鳇亚科棒花鱼属鱼类的分类与系统发育关系

逗亚科棒花鱼属鱼类的分类与系统发育关系尚未解决。研究选择线粒体Cyt b基因和核基因RAG1、MLH3及MSH6作为分子标记, 重建了棒花鱼属鱼类的系统发育关系, 并结合形态证据对该属鱼类进行了分类厘定。结果表明: 棒花鱼与钝吻棒花鱼是单系种。拉林棒花鱼与辽宁棒花鱼是并系种, 一起形成单系群。拉林棒花鱼+辽宁棒花鱼一起嵌套在小鳔逗属鱼类内部, 钝吻棒花鱼嵌套在片唇逗属鱼类内部。拉林棒花鱼+辽宁棒花鱼+钝吻棒花鱼+片唇逗属+胡逗属+小鳔逗属+琵琶逗属鱼类组成单系群, 它们一起与棒花鱼形成姊妹群关系。可量性状与可数性状均不能区分拉林棒花鱼和辽宁棒花鱼。结合系统发育关系与形态证据, 棒花鱼属鱼类的分类厘定如下: 棒花鱼属鱼类包括棒花鱼和平江棒花鱼(未取样); 辽宁棒花鱼是拉林棒花鱼的同物异名, 后者的分类位置有待进一步校订; 钝吻棒花鱼校订为钝吻片唇逗。     

鲤亚科鱼类的系统发育

鲤亚科是由原始的鲃亚科派生的一个单源群,因此,把鲤亚科各属筛选出的性状与纪亚科的相应性状比较,以确定其性质,即该性状为祖征,还是为离征。经比较,发现25项性状在鲤亚科的5个属中呈镶嵌分布。根据性状的镶嵌分布情况和简约性原则,推导出鲤亚科的属间系统发育分支图。以往的观点认为,鲃鲤属与原鲤属的关系较近。现在系统发育关系分析的结果与此全然不同,原鲤属与鲤属的关系较近,而纪鲤属在鲤亚科内是较早分化出的一支,与亚科内其他4个属的关系相对较远。最后,依化石资料分析了鲤亚科的分化时间。     

基于DNA序列信息的贞琵甲属物种界定分析（鞘翅目：拟步甲科：琵甲亚科）

贞琵甲属Agnaptoria是小琵甲亚族Gnaptorinina中第三大属和青藏高原特有类群,已知36种/亚种。本文选取3个线粒体基因（COI; Cytb; 16S rDNA）和1个核基因（28S rDNA-D2）片段,采用最大似然法（Maximum likelihood,ML）构建了该属的系统发育树;运用ASAP（Assemble Species by Automatic Partitioning）、GMYC（Generalized Mixed Yule Coalescent）和PTP（Poisson Tree Processes）3种方法对该属进行了分子物种界定分析。结果表明：综合运用3种分子物种界定方法的界定结果与形态鉴定结果基本吻合。依据形态特征与分子物种界定技术相结合的综合鉴定方法,大大提高了该类群的物种鉴定效率,为该类群未来在系统发育、地理分布格局演化等方面的研究提供了可靠的分子数据。     

似Ju类鱼类的系统发育研究（鲤形目：鲤科）

本文通过对似Ｊｕ类８属１３种和外类群７属１０种鱼类的比较研究,选取３７个骨骼及外部特征,运用外类群比较进行特征分析,根据分支系统学原理重建了似Ｊｕ类的系统发育。特征分析和系统发育分析表明似ｊｕ类是具有许多共同离征的单系群,朝着流水性氏栖生活和刮食性的主干方向发展;其中以似Ｊｕ属最原始的,胡Ｊｕ属最特化构成７对姐妹群,蛇Ｊｕ属是较早分化出的相对特化的类群,棒花鱼属和小鳔Ｊｕ属的关系相对较远。     

应用聚类分析方法研究鲤亚科鱼类的系统发育

本文把聚类分析方法与分支分类学的特征分析方法相结合,以单源群内各分类单元之间具有共同离征的多少作为聚类的依据,逐步把全部单元聚在一起。因聚类依据为共同离征的多少,因此,在一定程度上,聚类所得分浓图即为该单源群的系统发育图。按上述原理,应用于鲤亚科鱼类的系统发育研究,所得分支图与按分支分类学的简约性原则推导的分支图吻合,但应用聚类分析方法后,可使系统发育关系的推导建立在一定的数学基础上。     

虎尾草亚科系统发育关系的初步研究

运用广义形态学性状对虎尾草亚科（Chloridoideae）进行系统发育分析。内类群包括虎尾草亚科52属的69种植物,代表虎尾草亚科的主要类群;芦竹亚科（Arundinoideae）扁芒草族（Danthonieae）的Centropodia和Danthonia被选作外类群。分支分析表明,虎尾草亚科是一个单系类群。其严格一致树包括A、B、C、D、E5个分支。两个大族画眉草族（Eragrostideae）和虎尾草族（Chlorideae）代表虎尾草亚科内部类群分化的两个方向,分开处理较合理。细穗草族（Leptureae）放到虎尾草族中较合理。冠芒草族（Pappophoreae）是虎尾草亚科的基部类群,与画眉草族近缘。我们的研究支持虎尾草亚科从旧世界向新世界扩散的地理分布假说,并提供了虎尾草亚科属上类群的系统发育关系的框架。     

鲤科鲴亚科鱼类的系统发育及动物地理学

以雅罗鱼亚科为外群,采用分支系统学的原理和方法对鲐亚科17个属(须鳊属除外)进行了系统发育和动物地理学的分析。结果表明,(1)鲴亚科这17个属为一个单系群,并由4个较小的单系群组成;(2)鲴亚科现在的地理分布格局除源自离散事件外,主要源于扩散事件。鲐亚科的特征演化还表明,东亚地区地质历史的反转演化和平行演化可能在鲴亚科系统发育过程中起了重要的作用。     

鲤科盘鮈属鱼类系统发育及其历史地理分布格局解析

以盘鮈属鱼类作为内群,以巴马拟缨鱼作为外群。通过形态比较共筛选出85个稳定的特征,形成形态特征状态矩阵表。以PAUP4.0b软件,采用均权方式,在无序和有序状态下分别按Heuristic、Branch-and-Bound以及Bootstrap等3种方式计算和构树。每种方法计算均得到唯一的1棵树,最大简约树与严格一致树、Bootstrap值检测树呈现微小差异。但仅最大简约树体现了各种之间先后分化的次序以及各姐妹群之间的关系,所以选择最大简约树作为盘鮈鱼类的系统发育树。其结果显示,盘鮈具小吸盘的种类与具大吸盘的种类分别构成了A、B两支。B支又可分为C、D两支。其中,C支的种类以吻端形成1对明显珠星,甚至形成吻突而区别于同属中具大吸盘的其他种类。运用Component(2.0)软件计算,得到盘鮈属种类分布河流的唯一分支树,其结构基本与水系的地理分布成对应关系。盘鮈属鱼类祖先的形成时期应为第4纪中期之初或更早。古云贵高原是盘鮈属鱼类的起源、分布和分化中心。云贵高原面的抬升与河流的袭夺促成了盘鮈属鱼类的多次分化和扩散,由此形成了该属鱼类的现今分布格局。     

沙鳅亚科鱼类线粒体DNA控制区结构分析及系统发育关系的研究

对沙鳅亚科鱼类3属14个代表种的线粒体DNA控制区序列的结构进行了分析。通过与鲤形目鱼类的控制区序列进行比较,将沙鳅亚科鱼类的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域。同时识别了沙鳅亚科中一系列保守序列,并给出了它们的一般形式。以胭脂鱼为外类群,对比条鳅亚科、花鳅亚科、以及平鳍鳅科的代表性种类,采用NJ、MP和ML法构建沙鳅亚科的分子系统树。分子系统发育分析表明,沙鳅亚科为一单系,包括3个属:沙鳅属、副沙鳅属和薄鳅属,各属均构成单系。根据分子系统学、形态学的结果及地理分布推断,沙鳅亚科中沙鳅属可能为最为原始的属,副沙鳅属其次,而薄鳅属最特化。       

PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS OF GELIDIALES SPECIES IN COSTA RICA

Despite a general paucity of studies on marine algae in Costa Rica, within the red algal order Gelidiales, 9 species are reported from the Caribbean, and 6 species from the Pacific. In this study 5 species from the southeast Caribbean coast and 2 species from the northwest Pacific coast of Costa Rica were collected for DNA sequence and morphological analyses. At the time of this writing, morphological observations of four Caribbean taxa have identified them as Gelidium microdonticum , Pterocladiella capillacea , P. melanoidea , and Gelidiella acerosa. In rbc L sequence analyses, Gelidium microdonticum is resolved within a clade of small Gelidium species predominantly found in the south Atlantic. Two collections representing different forms of Pterocladiella melanoidea sensu Dawson were found to have identical rbc L sequences. These samples were resolved in rbc L trees with a taxon from Texas identified as P. bartlettii and not P. melanoidea from Europe. Comparisons with type material are being made to verify these identifications so that the status of P. melanoidea in the Caribbean may be determined. The unidentified Caribbean taxon is resolved as a distinct species within the Pterocladiella clade as well. Gelidiella acerosa from Caribbean Costa Rica is closely allied with other Caribbean G. acerosa samples in rbc L trees. The two pacific taxa are small intertidal turf species and have not yet been identified. Sequence analyses resolve these taxa within a large clade of Indo-Pacific and Caribbean Gelidium species.     

浙江近海鰓属鱼类形态描述及中国鰓属鱼类分子系统发育分析

为明确浙江近海鲵属鱼类物种组成, 对采自舟山和温州近海共计411尾鲵鱼样品进行形态学测定, 并基于线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因片段探讨其序列差异及系统发育关系。结果显示: 浙江近海的鲵属鱼类为少鳞鲵和中国鲵, 两种鲵鱼形态特征鲜明, 鱼鳔形态差异明显。所测得的少鳞鲵和中国鲵COⅠ基因片段长度均为600 bp, 平均GC含量分别为46.6%和49.9%。依据Kimura-2-parameter模型(K2P), 少鳞鲵和中国鲵的种内平均遗传距离分别为0.002和0.000, 两种间平均遗传距离为0.211。采用邻接法构建的系统发育树显示, 中国鲵先和邵氏鲵聚为一支, 然后与少鳞鲵聚为一支, 再与其他鲵属鱼类聚类。研究结果明确了浙江沿海鲵属鱼类的物种组成, 并为探讨少鳞鲵和中国鲵的系统发育关系及基于COⅠ基因的鲵属鱼类物种鉴定提供了参考。     

西太平洋沿海石斑鱼属鱼类DNA条形码及分子系统进化研究

研究测定了分布于西太平洋沿海的35种石斑鱼属鱼类共142个个体线粒体基因COⅠ及核基因TMO-4C4标记序列,基于最大似然法与贝叶斯法构建分析了石斑鱼类分子系统进化关系.同时,探讨了COⅠ基因作为DNA条形码在石斑鱼属鱼类物种鉴定中的有效性问题.结果显示:35种石斑鱼属鱼类COⅠ同源序列为636 bp,编码212个氨基...     

中国鲤科鱼类染色体组型的研究Ⅹ.鲃亚科五种鱼和(鱼句)亚科四种鱼的染色体组型

本文报道了鲤科鲃亚科5种鱼和(鱼句)亚科4种鱼的染色体组型考察结果,并对这两个亚科鱼类的染色体数日和臂数进行了统计分析,讨论了其染色体进化及系统关系等问题。     

THE SYSTEMATICS AND PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS OF VETULICOLIANS

Abstract:  Vetulicolians have variously been considered to be unusual arthropods, stem-group deuterostomes or relatives of the tunicates. They are known from a number of Cambrian Lagerstätten, and are particularly diverse in the Chengjiang biota of Yunnan Province, China. We recognize two classes, Vetulicolida and Banffozoa, which together form a monophyletic group. Within the Chinese collections we also identify two new species and recognize one new genus: Vetulicola monile sp. nov. and Bullivetula variola gen. et sp. nov. The evidence from new and previously described specimens is used to undertake a phylogenetic analysis and to evaluate a range of hypotheses for the affinities of vetulicolians. Given the difficulties of interpreting features in enigmatic fossils and the apparently contradictory set of characters possessed by vetulicolians, it is not possible on current evidence to reach an unequivocal conclusion regarding the phylogenetic position of the group. One possibility is that they are a sister group of arthropods that lost limbs but gained gill structures analogous to those of deuterostomes, but several features remain unexplained by this model. If they are protostomes, a more generally parsimonious position is close to the kinorhynchs. An alternative is that they are deuterostomes, although a placement at the base of the clade is not supported by the evidence. If they are deuterostomes, it is more likely that they are close to the tunicates.