疗提供了新的策略和途径。相关成果日前在线发表于《癌细胞》杂志。     

招聘启事

<正>国家蛋白质科学中心·上海(筹)陈勇研究组公开招聘博士后国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所负责筹建国家蛋白质科学中心·上海(筹),负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市海科路333号)。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力,进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用     

癌蛋白YAP1的研究进展

Yes相关蛋白1(Yes-associated protein 1,YAP1)是Hippo信号通路(Hippo pathway)中的一个分子.早期研究人员发现,在Hippo信号通路正常的情况下,YAP1处于非激活状态;当Hippo信号通路中的某些分子出现突变时,YAP1处于超激活状态.此时,超激活状态下的YAP1可以促进细胞增殖、转移、生存(survival)以及维持干细胞活性.由于YAP1的超激活可以促进肿瘤的发生与发展,因此,YAP1被定义为一个癌蛋白.近期,研究者发现,YAP1的突变体与小细胞肺癌病人的存活率有一定关系,YAP1与链蛋白(catenin)、Kras相互作用,调节肿瘤细胞的转移侵袭能力,此外,部分micro RNA也与YAP1有相互作用.基于YAP1的功能,可以制定一些抗癌策略,寻找一些抗癌靶点.本文对当前YAP1的研究进行综述,为肿瘤治疗的基础及临床研究提供一些依据.     

YAP1基因调控新西兰白兔肌肉生长发育

Yes相关蛋白1(Yes-associated protein 1,YAP1)在哺乳动物组织中对于调节器官大小、肿瘤发生和细胞的增殖、分化、凋亡等具有重要作用。为探究YAP1基因在新西兰白兔肌肉组织生长发育中的生物学功能，本研究通过RT-PCR从新西兰白兔腿肌中克隆到YAP1基因，并对其生物信息学功能、表达模式及亚细胞定位、启动下游基因表达的转录活性，以及参与调控肌肉组织生长发育的功能进行分析。结果表明，YAP1的CDS区序列长度为1 302 bp,编码433个氨基酸，等电点为5.10的亲水性蛋白质，YAP1蛋白不存在信号肽和跨膜区域，其结构主要由无规则卷曲构成。系统进化树分析表明，与绵羊的亲缘关系较近，与小鼠的亲缘关系较远。亚细胞定位显示，该蛋白质在细胞核和细胞质中均有表达。RT-qPCR结果显示，YAP1基因在新西兰白兔的心、肝、脾、肺、肾、卵巢、子宫和肌肉中均有表达，但在肌肉中的表达量最高，且在腿肌组织中表达水平较高。双荧光素酶报告基因检测结果表明，YAP1基因第127位的丝氨酸突变为丙氨酸(YAP1-S127A),8xGTIIC的启动子活性明显增强。在肌肉细胞中过表达YAP1基...     

《发育细胞》：研究揭示蛋白质部分降解新机制

中科院上海生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组、张雷研究组在与加拿大多伦多大学教授Chi—chung Hui进行合作研究的过程中,揭示了一种新的蛋白质部分降解机制。相关研究成果日前在线发表于学术期刊《发育细胞》。     

RNA结合模体蛋白3对细胞总蛋白质合成的影响及其靶基因的鉴定

RNA结合模体蛋白3 (RNA binding motif protein 3, RBM3) 受低温应激产生,参与介导亚低温的神经保护功能,但其作用机制及其下游靶分子尚不清楚。本研究构建了人RBM3基因的重组表达质粒,运用一种新型的、非放射性方法即翻译表面感应 (surface sensing of translation, SUnSET) 来检测RBM3过表达对细胞总蛋白质合成(global protein synthesis, GPS)的影响。结果显示,RBM3过表达使细胞总蛋白质的合成水平上调23.7% (P < 0.001),这与RBM3过表达引发的真核翻译延伸因子2 (eukaryotic translation elongation factor 2, eEF2)及真核翻译起始因子2α (eukaryotic initiation factor 2α, eIF2α) 的活性增高相一致。对RBM3可能的下游靶基因内质网蛋白3 (reticulon 3,RTN3),以及Yes相关蛋白1 (Yes-associated protein 1,YAP1) 的表达进行分析。结果显示,RBM3使RTN3及YAP1在蛋白质水平的表达分别提高了51.7% (P < 0.01) 与43.3% (P < 0.01)。与蛋白质水平变化相比,RBM3使YAP1在mRNA水平上调了2.0倍 (P < 0.001),但对RTN3的mRNA表达未见显著影响。以上研究表明,SUnSET是一种稳定、可靠的细胞GPS的检测手段;RBM3可显著促进细胞GPS,且对其下游基因RTN3和YAP1存在靶向关系。本研究的结果为深入探讨RBM3的神经保护作用机制提供了理论基础。     

招聘启事

<正>生化与细胞所丛尧研究组招聘博士后丛尧研究组主要应用冷冻电镜(cryo-EM)技术从事蛋白质质量控制及表观遗传中重要生物超大分子复合体的结构与功能研究(介绍见http://www.sibcb.ac.cn/Pl.asp?id=141)。现因工作需要,面向社会公开招聘博士后研究人员1名。所在的国家蛋白质科学中心·上海配备一流的冷冻电镜设施,包括配有直接     

国家蛋白质科学中心(上海)科研人员揭示四膜虫端粒酶组分p75-p45-p19是其独特的CST复合物

<正>Nature Structural and Molecular Biology于2015年11月9日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)雷鸣研究组的最新研究成果,揭示了端粒酶组分p75-p45-p19构成了四膜虫中独特的CST复合物。端粒是真核生物染色体最末端的区域,虽然不     

YAP蛋白T425A位点突变对YAP功能的影响

Hippo信号通路在个体发育与组织生长中发挥了关键的作用,YAP(Yes-associated protein)是该通路中主要的下游效应因子。已有的研究表明YAP活性与肿瘤的发生发展密切相关,然而关于YAP活性的调控机制目前还不是很清楚。本研究将YAP蛋白(NP_001123617)第425位苏氨酸(T)突变为丙氨酸(A),发现YAP T425A突变能减弱YAP的转录活性,并通过免疫荧光实验发现该位点的突变还能阻滞YAP进入细胞核。该位点对YAP活性的调控并不依赖于YAP在S127位点受到的磷酸化调控。同时本研究在细胞水平上检测到T425A位点突变能部分降低YAP对细胞迁移的促进作用。本研究主要揭示了YAP T425位点对YAP进出细胞核及其转录活性调控的重要作用,丰富了Hippo通路的调节机理和YAP在肿瘤发生发展中的作用研究。     

HIPPO通路在骨骼肌再生、结构重塑及其运动干预中的研究进展

机械应力敏感信号HIPPO通路由上游MST1/2、中游LATS1/2和下游YAP三个核心组件构成，参与调控细胞增殖、分化、凋亡、蛋白质合成和干细胞自我更新等生理过程。在维持骨骼肌再生、能量代谢稳态、骨骼肌结构和功能重塑过程中发挥重要作用。已证实，通过抑制HIPPO通路的下游效应因子YAP磷酸化可促进YAP在细胞核内积累并形成复合物，从而促进相关基因的转录过程。本文对HIPPO通路的调控机制及其介导骨骼肌再生和蛋白质稳态调控的研究进展进行综述，重点分析运动干预下HIPPO通路在骨骼肌线粒体功能、凋亡和蛋白质合成中的可能作用，为深入研究运动干预改善骨骼肌再生和结构功能重塑的机制研究提供理论参考。     

RNA结合模体蛋白3对细胞总蛋白质合成的影响及其靶基因的鉴定

RNA结合模体蛋白3 (RNA binding motif protein 3,RBM3)受低温应激产生,参与介导亚低温的神经保护功能,但其作用机制及其下游靶分子尚不清楚。本研究构建了人RBM3基因的重组表达质粒,运用一种新型的、非放射性方法即翻译表面感应(surface sensing of translation,SUnSET)来检测RBM3过表达对细胞总蛋白质合成(global protein synthesis,GPS)的影响。结果显示,RBM3过表达使细胞总蛋白质的合成水平上调23. 7%(P 0. 001),这与RBM3过表达引发的真核翻译延伸因子2 (eukaryotic translation elongation factor 2,e EF2)及真核翻译起始因子2α(eukaryotic initiation factor 2α,eIF2α)的活性增高相一致。对RBM3可能的下游靶基因内质网蛋白3(reticulon 3,RTN3),以及Yes相关蛋白1 (Yes-associated protein 1,YAP1)的表达进行分析。结果显示,RBM3使RTN3及YAP1在蛋白质水平的表达分别提高了51. 7%(P 0. 01)与43. 3%(P 0. 01)。与蛋白质水平变化相比,RBM3使YAP1在mRNA水平上调了2. 0倍(P 0. 001),但对RTN3的mRNA表达未见显著影响。以上研究表明,SUnSET是一种稳定、可靠的细胞GPS的检测手段; RBM3可显著促进细胞GPS,且对其下游基因RTN3和YAP1存在靶向关系。本研究的结果为深入探讨RBM3的神经保护作用机制提供了理论基础。     

中科院上海生命科学研究院揭示端粒酶蛋白亚基与RNA亚基的相互作用

<正>2014年5月4日,Nature Structural and Molecular Biology在线发表中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所/国家蛋白质科学中心·上海(筹)雷鸣研究组的研究成果,揭示了端粒酶催化蛋白亚基与RNA亚基识别机制在进化上的保守性。这是目前相关研究领域关于端粒酶中蛋白-RNA复合物的首次晶体结构报道,其在分子水平上所提供的信息解决了长期困扰人们的端粒酶蛋白亚基与RNA亚基之间是如何相互作用的难题,为治疗端粒相关疾病的新型药物的研发开辟     

RNA结合蛋白质HuR通过增加YAP1 mRNA稳定性促进白血病细胞增殖

RNA结合蛋白质人类抗原R(Hu R)与多种实体肿瘤的发生发展密切相关,但其在人急性髓系白血病(acutemyeloidleukemia,AML)中的功能和分子机制仍未阐明。本研究收集了30例临床初诊的AML病人和30例正常对照的外周血,分离单个核细胞,进行RT-qPCR法检测。结果显示,与正常对照相比,HuR在AML病人中呈显著表达上调趋势(3.17±1.12,P<0.05)。在AML细胞系HL-60中的功能检测发现,敲低内源性HuR后,对HL-60细胞培养12 h(0.17±0.07),24 h(0.38±0.05),36 h(0.51±0.03),48 h(0.69±0.05),60 h(0.92±0.08)和72 h(1.04±0.10)的增殖产生抑制作用(P<0.05)。同时,阻滞在G1期(47.3%±5.4)的HL-60细胞比例显著升高(P<0.05),而S期(37.5%±6.9)细胞比例显著降低(P<0.05)。相反,HuR的表达抑制对HL-60细胞向单核系分化产生促进作用。RNA免疫共沉淀法检测发现,HuR可与Hippo通路的Yes相关蛋白1关键效应基因(YAP1)的mRNA结合。后续的RNA稳定性检测发现,HuR的结合可以增强YAP1 mRNA的稳定性,进而促进YAP1的表达,并进一步影响YAP1下游基因的转录。综上所述,RNA结合蛋白质HuR可通过促进Hippo通路YAP1的表达参与AML发生发展的调节。     

铁死亡相关基因ACSL4、TFRC及Hippo通路关键分子YAP在间皮瘤组织中的表达及意义

摘要 目的：分析铁死亡相关基因长链酯酰辅酶A合成酶4（acyl-CoA synthetase long chain family member 4,ACSL4）、转铁蛋白受体（transferrin receptor, TFRC）及Hippo通路关键分子Yes相关蛋白（Yes-associated protein,YAP）在间皮瘤组织中的表达水平、相关性及意义,观察YAP活化对间皮瘤细胞系211H侵袭转移能力及铁死亡敏感性的影响。方法：应用组织芯片技术和免疫组化法观察ACSL4、TFRC及YAP在30例间皮瘤组织和10例正常组织中的表达,分析蛋白水平及分布的相关性。GEPIA数据库分析基因ACSL4、TFRC和YAP在间皮瘤组织中的mRNA水平相关性。应用逆转录病毒载体于211H细胞中过表达活化型YAP S127A (serine-127突变为alanine),利用实时荧光定量PCR检测ACSL4及TFRC表达;利用划痕实验和transwell侵袭实验检测211H细胞迁移及侵袭能力;利用erastin刺激及SYTOX Green染色检测铁死亡敏感性。结果：间皮瘤组织中YAP细胞核表达、ACSL4及TFRC阳性表达率显著高于正常组织,差异均有统计学意义（P<0.001,P<0.001,P<0.0001）。经Spearman秩相关检验,ACSL4及TFRC蛋白在间皮瘤中的表达呈正相关(Spearman r=0.61,P=0.0003);YAP在细胞核中的表达与ACSL4表达呈正相关(Spearman r=0.4872,P=0.0063)。GEPIA 数据库分析发现,YAP与ACSL4、ACSL4与TFRC在间皮瘤中的mRNA表达水平均呈正相关（Spearman r=0.33, P=0.0019;Spearman r=0.52,P=0.0000）。表达活化型YAP的211H细胞,ACSL4与TFRC mRNA水平与对照细胞相比均上调;迁移侵袭能力增强;铁死亡敏感性增强。结论：YAP、ACSL4及TFRC在间皮瘤组织中表达具有正相关性;YAP活化促进间皮瘤细胞侵袭转移能力,同时通过ACSL4及TFRC提高细胞对铁死亡诱导的敏感性。YAP、ACSL4及TFRC有望成为预测间皮瘤铁死亡敏感性的潜在生物学标志物。     

《自然-免疫学》:研究发现免疫炎症"刹车分子"

<正>中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所/国家蛋白质科学中心·上海周兆才研究组在一项最新研究中,发现了生发中心激酶MST4直接靶向TRAF6,从而调控免疫炎症信号通路的分子机制,为免疫炎症相关疾病的诊疗提供了新的思路。相关研究成果2月2日在线发表于《自然-免疫学》。在天然免疫应答过程中,Toll样受体首先识别病原特有的相关分子模式,然后通过中转信号分子TRAF6,迅速激活免疫炎症反应,以达到清     

Hippo信号对卵巢生殖干细胞增殖及卵巢功能的影响

已有研究表明,Hippo信号通路对干细胞的自我更新和分化至关重要,且Hippo信号通路在调控卵泡生长中起重要作用,然而,目前关于Hippo通路对卵巢生殖干细胞的增殖和分化以及卵巢功能重塑的影响相关的研究较少。为了明确Hippo信号通路效应因子YAP1与卵巢生殖干细胞体外增殖分化的关系,以及Hippo信号通路对卵巢癌的主要功能。我们采用两步法酶促分离和磁性分离技术分别鉴定卵巢生殖干细胞,通过测定MVH和OCT4标记物的表达,然后选择YAP1作为Hippo信号通路的主要效应分子,作为研究的靶基因。将含有过表达的YAP1或YAP1靶向的shRNA的慢病毒转导入卵巢生殖干细胞中。通过将过表达YAP1或YAP1 shRNA的慢病毒载体微量注射到不育小鼠模型中,观察调节Hippo信号通路对卵巢的增殖、分化和内分泌功能的影响。研究结果表明,在分离的卵巢生殖干细胞中观察到YAP1和MVH的共表达。与对照组相比,过表达YAP1的卵巢生殖干细胞中MVH和OCT4表达水平显著增加。而YAP1敲低后,MVH和OCT4水平显著降低;不育小鼠模型中YAP1过表达15 d后,E2和FSH含量显著升高,而YAP1 shRNA表达后,小鼠血清E2和FSH含量显著降低。YAP1可用于调控卵巢生殖干细胞的增殖和分化以及小鼠的卵巢功能。本研究表明,Hippo信号通路可能是调控卵巢功能重建的一个新的分子靶点。     

I型子宫内膜癌组织Amot、YAP1蛋白表达与临床病理参数和预后的关系研究

摘要 目的：研究I型子宫内膜癌（EC）组织中血管生成抑制素结合蛋白（Amot）、Yes相关蛋白1（YAP1）表达与临床病理特征和预后的关系。方法：选取自2014年01月至2017年6月期间徐州医科大学附属医院诊治的75例Ⅰ型EC患者为研究对象（EC组）,以同期诊治的30例病理证实的非典型增生子宫内膜组织标本为非典型增生子宫内膜组,以30例同期经病理证实的正常子宫内膜组织标本为正常子宫内膜组。采用免疫组化法检测各组子宫内膜组织中Amot、YAP1 蛋白表达。采用Spearman秩相关性分析I型EC癌组织中Amot蛋白与YAP1蛋白表达的相关性。比较不同临床病理特征I型EC患者癌组织中Amot、YAP1 蛋白表达的差异。采用Kaplan-Meier生存曲线分析Amot、YAP1蛋白表达与I型EC患者生存预后的关系,单因素及多因素COX回归分析影响I型EC患者生存预后的因素。结果：I型EC癌组织中Amot、YAP1 蛋白阳性表达率分别为80.00%（60/75）、85.33%（64/75）,明显高于非典型增生子宫内膜组织中Amot、YAP1 蛋白阳性表达率43.33%（13/30）、46.67%（14/30）,差异具有统计学意义（均P＜0.05）;非典型增生子宫内膜组织中Amot、YAP1 蛋白阳性表达率明显高于正常子宫内膜组织16.67%（5/30）、20.00%（6/30）,差异具有统计学意义（均P＜0.05）。I型EC癌组织中Amot与YAP1蛋白表达呈正相关（P＜0.05）。不同国际妇产科联盟（FIGO）分期、组织学分级及淋巴结转移情况I型EC患者癌组织中Amot、YAP1蛋白阳性表达率比较差异具有统计学意义（P＜0.05）。Amot阳性表达Ⅰ型EC患者累积生存时间明显低于Amot阴性表达Ⅰ型EC患者（P＜0.05）。YAP1阳性表达Ⅰ型EC患者累积生存时间明显低于YAP1阴性表达Ⅰ型EC患者（P＜0.05）。Amot蛋白阳性表达、YAP1蛋白阳性表达、FIGO分期Ⅲ期及伴淋巴结转移是影响I型EC患者不良预后的独立危险因素（P＜0.05）。结论：I型EC子宫内膜癌组织中Amot、YAP1 蛋白阳性表达升高,两者阳性表达与FIGO分期、组织学分级及淋巴结转移有关,Amot蛋白、YAP1蛋白阳性表达是影响I型EC患者预后不良的危险因素之一。     

YAP蛋白核过表达与卵巢癌腹膜及淋巴结转移的相关性分析

目的:探讨Yes相关蛋白(YAP)与卵巢癌腹膜及淋巴结转移的相关性。方法:选择148例原发性卵巢癌和30例正常卵巢石蜡切片标本,采用Western blot、免疫组化分析YAP蛋白在正常卵巢组织、非转移性卵巢癌组织及转移性卵巢癌组织中的表达,分析YAP蛋白在卵巢癌组织中的表达与临床病理特征的关系,并应用单因素及多因素logistics分析卵巢癌腹膜和淋巴结转移的独立危险因素。结果:YAP蛋白在正常卵巢组织、非转移性卵巢癌组织及转移性卵巢癌组织中的表达量依次增高,两两比较差异均有统计学差异(P0.05)。YAP蛋白核过表达与组织学分化、残余病灶、复发、腹膜转移以及淋巴结转移均显著相关(P0.05)。YAP蛋白核过表达是独立的影响卵巢癌腹膜(OR:5.443;95%CI:2.287-12.950;P0.001)和淋巴结转移(OR:4.477;95%CI:2.059-9.735;P0.001)的独立危险因素。结论:YAP基因核过表达与卵巢癌腹膜转移及淋巴结转移密切相关,有可能作为临床上预测卵巢癌腹膜及淋巴结转移的新的分子标记物。     

YAP甲基化修饰促进肥胖发生的机制研究

肥胖引起的并发症日益增多,严重影响人们的生理心理健康.该研究发现,YAP甲基化可以调节脂肪酸合成氧化促进肥胖的发生.使用Yap K327M(YAP第327位赖氨酸发生单甲基化修饰)转基因小鼠证明YAP甲基化修饰与肥胖表型的关系;采用qRT-PCR检测方法分析YAP甲基化对脂肪酸合成和氧化过程中关键基因表达水平的影响;运...     

甲状腺癌超声弹性成像定量参数与叉头盒A1、Yes相关蛋白的相关性研究

摘要 目的：探讨甲状腺癌患者的超声弹性成像（UE）定量参数及其与叉头盒A1（FOXA1）、Yes相关蛋白（YAP）的相关性。方法：选择2019年3月-2020年10月于本院就诊的142例甲状腺结节患者的临床资料,所有患者均为单发甲状腺结节,根据病理结果分为恶性组（72例,72个甲状腺结节）与良性组（70例,70个甲状腺结节）,所有患者行UE检查、组织活检。比较恶性组与良性组的弹性评分、应变率比值（SR）的差异,并分析恶性组的弹性评分、SR值与FOXA1、YAP的相关性。结果：恶性组的弹性评分、SR值显著高于良性组,差异有统计学意义（P<0.05）。恶性组FOXA1、YAP表达显著高于良性组,差异有统计学意义（P<0.05）。恶性组的弹性评分、SR值与FOXA1、YAP表达呈正相关（P<0.05）。结论：甲状腺结节恶性组与良性组的弹性评分、SR值及FOXA1、YAP表达的差异显著,且恶性组的弹性评分、SR值与其FOXA1、YAP表达呈正相关,UE定量参数在一定程度上可反映甲状腺癌患者的恶性的生物学行为。