《生物信息学》课程教学方法探索与实践

从教学实践出发,探讨开设生物信息学选修课的教学大纲、内容及方法,为提高学生综合能力提供一种教学模式。     

生物信息学本科人才培养的调研与思考

近年来,生物信息学已经逐步发展成为现代生物学和医学等领域的关键技术方法,社会对生物信息学专业人才的需求不断扩大,生物信息学的本科教育也受到了越来越多的关注和重视。为了探索更加合理的人才培养模式、完善课程设置和教学计划,本文以中美两国开设生物信息学本科专业的高校为对象,分别选取一些代表高校并进行深入调研,对比分析课程设置和人才培养现状。结果显示,生物信息学的跨学科性质在各高校中均得到一定体现,培养学生具有多元化的知识结构已经成为生物信息学人才培养的一项共识。同时,根据调研的结果,也对国内生物信息学本科教育提出一些启发与建议。     

《生物信息学》课程教学模式探讨

在教学实践的基础上,结合生物信息学课程的学科特点,以及现代教育技术,就开设生物信息学课程的必要性及构建最合适的复合型教育模式展开了初步的探讨,为我国生物信息学课程的教学实施提供指导。随着时代的不断进步和发展,生物信息学的内涵也在不断扩大,包括生物信息学所涉及到的计算机基础知识、生物学基础知识、生物信息学研究领域、生物信息学应用领域等等。在生物信息学的教学实施过程中,将多个基础学科交叉融合是必备的,这不仅有助于增强学生对生物信息学科的了解,也对于学生在后续的生物信息学研究中起到了基石的作用。因此,如何将这些涉及范围广、涉及内容深的生物信息学基础课程恰当的传授给学生是教师们最需要考虑的问题,从而形成一套独特的教学体系,使生物信息学的教学工作更顺利,完整的进行下去。     

信息技术与生物信息学实验教学整合的探索与实践

在生物信息学实验教学中,通过优化实验内容,构建多媒体网络同步教学系统为基础的生态课堂,实现了信息技术与生物信息学实验教学的有效整合,极大地提高了实验教学的效果,有利于创新人才的培养。     

《生物信息学》征稿

1.征稿范围:生物信息各分支领域及相关领域。包括基因组学、蛋白质组学、糖原组学、高通量药物筛选、组合化学、统计遗传学、生物数据挖掘、生物数据库、生物软件等。2.征稿体例:研究论文、研究简报、综述进展、学科前沿、论坛、技术与方法、研究快讯(Letter)、评论、动态、产业报道、知识产权、新书推介、展会报道等。     

生物信息学创新教学模式初探

生物信息学是生物科学中一门新兴的前沿学科。针对目前国内生物信息学教学现状,基于其他学科的成功教学模式,结合生物信息学课程特点,提出“以知识为中心,理论教学与实验教学有机结合”的教学模式。     

生物信息学本科专业建设现状

随着后基因组时代的到来,生物信息学逐渐进入了黄金发展期。生物信息学教育体系的建立和完善是永葆生物信息学活力的关键。国际和国内的生物信息学本科专业建设情况的分析显示全球生物信息学本科教育均处于起始阶段。深刻剖析了内蒙古自治区生物信息发展的瓶颈问题以及内蒙古科技大学开设生物信息学本科专业的优势和必要性。未来,随着测序技术、计算机技术等的进步,生物信息学将继续蓬勃发展;生物信息学人才的需求将不断扩大。为适应人才市场的需求,预计会有越来越多的高等院校将加入到中国的生物信息学本科教育事业。     

非专业研究生生物信息学课程教学中存在的问题及对策

生物信息学是一门多学科交叉的核心学科,对生物医学研究和发展有着巨大的推动作用。对非专业研究生生物信息学课程教学进行剖析,阐述了生物信息学课程的适用对象,总结了教学中存在的供需矛盾及课程教学中存在的问题,并提出了相应对策,为进一步提高非专业研究生生物信息学课程教学质量提供参考。     

植物生理学实验课程现代课堂教学

针对植物生理学课程的特点,系统介绍了现代课堂实验教学的模式和做法,将素质教育贯穿整个实验教学过程,为实验教学质量的综合评估奠定基础。     

本科生“分子生物学实验”课程设计的改革与探索

"分子生物学实验"是分子生物学理论课配套的实验课。掌握分子生物学基本实验技术是生命科学对新时代人才发展的基本需求。上海科技大学通过整合教学资源与实验室资源,对传统本科生"分子生物学实验"的教学内容和体系进行调整,建立了一套基础实验与前沿实验相结合、验证性实验和自主设计性实验相结合的教学体系,为提高本科生"分子生物学实验"课程教学质量和培养综合型人才奠定了基础。     

Capabilities of bioinformatics tools for optimizing physicochemical features of proteins used in Nano biosensors: A short overview of the tools related to bioinformatics

Protein-protein ligand is one of the most detection methods used in Nano biosensors. Based on the advantage of specific docking between two special 3D structures, they have become a potent candidate in bioanalysis and Nanodiagnostic tools. These tools lease users to do a simple, fast, cost-effective, sensitive, and specific detection of molecular biomarkers in real samples. Recent advantages of using protein-protein ligand Nano-biosensors application is remarkable due to its special docking that refers to each protein unique 3D conformation. However, it challenges different problems such as low rate of docking and hard process for fixation on the basic layer. These challenges make developers to optimize the structure and functions of proteins. The process has different Nano scale calculation that could be done with algorithms and solutions are available as bioinformatics tools. This article aimed to have a short overview of the abilities of bioinformatics tools for modeling and optimization of physiochemical features of proteins in Nano scale.     

农林院校生物信息学专业数据库技术课程教学改革刍议

生物信息学是一门交叉学科,对于现代生物学研究具有重要的意义。数据库技术是生物信息学的基础之一。本文对农林院校的生物信息学专业的数据库技术课程的教学现状做了一些介绍,对目前生物信息专业数据库教学存在的问题进行了分析。结合教学的实践,有针对性的提出了一些教学改革的具体措施。     

BioManager: the use of a bioinformatics web application as a teaching tool in undergraduate bioinformatics training

The completion of the human genome project, and other genome sequencing projects, has spearheaded the emergence of the field of bioinformatics. Using computer programs to analyse DNA and protein information has become an important area of life science research and development. While it is not necessary for most life science researchers to develop specialist bioinformatic skills (including software development), basic skills in the application of common bioinformatics software and the effective interpretation of results are increasingly required by all life science researchers. Training in bioinformatics is increasingly occurring within the university system as part of existing undergraduate science and specialist degrees. One difficulty in bioinformatics education is the sheer number of software programs required in order to provide a thorough grounding in the subject to the student. Teaching requires either a well-maintained internal server with all the required software, properly interfacing with student terminals, and with sufficient capacity to handle multiple simultaneous requests, or it requires the individual installation and maintenance of every piece of software on each computer. In both cases, there are difficult issues regarding site maintenance and accessibility. In this article, we discuss the use of BioManager, a web-based bioinformatics application integrating a variety of common bioinformatics tools, for teaching, including its role as the main bioinformatics training tool in some Australian and international universities. We discuss some of the issues with using a bioinformatics resource primarily created for research in an undergraduate teaching environment.     

对微生物工程类虚拟仿真实验建设与共享应用的思考

微生物工程是一门实践性和应用性较强的课程.让学生走进企业的生产线进行实践性学习是必不可少的教学环节.实习资源不足一直是限制微生物工程课程开展高水平实习教学的瓶颈.利用信息技术搭建的虚拟化生产线不但可以使学生从中学习复杂的生产系统中的理论性知识,还能进行更深层次的虚拟操作,从而促进学生实践能力和创新能力的形成.为了更好地...     

在遗传学课堂教学中培养本科生科研素质

课堂是本科教学的主要场地,充分利用课堂教学培养本科生的科研素质,是一个值得思考的教改问题。本文从系统架构课程内容体系、教学内容反映科研进展、知识点的讲解反映其科研活动、用PPT动画讲解科学原理和实验过程、用双语教学提高专业英语阅读能力、考试考察学生的科研分析能力6个方面介绍了作者多年来在遗传学课堂教学中培养学生科研素质的教改措施与实践经验。这些改革措施有利于激发本科生的学习积极性,培养本科生发现问题、分析问题和解决问题的科学思维能力,提高本科生的科技英语阅读能力和文献查阅能力,为本科生进入科研领域奠定了良好的基础。     

生物信息学及其在新药发现中的应用

人类基因组计划和蛋白质组计划的开展,为生物医药研究提供丰富的生物学信息。而在这纷繁复杂的生物信息中寻找合适的药物作用靶标是生物信息学的重要目的之一。目前,生物信息学已成为新药发现的重要工具和手段。