adr亚型乙型肝炎病毒DNA的酶切图谱分析

<正> 本文报道以pAT153质粒为载体克隆的adr亚型乙型肝炎病毒(HBV)全基因的限制性内切酶图谱。重组质粒已命名为pHBV-NCl。重组质粒的提取和酶解采用常规方法。限制性内切酶为Bio-Labs公司产品。用Sepharcry S-1000纯化得到的质粒,经电泳鉴定都是完整的超螺旋DNA。经过鉴定其BamHⅠ、XhoⅠ、XbaⅠ、SstⅡ、SphⅠ、BglⅠ、BglⅡ、BstEⅡ、AceⅠ、AvaⅠ、HincⅡ、HpaⅠ等12种酶的21个切口已被定位。其中XhoⅠ、XbaⅠ、SstⅡ、     

大尺蠖核多角体病毒DNA的限制性消化和物理图谱

用5种限制性核酸内切酶消化大尺蠖核多角体病毒(BsNPV)基因组DNA,所得片段数分别是:BamH Ⅰ,9;Bgl Ⅱ,7;Xho Ⅰ,10;HindⅢ 13;EcoR Ⅰ,12,从各个片段的累加测出BsNPV基因组的平均大小约为91,75kb;分子量约为59.60×10~6d。在单酶消化的基础上,用BamH Ⅰ/Bgl Ⅱ双酶消化得到16个片段(即9+7);大小为91,27kb,用、Bgl Ⅱ/Xho Ⅰ双酶消化产生7+10=17个片段,大小为90.04kb,由此组建了这三个酶在BsNPV基因组上的物理图谱。     

鸡肝脏线粒体DNA的限制图谱

本文用六种限制性内切酶对鸡肝脏线粒体DNA(mtDNA)进行了酶解。Eco RⅠ、Bam HⅠ、SalⅠ、HindⅢ、BglⅠ在鸡肝mtDNA上分别有2、2、3、4、4个切点,BglⅡ不能切割鸡肝mtDNA。根据鸡肝mtDNA的单酶、双酶完全酶解以及部分酶解片段的分子量,建立了鸡肝mtDNA的限制图谱。     

萘质粒ND1.860HindⅢ片段的分子克隆和限制酶图谱

萘质粒ND1.860经限制性核酸内切酶HindⅢ完全消化和部分消化所产生的限制片段,分别在大肠杆菌质粒pBR322中克隆。通过对含有ND1.860HindⅢ片段的17个重组质粒进行限制酶分析,建立了ND1.860质粒的HindⅢ、EcoRⅠ和XbaⅠ种内切酶26个切点的酶切图谱。     

长春地区引起婴幼儿肺炎的3、7型腺病毒分子流行病学研究

本文对长春地区1976年—1988年引起小儿肺炎的135株3.7型腺病毒核酸进行了限制性内切酶图谱分析,结果表明:75株7型腺病毒经BamHⅠ、BelⅠ、BglⅠ、XbaⅠ、SmaⅠ、HindⅢ分析后表现为二个基因组型—7b和7d。其中60株7b(88％),流行于1976—1988年;15株7d(12％)自1982年出现逐年增加,到1987—1988年的5株都是7d。60株3型腺病毒被BglⅡ、BamHⅠ分析后表现为三个基因组型,我们用3Ⅰ、3Ⅱ、3Ⅲ代表它们,其中S6株3Ⅰ(93.3％)流行于1976—1888年;3Ⅱ、3Ⅲ散在分布。通过临床资料整理,发现该地区3.7型腺病毒的不同基因组型在毒力致病性上存在着差别。     

油桐尺蠖核多角体病毒的基因型变异

本文用AvaⅡ、BamHⅠ、EcoRⅠ和HindⅢ四种限制性内切酶对油桐尺蠖核多角体病毒(Buzvra suppressaria Nuclear PolyhedrosisVirus)DNA作酶解图谱分析,比较了湖北、湖南、四川三个分离株的基因组。三者图谱基本相似,但少数片段略有不同。亚克分子片段的存在表明野生的油桐尺蠖核多角体病毒有基因型变异,包含着数个基因型变种。     

丁酰苷菌素产生菌Bacillus circulans3342质粒pBCl的分离及其性质

在氨基寡糖类抗生素丁酰苷菌素的产生菌Bacillus circulans 3342中发现了一种质粒DNApBC1,其分子量为9.0×10~6道尔顿。 用限制性内切酶BglⅠ、SmaⅠ和Hind Ⅲ酶切这种质粒DNA,构成了pBC1的限制性内切酶图谱。selⅠ、SmaⅠ和Hind Ⅲ分别将这种质粒DNA切为2、2和5条片段,EcoRI则切为4条片段,而SalⅠ、Bam HI和Pv(?) Ⅱ不能切这种质粒DNA。     

鳜及大眼鳜线粒体DNA比较研究

采用10种限制性内切酶HindⅢ、EcoRⅠ、BglⅠ、BglⅡ、BamHⅠ、PvuⅡ、PstⅠ、SalⅠ、XbaⅠ、XhoⅠ对鳜及大眼鳜肝脏线粒体DNA（mtDNA）进行了分析。鳜鱼mtDNA分子量为9.703×106u,大小为16．19kb;大眼鳜mtDNA分子量为9．603×106u,大小为16．02kb。根据单、双酶切结果构建了鳜及大眼鳜mtDNA10种酶限制性酶切图谱,并对两种鱼的mtDNA酶切图谱进行了比较。     

滑鼠蛇肝线粒体DNA的限制酶图谱

用六种限制性内切酶BamHⅠ、EcoRⅠ、PstⅠ、BglⅠ、BglⅡ和SalⅠ对滑鼠蛇肝脏线粒体DNA(mtDNA)进行酶解。发现BglⅡ、PstⅠ、BamHⅠ、BglⅠ和EcoRⅠ在滑鼠蛇肝mtDNA上分别有1、2、3、3和4个切点。SalⅠ不能切割滑鼠蛇肝mtDNA。根据滑鼠蛇肝mtDNA的单酶、双酶完全酶解及部分酶解片段的数目和分子量,建立了滑鼠蛇肝mtDNA的限制酶图谱。     

棒杆菌启动子片段的酶谱分析及定位

用大肠杆菌启动子探测质粒pSDS I (Ap^r,Tc^s)从钝齿棒杆菌(Corynebacterium crenatum)6282染色体的HindⅢ酶切片段中,克隆到两个具有启动功能的DNA片段,分别将两个重组质粒命名为pSDB5和pSDB21。含有这两个质粒的菌株均可以在含300μg/ml Tc的平板上生长。通过酶切分析,pSDB5的插入片段为1.6kb,pSDB21的插入片段为3.4kb,并分别作出了它们的限制性酶切图谱。对pSDB21利用其EcoR Ⅰ和BglⅡ位点,通过亚克隆删除了与启动功能无关片段,构建成pSDB210和pSDB211,从而使启动子定位于约0.1kb的BglⅡ/HindⅢ外源片段上。分子杂交实验证明所得到的这两个具有启动功能的DNA片段确实来源于钝齿棒杆菌6282的染色体DNA。     

The cDNA Cloning and Nucleotide Sequence of the Gene Encoding Nonstrucure Protein of Rice Dwarf Virus Genome Segment 10

The results of cloning and sequencing the gene encoding nonstructure protein of the rice dwarf virus (RDV) gtnome segment 10 with polymerase chain reaction(PCR) technique were reported. The amplified PGR product was cloned into Hind Ⅱ site of plasmid pGEM3zf(-) and analysed with restriction enzymes. The physical map of the cloned fragment has been constructed, the insert is 1150 bp in length with restriction enzyme sites of Sac Ⅰ, Hind Ⅲ, NdeⅠ, BamH Ⅰ, etc. Besides, two restriction enzyme sites Bgl Ⅱ and EcoR Ⅰ have been separetely added in the 5 and 3 end of the segment in order to be cloned into plant intermediate vector in a convenient way. The fragments cleaved by the above-mentioned restriction enzymes were subcloned and the DNA sequence of full length of segment 10 was determined. In comparison with the RDV epidemic in Japan, the nucleotide sequence and deduced amino acid sequence of cloned segment 10 are 96.03% and 97.17% in homology respectively.     

鲤鱼mtDNA酶切图谱的构建

采用密度梯度离心法及ＲＮａｓｅ消化法制备并纯化了鲤（ＧｙｐｒｉｎｕｓｃａｒｐｉｏＬｉｎｎａｅｕｓ）肝脏线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）,用１０种限制性内切酶对ｍｔＤＮＡ进行了分析,鲤鱼ｍｔＤＮＡ分子量约１０．１２×１０￣６,约１６．４９ｋｂ．ＳａｌⅠ、ＰｓｔⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＸｂａⅠ、ＢｇｌⅠ、ＰｖｕⅡ、ＸｈｏⅠ、ＥｃｏＲⅠ、ＤｒａⅠ和ＨｉｎｄⅢ分别为１、１、３、３、３、４、１、４、４、和６个切点。根据单酶解及双酶解结果,构建了鲤ｍｔＤＮＡ１０种具酶３０个切点的限制性酶切图谱。     

用富集文库克隆人胰岛素基因组基因

通过构建可富集人胰岛素基因的λ噬菌体文库,克隆了人胰岛素基因组基因．首先从中国人血液白细胞中提取到人基因组ＤＮＡ,用ＥｃｏＲⅠ和ＢｇｌⅡ对基因组ＤＮＡ进行全酶切,经０．４％琼脂糖凝胶电泳,特异回收９．５ｋｂ左右的ＤＮＡ片段．将该片段与λＥＭＢＬ３／ＢａｍＨⅠ臂连接,构建成一个特殊的人基因组λ噬菌体文库（富集文库）,效价为２×１０４．同时采用ＰＣＲ方法及用引物Ⅰ：５′ＧＧＡＣＡＧＧＣＴＡＣＡＴＣＡＧＧＡＡＧＡＧＧ３′,引物Ⅱ：５′ＣＴＧＣＧＴＣＴＡＡＴＴＧＣＡＧＴＡＧＴＴＣ３′,从人基因组ＤＮＡ中扩增出一段含胰岛素基因的１．３６ｋｂＤＮＡ片段,做为放射性标记探针,对文库进行了噬菌斑原位杂交筛选,从１×１０４个噬菌斑中筛选到一个含人胰岛素基因组基因的阳性克隆,并进一步完成了亚克隆和该基因１７３２ｂｐＤＮＡ序列的测定．结果该基因的１７３２ｂｐＤＮＡ序列包括部分５′端和３′端与国外发表的人胰岛素α型等位基因的序列相同     

pBR322DNA与8-甲氧补骨脂素光化学反应部位的碱基顺序特异性

用限制性核酸内切酶酶切试验研究了质粒pBR322 DNA经8-MOP及近紫外线作用后损伤部位的碱基顺序特异性。实验研究发现PUVA损伤的DNA在HindⅢ及RsaⅠ识别位置上酶切反应受到严重抑制,而在SphⅠ,EcoRⅠ,PvuⅡ,BamHI,PstⅠ识到位置上抑制轻微。通过对不同识别位置上碱基顺序及其光化学反应敏感性的分析,推断出DNA的TpA顺序可能是最易接受8-MOP光化学反应的部位。     

人促红细胞生成素基因组基因和cDNA的克隆及其在COS－7细胞中的表达

利用ＰＣＲ技术,从正常人胎肝染色体ＤＮＡ中克隆到长度为１５７２ｂｐ的人促红细胞生成素（ＥＰＯ）基因组基因片段,它包含除第一个外显子和第一个内含子外所有外显子及内含子。再人工合成１３ｂｐ外显子１的编码区,并与１５７２ｂｐ片段拼接,从而得到除第一个内含子的人促红细胞生成素基因组基因。将克隆得到的ＥＰＯ基因插入载体ｐＳＶ２－ｄｈｆｒ得到ｐＳＶ２－ＥＰＯ表达载体,转染ＣＯＳ－７细胞后获得高效表达。利用自行研制的小鼠抗人ＥＰＯ单抗及兔抗人ＥＰＯ多抗,对表达产物进行ＥＬＩＳＡ定量测定,细胞分泌ＥＰＯ量高达２５１±７Ｕ／ｍｌ．Ｋｒｙｓｔａｌ法测得体外生物活性２４１．５±６．５Ｕ／ｍｌ．用ＥＰＯ单抗免疫沉淀结合ＳＤＳ－ＰＡＧＥ对转染细胞的表达产物做了进一步鉴定,清晰地看到了ＥＰＯ条带。从高效表达ＥＰＯ的转染细胞中分离纯化ｍＲＮＡ,用ＲＴ－ＰＣＲ方法扩增并克隆到ＥＰＯ的ｃＤＮＡ,这为ＥＰＯ在其它系统中的表达及ＥＰＯ的功能与结构的研究打下了基础。     

桃蚜自然种群初级和次级共生菌的分子鉴定

蚜虫不仅带有专性初级内共生菌,还常常带有不同类群的兼性次级共生菌。本研究采用真细菌16S rDNA的通用引物,从桃蚜Myzus persicae (Sulzer)烟草种群体内扩增出1.5 kb的共迁移目的条带,然后将其克隆,并在阳性克隆筛选时进行了RFLP分析。当采用EcoRⅠ进行单酶切分析时,目的片段被切割成～650 bp和～850 bp两个小片段;当采用EcoRⅠ和HindⅢ进行双酶切分析时,该蚜群共生菌酶切谱带被分成2组,其中1组(GroupⅠ)只具有一个EcoRⅠ酶切位点,而另1组(Group Ⅱ)不仅具有一个EcoRⅠ酶切位点,还具有一个HindⅢ酶切位点,而且GroupⅠ为优势共生菌群。在此基础上分别对2组共生菌的16S rDNA全序列（～1.5 kb）进行了测定,结果表明：GroupⅠ属于泛菌属Pantoea,与成团泛菌Pantoea agglomerans亲缘关系最近（同源性达99.70%）,而Group Ⅱ属于蚜虫的专性内共生菌,即Buchnera aphidicola（同源性达99.50%）。这是在蚜虫体内存在泛菌次级共生菌的首次报道。     

Characterization of restriction endonuclease maps of hepatitis B viral DNAs

The HBV DNA isolated from Dane particles of 9 patients' plasma was cloned into the EcoRI or BamHI site of the pUC8 plasmids. Two plasmids with full length HBV DNA and four plasmids containing the HBV surface antigen gene were obtained. Based on our cloned HBV DNA and a comparison with 7 complete sequences and 5 restriction endonuclease patterns of HBV DNA published by others, we can recognize common restriction sites shared by different subtypes (adw, adr, ayw, and adyw): (1) a HincII site in the S gene, (2) a BamHI site in the X region, and (3) two BglII sites in the C gene. In addition adw has specific sites for HincII, BamHI, and PstI in the pre-S region. A unique XhoI site is present in the pre-S region in all subtypes except for adw.     

Genome organization of RNA tumor viruses II. Physical maps of in vitro-synthesized Moloney murine leukemia virus double-stranded DNA by restriction endonucleases.

Physical maps of the genome of Moloney murine leukemia virus (M-MLV) DNA were constructed by using bacterial restriction endonucleases. The in vitro-synthesized M-MLV double-stranded DNA was used as the source of the viral DNA. Restriction endonucleases Sal I and Hind III cleave viral DNA at only one site and, thus, generate two DNA fragments. The two DNA fragments generated by Sal I are Sal IA (molecular weight, 3.5 x 10(6)) and Sal IB (molecular weight, 2.4 x 10(6)) and by Hind III are Hind IIIA (molecular weight, 3.6 x 10(6) and Hind IIIB (molecular weight, 2.3 x 10(6)). Restriction endonuclease Bam I generates four fragments of molecular weights of 2.1 x 10(6) (Bam IA), 2 X 10(6) (Bam IB), 1.25 X 10(6) (Bam IC), and 0.24 x 10(6) (Bam ID), whereas restriction endonuclease Hpa I cleaves the M-MLV double-stranded DNA twice to give three fragments of molecular weights of 4.4 x 10(6) (Hpa IA), 0.84 X 10(6) (Hpa IB), and 0.74 x 10(6) (Hpa IC). Digestion of M-MLV double-stranded DNA with restriction endonuclease Sma I produces four fragments of molecular weights of 3.9 x 10(6) (Sma IA), 1.3 X 10(6) (Sma IB), 0.28 X 10(6) (Sma IC), and 0.21 x 10(6) (Sma ID). A mixture of restriction endonucleases Bgl I and Bgl II (Bgl I + II) cleaves the viral DNA at four sites generating five fragments of approximate molecular weights of 2 x 10(6) (Bgl + IIA), 1.75 X 10(6) (Bgl I + IIB), 1.25 X 10(6) (Bgl I + IIC), 0.40 X 10(6) (Bgl I + IID), and 0.31 x 10(6) (Bgl I + IIE). The order of the fragments in relation to the 5' end and 3' end of the genome was determined either by using fractional-length M-MLV double-stranded DNA for digestion by restriction endonucleases or by redigestion of Sal IA, Sal IB, Hind IIIA, and Hind IIIB fragments with other restriction endonucleases. In addition, a number of other restriction endonucleases that cleave in vitro-synthesized M-MLV double-stranded DNA have also been listed.     

小鼠survivin基因重组真核表达载体的构建及鉴定

目的：应用质粒pEGFP-N1构建含小鼠survivin基因的重组真核载体。方法：采用Oligo核酸软件对Genbank上所发表的小鼠survivin mRNA序列进行分析,自行设计一对分别含有HindⅢ、BamHⅠ酶切位点的survivin基因上下游引物,利用PCR扩增出该基因的全序列cDNA,并将其定向克隆入pEGFP-N1的多克隆位点,构建pEGFP-N1/survivin重组真核表达载体。然后通过卡那霉素抗性筛选、双酶切及PCR鉴定,选取鉴定正确的克隆测序。结果：双酶切与测序结果表明目的基因序列克隆正确,成功构建了含有小鼠survivin基因的重组真核表达载体。结论：重组真核表达载体pEGFP-N1/survivin构建成功,为下一步研究sur-vivin在未成熟树突状细胞中诱导分化与致耐受作用奠定基础。