基于Web of Science的阴道菌群研究现状和热点的可视化分析与展望

探索阴道菌群近10年来的研究现状并预测其发展趋势。

在Web of Science数据库中检索近10年阴道菌群相关的文献,运用可视化软件VOSviewer进行共词分析、文献耦合、合著分析等。

阴道菌群领域发文量呈整体上升趋势,目前的主要热点研究分为阴道菌群的多样性、传染病学、细胞生物和基因学、阴道菌群与生殖的关联四大方面。

文献可视化研究展现了阴道菌群的研究现状和发展趋势,为相关研究人员提供了借鉴。

     

基于Web of Science的生酮饮食与肠道菌群研究文献计量学分析

基于Web of Science数据库分析生酮饮食与肠道菌群研究的相关文献,明确研究热点与趋势,为日后相关研究提供参考。

通过对Web of Science核心数据库进行主题词字段检索,于2022年10月23日完成检索,应用文献计量学方法与CiteSpace软件,对机构、期刊、共被引及关键词等文献特征进行统计学分析。

共获得有效文献186篇,发文总量较低,但呈不断增长的趋势;发文量多及影响力高的国家、机构多分布于美国、意大利、中国等;期刊与高被引文献的研究方向重点涉及营养学和癫痫研究;研究热点逐渐由生酮饮食影响肠道菌群组成与患者临床特征变化转变为分析相关机制及临床干预研究;研究趋势为抗生素、双盲试验、难治性癫痫。

近年来,国内外学者对生酮饮食与肠道菌群的关注度明显提高,已形成小范围的机构合作团队。研究热点与前沿对未来生酮饮食与肠道菌群研究的新方式、新思路具有导向价值,我国仍需加强对该方向的研究。

     

基于CiteSpace可视化分析生命早期肠道菌群领域研究现状和发展趋势

探讨近10年生命早期肠道菌群领域的研究现状和发展趋势,梳理知识结构,以期为今后的研究提供参考资料。

检索2012—2022年中国知网、维普、万方和Web of Science数据库中的相关文献,通过CiteSpace软件进行知识图谱的构建和可视化呈现。

2012—2022年该领域的发文量总体呈上升趋势。关键词分析表明菌群的组成与功能、菌群的发育与演化、菌群与宿主的相互作用,以及婴幼儿食品的研发生产等是现阶段研究的热点方向;16S rRNA基因测序、宏基因组测序以及代谢组学等是现在热门的研究方法。

该领域研究的重点正逐渐从菌群组成向菌群功能转变;多组学方法的整合逐渐成为新的研究趋势。

     

基于VOSviewer的肝硬化肠道微生态研究的可视化分析——

分析肝硬化肠道微生态的研究现状、热点及前沿趋势。

检索Web of Science（WOS）核心数据库建库至2020年12月31日的肝硬化肠道微生态研究的英文文章。通过文献计量分析软件VOSviewer分析发文国家、机构、作者和本研究领域的热点和前沿方向。

共检索到848篇文章。美国的Virginia Commonwealth University是肝硬化肠道微生态相关文章发表最多的机构。国外学者Bajaj JS在该领域发文量最高。肝硬化肠道微生态相关研究在《Hepatology》上的发表数量最多,为48篇。研究热点可概括为肝性脑病、代谢性肝病、菌群失衡与炎症感染等。

通过对肝硬化肠道微生态研究热点和新兴趋势进行可视化分析,为肝硬化肠道微生态的研究人员及研究单位提供了研究方向及潜在合作可能。

     

阴道镜操作对阴道微生态的影响

初步探讨阴道镜操作对于阴道微生态的影响。

选取北京大学第一医院2019年3月至2019年6月行阴道镜检查的患者, 共60例, 在阴道镜检查前及阴道镜检查结束2~3周行阴道微生态检测, 分析患者阴道镜检查前后阴道微生态变化情况。

60例患者阴道镜检查前后均无症状。阴道镜检查前菌群异常者16例, 包括细菌性阴道病(BV)13例, 发生率为21.6%;外阴阴道假丝酵母菌病(VVC)1例, 发生率为0.16%;微生态异常比26.6%。60例患者阴道镜检查前后阴道微生态变化、菌群密集度、多样性、优势菌、真菌检出率差异无统计学意义(均P < 0.05)。阴道分泌物pH值在阴道镜检查前后的中位数值均为4.1。检查后, 16例检查前阴道微生态异常的患者中8例改善, 7例无变化, 1例由菌群异常转变为菌群抑制。阴道镜检查前后阴道微生态无变化者44例(73.3%), 微生态好转8例(13.3%), 均发生于BV和菌群异常的患者; 阴道微生态由正常转为异常7例(11.7%)。检查前后阴道微生态均异常但发生变化者1例。

阴道镜检查者菌群异常比例较高, 阴道镜检查后小部分患者有可能新发阴道微生态异常, 建议阴道镜检查前后及时进行阴道微生态检测。

     

孕晚期女性阴道菌群与妊娠结局的相关性

分析不同妊娠结局女性孕晚期阴道菌群,探索阴道菌群变化与妊娠结局的相关性。

收集厦门市第五医院收治的妊娠期女性阴道分泌物,筛选排除后,纳入不良妊娠组14例,正常妊娠组17例。采用高通量测序法对阴道菌群16S rDNA V3−V4区进行测序;采用QIIME2软件分析阴道菌群的组成和多样性指标;采用PCoA主坐标分析菌群β多样性差异;采用LEfSe比较不同妊娠结局女性阴道微生物差异,获得具有统计学意义的菌群标志物,并对差异菌群做相关性分析。

在菌群组成方面,厚壁菌门、乳杆菌属比例在正常妊娠组中显著增加,放线菌门、双歧杆菌属比例在不良妊娠组中显著升高（均P＜0.05）。在多样性方面,两组的α多样性差异无统计学意义（P＞0.05）,正常妊娠组β多样性较高,不良妊娠组的菌群相似度较高（均P＜0.05）。LEfSe分析结果显示,正常妊娠组阴道乳杆菌属丰度显著升高,不良妊娠组加德纳菌属、双歧杆菌属和梭菌目丰度显著增加。相关性分析表明,乳杆菌目与梭菌目比例呈负相关。

与正常妊娠组相比,不良妊娠组女性阴道菌群存在多样性下降、乳杆菌丰度下降的趋势,同时双歧杆菌、加德纳菌、梭菌等厌氧菌丰度增加。

     

胚胎移植前的阴道微生态对辅助生殖患者妊娠结局的影响

探讨辅助生殖治疗患者在胚胎移植前的阴道微生态对妊娠结局的影响。

选取1 420例在北部战区总医院生殖医学科经体外受精/卵胞浆内单精子注射(IVF/ICSI)治疗并接受冻融胚胎移植的不孕患者。在胚胎移植前取阴道分泌物涂片、革兰染色、显微镜镜检检查阴道微生态情况, 回顾性分析阴道微生态对辅助生殖患者妊娠结局的影响。

微生态失衡患者的HCG阳性率、临床妊娠率、胚胎种植率、流产率和早产率与微生态正常患者相比差异无统计学意义(P > 0.05)。708例微生态失衡患者中, 菌群正常功能下降335例、菌群抑制141例、白细胞异常127例、BV中间型52例、BV 30例、VVC 23例。BV患者的流产率与其他几种微生态失衡情况相比, 差异有统计学意义(P < 0.01)。

微生态失衡对辅助生殖患者的妊娠率影响有限; BV患者在胚胎移植后可能有流产的风险, 建议调整阴道微生态的平衡防止流产发生。

     

阴道菌群与子宫脱垂的相关性研究

研究阴道菌群与子宫脱垂的相关性,为该类患者的治疗提供参考。

选取杭州市妇产科医院门诊或体检中心募集的30例子宫脱垂患者（研究组）和30例健康人群（对照组）。利用细菌16S rDNA扩增技术分析两组对象阴道菌群的组成特点,并利用 LEfSe 及 LDA 分析具有显著差异的菌群。

在属水平上,绝经前人群阴道Oribacterium、Xanthomonadaceae_unclassified在研究组的相对丰度大于对照组（均P＜0.05）;绝经后人群阴道Finegoldia、Paracnuella、Clostridium_XVIII在研究组的相对丰度大于对照组,Alterileibacterium、Ileibacterium、Microbacteriaceae_unclassified在研究组的相对丰度小于对照组（均P＜0.05）。两组对象阴道菌群丰度指数（Sobs、Chao、Ace）及多样性指数（Shannon、Simpson、InvSimpson）差异无统计学意义（均P＞0.05）。研究组中绝经前人群阴道菌群Sobs、Chao、Shannon、Invsimpson指数小于绝经后人群,Simpson指数大于绝经后人群（均P＜0.05）。绝经后人群中,研究组对象Finegoldia丰度较高,对照组对象Sneathia丰度较高。绝经前人群中,研究组对象Fastidiosipila丰度较高,对照组对象Parvimonas丰度较高。ROC曲线提示,Anaerococcus和Sneathia的组合有助于预测子宫脱垂的发生。绝经后,研究组对象脂质代谢显著下降,而蛋白酶体代谢通路功能显著上升。

阴道菌群与子宫脱垂具有相关性。蛋白酶体代谢通路可能通过下调雌激素及受体水平参与了子宫脱垂的发生。

     

妇科恶性肿瘤患者阴道微生态状况

了解妇科恶性肿瘤患者及化疗后患者阴道微生态状况, 探讨化疗后患者阴道微生态评价的临床意义。

选取2017年8月至2019年8月在我院妇科住院治疗的60例妇科恶性肿瘤患者(肿瘤组)及同期因妇科恶性肿瘤进行化疗的40例患者(化疗组)作为研究对象, 同时以40例健康体检女性作为体检组, 取阴道分泌物进行微生态评估。

肿瘤组患者阴道菌群密集度正常(++和+++)者占58.3%, 与体检组及化疗组比较差异均有统计学意义(均P < 0.05)。肿瘤组、化疗组和体检组对象中菌群正常者分别占18.3%、5.0%、55.0%, 差异均有统计学意义(均P < 0.05)。化疗组、肿瘤组和体检组菌群抑制者分别占42.5%、35.0%、10.0%, 差异均有统计学意义(均P < 0.05)。不同类型妇科恶性肿瘤患者阴道微生态状况比较差异无统计学意义(P > 0.05)。

妇科恶性肿瘤患者阴道微生态失调率增高, 化疗后患者在阴道微生态失调率升高的同时生殖道感染风险增加。

     

B族链球菌感染及微量元素营养干预对产妇阴道微生态的影响

分析产妇阴道微生态失衡的发生情况和B族链球菌（GBS）感染及营养相关因素在正常与微生态失衡产妇中的差异,同时检验不同干预的效果。

选取2020年1月—2021年6月本院就诊的105例产妇作为研究对象,采用随机数字表法将其分为观察组（51例）和对照组（54例）。对照组患者接受常规医疗照护干预,观察组在对照组基础上接受个体化营养干预（视产妇具体血清微量元素水平情况）,比较两组产妇阴道菌群分布、GBS感染、血清微量元素分布和新生儿情况。

全部受试对象阴道内优势菌群前5位依次是菌群抑制无优势菌、非典型乳杆菌类革兰阳性杆菌、革兰阳性短杆菌、革兰阳性大杆菌、革兰阳性球菌。阴道微生态指标检测结果显示,阴道微生态失衡产妇共49例,阴道微生态正常产妇共56例。阴道微生态失衡产妇的GBS感染率更高（30.61% vs 5.36%）,且微量元素锌和硒缺乏情况更为严重（P＜0.05）。营养干预后,观察组阴道菌群的分布异常情况改善优于对照组,且菌群多样性正常比例、锌和维生素D水平高于对照组,而GBS感染率低于对照组（P＜0.05）。

GBS感染可加重产妇阴道微生态紊乱,增加不良妊娠结局发生风险,而营养相关干预能够减低GBS感染率并提高微量元素的血清水平,有利于产妇健康,值得临床推广。

     

羊膜腔内感染微生物分布及相关影响因素分析

研究剖宫产术中产妇的感染症状、羊水微生物分布情况及相关影响因素,为该类患者的治疗提供帮助。

采集本院2020年6月至2023年2月于剖宫产术中提取的羊水498份进行细菌培养,根据羊水微生物分布情况和相关因素,综合分析产妇临床感染症状。

498份送检羊水标本中有147份标本检出微生物,总检出率为29.5%（147/498）。498例产妇中有100例术前出现感染症状,检出微生物78株;51例术后出现感染症状,检出微生物34株;8例术后切口感染,检出微生物7株。339例没有临床感染症状的产妇检出微生物28株。羊水微生物的检出率与胎膜早破或试产后人工破膜、产妇自身阴道菌群分布、术前出现感染症状呈显著相关（均P＜0.05）。

对胎膜早破、阴道菌群失调等高危产妇及时送检标本查找病原体,对羊膜腔内感染的早期预防和针对性治疗具有显著意义。

     

圈养食叶猴的肠道菌群特征

充分认识圈养食叶猴的肠道菌群组成特征, 为饲养管理方法的改进提供参考依据。

通过MiSeq高通量测序平台对3个物种的19个个体[黑叶猴(n=5)、川金丝猴(n=9)和西非黑白疣猴(n=5)]的肠道菌群16S rRNA V4-V5区进行测序和分析。

食叶猴肠道菌群以厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌门, 瘤胃菌科、普氏菌科、理研菌科和毛螺菌科为优势菌科, 普氏菌属、密螺旋体属和瘤胃球菌属为优势菌属; 食叶猴物种间肠道菌群组成存在显著差异, 肠道菌群按照宿主物种聚类, 而不受环境因素的影响。

宿主物种是决定肠道微生物组成的重要因素, 食叶猴肠道菌群特征反映了宿主对其食性的适应。

     

细菌性阴道炎合并HPV16感染患者阴道菌群分布与局部免疫的关系

探究细菌性阴道炎（BV）合并人乳头瘤病毒16（HPV16）感染患者阴道菌群分布与局部免疫的关系。

选取2019年1月到2023年1月我院收治的83例BV合并HPV16感染患者和81例单纯BV患者,分别作为研究组和对照组,检测两组患者阴道菌群分布和宫颈阴道分泌物中T淋巴细胞亚群（CD4⁺、CD8⁺、CD4⁺/CD8⁺）和炎症因子（IL-1β、IFN-γ、IL-2）水平。

研究组乳酸杆菌数量低于对照组,加德纳菌、大肠埃希菌、无乳链球菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、白假丝酵母菌数量高于对照组（P＜0.05）;研究组阴道菌群密集度Ⅲ+Ⅳ级、多样性Ⅱ+Ⅲ级、微生态失调比例均高于对照组（P＜0.05）;研究组宫颈CD4⁺、CD4⁺/CD8⁺比值低于对照组（P＜0.05）;研究组宫颈IL-1β、IFN-γ、IL-2水平低于对照组（P＜0.05）。

合并HPV16感染可使BV患者阴道乳酸杆菌数量减少,阴道微生态失衡,局部免疫功能下降,应尽早检测此类患者阴道菌群和宫颈阴道局部免疫情况,进行针对性干预。

     

两种乳杆菌联用在食蟹猴阴道的定植效率及其毒性分析

研究乳杆菌鼠李糖乳杆菌-格氏乳杆菌联用制剂(LACT)的定植效率, 评估其有效剂量在动物体内的急性和长期毒性。

在食蟹猴中进行2轮阴道定植试验, 通过检测阴道分泌物pH值和清洁度, 并分离鉴定分泌物中的乳杆菌, 确定乳杆菌联用制剂的定植率和定植剂量; 通过单次和多次阴道给药, 检测联用制剂对食蟹猴体质量、食量、生殖器官及生化指标等的影响, 检测联用制剂在体内的急性和长期毒性。

联用制剂在食蟹猴中连续阴道给药5 d后能成功定植, 改善阴道的微生态; 甲硝唑预处理能够提高定植效率和定植时间; 联用制剂对食蟹猴不具有急性和长期的毒性作用。

在动物模型中, 2种乳杆菌联用制剂对细菌性阴道病具有良好的治疗潜质。

     

腹腔镜联合GnRH-a治疗后Ⅲ-Ⅳ期子宫内膜异位症患者妊娠情况与阴道微生态的相关性

探讨腹腔镜联合GnRH-a治疗后Ⅲ-Ⅳ期子宫内膜异位症（EMS）患者妊娠情况与阴道微生态的相关性。

经腹腔镜联合GnRH-a治疗后的196例EMS患者根据妊娠情况分为妊娠组（n = 98）和未妊娠组（n = 98）,比较两组阴道微生态差异。将已成功妊娠的患者按照阴道微生态情况分组探讨阴道微生态对妊娠结局的影响和相关性。

治疗前未妊娠组与妊娠组的pH值、H₂O₂值、菌群密集度、菌群多样性、Nugent评分、AV评分差异无统计学意义（P＞0.05）,但治疗后未妊娠组上述指标异常的病例比例显著高于妊娠组（P＜0.05）。在已成功妊娠的EMS患者中,阴道微生态异常的患者发生不良妊娠结局的比例显著高于阴道微生态正常的患者（P＜0.05）。pH值、H₂O₂值、菌群密集度和多样性、Nugent评分和AV评分的异常可导致不良妊娠结局。

阴道微生态失衡是经腹腔镜和GnRH-a联合治疗后的Ⅲ-Ⅳ期EMS患者不能成功妊娠或妊娠后发生不良妊娠结局的重要原因。

     

CIN患者阴道微生态状况与HPV感染的关系分析

分析宫颈上皮内瘤变（CIN）患者阴道微生态与人乳头瘤病毒（HPV）感染的关系。

选取326例本院收治的CIN患者,采集阴道分泌物和宫颈脱落细胞,通过形态学和功能学检测阴道微生态状况,采用PCR-反向点杂交法进行HPV分型检测,采用二分类Logistic回归分析影响CIN患者HPV感染的因素。

CIN患者HPV阳性共256例,占78.5%,HPV阴性共70例,占21.5%。HPV阳性CIN患者白细胞计数＞10个/高倍视野、阴道清洁度Ⅲ-Ⅳ度、VVC阳性、AV阳性、BV阳性、pH值＞4.5、白细胞酯酶阳性、过氧化氢阳性占比高于HPV阴性患者,微生态正常者占比低于HPV阴性患者（P＜0.05）。二分类Logistic回归分析显示,VVC、BV、微生态正常和pH值为CIN患者HPV感染的影响因素。

CIN患者HPV感染率较高,且感染后存在阴道微生态失调,VVC、BV、微生态异常和pH值是CIN患者HPV感染的影响因素。

     

人体肠道菌群对二甲基亚砜的体外降解作用——

通过二甲基亚砜（DMSO）与肠道菌群相互作用机制的研究,为DMSO的降解及其在药物研究中的应用提供肠道菌群方面的理论依据。

采用分批发酵、气相色谱、气质联用和高通量测序技术研究DMSO的降解量与肠道菌群结构间的关系。

发酵液中主要检测到甲硫醚、二甲基砜、二甲基二硫醚及甲基硫代磺酸甲酯等DMSO相关代谢产物;与其他他汀相比,生理浓度氟伐他汀组菌群的DMSO降解效果最佳,可能与Proteobacteria及Solobacterium和Escherichia-Shigella等菌群的相对丰度增加有关。不同肠道菌群产二甲基硫醚（DMS）水平差异明显,DMS分解可能与硫代谢途径相关,涉及的微生物主要是Desulfovibrio。

人体肠道菌群可降解DMSO,其降解效率可能与Escherichia-Shigella的相对丰度有关,降解产物对人体肠道菌群结构无影响。

     

不同方案阴道乳杆菌活菌胶囊结合抗菌药物治疗混合性阴道炎的临床研究

研究两种阴道乳杆菌活菌胶囊结合抗菌药物对混合性阴道炎的疗效。

选取2015年4月至2020年12月北京大学第一医院收治的混合性阴道炎患者50例。同时符合以下两项即确诊为混合性阴道炎：（1）阴道分泌物真菌检测阳性;（2）阴道分泌物革兰染色积分法评分（Nugent评分）≥7分;（3）阴道分泌物滴虫镜检阳性。入选患者根据乳杆菌胶囊使用方法分为联合组（25例）及序贯组（25例）,联合组在使用抗菌药物的同时使用阴道乳杆菌活菌胶囊,序贯组在使用抗菌药物结束后序贯使用阴道乳杆菌活菌胶囊。评估两组患者病原体转阴率、症状改善及乳杆菌恢复情况。

序贯组患者综合治愈率高于联合组（56.0% vs 28.0%,P＜0.05）。经过治疗后,联合组有12.0%的患者阴道菌群恢复为形态类似乳杆菌的革兰阳性大杆菌,序贯组有32.0%恢复为形态类似乳杆菌的革兰阳性大杆菌,两组差异无统计学意义（P＞0.05）,但序贯组在趋势上高于联合组。

对于混合性阴道炎的治疗来说,抗菌药物治疗后序贯使用阴道乳杆菌活菌胶囊优于抗菌药物治疗同时联合使用阴道乳杆菌活菌胶囊。

     

妊娠妇女阴道微生态和B族链球菌与胎膜早破及母婴结局的相关性

探讨妊娠妇女阴道微生态状况和B族链球菌（GBS）感染与妊娠晚期胎膜早破及母婴结局的相关性。

回顾性收集2021年1月至2022年12月我院114例临床确诊足月胎膜早破妊娠妇女为研究对象（胎膜早破组）,随机选取同期分娩的129例健康妊娠妇女为对照组。收集两组对象临床资料,比较两组对象阴道微生态变化、GBS感染及不良母婴结局发生情况。

两组妊娠妇女阴道假丝酵母菌菌体及孢子检出情况比较差异均无统计学意义（均P＞0.05）。胎膜早破组患者阴道pH≥4.5、细菌性阴道病、需氧菌性阴道炎的发生率及微生态失衡率高于对照组（均P＜0.05）。胎膜早破组妊娠妇女绒毛膜羊膜炎、产褥感染、胎儿窘迫及新生儿肺炎等不良母婴结局发生率高于对照组（均P＜0.05）。单因素分析结果显示,阴道pH≥4.5、有GBS感染、阴道微生态失调与不良母婴结局有关（均P＜0.05）。

妊娠晚期阴道微生态失衡、GBS感染与妊娠晚期胎膜早破的发生相关,同时会增加不良母婴结局的发生率。加强相关危险因素的干预可降低妊娠晚期女性胎膜早破发生率,改善不良母婴结局。

     

呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变

探究呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变,为该类患儿的治疗提供参考。

选取我院2020年4月至2022年4月收治的83例呼吸窘迫综合征新生儿作为试验组,另选我院同期健康新生儿83例作为对照组,收集两组对象粪便标本。对比两组对象肠道菌群的变化情况。

与对照组相比,试验组患儿肠道菌群Chaol指数和Shannon指数显著降低,Ace指数显著升高,差异均有统计学意义（均P＜0.05）。两组对象肠道厚壁菌门、变形菌门、链球菌属相对丰度对比差异均有统计学意义（均P＜0.05）。

呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群改变较大。