《生物信息学》课程教学模式探讨

在教学实践的基础上,结合生物信息学课程的学科特点,以及现代教育技术,就开设生物信息学课程的必要性及构建最合适的复合型教育模式展开了初步的探讨,为我国生物信息学课程的教学实施提供指导。随着时代的不断进步和发展,生物信息学的内涵也在不断扩大,包括生物信息学所涉及到的计算机基础知识、生物学基础知识、生物信息学研究领域、生物信息学应用领域等等。在生物信息学的教学实施过程中,将多个基础学科交叉融合是必备的,这不仅有助于增强学生对生物信息学科的了解,也对于学生在后续的生物信息学研究中起到了基石的作用。因此,如何将这些涉及范围广、涉及内容深的生物信息学基础课程恰当的传授给学生是教师们最需要考虑的问题,从而形成一套独特的教学体系,使生物信息学的教学工作更顺利,完整的进行下去。     

面向生物信息学的工作流管理系统框架

生物信息学实验的实施通常需要整合多种类型的数据和工具,随着大量的web服务、算法程序和分析工具的出现,如何高效整合这些可用资源共同完成分析实验是当前生物信息学研究的重要内容之一,工作流技术已经成为解决这类问题的一种通用机制.然而,生物信息学工作流的实施涉及高通量数据的计算与存储,同时面临着资源异构性和分布性的挑战.本文首先介绍了生物信息学工作流的基本机制,然后阐述了面向生物信息学的工作流管理系统框架,最后讨论了框架应用中存在的问题和可能的解决途径.     

自然语言处理技术在生物信息学中的应用

从信息处理的角度来看,生物信息学与自然语言处理中的许多问题是非常相似的,因此,可以将一些自然语言处理中的经典方法应用到生物信息学文字中。本文介绍了自然语言处理和生物信息学中共有的问题,如比对、分类、预测等,以及这些问题的解决方法。通过对两个领域形似问题的分析可知,优秀的自然语言处理技术也可用来解决生物信息学方面的问题,并且一些还未在生物信息学领域得到应用的自然语言理解技术也有其潜在的应用价值。最后给出了一个分类问题的解决方案,演示了如何在生物数据上应用算法进行实验。     

数据挖掘在生物信息学中的应用——文献计量学视角

基因组和蛋白质结构与功能方面已积累了海量数据。如何从海量数据中获取有效信息成为生物信息学迫切要解决的问题。本文以相关主题词检索文献,分析了该领域历年文章数量、发文最多的机构和作者、被引用频次居前论文、期刊载文量,并对关键词和被引用频次居前论文的作者进行共现分析。我们发现,生物信息学中运用数据挖掘方法的文献逐年增多,该领域30.1%的文献发表在十个期刊上,分类、聚类、特征选择和支持向量机等数据挖掘方法使用较多。本研究描绘了生物信息学与数据挖掘这一交叉领域的研究概况,为后续数据挖掘方法与生物信息学研究相结合提供帮助。     

自建和选用微生物信息学平台辅助“生物信息学”课程教学探索

"生物信息学"课程主要讲授生物信息分析技术及其在动植物和微生物学研究领域中的应用。随着课程涉及的多种信息学分析软件和算法的不断开发和使用,应用领域也在不断拓展,因而其教学内容也需不断发展和更新。本文主要从不断发展和自建的微生物信息学平台如何辅助教学角度,探讨研究生"生物信息学"课程的教学模式及其实践效果。我们基于自建微生物信息学分析平台,以强化研究生解决实际问题和创新能力培养为目标,在教学内容、教学手段、授课方式和考核标准4个方面积极探索,建立了适合我校微生物学相关专业研究生培养目标的课程设置、启发式教学模式和成绩评价方式,促进了研究生培养质量和水平的提升。     

生物信息学的研究现状及其发展问题的探讨

结合生物信息学产生的历史条件,对生物信息学的定义进行了介绍;归纳总结了现代生物信息表述、采集、储存、传递、检索的表现形式-生物学数据库的分类与分布;着重介绍了生物信息学的主要研究内容和基本的分析方法,阐明了生物信息的分析和解读模式;强调了生物信息学与其他相关学科的相关性,提出了生物信息学发展的一些亟待解决的问题及其相应的解决方案。     

基于微阵列数据构建的基因通路分析软件的研究进展

如今生物信息学领域有一个共识,即基因组学和蛋白组学研究产生了爆炸性的微阵列数据,如何利用这些数据构建基因调控网络也成为一个研究热点.文章利用相关的软件平台实现对基因调控网络的构建,并对网络进行分析,在生物信息学、系统生物学、生物医学等领域起着重要的作用.通过综合分析各种软件的特点,有利于帮助研究者根据自己的需要进行合理的选择.     

生物信息学本科专业建设现状

随着后基因组时代的到来,生物信息学逐渐进入了黄金发展期。生物信息学教育体系的建立和完善是永葆生物信息学活力的关键。国际和国内的生物信息学本科专业建设情况的分析显示全球生物信息学本科教育均处于起始阶段。深刻剖析了内蒙古自治区生物信息发展的瓶颈问题以及内蒙古科技大学开设生物信息学本科专业的优势和必要性。未来,随着测序技术、计算机技术等的进步,生物信息学将继续蓬勃发展;生物信息学人才的需求将不断扩大。为适应人才市场的需求,预计会有越来越多的高等院校将加入到中国的生物信息学本科教育事业。     

生物信息学在生物学研究领域的应用

综合叙述了生物信息学对生物学科研工作的影响,介绍了生物信息学在生物技术、生物医学、农业、食品、环境、能源等研究领域的应用概况,阐述了生物信息学为生物科研工作服务的意义。     

我国生物信息产业的现状及问题分析

针对我国生物信息产业的现状及存在的问题进行分析,介绍了生物信息学以及生物芯片研究的现状和新技术、生物信息产业的发展,并对生物信息产业的知识产权保护问题进行了分析和讨论。对于今后如何发展我国生物信息产业以及如何采取策略和措施提供参考。     

多维立体教学在细胞工程中的应用与实践

为提升工科专业课程教学质量,以成长记录袋课堂评价体系为基础,将多维立体教学法引入到高等院校生物类专业课程细胞工程的教学改革中,对课程的知识体系、施教形式、实施方案等开展了探索与实践。授课教师通过结合线上教学、互动教学、案例教学等多种教学模式的改革,不仅让生物工程专业的学生掌握了细胞工程的相关专业知识及科技前沿,更增强了学生的学习兴趣与积极性,提高了学生分析、解决与细胞工程相关的专业问题的能力,整体执行效果较好。本课程教学改革的实施,可为高校同类性质的其他专业课程提供借鉴与参考。     

《分子生物学》研究性教学初探

当前高等学校教学改革的一个重要特点在于倡导进行研究性教学,研究性教学成为现代教学理念的构成要素,它是对传统的传递式——被动接受式的教育理念的革新。这种教学模式有利于培养学生研究能力,提升教学的有效性。从理论教学、问题情境教学、实验教学、科研成果的引入等4个方面阐述在《分子生物学》教学中如何运用研究性教学模式,贯穿研究性教学理念,有效培养学生的研究能力。     

《生物信息学》课程教学方法探索与实践

从教学实践出发,探讨开设生物信息学选修课的教学大纲、内容及方法,为提高学生综合能力提供一种教学模式。     

以病例为基础的互动教学法提高口腔见习教学质量的探索

目的：为提高口腔科学教学质量,探索”以病例为基础的互动教学法”在口腔见习课教学中的效果。方法：五年制医学本科2007级125名学生为对照组口腔临床见习课教学中采用传统教学法,2008级120名学生为实验组采用以病例为基础的互动教学法,对这2组学生考试成绩进行分析,用P检验进行统计分析,同时进行问卷调查,比较两种教学方法的教学效果和学生的评价。结果：实验组学生的考核成绩优于对照组,差异有显著性;问卷调查表明实验组学生总体满意度较高,学习自我感觉较轻松,学生反应课程内容充实,对疾病的诊断、鉴别诊断、治疗设计、并发症等的认识更系统,且参与实践机会多,提高了学习的积极性。结论：”以病例为基础的互动教学法”能加强理论知识和临床病例的联系,提高学生的临床实践能力和自主学习能力,有助于提高教学效果。     

提高生物工程专业生物化学实验教学效果的改革探索

生物化学实验教学是生物化学教育的重要组成部分,要培养高素质、高能力的人才,提高实验教学质量势在必行。作者就生物化学实验教学方法、优化实验教学内容和加强实验教学管理等方面做了一些尝试,以求提高生物化学实验教学质量,获得最佳的实验教学效果。     

利用网络平台辅助遗传学教学的探索与实践

随着新技术的发展, 教学方法日趋丰富。在传统的教学基础上, 网络技术为教学过程搭建了新的平台。在遗传学教学中, 应用网络平台指导学生进行学习, 为提高学生的学习兴趣和进行自主性学习提供了可能。本教研组多年的探索与应用过程表明, 网络教学是遗传学教学中有效的辅助手段之一, 具有传统教学不可比拟的优势。文章就网络教学平台的构建、网络教学的优势与不足以及相应的对策进行了介绍。     

微生物学课程绪论课教学的探索与实践

绪论课教学在整个微生物课程教学中起着至关重要的作用。本文结合大连大学的教学目标从教学定位、教学实施2个方面对绪论课教学进行了探索,经过一定时间的实践,取得了较好的教学效果。     

PBL 结合案例教学法在病理生理学教学中的应用

以问题为基础(Problem-based learning,PBL)的教学法和案例教学法都是近年来我国医学教育改革中经常采用的两种新型教学方法。但二者从教学论方面来看,在教学材料的选择上、教学目的上都存在着差别。病理生理学是沟通基础和临床各学科间的桥梁学科,将"以问题为基础"的教学模式与案例教学法有机地结合引入病理生理学教学,符合病理生理学的学科特点,能够有效提高教学质量,在教育观念上更易于被医学生所接受,因而适应对高素质医学人才培养的需要。     

综合性大学医学院细胞生物学教学改革实践

就如何提高综合性大学医学院校中细胞生物学的教学质量进行了讨论,从如何合理组织优化教学内容,充分应用现代教学手段和教学方法提高课堂教学效果,开展实践性教学环节的改革,不断提高学生的分析问题和解决问题的能力等方面介绍了细胞生物学教学改革的方法和措施,并就如何进一步提高教学质量、激发学生学习积极性等方面进行探讨。     

基因工程学教学改进的探索和实践

基因工程学是生命科学相关专业重要的专业基础课。该课程的教学质量将直接影响学生的专业素质和创新能力的培养。文章根据近年来在基因工程学教学的实践中积累的经验和体会, 对教学内容和教学方式进行了探索和改进, 以提高理论教学质量和效果, 争取达到培养应用型人才和高级基础研究型人才的目的。