肺部菌群研究的方法学进展CSCD

菌群在促进人类健康方面发挥着重要的作用,而人体菌群紊乱可导致或加剧多种疾病。由于肺部菌群和肺部病变在空间上重叠,二者可能存在更紧密的联系。有研究者以肺部菌群为切入点,探索肺部疾病和健康的关系。但目前关于肺部菌群的检测技术和送检样本类型等实验实施过程中涉及的方法学问题尚未达成共识,样本污染问题在收集和测序过程中出现的频率越来越高,降低了研究的科学性和说服力。因此,为使研究者了解肺部菌群研究的方法学进展,避免陷入实验设计和方法选择的误区,本文就该领域的主要研究技术和影响肺部菌群检测结果的因素作一综述。     

足月小样儿与正常足月儿母亲胎盘菌群差异研究CSCD

目的探讨足月小样儿与正常足月儿母亲胎盘菌群差异,为今后开展深入研究提供数据参考。方法采集2018年1月至9月在昆明医科大学第一附属医院产科规律产检并住院分娩的足月儿母亲的胎盘组织,共9例,按出生体重分为足月小样儿组和正常足月儿组。应用组织DNA提取试剂盒提取胎盘组织菌群DNA,采用16S rDNA高通量测序技术检测样本,分析测序结果,比较两组胎盘菌群差异。结果两组胎盘菌群在门水平上无差异(P>0.05),均以厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门和放线菌门为主。在属水平上,链球菌属、副普雷沃菌属、黄曲霉属、小杆菌属、梭状芽孢杆菌属XI、Pelomonas和丁酸菌属的相对丰度在足月小样儿组中显著升高(P<0.05)。结论足月儿胎盘组织中可检测到细菌,足月小样儿与正常足月儿其母亲胎盘菌群的组成和丰度在属水平上存在差异。     

妊娠期糖尿病孕妇肠道菌群变化及其与血糖的相关性——

利用16S rDNA高通量测序技术,研究妊娠期糖尿病（GDM）孕妇的肠道菌群变化及与血糖的相关性。

2020年9月—2021年3月,选取在温州市人民医院定期产前检查并分娩的孕妇44例,根据妊娠24~28周口服75 g葡萄糖耐量试验结果分为妊娠期糖尿病组（22例）及正常对照组（22例）,收集孕妇的一般资料。通过Illumina Miseq平台对受试者粪便细菌DNA进行16S rDNA测序,比较两组肠道菌群的结构、丰度及多样性。

肠道菌群ɑ−多样性分析结果显示,GDM组孕妇Chao1、Shannon、Ace、Coverage指数与正常对照组相比,差异无统计学意义（P＞0.05）。两组孕妇肠道菌群的共同优势菌群为厚壁菌门和拟杆菌门,GDM组弯曲杆菌门比例高于对照组（P＜0.05）。LEfSe分析结果显示两组丰度有显著差异的物种共有28种,其中24种在GDM组中富集,4种在正常对照组中富集。通过Bray-Curtis dbRDA分析发现,肠道菌群结构与75 g OGTT 0 h血糖及75 g OGTT 1 h血糖呈负相关（P＜0.05）。采用Spearman相关性分析评估两组肠道菌群与OGTT血糖值的相关性,发现瘤胃球菌属、链球菌属、丁酸球菌属与OGTT 0 h血糖呈负相关（P＜0.05）;小杆菌属、布劳特菌属、Monoglobus与OGTT 1 h血糖呈负相关（P＜0.05）;毛螺旋菌属、普雷沃菌属与OGTT 2 h血糖呈负相关（P＜0.05）。

16S rDNA高通量测序有助于分析GDM孕妇肠道菌群的丰度及多样性,为研究GDM孕妇肠道菌群结构的特点及与血糖的相关性提供新的思路和理论依据。

     

16S rDNA测序研究高脂饮食诱导的高脂血症大鼠肠道菌群变化

通过高脂饮食诱导大鼠高脂血症, 采用16S rDNA测序检测高脂血症大鼠肠道菌群变化情况。

SD大鼠20只(清洁级), 按体质量随机分为模型组和对照组, 对照组大鼠给予维持饲料, 模型组大鼠给予高脂饲料。1周后检测血清总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平。采集大鼠粪便, 采用16S rDNA测序法对大鼠肠道菌群进行分析, 考察高脂血症大鼠肠道菌群变化情况。

高脂血症大鼠肠道菌群生物多样性(Alpha多样性和Beta多样性)发生显著变化, 肠型与对照组差异明显, 在门、科、属等多个水平差异均具有统计学意义。其中, 厚壁菌门(Firmicutes)和念珠菌门(Candidatus saccharibacteria)数量显著下降, 拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)数量显著升高。

高脂饮食诱导的高脂血症可引起大鼠肠道菌群发生显著变化。

     

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌对C57BL/6小鼠肺部菌群的扰动

【背景】肺部菌群与宿主健康和呼吸道疾病密切相关,耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistantKlebsiella pneumonia,CRKP)是临床常见的条件致病菌,感染后对肺部菌群的影响尚不清楚。【目的】探究耐碳青霉烯类肺炎克雷伯杆菌CRKP2对C57BL/6小鼠肺部菌群的扰动。【方法】将C57BL/6小鼠随机分为3组,分别用CRKP2、碳青霉烯类敏感肺炎克雷伯菌KP2044和无菌PBS溶液滴鼻,利用16S rRNA基因的高通量测序技术分析肺部菌群结构。【结果】与健康小鼠相比,菌株KP2044和CRKP2感染后小鼠肺部菌群α多样性和β多样性均显著改变,变形菌门相对丰度显著增加,乳酸杆菌属相对丰度明显下降。与KP2044相比,CRKP2生物膜形成能力较弱,感染后小鼠死亡率较低,对肺部菌群的扰动较小。【结论】虽然肺炎克雷伯菌是条件致病菌,但高剂量耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌CRKP2仍对健康小鼠肺部菌群造成显著影响;尽管菌株CRKP2具有多重耐药性,但与菌株KP2044相比对肺部菌群的扰动较小,因此推测KP菌株感染对肺部菌群的扰动程度可能与菌株毒力有关。     

裕固族血脂异常人群肠道菌群结构特征分析

探究生活在相同环境下的同一民族血脂异常人群与健康人群的肠道菌群差异,为血脂异常的精准预防和治疗提供参考。

收集甘肃肃南县裕固族血脂异常人群和健康人群粪便样本,提取细菌总DNA,通过16S rDNA高通量测序和生物信息学技术,分析2组人群肠道菌群的差异。

裕固族健康组人群肠道菌群分属26个门,73个纲,169个目,301个科,709个属,门水平上丰度＞1%的物种有4个,属水平上丰度＞1%的物种有22个。裕固族血脂异常组人群肠道菌群分属29个门,75个纲,280个目,304个科,702个属,门水平上丰度＞1%的物种有4个,属水平上丰度＞1%的物种有15个。裕固族血脂异常组人群肠道菌群与健康组间拟杆菌门、厚壁菌门、放线菌门水平以及F/B比值存在显著差异,Р＜0.05的差异物种有5个,Subdoligranulum、Christensenellaceae_R-7_group及Dialister与血脂水平呈负相关,Lachnoclostridium、Parasutterella与血脂水平呈正相关。

肃南县裕固族血脂异常组人群肠道菌群结构与健康组存在差异,为下一步关联分析肠道菌群与血脂异常及环境因素提供了基础数据。

     

原发性肝癌患者经肝动脉化疗栓塞术后舌苔菌群变化特征研究

对比分析原发性肝癌（PLC）患者和经肝动脉化疗栓塞术（TACE）后患者舌苔菌群多样性变化和菌群结构差异。

收集我院20例确诊肝癌患者和10例同期体检无异常的健康组（HC组）,根据确诊的肝癌患者治疗期间是否行TACE术,进一步分为原发性肝癌初诊组10例（NL组）,原发性肝癌患者TACE术后患者组10例（LIT组）,总纳入人数30例。采用16S rDNA高通量测序技术分析各组舌苔菌群结构并比较菌群差异。

舌苔菌群ɑ-多样性分析结果显示,NL组、LIT组Chao1、Shannon、Ace、Simpson指数与HC相比,差异无统计学意义（P＞0.05）。β-多样性分析表明,三组样本的舌苔菌群组间结构有差异,与LIT组相比,NL组与HC组的舌苔菌群构成差异更小,更接近于HC组。在科水平上,与HC组相比,NL组和LIT组的消化链球菌科丰度显著升高（P＜0.05）,LIT组的瘤胃球菌科、支原体科、丰度明显下降,差异具有统计学意义（P＜0.05）。与NL组相比,LIT组舌苔拟杆菌纲、普雷沃菌科和瘤胃球菌科丰度显著降低（P＜0.05）。

原发性肝癌患者的舌苔菌群失调,TACE治疗可能一定程度调节舌苔菌群的丰度,降低致病菌,恢复口腔微环境的稳态。

     

基于16S rDNA测序技术分析功能性便秘患者粪便菌群

运用16S rDNA测序技术分析功能性便秘（FC）患者粪便菌群特征,以期寻找FC特征菌,为FC诊治寻找新的治疗靶点。

收集福建中医药大学附属第二人民医院60例实验组（FC患者）和30例正常组的粪便,采用16S rDNA测序技术分析粪便菌群结构,并进行基因功能的预测。

两组在门水平上,主要由厚壁菌门和拟杆菌门组成;在属水平上,主要优势菌以粪杆菌属和拟杆菌属为主。实验组粪便菌群丰富度指数Chao1、Observed_OTUs较正常组升高（P＜0.05）,多样性指数Shannon指数和Simpson指数虽有上升趋势,但差异无统计学意义（P＞0.05）。布劳特菌属、罗氏菌属、Ruminococcus_gnavus_group、Ruminococcus_gauvreauii_group、Eubacterium_hallii_group、Anaerostipes、Lachnospiraceae_ND3007_group、Dorea、乳球菌属在实验组中丰度均显著降低（P＜0.01）。实验组特征菌为小杆菌属,正常组为布劳特菌属和埃希菌−志贺菌属。实验组蔗糖降解Ⅲ（PWY-621）、丙酮酸发酵成乙酸和乳酸（PWY-5100）和琥珀酸发酵成丁酸盐（PWY-5677）功能下降（P＜0.05）。

功能性便秘患者主要表现为肠道菌群丰度与多样性升高,FC的发病可能与菌群结构发生改变有关。

     

慢传输型便秘患者肠道粪便菌群的变化特征

目的通过16S rDNA高通量测序技术,研究慢传输型便秘(slow transit constipation,STC)患者粪便菌群的变化特征。方法选取12例慢传输型便秘患者(STC组)及12例健康志愿者(对照组),留取粪便标本后,应用16S rDNA高通量测序技术对标本进行测序,并分析测序结果。结果 STC组与对照组人群肠道在菌群物种种类(Chao1指数和Sobs指数)上差异存在统计学意义(Z=-2.771,P=0.006;Z=-2.425,P=0.015),对照组人群肠道菌群物种种类明显高于STC组;两组在物种均一性(Shannon指数、Simpson指数)上差异无统计学意义(Z=-0.520,P=0.603;Z=-0.348,P=0.728)。在门水平,两组人群粪便菌群多样性差异无统计学意义。在属水平,Phascolarctobacterium(Z=-2.194,P=0.028)、Streptococcus(Z=-4.157,P0.001)、Eggerthella(Z=-2.427,P=0.015)和Actinomyces(Z=-2.310,P=0.021)在STC组人群肠道中相对丰度增加,而Faecalibacterium(Z=-2.887,P=0.004)、Roseburia(Z=-3.118,P=0.002)、Sphingomonas(Z=-4.157,P0.001)、Variovorax(Z=-2.732,P=0.006)、Holdemania(Z=-1.970,P=0.049)、Phyllobacterium(Z=-2.732,P=0.006)、Pseudomonas(Z=-2.439,P=0.015)、Acinetobacter(Z=-2.732,P=0.006)、Aquabacterium(Z=-2.134,P=0.033)和Novosphingobium(Z=-2.134,P=0.033)在STC组中相对丰度减少。结论 STC组与对照组人群肠道在菌群物种种类丰富度上差异存在统计学意义,而在菌群分布均一性上差异无统计学意义;在菌属水平,两组人群的粪便菌群构成也存在较大差异。     

幽门螺杆菌相关胃炎患者唾液菌群的研究

目的 探究幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,H. pylori）相关胃炎（HpAG）患者和健康人群的唾液菌群特征,找出HpAG患者与无H. pylori感染人群唾液菌群之间的差异。方法 选取符合纳入标准的门诊及住院HpAG患者30例（HP组）,无H. pylori感染者30例（HC组）,收集2组人群唾液标本,通过PCR法扩增16S r RNA基因V3―V4区,经过高通量测序后,对测序数据处理后进行ASV注释、群落结构及多样性分析。结果 群落结构分析表示HpAG患者有其特征性的菌群结构。门水平上,HC组与HP组患者均以拟杆菌门（Bacteroidota）、变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、梭杆菌门（Fusobacteriota）和放线菌门（Actinobacteriota）为主要优势菌门。与HC组比较,HP组患者唾液菌群中Fusobacteriota相对丰度显著增加（t=2.01,P<0.05）。属水平上,HC组与HP组患者均以普雷沃菌属（Prevotella）、奈瑟菌属（Neisseria）、嗜血杆菌属（Haemophi...     

Bacterial microbiota in upper respiratory tract of COVID-19 and influenza patients

The upper respiratory tract is inhabited by diverse range of commensal microbiota which plays a role in protecting the mucosal surface from pathogens. Alterations of the bacterial community from respiratory viral infections could increase the susceptibility to secondary infections and disease severities. We compared the upper respiratory bacterial profiles among Thai patients with influenza or COVID-19 by using 16S rDNA high-throughput sequencing based on MiSeq platform. The Chao1 richness was not significantly different among groups, whereas the Shannon diversity of Flu A and Flu B groups were significantly lower than Non-Flu & COVID-19 group. The beta diversity revealed that the microbial communities of influenza (Flu A and Flu B), COVID-19, and Non-Flu & COVID-19 were significantly different; however, the comparison of the community structure was similar between Flu A and Flu B groups. The bacterial classification revealed that Enterobacteriaceae was predominant in influenza patients, while Staphylococcus and Pseudomonas were significantly enriched in the COVID-19 patients. These implied that respiratory viral infections might be related to alteration of upper respiratory bacterial community and susceptibility to secondary bacterial infections. Moreover, the bacteria that observed in Non-Flu & COVID-19 patients had high abundance of Streptococcus, Prevotella, Veillonella, and Fusobacterium. This study provides the basic knowledge for further investigation of the relationship between upper respiratory microbiota and respiratory disease which might be useful for better understanding the mechanism of viral infectious diseases.     

采用高通量测序技术研究抗生素对小鼠肠道菌群的影响

目的 探讨不同浓度抗生素对小鼠肠道菌群多样性和结构的影响,并预测相关功能变化。方法 15只SPF级ICR小鼠随机分为正常组、低浓度抗生素组和高浓度抗生素组,连续灌胃5 d后,采集小鼠新鲜粪便样本。利用Illumina MiSeq测序平台,对细菌的16S rRNA V3‒V4区进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析。结果 高、低浓度抗生素组小鼠肠道菌群组成与正常组存在明显差异。与正常组相比,高剂量组小鼠肠道肠球菌属、志贺埃希菌属相对丰度显著升高（t=‒2.71,P=0.026;t=‒2.30,P<0.05）;分节丝状菌属、拟普雷沃菌属相对丰度显著降低（t=2.88,P=0.020;t=2.49,P=0.037）,理研菌属极显著降低（t=3.79,P=0.005）。低剂量组小鼠肠道菌群变形菌纲成为优势菌,芽胞杆菌属、粪球菌_2、苏黎世杆菌属、普雷沃菌属_2、普雷沃菌属_7、志贺埃希菌属、沙雷菌属和放线菌属等相对丰度显著升高（均P<0.05）;梭杆菌属、泛菌属极显著升高（t=‒3.19,P=0.013;t=‒3.50,P=0.008）;分节丝状菌属、理研菌属相对丰度显著降低（t=2.69,P=0.028;t=2.33,P=0.048）。PICRUSt功能预测分析显示,抗生素组显著增加人类疾病、细胞过程和环境信息处理功能层的基因拷贝数,显著降低有机系统、遗传信息处理和代谢功能层的基因拷贝数。结论 广谱抗生素能破坏小鼠肠道的微生态平衡,有必要深入研究抗生素对心血管、免疫性、感染性及神经退行性疾病发展的潜在作用。     

炎性因子IL6的缺失对C57BL/6鼻咽部细菌群落组成的影响

目的研究炎症因子IL-6缺失是否影响鼻咽部菌群组成。方法提取鼻咽部灌洗液DNA并进行扩增子测序检测IL-6敲除前后鼻咽部菌群,分析菌群α多样性,并使用Wilcoxon秩和检验分析差异菌群。通过PICRUSt对菌群OTU丰富度表进行标准化,然后进行菌群关联的KEGG分析。结果 IL-6基因敲除后鼻咽部菌群丰富度和多样性变化不明显,但菌群组成发生明显变化。丰富度前15个属中9个属明显变化,有6个属明显下降,3个属明显上升。其中,Streptococcus和Bergeyella丰富度明显升高,Staphylococcus、Rothia和Corynebacterium_1丰富度明显降低。Real time PCR检测种水平发现IL-6敲除后Staphylococcus lentus丰富度明显降低。菌群KEGG分析发现,IL-6敲除后,炎性功能相关的脂肪细胞因子信号通路表达下调、细胞凋亡通路表达上调,另外,部分抗病毒活性通路表达上调。结论炎性因子IL-6与鼻咽部菌群组成存在明显相关性,菌群KEGG分析发现IL-6敲除后多个炎性功能相关通路表达受到影响。     

包衣益生菌对功能性便秘患者肠道菌群的影响和临床疗效

观察包衣益生菌产品对功能性便秘患者的疗效及对患者肠道菌群的影响。

收集2022年1月到3月大连市第二人民医院消化内科就诊的功能性便秘患者10例,患者均服用包衣益生菌产品7 d,使用16S rDNA测序技术检测患者服用前后及停药后3 d和7 d的肠道菌群变化情况,评价患者便秘情况是否改善。

治疗后患者便秘相关生活质量（PAC-QOL）评分、便秘严重程度（CSI）评分均较治疗前显著降低（均P＜0.01）,粪便性状好转。停用3 d和7 d时,患者肠道菌群Ace和Chao1指数均较服用前升高（均P＜0.05）。服用后,在属水平上,患者肠道Klebsiella、Lactococcus、Bacteroides相对丰度上升,Blautia和Anaerostipes相对丰度下降;在种水平上,肠道Lactobacillus plantarum、Klebsiella quasipneumoniae、Enterococcus faecium和Megasphaera elsdenii相对丰度升高,Anaerostipes hadrus相对丰度降低。

包衣益生菌产品对功能性便秘有一定的改善作用,能够增加患者肠道菌群的丰度,使肠道菌群结构更加接近健康人群。

     

测序平台在母婴肠道菌群结构分析中产生的可能偏倚

目的将两个不同的二代测序平台及其生物信息学流程进行的相同标本的微生物群分析结果的异同进行比较。方法在同一实验室采用相同的生物信息学分析方案,使用两个不同的测序平台(Ion Torrent S5-xl和Illumina HiSeq 2500)对56个(28对)母婴粪便样本进行16S rRNA扩增子测序,采用相关性分析、主成分分析(PCA)、主坐标分析(PCoA)以及MRPP分析比较两个平台产生的微生物群落结构的异同。结果 Alpha多样性除Shannon指数外,Chao1指数(t=1.96,P=0.001 1)、Observed species指数(t=2.13,P0.001 0)、PD_whole tree指数(t=2.07,P0.001 0)、Simpson指数(t=1.87,P=0.003 1)和Good coverage指数(t=2.32,P0.001 0)差异存在统计学意义。对不同分类水平下的菌群相对丰度进行分析,测序和注释的细菌种类越多,两个平台间建立的细菌相对丰度的相关性越低。PCA结果显示,超过87%的样本被聚类。通过PCoA结果将两个平台的56个样本分为两个集群(cluster),两个平台之间的重叠率为71.43%。MRPP差异分别显示了两个测序平台的菌群数据在科水平、属水平上差异存在统计学意义(A=0.094 1,P=0.001 0;A=0.085 2,P=0.002 1)。当考虑样本来源时,在科水平上,母亲组的菌群组成没有明显的测序平台差异(A=0.006 3,P=0.149 1),新生儿组差异则有统计学意义(A=0.035 2,P=0.006 1);在属水平,母、婴组的菌群组成有显著的测序平台差异(A=0.021 6,P=0.004 2;A=0.098 1,P=0.001 0)。结论相同样本在不同平台进行扩增子测序,其菌群结构相对丰度基本相似,但其多样性和相关性仍然有很大差异。为了队列研究数据的可重复性和可靠性,建议使用相同的测序平台和分析流程以减少菌群分析中的偏倚。     

肠道和呼吸道菌群与肺部疾病的研究新进展

宿主微生物群落对机体局部以及系统免疫的影响已逐渐引起人们的关注,目前发现局部的微生物群落能够对机体远端部位的免疫能力造成影响。肠道和呼吸道菌群稳态对机体免疫系统发育以及抗病原微生物感染至关重要,肠道和呼吸道菌群失衡与炎症性疾病、代谢性疾病以及过敏性疾病密切相关。肠道和呼吸道菌群失衡会通过"肠—肺轴"的相互作用,引起免疫系统改变与急性、慢性肺部疾病的发生。在这篇综述中,我们对肠道微生物和呼吸道微生物在肠-肺轴中发挥作用的研究进展作一总结,并对从微生物角度进行疾病治疗干预的可能性进行分析。     

细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者的阴道菌群分析

目的 对比细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者与健康个体的阴道菌群,分析阴道菌群的结构,为确定该疾病的特征细菌及研究致病机制奠定基础。方法 采用临床Amsel标准筛选的17例细菌性阴道病患者、13例细菌性阴道病合并盆腔炎患者和52例健康者,使用无菌拭子采集阴道后穹窿分泌物以提取细菌基因组DNA。采用PCR技术扩增上一步得到的16S rRNA片段,而后将扩增产物通过变形梯度凝胶电泳（DGGE）分离以得到阴道细菌种属结构图谱,应用Quantity One软件进行聚类分析,应用凝胶测序法进行特异条带分析。检测16S rRNA基因,具体研究样品中的物种分类。结果 细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者的阴道菌群的构成与健康者相比较具有显著性差异。其中,Firmicutes等菌门细菌减少,Actinobacteria等菌门细菌增多;G. vaginallis、P. vaginallis等厌氧菌数量均增加,L.crispatus、L.iners等益生菌数量均有减少。结论 细菌性阴道病及其合并盆腔炎患者的生殖道内的合并感染改变了阴道内的原有微生态平衡。两组疾病组患者的阴道菌群构成相比于健康对照组变化明显。     

阴道菌群与子宫脱垂的相关性研究

研究阴道菌群与子宫脱垂的相关性,为该类患者的治疗提供参考。

选取杭州市妇产科医院门诊或体检中心募集的30例子宫脱垂患者（研究组）和30例健康人群（对照组）。利用细菌16S rDNA扩增技术分析两组对象阴道菌群的组成特点,并利用 LEfSe 及 LDA 分析具有显著差异的菌群。

在属水平上,绝经前人群阴道Oribacterium、Xanthomonadaceae_unclassified在研究组的相对丰度大于对照组（均P＜0.05）;绝经后人群阴道Finegoldia、Paracnuella、Clostridium_XVIII在研究组的相对丰度大于对照组,Alterileibacterium、Ileibacterium、Microbacteriaceae_unclassified在研究组的相对丰度小于对照组（均P＜0.05）。两组对象阴道菌群丰度指数（Sobs、Chao、Ace）及多样性指数（Shannon、Simpson、InvSimpson）差异无统计学意义（均P＞0.05）。研究组中绝经前人群阴道菌群Sobs、Chao、Shannon、Invsimpson指数小于绝经后人群,Simpson指数大于绝经后人群（均P＜0.05）。绝经后人群中,研究组对象Finegoldia丰度较高,对照组对象Sneathia丰度较高。绝经前人群中,研究组对象Fastidiosipila丰度较高,对照组对象Parvimonas丰度较高。ROC曲线提示,Anaerococcus和Sneathia的组合有助于预测子宫脱垂的发生。绝经后,研究组对象脂质代谢显著下降,而蛋白酶体代谢通路功能显著上升。

阴道菌群与子宫脱垂具有相关性。蛋白酶体代谢通路可能通过下调雌激素及受体水平参与了子宫脱垂的发生。

     

慢性胃炎患者肠道菌群分析

探索慢性胃炎（CG）患者肠道菌群变化特点。

采集我院青年CG患者（CG组）和健康人群（NC组）的粪便样品,对其细菌16S rDNA V3—V4区域进行扩增并进行高通量测序,然后运用多种生物信息学手段进行分析。

CG组与NC组对象肠道菌群在门和科水平上均有不同之处,其中CG组对象有较高丰度的Actinobacteriota和较低丰度的Ruminococcaceae。CG组对象肠道菌群多样性及均一度均显著低于NC组（均P＜0.05）,但两者具有相似的丰富度水平。多元方差分析和相似性百分比分析均发现CG组和NC组对象肠道菌群有较大差异。Bifidobacterium、Blautia、Collinsella、Ruminococcus_torques_group和Streptococcus与CG患者密切相关。

CG患者的肠道菌群存在较大变化,其中Bifidobacterium、Blautia等细菌与CG的发生相关。