三重RT-PCR同步检测马铃薯多种病毒影响因素

根据病毒外壳蛋白区序列设计PVX、PVS特异性引物对,根据P1基因区序列设计PVA特异性引物对,应用三重RT-PCR同步检测马铃薯X病毒,马铃薯A病毒及马铃薯S病毒,分别得到562bp、255bp、182bp大小的扩增片段。试验从反转录反应、PCR反应及循环条件3方面讨论了试剂和循环条件对三重RT-PCR同步检测3种病毒的影响。结果表明反转录反应中dNTPs浓度、3种病毒下游引物浓度比例对整个反应影响较大;其次是PCR反应中MgC12浓度和退火温度;反转录时间,循环条件对RT-PCR影响较小。     

三重RT-PCR同步检测马铃薯多种病毒影响因素*

根据病毒外壳蛋白区序列设计PVX、PVS特异性引物对 ,根据P1基因区序列设计PVA特异性引物对 ,应用三重RT PCR同步检测马铃薯X病毒 ,马铃薯A病毒及马铃薯S病毒 ,分别得到 5 62bp、 2 5 5bp、 1 82bp大小的扩增片段。试验从反转录反应、PCR反应及循环条件 3方面讨论了试剂和循环条件对三重RT PCR同步检测 3种病毒的影响。结果表明反转录反应中dNTPs浓度、 3种病毒下游引物浓度比例对整个反应影响较大 ;其次是PCR反应中MgCl₂ 浓度和退火温度 ;     

河北省丙型肝炎病毒基因分型研究

丙型肝炎病毒 (Hepatitis C virus, HCV)感染是输血后肝炎的主要原因[1],主要通过输血或使用污染的血制品传播[2],且与肝硬化和肝细胞癌的发生有密切关系.     

2例PCR扩增失败的分析与探讨

根据GenBank报道的序列设计引物,PCR扩增克隆玉米乙醇脱氢酶1(Adh)核基质结合区序列及大鼠脑啡肽基因。扩增的序列电泳分析条带与预期的片段大小基本一致,但测序分析均为非目的片段,为非特异PCR产物,一例为非靶序列间的重复序列配对造成,一例为一侧引物单独引起,重新设计引物,采用巢式PCR获得了目的基因片段。     

采用半巢式RT-PCR检测兰州地区住院肺炎患儿下呼吸道分泌物中的RSV

从人呼吸道合胞病毒(hRSV)基因序列中高度保守的N基因处,设计了特异性半巢式引物,以反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法随机检测了46份兰州地区2007年春季住院肺炎患儿下呼吸道分泌物样本。结果46份样本中有19份扩增出了预期目的片段,对所有扩增产物进行基因序列测定。结果表明19份样本均有RSV感染,其检出率为41%,而且序列分析结果显示,所有RSV阳性样本均与RSVA亚型的同源性高于B亚型。     

RT-PCR一步法检测甲型肝炎活病毒方法的建立

建立灵敏、特异、快速检测甲型肝炎活病毒(HAV)的方法。提取HAV总RNA,选用HAV高保守区为目标区,设计合成一对引物,通过RT-PCR反应扩增其核酸,用琼脂糖凝胶电泳法检测其扩增产物,紫外灯下观察,约200bp处为目标片段,根据观察结果,计算HAV滴度。RT-PCR一步法快速、灵敏、重复性好、特异性强,可用于甲型肝炎活病毒检测。     

牛流行热病毒LUX~(TM)荧光RT-PCR检测方法的建立

采用LUXTM荧光PCR技术原理,以牛流行热病毒(BEFV)糖蛋白抗原G基因保守序列为模板设计特异荧光PCR扩增引物,建立BEFV LUXTM实时荧光RT-PCR快速检测方法。试验结果显示,所建立的荧光RT-PCR可特异检测牛流行热病毒RNA,而对蓝舌病病毒、牛病毒性腹泻-粘膜病病毒、水泡性口炎病毒、口蹄疫病毒、牛白血病病毒以及与BEFV同种属的狂犬病病毒核酸检测呈阴性反应。敏感性试验表明LUXTM荧光RT-PCR对BEFV RNA的检测敏感性比常规RT-PCR方法提高达100倍以上。该LUXTM荧光RT-PCR的批内检测变异系数0.64%-1.17%,批间检测变异系数均小于2%,表明检测体系稳定、重复性好。通过人工添加灭活病毒液的方法制备30份模拟感染牛血清样品,采用上述所建立的BEFV LUXTM荧光RT-PCR方法检测均呈阳性。     

小菜蛾羧酸酯酶基因的克隆及其序列分析

利用CODEHOP设计简并引物,通过反转录多聚酶链式反应(RTPCR)克隆小菜蛾Plutellaxylostella抗性种群中抗性相关的羧酸酯酶基因,随机挑取测序5个阳性克隆进行测序,测序结果经过blastx比较,发现所获得的大约420bp的基因片断均为羧酸酯酶基因,与双翅目昆虫蚊子的氨基酸序列同源性达85%以上 。     

PCR条件对扩增SARS-CoV多聚酶部分基因的影响

目的：对该实验室已建立的检测SARS冠状病毒多聚酶基因的套式RT-PCR方法进行优化。方法：从SAPS病人的嗽口水标本中提取RNA,调整套式PCR的退火温度,扩增SARS冠状病毒多聚酶部分基因。扩增出的阳性片段连接入pGEM-T载体中,测序后比较其与已知SARS冠状病毒的同源性。结果：通过改变PCR条件,成功从一SARS病人的嗽口水中扩增出SARS冠状病毒多聚酶部分基因。结论：针对不同标本优化PCR反应条件非常重要。     

CEREBRAL ANOXIA: EFFECT ON TRANSCRIPTION AND TRANSLATION1

Abstract— The activity of DNA-dependent RNA polymerase and the synthesis of microsomal protein were investigated after various periods of anoxic condition produced with rabbit brain in an in vitro experimental model. There was prompt inhibition of protein synthesis even after an anoxic period of 5 min, and inhibition was more than 80 per cent after an anoxic period of 30 min. However, RNA polymerase activity was retained during the early stage of anoxia, but definite inhibition appeared after an anoxic period of 15 min. Comparisons with other available information suggest that the inhibition of protein synthesis observed with brain slices is closely related to their polysomal function, that irreversibility of inhibition of protein synthesis might be related to the involvement of nuclear RNA synthesizing mechanism, and that these can occur both in the neuronal and glial elements.     

DDPH对HECCM促PASMC增殖后的逆转及时间相关性的研究

目的 研究DDPH对肺动脉平滑肌细胞（PASMC）增殖后的逆转效应与DDPH的作用时间依赖性。方法 采用细胞培养,四甲基偶氮唑盐比色法（MTT）,免疫细胞化学染色测定α-SM-actin等方法观察低氧内皮细胞条件培养基（HECCM）促猪肺动脉平滑肌细胞的增殖作用。以及DDPH对肺动脉平滑肌细胞（PASMC）增殖后的逆转效应与DDPH的作用时间依赖性。结果 （1）在HECCM促使PASMC增殖后,PASMC的表型发生转化,由收缩型转化为合成型,而DDPH能使HECCM促PASMC增殖后的表型,由合成型逆转为具有执行正常收缩功能的收缩型;（2）在HECCM促PASMC增殖24h,36h,48h后,各加入DDPH24h,36h,48h后,MTT法测定OD值下降;免疫组织化学测定α-SM-ac-tin的吸光度上升,并具有时间依赖性。结论 DDPH对HECCM促PASMC增殖有逆转效应并具有时间依赖性。     

血管紧张素Ⅱ对大鼠下丘脑内血管升压素基因转录的影响

实验在雄性ＳＤ大鼠中进行,用核酸斑点杂交技术观察下丘脑组织中血管升压素（ＡＶＰ）基因转录水平变化,用异羟基洋地黄毒甙（ＧＩＧ）标记的２６个碱基长寡聚核苷酸作为检测探针。实验中观察到,用渗透压微泵向大鼠侧脑人连续注射微量血管紧张素Ⅰ（０．２ｎｍｏｌ／ｈ）２ｄ后,可引起动物饮水量显著增加,下丘脑组织中ＡＶＰ基因转录水平高,但无统计学显著意义。将实验动物日饮水量限制在与对照动物相同的每日饮水量之后,侧脑     

外源性端粒酶基因对人脐静脉内皮细胞的影响

为了观察外源性端粒酶逆转录酶基因(hTERT)在人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)的表达及对细胞功能和生长的影响。采用逆转录病毒载体转导的方法,将hTERT基因转入HUVEC,检测基因转导后内皮细胞端粒酶的活性和生物学特性。结果发现hTERT转导后细胞端粒酶表达阳性,未转导的亲代细胞为阴性;转导细胞的体外生存时间延长但未永生化,而内皮细胞黏附分子表达的功能未受影响。     

PCR引物特异性核查系统(PSC)的构建与应用

聚合酶链式反应(PCR)虽已广泛用于分子生物学研究中,然而PCR实验中的非特异性产物问题将直接影响PCR的效率,在多重PCR实验中更是如此。为了最大限度地降低非特异性产物的出现率,同时避免用户频繁使用Blast比对检查非特异性,我们开发了基于NCBI-Blast的引物评估和模板DNA特异性结合能力评估的核查系统PSC(Primer Specificity Checking,http://biocompute.bmi.ac.cn/PSC),并基于虚拟PCR实验确定了用于引物质量核查计算的多种参数,能够在线提供多个物种的引物特异性核查结果。该系统可以有效地对引物序列可能产生的所有非特异性扩增进行预测,有助于实验前引物优化或者对非特异扩增结果进行解释,最终达到提高PCR效率的目的。     

环境条件对乐果残留动态影响的初报

乐果系一种高效低毒的内吸剂,目前广泛应用于防治蚜虫,红蜘蛛等害虫。但对这些发生期长,繁殖力强的害虫来说,药剂残效期的长短与实际防治效果有密切关系。一般报导乐果残效期较短,例如(1960)指出仅一周左右。不过也有报导在果树及棉花上,药效可维持2—3星期(Chilwell et al.,1960;Dauterman et al.,1960)。我们前一试验用P~(32)乐果处理棉株叶部,也发现叶面的药剂消失很快,至第七天几乎全部消失殆尽,     

Development of PCR Diagnostic System for Detection of the Seed-Transmitted Tobacco Ringspot Virus in Quarantine

Tobacco ringspot virus (TRSV) is a plant quarantine virus in Korea. As such, a TRSV examination is conducted when importing various crops. In this study, RT-PCR and nested PCR systems for TRSV detection in quarantine sites, and the modified-positive control plasmid for proving laboratory contamination and false positive reactions were developed. The developed diagnostic system was used to detect TRSV in the quarantine site. It revealed that from 2012 to August 2014, a total of 12 cases were detected in imported various crops. The system is expected to continue contributing to TRSV detection in plant quarantine.

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The online version of this article (doi:10.1007/s12088-015-0518-8) contains supplementary material, which is available to authorized users.