基于VOSviewer的肝硬化肠道微生态研究的可视化分析——

分析肝硬化肠道微生态的研究现状、热点及前沿趋势。

检索Web of Science（WOS）核心数据库建库至2020年12月31日的肝硬化肠道微生态研究的英文文章。通过文献计量分析软件VOSviewer分析发文国家、机构、作者和本研究领域的热点和前沿方向。

共检索到848篇文章。美国的Virginia Commonwealth University是肝硬化肠道微生态相关文章发表最多的机构。国外学者Bajaj JS在该领域发文量最高。肝硬化肠道微生态相关研究在《Hepatology》上的发表数量最多,为48篇。研究热点可概括为肝性脑病、代谢性肝病、菌群失衡与炎症感染等。

通过对肝硬化肠道微生态研究热点和新兴趋势进行可视化分析,为肝硬化肠道微生态的研究人员及研究单位提供了研究方向及潜在合作可能。

     

基于Web of Science的阴道菌群研究现状和热点的可视化分析与展望

探索阴道菌群近10年来的研究现状并预测其发展趋势。

在Web of Science数据库中检索近10年阴道菌群相关的文献,运用可视化软件VOSviewer进行共词分析、文献耦合、合著分析等。

阴道菌群领域发文量呈整体上升趋势,目前的主要热点研究分为阴道菌群的多样性、传染病学、细胞生物和基因学、阴道菌群与生殖的关联四大方面。

文献可视化研究展现了阴道菌群的研究现状和发展趋势,为相关研究人员提供了借鉴。

     

基于CiteSpace可视化分析生命早期肠道菌群领域研究现状和发展趋势

探讨近10年生命早期肠道菌群领域的研究现状和发展趋势,梳理知识结构,以期为今后的研究提供参考资料。

检索2012—2022年中国知网、维普、万方和Web of Science数据库中的相关文献,通过CiteSpace软件进行知识图谱的构建和可视化呈现。

2012—2022年该领域的发文量总体呈上升趋势。关键词分析表明菌群的组成与功能、菌群的发育与演化、菌群与宿主的相互作用,以及婴幼儿食品的研发生产等是现阶段研究的热点方向;16S rRNA基因测序、宏基因组测序以及代谢组学等是现在热门的研究方法。

该领域研究的重点正逐渐从菌群组成向菌群功能转变;多组学方法的整合逐渐成为新的研究趋势。

     

近20年阴道菌群的知识结构和发展趋势——基于CiteSpace的文献计量分析

分析阴道菌群研究动态与热点,为其相关研究提供更全面的视角。

以Web of Science为来源数据库,运用CiteSpace.6.1.R2软件绘制文献的作者、机构、国家合作网络图谱以及关键词共现、聚类、突现图谱并进行分析。

共纳入文献4 624篇;美国和华盛顿大学分别是最高产的国家和机构。关键词聚类形成10大板块;获得20个引用爆发的关键词。

阴道菌群的研究热点集中在微生物特征和研究、对疾病的影响及菌群失调的诊治三大方面;阴道菌群与人乳头瘤病毒感染、艾滋病病毒感染及肠道菌群的相互关系在一定时期内为研究前沿。

     

规定饮食条件下不同性别和年龄恒河猴的肠道菌群差异探讨

探讨规范统一的饮食在不受饮食因素干扰前提下不同性别和年龄恒河猴肠道菌群的差异。

将38只恒河猴按性别和年龄分为6组,规定饮食喂养3个月,收集粪便标本,应用16S rRNA测序和生物信息学分析探讨不同性别和年龄恒河猴肠道菌群的差异。

雄性和雌性恒河猴肠道菌群多样性无显著差异,但雌性群体中Epsilonproteobacteria和Helicobacter macacae的丰度显著增加。成年和老年恒河猴肠道菌群的多样性均显著高于幼年,Rikenellaceae、Christensenellaceae和Prevotella的丰度在老年群体中显著增加。

恒河猴的肠道菌群受性别和年龄的影响,尤其是与代谢和精神疾病相关的Rikenellaceae、Christensenellaceae和Prevotella在老龄恒河猴肠道菌群丰度更高。这些特定肠道菌群在不同性别和不同生命阶段调节机体生理或行为过程中的功能有待进一步研究。

     

人体肠道菌群对二甲基亚砜的体外降解作用——

通过二甲基亚砜（DMSO）与肠道菌群相互作用机制的研究,为DMSO的降解及其在药物研究中的应用提供肠道菌群方面的理论依据。

采用分批发酵、气相色谱、气质联用和高通量测序技术研究DMSO的降解量与肠道菌群结构间的关系。

发酵液中主要检测到甲硫醚、二甲基砜、二甲基二硫醚及甲基硫代磺酸甲酯等DMSO相关代谢产物;与其他他汀相比,生理浓度氟伐他汀组菌群的DMSO降解效果最佳,可能与Proteobacteria及Solobacterium和Escherichia-Shigella等菌群的相对丰度增加有关。不同肠道菌群产二甲基硫醚（DMS）水平差异明显,DMS分解可能与硫代谢途径相关,涉及的微生物主要是Desulfovibrio。

人体肠道菌群可降解DMSO,其降解效率可能与Escherichia-Shigella的相对丰度有关,降解产物对人体肠道菌群结构无影响。

     

双歧杆菌制剂对肿瘤化疗患者肠道菌群影响的Meta分析

探讨双歧杆菌制剂对肿瘤化疗患者肠道菌群的影响。

通过检索PubMed、Embase、The Cochrane Library、Web of Science以及CBM、CNKI、WanFang Data和VIP数据库,收集各数据库从建库至2022年7月发表的所有关于肿瘤化疗患者应用双歧杆菌制剂的随机对照试验,由2名研究者独立筛选文献,按照系统评价的要求对文献质量进行评估,使用Revman 5.4和Stata 17.0统计学软件进行Meta分析。

共纳入25篇文献（2 152例患者）,Meta分析结果显示,双歧杆菌制剂组患者肠道中双歧杆菌和乳杆菌的数量高于对照组[SMD = 2.89,95% CI（2.28,3.49）,P＜0.001;SMD = 2.20,95% CI（1.57,2.84）,P＜0.001],双歧杆菌制剂组患者肠道中大肠埃希菌、肠杆菌和肠球菌的数量低于对照组[SMD = −1.08,95% CI（−1.64,−0.52）,P＜0.001;SMD = −0.88,95% CI（−1.58,−0.17）,P = 0.010;SMD = −0.98,95% CI（−1.68,−0.28）,P = 0.006]。

在化疗的基础上添加双歧杆菌制剂对肠道主要菌群水平能起到显著的改善作用,降低不良反应发生率,值得在临床上推广及应用。

     

肠道微生态干预对非酒精性脂肪性肝病患者的影响：系统评价和网状meta分析

评估肠道微生态干预对成年非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）患者的肝脏特异性、代谢、炎症和肠道微生物群影响的最新证据。

检索Embase、PubMed、Cochrane Library、Web of Science、中国知网、万方数据库,筛选符合条件的随机临床试验,对纳入研究的数据进行提取和分析。

纳入37项随机对照试验：20项评估益生菌,2项评估益生元,10项评估合生元,2项评估益生菌和益生元,3项评估益生菌、益生元和合生元,治疗时间7～48周。经网状meta分析,对于大部分临床指标,益生元与合生元组干预效果优于对照组,且呈现出时间相关性,但肠道微生态干预各组干预效果差异无统计学意义。

网状meta分析表明肠道微生态干预改善了NAFLD的临床指标和肠道微生态,提示合生元可能是一种优于益生菌和益生元的干预措施,但需要足够的剂量和干预时间,我们的研究建议至少连续使用24周。

     

呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变

探究呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变,为该类患儿的治疗提供参考。

选取我院2020年4月至2022年4月收治的83例呼吸窘迫综合征新生儿作为试验组,另选我院同期健康新生儿83例作为对照组,收集两组对象粪便标本。对比两组对象肠道菌群的变化情况。

与对照组相比,试验组患儿肠道菌群Chaol指数和Shannon指数显著降低,Ace指数显著升高,差异均有统计学意义（均P＜0.05）。两组对象肠道厚壁菌门、变形菌门、链球菌属相对丰度对比差异均有统计学意义（均P＜0.05）。

呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群改变较大。

     

YNS益肤面霜对豚鼠皮肤变态反应及肠道菌群的影响

建立豚鼠皮肤变态反应模型,并使用YNS益肤面霜对皮肤变态反应模型进行干预,探讨这种面霜对改善及修复受损皮肤的作用及其对豚鼠肠道菌群的影响。

豚鼠24只,随机分成4组：对照组、阳性组、化妆品组和治疗组,每组6只。致敏接触后进行激发反应。提取4组豚鼠粪便标本DNA,使用16S rRNA高通量测序检测肠道菌群构成。

治疗组豚鼠皮肤致敏率为16.7%。益肤面霜治疗对肠道菌群alpha多样性影响不大,但有降低厚壁菌门（Firmicutes）与拟杆菌门（Bacteroidetes）比值（F/B）及粪球菌属（Coprococcus）相对丰度的趋势,有利于皮肤变态反应豚鼠肠道菌群组成的恢复。

YNS益肤面霜对皮肤具有改善及修复作用,并对豚鼠肠道菌群具有一定影响。

     

氮肥农学效应与环境效应国际研究发展态势

分析国内外农田氮素农学效应和环境效应研究的发展动态、研究热点,为以后研究农田氮素效应提供参考。基于ISI Web of Science数据库,检索出以"农田氮肥施用"为主题的所有SCI论文(1957—2014年8月),并分别提取出与"农学效应"、"环境效应"、"适宜施氮量"相关的文献,采用计量学方法,分析各研究方向的主要热点、研究机构、发文期刊和高被引论文等。共检索出关于农田施氮研究的SCI文献7460篇,其中与"农学效应"研究相关的文献2773篇,主要涉及到施氮肥对小麦、玉米、水稻、大豆等作物产量、氮素利用率和土壤有机碳的影响;与"环境效应"研究相关的文献1609篇,主要涉及到氮肥施用对氨挥发、硝化反硝化、温室气体排放、硝酸盐淋失、地下水水质等环境因素的影响;与"适宜施氮量"研究相关的文献408篇,主要涉及氮肥施用量、氮肥管理等。刊发各类研究成果最多的机构主要来自欧美发达国家,影响力大的期刊与高被引论文也主要来自欧美国家,中国在该领域的研究发展迅速,以中国科学院、中国农业大学、南京农业大学和中国农业科学院等为代表的中国研究机构的研究水平逐渐进入世界前列。文献计量学可用于分析农田氮素效应主题的研究热点和发展态势,目前氮素农学效应仍是研究的重点,随着当前环境污染问题日益突出,农田氮素环境效应研究越来越多,特别是氮流失对水体水质的影响备受关注,而基于氮素综合效应确定农田适宜施氮量是同时保障粮食安全和环境安全的有效措施。中国在相关研究领域的研究起步较晚,高影响力论文偏少,优秀国际期刊不足,但研究实力不断增加,研究成果也逐渐被国际社会所认可。     

基于Web of Science的国际海草研究文献计量评价

海草及其与周围环境形成的海草场是近海海洋生态系统的重要组成部分,具有多种重要的生态服务功能。相较于红树林和珊瑚礁,国内外学者和公众对海草的关注度偏低,至今对国际海草研究的现状、趋势和热点等的认识还较为有限。检索了1983-2017年Web of Science的SCI-E数据库中收录的海草研究相关文献,借助文献计量信息可视化分析方法,从年度发文量、研究力量和研究热点与主题等方面进行了较为系统的文献计量评价,以期阐明国内外海草研究的态势与热点。结果表明:1983-2017年间国际海草研究的文献数量总体呈明显上升趋势,该领域发文量排前3位的国家是美国、澳大利亚和西班牙;全球发文量最多的机构是佛罗里达州立大学,其次是西班牙高等科学研究理事会与美国国家海洋和大气管理局;发文总量较多的作者是Duarte CM、Marba N和Fourqurean JW,近3年发文量最高的是学者Santos R;刊文量最多的期刊分别是《Marine Ecology Progress Series》、《Aquatic Botany》和《Estuarine, Coastal and Shelf Science》,刊文量前15期刊中影响因子最高的是《Limnology and Oceanography》(3.969)。在国家、机构与作者合作方面,西班牙、丹麦、荷兰、墨西哥4个国家形成了关系密切的合作网络,西班牙高等科学研究理事会和美国国家海洋和大气管理局是海草研究机构合作网络中的两个中心,Duarte CM、Marba N等较多学者间有紧密的学术合作关系。通过高频关键词的关联关系分析,表明该领域的3个热点研究主题,即环境(污染)胁迫对海草场的影响、海草的生长与生理生态和海草及其相关生态系统的结构与功能。中国科学院、中国海洋大学等机构为我国海草研究做出了重要贡献,但由于研究起步较晚,我国学者的发文量、篇均被引频次等与欧美国家学者存在一定差距,但近几年的发文量增长迅速,预计未来的发展趋势良好。     

基于CiteSpace分析核酸适体（Aptamer）技术研究现状

利用可视化分析软件,客观、全面地展示和分析适体的研究现状、研究热点和发展趋势,为适体的研究提供指导和参考。以SCI数据库Web of Science平台为数据源,采用CiteSpace 5.5.R2软件对1900年1月1日至2020年12月31日的适体相关文献进行分析。共纳入文献14 939篇。在该领域发表论文最多的作者是WEIHONG TAN、KHALIL ABNOUS等;近年来突现的主题词是“wide linear range”“pg ml”“clinical diagnosis”“early diagnosis”等,是目前该领域的研究热点;作者共被引分析和文献共被引分析表明,该领域的研究主要集中在适体的体外筛选、适体构象的变化、适体在药物靶向治疗中的应用及适体生物传感器。结果表明,利用CiteSpace软件对Web of Science数据库中已发表的适体文献进行分析,揭示了该领域的研究热点从体外筛选和适体构象变化（1992—2002）到适体在药物靶向治疗和适体生物传感器中的应用（2002—2020）。结合近年来突现的主题词预测适体在药物靶向治疗和适体生物传感器中的应用仍将是未来的研究热点。     

基于CNKI数据库的肠道菌群与中医药文献计量学研究

目的 通过分析目前我国已发表的肠道菌群与中医药相关文献报道及其发展趋势,为科研工作者提供参考。方法 研究资料来源于CNKI数据库,应用文献计量学的方法对该数据库中所收录的肠道菌群与中医药的文献进行分析研究。结果 截止到2016年12月31日,总共检索到相关文献786篇。文献发表的数量在2003年以后增长速度显著提高;发表文献在10篇以上的单位共有15所,其中最多的单位发表42篇;25.70%的文献受到各级科研提供的资金支持和帮助。文献中以实验研究报告的类型为主,是总体文献数量的37.79%。文献被引用频次总体偏低,被引用次数在2次及以下的占60.43%。结论 肠道菌群与中医药的科研工作还存在需要改进和完善的地方,并且应该在提高文献数量的同时,努力加强文献的质量。     

鸟类学研究:过去二十年的回顾和对中国未来发展的建议

为了解中国鸟类学研究的状况和发展趋势,我们利用在线文献数据库(Web of Science)检索了1991-2010年间发表的与鸟类有关的文献,对中国和其他国家的鸟类学研究论文、研究领域、研究机构等进行了分析和比较。结果发现,中国鸟类学研究发展很快,专业研究人员数量在1991-2010年间增长了近四倍,在国际上发表的研究论文的数量近几年年均增长25%;论文数量占世界的比例已经由1991-2000年的0.46%上升到了2001-2010年期间的1.53%,世界排名由第27位上升至第16位,并且研究领域更加多元化,论文水平不断提高。在鸟类系统发育与演化、合作繁殖和婚配、禽流感、巢寄生等领域的许多成果开始在国际相关领域的高水平刊物上发表,在古鸟类以及雉类和鹤类等濒危鸟类的保护研究方面位居世界前列。但从整体而言,中国鸟类学研究与世界上一些发达国家相比还有很大差距。为此我们对中国鸟类学未来的发展提出了一些建议,包括需要更加关注鸟类的生活史对策、气候变化和城市化对鸟类的影响、鸟类迁徙、濒危物种保护生物学等领域的研究,进一步加强国际交流与合作,规范鸟类研究及数据保存和处理的方法,采取更有效措施加大对青年研究人员的支持力度等。     

基于近10年红球菌发展的文献计量分析

【背景】近些年,越来越多的研究集中在红球菌上,很少有研究人员对现有文献进行全面回顾。【目的】为了探究国内外红球菌领域的研究热点、前沿和未来发展趋势,以便为后续研究人员提供全面直观的参考。【方法】对近10年发表在Web of Science的红球菌领域论文进行统计分析和文献计量分析。通过VOSviewer文献可视化软件绘制作者标签视图和关键词共现网络图。【结果】全球有关红球菌领域的发文量总体呈逐年上升趋势,发表期刊多为微生物学领域的专科期刊,中国和美国的文章发表数和引用数远超其他国家,红球菌的研究内容也主要集中在生物催化、生物降解和非核糖体肽合成酶等方面。【结论】红球菌在世界范围内越来越受到重视,并逐渐成为研究热点,国家和研究机构应继续加强合作,推动红球菌领域的继续发展。     

阿尔茨海默症基因研究态势分析

阿尔茨海默症是一种起病隐匿的进行性发展的神经系统退行性疾病。随着全球老龄化日趋严重,阿尔茨海默症严重威胁人民的生命健康与生活质量。阿尔茨海默症成因复杂,治疗阿尔茨海默症仍然是重要的医学难题。通过对Web of Science核心合集中收录的阿尔茨海默症基因研究相关的文献,利用文献计量的方法,进行研究趋势、研究人员、研究机构、国家和研究热点等方面进行态势分析,为相关领域的研究人员提供重要的参考。