Meta-Mesh——元基因组数据分析系统

随着元基因组数据的不断增多,建立一个包含高品质的元基因组样本(也称为"微生物群落")数据的集成化的分析平台成为可能,使得微生物群落样本能够被有效分析、比较与搜索,从中发现更加深入的生物学意义。然而,一方面目前大部分元基因组数据库仅仅提供了简单的数据存储,缺乏良好的样本注释或者仅仅提供了很少的分析功能。另一方面,用于计算微生物群落数据相似性的方法所能够接受的样本数据量非常有限。长期以来,科学家们一直在寻找有效的方法计算海量微生物群落之间的相似性,从而研究样本之间的相似度并发现元基因组数据信息的相关性。Meta-Mesh是一个全新的在线元基因组分析系统,它包括元基因组数据库和分析平台,可以对元基因组样本进行系统、有效地分析,并实现样本的群落结构比较和精确搜索。其中,元基因组数据库已经从公共领域和内部实验室收集了超过7 000个高品质、带有有效注释的样本。同时,Meta-Mesh的分析平台提供了多种在线分析工具,可以对元基因组样本进行群落的结构分析与注释,多角度比较,并能通过快速索引策略和群落结构相似性算法在数据库中高效搜索近似的样本。Meta-Mesh通过"人体微生物群落样本的数据库搜索识别"以及"基于相似度矩阵的样本的聚类"等一系列的元基因组研究案例证明了其分析方面的性能。作为一个在线的元基因组数据库和分析系统,Meta-Mesh将服务于元基因组样本的快速分析、识别、比对、搜索等相关领域。     

稻田土壤－作物－家畜系统中氮的循环研究

本文用Ｎ￣（１５）标记水稻和绿肥研究了稻田土壤－作物－家畜系统中氮的循环。Ｎ￣（１５）标记稻草喂羊,羊体回收饲料稻草Ｎ３１．１６％,羊粪２８．２６％,羊尿５．７２％,总回收６５．１４％,损失３４．８６％。将羊粪尿单施,稻谷回收饲料稻草Ｎ３．１９％,水稻全株回收４．８２％,土壤残留１９．００％,损失１０．１４％。故羊体、水稻及土壤残留共回收饲料稻草Ｎ５４．９８％．将羊粪与尿素配施,则饲料稻草Ｎ的总回收率为５５．８８％。Ｎ￣（１５）标记绿肥喂猪;猪体回收饲料绿肥Ｎ２３．５１％．猪粪２３．８５％,猪尿２８．７６％,总回收率７６．１２％,损失率２３．８８％。将猪粪、尿还田,稻谷回收饲料绿肥Ｎ６．６９％,水稻全株回收１０．０５％,土壤残留１９．１７％,故猪体、水稻和土壤残留共回收饲料绿肥Ｎ５２．７３％,将猪粪与尿素配施,则饲料绿肥Ｎ的总回收率为５２．７５％。     

肾素－血管紧张素系统──应激激素反应系统

各种急性与慢性应激时,循环血中及脑、心血管、肾腺等组织中血管紧张素Ⅱ（ＡⅡ）显著增多;人剧烈运动后血浆ＡⅡ与皮质醇一样均剧烈增加,在慢性应激性高血压动物循环及组织中,ＡⅡ含量持续地增高。还发现高浓度ＡⅡ对肾上腺糖皮质激素的分泌有直接的刺激作用,而组织ＡⅡ增多又受肾上腺素能β受体的激发。根据近年来的系列工作,并结合文献,我们认为ＡⅡ是一种重要的应激激素;肾素－血管紧张素系统是一个应激激素反应系统;它与经典的应激激素反应系统,下丘脑－垂体－肾上腺皮质系统及交感－肾上腺髓质系统也存在着密切的关系。     

一个有重大意义的开创性工作－－浅要介绍2004年诺贝尔生理学或医学奖

Buck及Axel因为他们对嗅觉研究所作出的巨大贡献获得了2004年度的诺贝尔生理或医学奖。他们于1991年克隆了部分的嗅觉感受体基因并最终发现了总数超过1000个的此类基因。他们后来的工作揭示了嗅觉神经通路所具有的非常漂亮的分子组织和解剖连接。他们的工作极大地拓展了嗅觉研究的领域并为功能性的研究提供了坚实的基础。     

猪圆环病毒2型－细小病毒－伪狂犬重组病毒免疫小鼠试验研究

为了研究表达猪2型圆环病毒ORF2基因和猪细小病毒VP2基因的重组伪狂犬病毒疫苗株SA215(D)的疫苗价值,对该病毒株安全性、免疫原性、保护力及对PRV Fa株定值进行了研究。研究结果表明重组病毒SA215（D）毒力显著低于PRV Fa强毒株,可以抵御伪狂犬病强毒Fa株的攻击,并能抵御其在小鼠体内的定植;抗体检测显示SA215（D）免疫小鼠后第2周抗PRV、PCV2和PPV的抗体水平均很低,加强免疫后第4周抗体水平大幅上升,且显著高于阴性对照组,而与阳性对照组无明显差异,表明SA215（D）可诱导小鼠产生体液免疫反应。淋巴细胞增殖试验显示SA215（D）可诱导小鼠产生较强的淋巴细胞增殖反应,与亲本株SA215组相比,差异显著(0.01     

苯并［a］芘在土壤－水－水稻系统中传输动力学研究

建立了ＢａＰ在土壤水稻系统中传输模型,并对其在系统各组分中的含量变化做了定量分析。实验求得了ＢａＰ在系统各相间传输速度常数和分配系数。揭示了水中ＢａＰ向水稻体传输路径和它们的速度大小。水稻从水中吸收ＢａＰ的速度比其从土壤中吸收的速度高４倍,水中ＢａＰ向土壤沉积速度比水稻从水中吸收ＢａＰ的速度高７倍。水中ＢａＰ在迁移到达水稻体之前,绝大部分被土壤牢牢吸附而很难被水稻吸收。     

用于立体视检测的微机软件包的设计

为了快速、方便、准确地检测人的立体视功能,根据双眼视差原理,设计了用于立体视检测的微机软件包称为立体视检测(SVT).利用该软件可在彩色屏幕(VGA)上产生静态等视差图(图中各部分的视差不随空间位置的变化而改变)、变视差图、以及在深度上的正弦波状起伏图形.叙述了设计原理和程序框图;报导了用SVT软件包对视力正常和异常儿童的立体视检测结果并讨论了其临床应用价值．     

灭蚊真菌－贵阳腐霉对植物的安全性试验

The aim of this study is to investigate whether Pythium guiyangense, a mosquito-killing fungus isolated in Guiyang, Guizhou Province of China in 1994, is pathogenic to plants. Six common crops, Cucumis sativa, Lycopersicon esculentum, Capsicum annuum, Nicotiana tabacum, Brassica campestris and Oryza sativa were used as subjects for test. Zoospores of the fungus were used to infect the plants with soil inoculation method, caudex injection method and foliage spray method. Both positive control (using P. aphanidermatum) and negative control (using sterile water) were set up in all the experiments. The results showed that no infection was found on the tested plants in soil inoculation experiments. In caudex injection test, callus grew around the wounded tissue in most of the plants. Brownish rottenness could be found only in the injected wounds in a few plants, probably caused by saprophytic bacteria or other fungi, and the germ-carrying plants grew normally. No abnormal appearance was found on the six crops in foliage spray test. It was demonstrated that P. guiyangense could hardly infect plants in nature, and was a safe and promising agent for mosquito biological control.     

SeqHunter：序列搜索与分析的生物信息学软件包

利用Microsoft Visual Basic 6.0脚本,开发了一个在Windows平台下使用的生物信息学软件包SeqHunter;该软件包以简便的图形界面操作方式,可以实现本地化Blast,序列提取、比对与分析,序列数据库建立和管理等多种常用功能,为基因功能分析与大规模基因组数据挖掘提供了一个实用工具。     

黄土区农业景观空间格局分析

景观空间格局分析是景观生态学研究的核心问题之一。本文用地理信息系统,分维分析和统计分析相结合,以１∶１万土地利用现状图为基础,选取斑块大小、分维数、斑块伸长指数、多样性、优势度、相对丰富度、破碎度等指标,陕北米脂县泉家沟流域农业景观的空间格局。结果显示,乔木林地、坡耕地、果园、草地和梯田农地的分维数较低,坝地、水库、灌溉农田、居信用地和灌木林地的人维数较高,斑块形状较为复杂。随着斑块面积的增加,农     

QUALITATIVE ANALYSIS OF BIOECOLOGY DIFFERENTIAL SYSTEM

In this paper, the author studies the quartic bioecology differential system:Here n and q are positive constants, l、m and p are constants. The author also proves some theorems of existence and uniqueness of limit cycles of this differential system.     

二种群生态系统的能量结构分析

每一个生命系统均存在一个能量系统与之相对应。能量进入生命系统后按生理的组织和功能进行分配,形成具有特定的能量传递关系,组分配置关系及相互关联形式的能量结构,这种结构是完成一定生命功能的物质基础,也是不同生命系统之间相互区别的重要特征。以二种群生态系统分析为例,从其能量的传输类型,配置和奇点的控制特性三个方面扼要地介绍了生命能量系统结构的概念和分析方法。     

RAPID ANALYSIS OF ECHOCARDIOGRAPHIC DATA AND TWO-DIMENSIONAL IMAGES WITH A MINI-COMPUTER BASED SYSTEM

This study evaluates a mini-computer based system (ECHO-COMP(*)) for analyzing echocardiographic and cineangiographic data. The system consists of a programmed 16-bit mini-computer, a digitizer and a printer. Any M-mode echocardiographic recording or two-dimensional image can be analyzed with a minimal number of operator controls, and large quantities of data can be processed with statistical accuracy.     

植物标本标签的计算机印制数据系统

本文讨论了主要用以印制标本采集记录标签的数据系统及其数据库建库方案与编程原理。该系统可在ＩＢＭ及其兼容系列个人计算机上使用,适合用于个人或科研与教学机构中小型标本采集信息管理;可用以数据的检索、标本标签的印制和植物名录的打印;也可用以地区性的植物区系与生态学研究。     

一类捕食—食饵系统的定性分析

本文分析了一类具有Holling Ⅰ型功能性反应的捕食者种群与食饵种群相互作用的数学模型得出了如下结论:当e≥1,cd+br-ec~2x_0<0时,且b充分小则至少存在一个极限环;如果更要求d+r-ecx_0<0,b充分小时至少存在两个极限环。     

龙虾胃肠神经系统的数值分析

利用抑制神经系统的WinnerLess Competition(WLC)模型,通过数值方法分析Mulloney型龙虾胃肠神经系统神经元的电位发放,得到胃研磨囊和幽门神经系统中各个神经元的电位发放和系统的节律变化。结果表明,胃研磨系统内神经元的发放规律显示两侧牙齿和中间牙齿出现切断、挤压和研磨食物等状态,幽门系统内神经元的发放规律显示幽门节律出现依次发放的三个部分。两个神经系统的数值结果,不仅解释了龙虾胃肠神经系统中神经元电位发放与肌肉运动的关系,而且理论再现了龙虾胃肠神经系统的节律变化和实验结果。     

生猪供给系统反馈结构的定量分析

本文研究了浙江省生猪供给系统变量间的线性与非线性回归函数关系,确定了系统反馈结构．     

呼吸系统声传播特性分析的一种新方法

分析了传导语音信号的产生与传播过程,建立了传导语音信号的数学模型,在模型的基础上,研究了传导语音信号的功率倒谱的特点,提出了利用同态处理技术分析呼吸系统声传播特性的一种新方法。实验结果表明,正常呼吸系统有一个共振峰,肺实变处呼吸系统有两个共振峰,且第二共振峰在系统中起主要作用,这种新方法是一种简单、有效的方法。