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根瘤菌分类的最新进展 总被引:1,自引:0,他引:1
一、传统的根瘤菌分类系统及存在的问题早期对豆科植物-根瘤菌共生的研究只涉及一些农业上重要的一年生种,很快就注意到了根瘤菌共生的“专一性”及相互接种的关系,即一个植物的分离物只与本属植物或少数其他属植物共生结瘤,反之亦然。以一个根瘤菌将一些植物联系起来成为一个族群,这 相似文献
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花生根瘤菌的数值分类 总被引:4,自引:0,他引:4
从我国 11个省、 16种土壤类型、 20多个花生(Arachis hypogaea L.)品种上分离到的花生根瘤菌[Bradyrhizobium sp.(Arachis)]中选取50个代表菌株、并与从津巴布韦引进的4株花生根瘤菌及7株慢生根瘤菌常用的参比菌株共61株菌进行了128项表型特征的测定。数值分类的结果表明,全部菌株在75%水平上相聚,并在76%和77%的水平上分别聚成两大群(群Ⅰ、群Ⅱ),每大群以较高的相似性(85%- 94%)各聚成6个亚群。所用数值分类方法不能将花生根瘤菌和大豆根瘤菌在属的水平上分开,但亚群和未归入亚群的菌株可能暗示亚种或种存在,同时本文结果还表现出花生根瘤菌的地域分布差异及其多样性。 相似文献
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黄芪根瘤菌的分类研究 总被引:4,自引:3,他引:4
采用数值分类方法研究了分离自不同地区的黄氏属根瘤菌36株,发现在80%的相似性水平上,8株菌形成了亚群8,7株菌形成了亚群9。DNA同源性测定结果表明,这两个亚群是不同于已知根瘤菌种的新的DNA同源群。其中心菌株CA8561和JL84的部分16S rRNA基因序列分析发现,CA8561菌株与所有已知根瘤菌远缘,形成了一个独立的系统发育分支。JL84菌株在快生型根瘤菌属(Rhizobium)和土壤杆菌属(Agrobacterium)形成的系统发育分支中占据了一个独立的系统发育地位。 相似文献
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简要综述了目前根瘤菌结癌基因研究的3个热点方向,即结瘤因子、nodlD基因的调控和结瘤基因系统发育分析的新进展。结瘤因子的骨架核心是结瘤基因中的共同性基因nodABC表达的产物,宿主专一性基因则进行骨架结构的修饰,所形成的特异性结瘤因子是根瘤苗宿主范围的主要决定因素。结瘤调控基因nodD的作用方式与其存在的拷贝数目和产物NodD蛋白活性有关,同时NodD的敏感性还影响到根瘤菌的宿主范围。结瘤基因的系统发育揭示出根瘤菌宿主范围与共同性结瘤基因间比其它基荫的相关性更高。结瘤基因与豆科宿主之间存在一定的共进化关系。 相似文献
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根瘤菌数值分类方法探讨 总被引:1,自引:0,他引:1
数值分类是指用数值分析方法,借助电子计算机将运筹分类单位(OTU)(如细菌菌株)按其性状状态的相似程度归类成表观群(phenon)。为了揭示生物分类单位间的真实关系,需要尽可能多的特性测定,将这些信息转换为数值,对这些数值进行运筹处理,其计算量往往十分巨大,必须依靠电子计算机来完成,所以直至本世纪四十年代电子计算机技术兴起,才 相似文献
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J. P. W. Young 《Plant and Soil》1996,186(1):45-52
Rhizobia are bacteria that form nitrogen-fixing nodules on the roots, or occasionally the shoots, of legumes. There are currently more than a dozen validly named species, but the true number of species is probably orders of magnitude higher. The named species are listed and briefly discussed. Sequences of the small subunit ribosomal RNA (SSU or 16S rRNA) support the well-established subdivision of rhizobia into three genera: Rhizobium, Bradyrhizobium, and Azorhizobium. These all lie within the alpha subdivision of the Proteobacteria, but on quite distinct branches, each of which also includes many bacterial species that are not rhizobia. It has been clear for several years that Rhizobium, on this definition, is still too broad and is polyphyletic: there are many non-rhizobia within this radiation. Recently, therefore, it has been suggested that this genus should be split into four genera, namely Rhizobium (R. leguminosarum, R. tropici, R. etli), Sinorhizobium (S. fredii, S. meliloti, S. teranga, S. saheli), Mesorhizobium (M. loti, M. huakuii, M ciceri, M. tianshanense, M. mediterraneum), and a fourth, unnamed, genus for the current R. galegae. The evidence and pros and cons are reviewed. 相似文献
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The taxonomy of rhizobia: an overview 总被引:4,自引:0,他引:4
Anne Willems 《Plant and Soil》2006,287(1-2):3-14
The taxonomy of rhizobia, bacteria capable of nodulating leguminous plants, has changed considerably over the last 20 years, with the original genus Rhizobium, a member of the alpha-Proteobacteria, now divided into several genera. The study of new geographically dispersed host plants, has been a source of many new species and is expected to yield many more. Here we provide an overview of the history of the rhizobia, but focus on the Rhizobium–Allorhizobium–Agrobacterium relationship. Finally, we review recent reports of nodulation and nitrogen fixation with legume hosts by bacteria that are outside the traditional rhizobial phylogenetic lineages. They include species of Methylobacterium and Devosia in the alpha- Proteobacteria and of Burkholderia and Ralstonia in the beta-Proteobacteria. 相似文献
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About 20 strains of rhizobia from wild legumes were characterized based on numerical analysis of phenotypic characteristics, nodulating ability, fatty acid methyl esters (FAME) and SDS-PAGE profiles of whole cell proteins. FAME analysis revealed that palmitic (16:0), stearic (18:0) and arachidonic (20:0) were detected in most of wild-legume rhizobia, the latter being uncommon in fatty acid profiles of Rhizobium and Sinorhizobium. Numerical analysis of FAME classified strains of wild-legume rhizobia into 9 clusters and one heterogeneous group. There was both agreement and disagreement with the clustering data based on phenotypic analysis and FAME analysis. Four strains were grouped together in the same cluster based on both methods. However, 4 another strains, which were placed in one cluster of phenotypic analysis, were distributed in several clusters after FAME analysis. SDS-PAGE of whole-cell proteins revealed that the rhizobial strains exhibited protein profiles with peptide bands ranging from 5-19 band per profile and showed molar mass of 110-183 kDa. As in the case of FAME analysis, numerical analysis of protein bands was compared with clustering of phenotypic analysis. Agreement of the two methods was obvious when clustering some strains but conflicted in the classification of some other strains. However, integration of the three methods could be the basis of a polyphasic taxonomy. The twenty strains of wild-legume rhizobia were finally classified as follows: 12 strains related to Rhizobium leguminosarum, 5 strains related to Sinorhizobium meliloti and 3 strains to Rhizobium spp. Rhizobia nodulating wild herb legumes are among indigenous strains nodulating crop legumes in cultivated as well as noncultivated lands. 相似文献
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赤杆菌科微生物分类研究进展 总被引:4,自引:0,他引:4
赤杆菌科微生物隶属于细菌域(Bacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)。依据16S rRNA基因序列的系统发育分析结果,2005年赤杆菌科被提议建立,成立之初由3个属5个种组成;在过去10年中,该科的物种数量增加迅速;截止2015年10月,赤杆菌科合格发表6个属44个种。赤杆菌科微生物在土壤、热泉、海水和沉积物等环境中广泛分布,其在环境修复、食品工程及生物医药等领域具有重要的应用前景。此外,部分菌株具有细菌叶绿素a,营好氧异养生长兼具光合作用功能,是好养不产氧光合异养菌的一个重要类群,近年来其在全球海洋碳循环和能量代谢过程中的重要作用日益凸显,得到了国内外学者的关注。本文综述了赤杆菌科微生物的分类特征、生态分布和应用基础等方向的研究进展,并对其分类研究趋势做了分析。 相似文献
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丽金龟亚科Rutelinae隶属于鞘翅目Coleoptera多食亚目Polyphaga金龟总科Scarabaeoidea金龟科Scarabaeidae。世界性分布,全世界已知7族235属4 200余种,中国目前记录3族25属(亚属),共526种(亚种)。丽金龟成虫为植食性,可取食植物范围广,幼虫土栖,主要取食植物根部,部分种类是农林业害虫。因此,对其开展分类学研究,对农林业生产具有理论意义。本文通过全面核查文献及统计分析,回顾和总结了丽金龟亚科分类学研究历史,并重点介绍了我国的研究现状。目前已开展的丽金龟亚科研究工作仍以新种发表为主,缺乏高质量的分类修订工作及系统发育研究。另外,丽金龟亚科是鞘翅目中重要的植食性昆虫之一,开展深入的生物多样性研究,对于探讨甲虫的多样性和与植物协同进化关系有重要意义。 相似文献
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采用数值分类,全细胞可溶性蛋白电泳分析,DNA,G+Cmol%和DNA相关性的测定以及16SrDNAPCR-RFL分析等多相分类技术对来源于不同地区的16种寄主的胡枝子根瘤菌进行了系统的分类研究,数值分类的结果表明,在67%的相似性水平上,全部供试菌可以为快生型根瘤菌和慢性型根瘤菌两大群,在80%的相似性水平上又可分为两个亚群。在此基础上,对各亚群的胡枝子根瘤菌进行了DNA相关性的测定,以进一步证 相似文献
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芽胞杆菌分类与应用研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
芽胞杆菌是一类产生具有抗逆特性芽胞的重要微生物资源,研究其分类地位对挖掘和利用芽胞杆菌功能菌株具有重要科学意义。基于基因组学的多相分类法,使得芽胞杆菌分类地位更加精确。截至2016年6月,全世界芽胞杆菌种类达813种,来自于5个科,即芽胞杆菌科、脂环酸芽胞杆菌科、类芽胞杆菌科、动球菌科、芽胞乳杆菌科,74个属。中国芽胞杆菌研究从2004年开始发表新种,目前,中国学者发表中国分离的芽胞杆菌新种达176种。本文就当前芽胞杆菌主要分类鉴定方法及应用进展进行了描述,希望为国内外芽胞杆菌同行研究者提供一定的帮助。 相似文献
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橘小实蝇复合体分类学研究进展 总被引:3,自引:0,他引:3
橘小实蝇复合体Bactroceradorsaliscomplex是以橘小实蝇命名的实蝇类群,已知75种,广泛分布于亚洲、澳洲及环太平洋周边地区。文章概述基于形态学和遗传学特征基础上的橘小实蝇复合体的分类鉴定及系统发育研究进展,介绍近年来分子生物学技术在橘小实蝇复合体分类及系统发育研究中的应用情况,展望系统发育和行为学研究是橘小实蝇复合体未来研究的重点领域。 相似文献
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新疆苦豆子根瘤菌的数值分类研究 总被引:8,自引:0,他引:8
苦豆子(Sophora alopecuroides)对于干旱荒漠地区的畜牧业发展有着非常重要的意义,其生长特性与根瘤菌有密切关系。我们对分离自新疆苦豆子根瘤的67株根瘤菌及36个模式菌株进行了118项表型性状的测定,包括唯一碳源利用、唯一氮源利用、对抗生素和染料的抗性、耐盐性、初始pH值生长范围、生长温度范围及石蕊牛奶反应、氧化酶、过氧化氢酶和脲酶。对测定结果用聚类分析方法进行了分析,获得数值分类树状图。结果表明:新疆苦豆子根瘤菌在碳氮源利用、抗生素敏感性以及对染料的抗性程度等方面存在着差异。新疆苦豆子根瘤菌能耐受低温,并具有较强的耐盐、碱能力,所有供试菌株均能在初始pH值为9-12的YMA培养基上生长,92.5%的菌株能耐受3.0%的NaCl,91.0%的菌株能耐受4.0%的NaCl,有18株菌甚至能耐受5.0%和6.0%的NaCl。聚类结果表明, 在84.8%的相似性水平上,67个供试菌株构成了4个新的表观群,第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ类群分别有21、7、4、3个菌株,中心菌株分别为NWBC152、NWTKX101、NWYJS12、NWLP112。此外,数值分类结果还表明,苦豆子根瘤菌与模式菌株的相似性较低,它们所形成的4个独立群可能有新种出现。 相似文献