川崎病及川崎病冠状动脉病变患儿肠道菌群变化

研究川崎病及川崎病冠状动脉病变患儿肠道菌群变化情况, 为调节其肠道菌群提供参考。

选择我院2018年7月至2020年5月纳入的97例川崎病患儿作为观察对象, 依据超声心动图检查将其中出现冠状动脉病变的45例患儿作为研究组, 另外52例单纯川崎病患儿作为对照组, 检测两组患儿肠道菌群情况。

两组患儿肠道菌群多样性相比差异无统计学意义(P > 0.05), 但研究组患儿肠道菌群丰度高于对照组(P < 0.05)。研究组患儿肠道厚壁菌门占35.85%, 低于对照组的54.06%(P < 0.05)。研究组患儿肠道拟杆菌门占33.57%, 高于对照组的21.30%(P < 0.05)。研究组患儿肠道变形菌门占24.39%, 与对照组的25.21%相比差异无统计学意义(P > 0.05)。研究组患儿肠道乳杆菌属、拟杆菌属、韦荣球菌属分别占3.87%、25.03%、2.75%, 与对照组的21.23%、16.23%、17.95%相比差异均有统计学意义(均P < 0.05)。

川崎病冠状动脉病变患儿肠道菌群状况与单纯川崎病患儿存在显著差异, 合并冠状动脉病变的患儿肠道菌群紊乱更为显著, 应受到临床重视。

     

急性脑卒中患者肠道菌群研究

通过粪便标本检测急性脑卒中患者肠道菌群变化情况, 探讨急性脑卒中患者肠道菌群结构。

通过高通量二代测序技术对10例健康者(对照组)及10例急性脑卒中患者(疾病组)粪便样本进行菌群结构测序分析。

与对照组比较, 急性脑卒中患者粪便样本中物种OTU信息量显著增加(P < 0.01), 菌群多样性指数(Shannon)和物种均一度指数(Evenness)也有所增加但差异无统计学意义(均P > 0.05)。门水平上, 疾病组患者肠道Bacteroidetes数量较对照组显著增加, Firmicutes数量显著减少(均P < 0.05)。属水平上, 疾病组患者肠道Bacteroides、Bilophila、Butyricimonas比例较对照组显著升高, 而Collinsella、Coprococcus、Clostridium等比例较对照组显著降低(均P < 0.05)。

急性脑卒中患者肠道菌群结构与健康人存在显著差异。

     

沼泽红假单胞菌对健康小鼠肠道微生物的影响

探讨不同剂量沼泽红假单胞菌对健康小鼠生理功能及肠道微生物结构的影响。

将48只C57/BL6小鼠随机分为对照组(无菌生理盐水)以及沼泽红假单胞菌低剂量组(5×10⁸ CFU/mL)、中剂量组(5×10⁹ CFU/mL)、高剂量组(5×10¹⁰ CFU/mL), 每组12只; 不同剂量灌胃4周后, 测定小鼠胃泌素(Gas)、生长抑素(SS)含量, 观察肠道形态, 并应用Illumina-MiSeq测序平台进行16S rRNA基因V3-V4区测序, 分析其肠道微生物群落结构、多样性及组间差异。

与对照组相比, 低剂量组对促进小鼠Gas分泌差异具有统计学意义(t=6.426, P < 0.01), 高剂量组对抑制小鼠SS分泌差异具有统计学意义(t=3.711, P < 0.05);对照组小鼠回肠肠绒毛高度差异无统计学意义(P > 0.05), 且无肠道炎症刺激反应。沼泽红假单胞菌干预后细菌丰富度和多样性增加, 在门水平上, 与对照组相比, 实验组小鼠肠道菌群拟杆菌门丰度显著降低, 厚壁菌门丰度显著增加(均P < 0.05);在属水平上, 与对照组相比, 实验组小鼠肠道菌群Lachnospiraceae NK4A136 group、乳杆菌属、拟杆菌属、理研菌属和Prevotellaceae UCG-001相对丰度显著增加(均P < 0.05)。

沼泽红假单胞菌能够维持胃肠激素稳态和肠道形态结构, 且对健康小鼠肠道菌群的丰富度和组成产生一定的影响, 维持肠道平衡与稳定。

     

变应性鼻炎患者肠道微生态变化及其与T淋巴细胞亚群的关系

探讨变应性鼻炎患者肠道微生态变化及其与T淋巴细胞亚群的关系。

回顾性分析2019年4月至2020年4月医院收治的64例变应性鼻炎患者的资料, 记为A组; 另回顾性分析同期在该院体检的58例健康者的资料, 记为B组。对比A组和B组研究对象肠道菌群多样性和丰富度的变化, 对比A组和B组研究对象血清T淋巴细胞亚群水平, 分析变应性鼻炎患者肠道菌群相对丰度与血清T淋巴细胞亚群水平的相关性。

A组研究对象肠道菌群Chao1指数和Shannon指数均低于B组(P < 0.05), A组肠道菌群门水平拟杆菌门、变形菌门、厚壁菌门的相对丰度均高于B组(P < 0.05), 放线菌门的相对丰度低于B组(P < 0.05), 属水平毛螺菌属、链球菌属的相对丰度均高于B组(P < 0.05), 肠球菌属、双歧杆菌属、棒状杆菌属的相对丰度均低于B组(P < 0.05)。主成分分析显示2组菌群样品均能明显分开, 横纵坐标的贡献率分别为48.9%和16.7%, 两坐标轴总共解释了不同细菌群落差异的65.6%, 2组群落结构差异明显(P < 0.05)。A组CD3⁺比例、CD4⁺比例和CD4⁺/CD8⁺比值高于B组(P < 0.05), CD8⁺比例低于B组(P < 0.05);采用Pearson相关性检验, 变应性鼻炎患者肠道菌群门水平拟杆菌门、变形菌门和厚壁菌门的相对丰度分别与CD3⁺、CD4⁺比例和CD4⁺/CD8⁺比值呈正相关(P < 0.05), 分别与CD8⁺比例呈负相关(P < 0.05), 放线菌门的相对丰度分别与CD3⁺、CD4⁺比例和CD4⁺/CD8⁺比值呈负相关(P < 0.05), 与CD8⁺比例呈正相关(P < 0.05);属水平毛螺菌属和链球菌属的相对丰度分别与CD3⁺、CD4⁺比例和CD4⁺/CD8⁺比值呈正相关(P < 0.05), 分别与CD8⁺比例呈负相关(P < 0.05), 肠球菌属、双歧杆菌属和棒状杆菌属的相对丰度分别与CD3⁺、CD4⁺比例和CD4⁺/CD8⁺比值呈负相关(P < 0.05), 分别与CD8⁺比例呈正相关(P < 0.05)。

变应性鼻炎患者肠道菌群多样性降低, 门、属水平菌群比例均发生改变, 菌群结构差异明显, 血清CD3⁺、CD4⁺水平和CD4⁺/CD8⁺比值升高, CD8⁺水平降低, 变应性鼻炎患者肠道菌群相对丰度与血清T淋巴细胞亚群水平相关。

     

糖脂代谢性疾病模型小鼠肠道菌群特征分析

基于16S rDNA测序研究非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)、2型糖尿病(T2D)及动脉粥样硬化(AS)小鼠的肠道菌群特征, 分析上述疾病肠道微生物的异同。

以SPF级C57BL/6J雄鼠为对象, 分别采用高脂饮食制备NAFLD模型, 高脂饮食联合小剂量链脲佐菌素腹腔注射建立T2D模型, ApoE^-/-小鼠高脂饮食诱导AS模型, 另设对照组, 每组10只。采用试剂盒测定小鼠血清中总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)的水平。收集粪便样本, 以Illumina MiSeq测序平台, 采用QIIME2软件对肠道菌群的可分类操作单元(OTUs)数量, Alpha、Beta多样性和菌群多样性指数以及差异菌门、菌属等进行综合分析与评价, 并对肠道菌群代谢功能进行预测。

与对照组小鼠比, T2D组、NAFLD组、AS组血清中TC、TG和LDL-C水平均显著升高, 菌群多样性指数显著降低(F=14.33, P < 0.01), Firmicutes/Bacteroidetes比值逐渐升高; 双歧杆菌属(Bifidobacterium)丰度在AS组、T2D组中显著增加(F=12.15, P < 0.01), 在NAFLD组中显著下降(F=12.15, P < 0.05), 乳杆菌属(Lactobacillus)丰度在NAFLD组、AS组中著降低(F=9.35, P < 0.01), 在T2D组中显著降低。关联分析表明Lactobacillus、Akkermansia等与血脂呈负相关, Faecalibaculum、Blautia等与血脂呈正相关。肠道菌群参与代谢性疾病主要涉及碳水化合物代谢、氨基酸代谢、脂质代谢以及能量代谢等通路。

本研究阐明了NAFLD、T2D、AS肠道微生物组成与变化的共性和个性特征, 为靶向调控肠道微生物治疗代谢性疾病提供科学依据。

     

不同程度颅脑疾病患者肠道菌群分析

检测不同程度颅脑疾病患者肠道菌群分布情况, 探讨患者肠道菌群分布与疾病的关系, 为该类患者的治疗提供参考。

通过MiSeq PE2x300 bp高通量测序技术对21例重度颅脑损伤患者(G1组, GCS≤8分)和14例轻度颅脑损伤患者(G2组, GCS > 8分)粪便样本中细菌的16S rRNA基因V3-V4可变区进行定性分析, 并对两组患者肠道菌群进行生物学分类比较、多样性分析和组间物种差异分析。

两组患者肠道菌群多样性差异无统计学意义(均P > 0.05)。G1组患者肠道厌氧球菌属(Anaerococcus)、埃希菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella)、链球菌属(Streptococcus)、肠球菌属(Enterococcus)、棒状杆菌属(Corynebacterium)数量高于G2组(均P < 0.05)。

颅脑疾病患者肠道菌群紊乱, 其肠道菌群丰度及多样性显著下降, 有害菌数量升高, 有益菌数量下降。

     

呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变

探究呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群的改变,为该类患儿的治疗提供参考。

选取我院2020年4月至2022年4月收治的83例呼吸窘迫综合征新生儿作为试验组,另选我院同期健康新生儿83例作为对照组,收集两组对象粪便标本。对比两组对象肠道菌群的变化情况。

与对照组相比,试验组患儿肠道菌群Chaol指数和Shannon指数显著降低,Ace指数显著升高,差异均有统计学意义（均P＜0.05）。两组对象肠道厚壁菌门、变形菌门、链球菌属相对丰度对比差异均有统计学意义（均P＜0.05）。

呼吸窘迫综合征新生儿肠道菌群改变较大。

     

肠道微生物与首发抑郁症的关系分析

分析肠道微生物与首发抑郁症的关系。

选取本院92例首发抑郁症患者纳入抑郁症组, 并取同期年龄、性别构成等匹配体检健康者50例作为对照组, 评估其24项汉密尔顿抑郁量表(HAMD-24)评分, 并于量表评估完成24 h内进行新鲜粪便的收集, 以PCR法定性分析16S rRNA V3-V4可变区, 并采用Pearson法分析菌群与HAMD-24评分的相关性。

两组菌群多样性指数(Ace、Chao、Shannon、Simpson)比较差异无统计学意义(P > 0.05);主坐标分析(PCoA)显示两组肠道微生物群落构成有差异。LEfSe结果显示, 首发抑郁症患者以拟杆菌门、β-变形菌纲、产碱菌科、幽门螺杆菌和伯克菌目等肠道微生物为主; 对照组优势菌主要包括厚壁菌门、乳酸杆菌目和双歧杆菌科等。抑郁症组厚壁菌门、放线菌门、柔壁菌门、Ruminococcus、Subdoligranulum、Enterobacter、Coprococcus、Bifidobacterium、Lactobacillus丰度明显低于对照组(P < 0.05), 拟杆菌门、Klebsiella、Flavonifractor、Bacteroides丰度明显高于对照组(P < 0.05)。HAMD-24评分与拟杆菌门、Flavonifractor、Bacteroides呈正相关(P < 0.05), 与厚壁菌门、放线菌门、柔壁菌门、Ruminococcus、Subdoligranulum、Coprococcus、Lactobacillus呈负相关(P < 0.05)。

首发抑郁症患者肠道微生物α-多样性与正常人相似, 但β-多样性与菌群丰度发生了异常改变, 这些改变和首发抑郁症病情密切相关。

     

内毒素血症对新生鼠肠道菌群的影响

利用高通量测序技术分析内毒素血症新生鼠肠道菌群的变化, 探究肠道菌群与内毒素血症的关系, 为临床诊治提供思路。

复制新生大鼠内毒素损伤模型, 注射LPS后第24小时、第3天、第7天分别处死新生大鼠, 留取粪便并将对照组(C1组6只、C3组5只、C7组7只)和LPS组(L1组5只、L3组5只、L7组5只)按处死天数各分为3组。高通量测序分析各组间菌群多样性及相对丰度差异。

(1) Alpha多样性分析提示对照组和LPS组菌群多样性及丰度有显著差异, C3组较L3组Shannon指数均值小(t=-3.386 8, P=0.009 5), Simpson指数均值大(t=3.102 4, P=0.014 6);C7组较L7组Shannon指数均值大(t=2.459 4, P=0.033 7), Simpson指数均值小(t=-2.475 6, P=0.032 8)。(2)物种组成分析表明LPS组的菌群结构发生改变, 在门水平LPS组较对照组变形菌门相对丰度高, 厚壁菌门相对丰度低; 在属水平上LPS组较对照组埃希菌-志贺菌属相对丰度高, 乳杆菌属相对丰度低; 且随着天数的递增LPS组埃希菌-志贺菌属呈递增趋势, 红球菌属呈递减趋势。

内毒素血症可以改变新生鼠肠道菌群的组成, 并与肠道菌群失调有一定的关系。

     

首发抑郁症患者肠道菌群特征及其与健康人群肠道菌群结构的差异

比较首发抑郁症患者与健康人群肠道菌群的差异,探讨抑郁症患者肠道菌群和抑郁症状间的关系,为抑郁症的发病机制研究及治疗提供一定的理论依据。

选择2019年10月至2020年9月我院收治的首发抑郁症患者及健康人群为研究对象,分为抑郁组（n = 23）和健康组（n = 31）。对研究对象肠道菌群16S rRNA基因中V4−V5区域片段进行基因测序,使用汉密尔顿抑郁量表对两组对象抑郁症状进行评估。检测两组对象肠道菌群α多样性、β多样性和组间差异。

首发抑郁症患者与健康人群肠道菌群多样性差异无统计学意义（均P＞0.05）。两组对象肠道拟杆菌门和拟杆菌纲的相对丰度差异有统计学意义（均P＜0.05）。两组对象芽胞杆菌目等的相对丰度差异有统计学意义（P＜0.05）。在属水平和种水平上,两组对象分别有28个菌属和40个菌种的丰度差异有统计学意义（均P＜0.05）。LEfSe分析显示,拟杆菌科、艾克曼菌科等10种菌科是造成两组对象肠道菌群差异的主要细菌。

首发抑郁症患者与健康人群肠道菌群多样性未发现显著差异,但抑郁症患者肠道菌群结构与健康人群相比发生了改变,主要体现在拟杆菌属等细菌在抑郁症患者肠道中的相对丰度显著上升。

     

重症慢性阻塞性肺病急性发作期患者血清PCT, hs-CRP及D-D的表达及意义

目的:探究重症慢性阻塞性肺病(COPD)急性发作期患者血清降钙素原(PCT)、超敏C反应蛋白(hs-CRP)和D-二聚体(D-D)的表达及意义。方法:选取2014年9月-2016年9月我院收治的146例COPD患者作为研究对象,其中73例COPD急性发作期(AECOPD)患者纳入急性期组,73例COPD缓解期患者纳入缓解期组,另选取同期来我院体检的40例健康者作为对照组。比较三组研究对象的血清PCT、hs-CRP和D-D水平,同时比较急性期组细菌感染与无细菌感染患者、不同肺功能分级的患者血清PCT、hs-CRP和D-D水平的差异。结果:急性期组与缓解期组患者的血清PCT、hs-CRP和D-D水平较对照组显著升高(P0.05),急性期组的血清PCT、hs-CRP和D-D水平较缓解期组显著升高,差异有统计学意义(P0.05)。合并细菌感染组血清PCT、hs-CRP水平均显著高于无细菌感染组(P0.05),而D-D水平则无统计学差异(P0.05)。不同肺功能分级患者间的血清PCT、hs-CRP和D-D水平比较差异显著(P0.05),且肺功能分级越高水平越高(P0.05)。结论:AECOPD患者的血清PCT、hs-CRP和D-D水平均显著的升高,三者联合检测能够有效反映患者病情严重程度,并有利于诊断患者是否存在有细菌感染。     

金汁对脂多糖诱导脓毒症小鼠肠道微生态的影响

探讨金汁对脂多糖诱导脓毒症小鼠肠道微生态的影响, 研究肠道微生态的改变对内毒素释放的作用。

选择BALB/c小鼠150只, 随机分为4组: 空白对照组10只, 生理盐水(NS)+脂多糖(LPS)组40只, LPS组60只, 金汁+LPS组40只。除空白对照组外其余组小鼠均腹腔注射LPS造模; 造模成功后金汁+LPS组灌胃金汁干预, NS+LPS组灌胃NS干预。比较不同处理下小鼠的生命体征和存活率。在清洁条件下收集各组小鼠粪便样本, 进行16S rRNA基因测序分析金汁对LPS诱导的脓毒症小鼠肠道微生态的影响。

金汁干预可以提高LPS诱导的脓毒症小鼠存活率; Alpha多样性分析显示, 金汁组菌群群落丰度有所下降, 与LPS组相比菌群多样性高; Beta多样性分析显示, 金汁组与其他3组相比肠道菌群结构相似度高, 同时4组之间菌群也发生了变化并且还存在着差异。在门水平, 4组小鼠肠道菌群都是以拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门为优势菌; 在属水平, Blautia在空白对照组中丰度最高(0.170 9±0.062 4;H=14.762 0, P=0.002 0), 副杆菌属在金汁组中丰度最高(0.000 7±0.000 8;H=8.662 3, P=0.034 1), Rikenella丰度金汁组高于LPS组(0.024 3±0.021 4 vs 0.013 8±0.009 9;T=956, P=0.026 3), LPS组的葡萄球菌属(0.019 4±0.096 7;H=8.478 3, P=0.037 3)和棒状杆菌属(0.011 1±0.049 5;H=14.230 0, P=0.003 1)的丰度最高。

LPS可以降低肠道有益菌丰度, 增加致病菌丰度, 导致肠道微生态紊乱, 破坏肠黏膜屏障, 增加内毒素入血。而金汁干预可以降低致病菌丰度、增加有益菌来恢复肠道微生态, 是治疗LPS引起的脓毒症的一种很有前途的选择。

     

16S rDNA测序研究高脂饮食诱导的高脂血症大鼠肠道菌群变化

通过高脂饮食诱导大鼠高脂血症, 采用16S rDNA测序检测高脂血症大鼠肠道菌群变化情况。

SD大鼠20只(清洁级), 按体质量随机分为模型组和对照组, 对照组大鼠给予维持饲料, 模型组大鼠给予高脂饲料。1周后检测血清总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平。采集大鼠粪便, 采用16S rDNA测序法对大鼠肠道菌群进行分析, 考察高脂血症大鼠肠道菌群变化情况。

高脂血症大鼠肠道菌群生物多样性(Alpha多样性和Beta多样性)发生显著变化, 肠型与对照组差异明显, 在门、科、属等多个水平差异均具有统计学意义。其中, 厚壁菌门(Firmicutes)和念珠菌门(Candidatus saccharibacteria)数量显著下降, 拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)数量显著升高。

高脂饮食诱导的高脂血症可引起大鼠肠道菌群发生显著变化。

     

Microbiome analysis among bats describes influences of host phylogeny, life history, physiology and geography

Metagenomic methods provide an experimental approach to inform the relationships between hosts and their microbial inhabitants. Previous studies have provided the conceptual realization that microbiomes are dynamic among hosts and the intimacy of relation between micro- and macroorganisms. Here, we present an intestinal microflora community analysis for members of the order Chiroptera and investigate the relative influence of variables in shaping observed microbiome relationships. The variables ranged from those considered to have ancient and long-term influences (host phylogeny and life history) to the relatively transient variable of host reproductive condition. In addition, collection locality data, representing the geographic variable, were included in analyses. Results indicate a complex influence of variables in shaping sample relationships in which signal for host phylogeny is recovered at broad taxonomic levels (family), whereas intrafamilial analyses disclosed various degrees of resolution for the remaining variables. Although cumulative probabilities of assignment indicated both reproductive condition and geography influenced relationships, comparison of ecological measures among groups revealed statistical differences between most variable classifications. For example, ranked ecological diversity was associated with host phylogeny (deeper coalescences among families were associated with more microfloral diversity), dietary strategy (herbivory generally retained higher diversity than carnivory) and reproductive condition (reproductively active females displayed more diverse microflora than nonreproductive conditions). Overall, the results of this study describe a complex process shaping microflora communities of wildlife species as well as provide avenues for future research that will further inform the nature of symbiosis between microflora communities and hosts.     

慢性阻塞性肺疾病患者肠道微生物组成及基因功能分析

探讨慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者肠道微生物组成、丰度及差异基因功能变化。

收集我院呼吸科10例确诊COPD患者（COPD组）和10例对照受试者（对照组）粪便样品进行宏基因组高通量测序分析。

PCA分析组间比较发现2组研究对象粪便样品微生物群落差异大,具有可比性。物种组成分析显示：对照组粪便样品中高度富集的菌科主要包括毛螺菌科、理研菌科、韦荣球菌科、优杆菌科、臭杆菌科、氨基酸球菌科、乳杆菌科等,属层面富集的主要包括罗斯菌属、胃瘤球菌属、小杆菌属、真杆菌属、拟杆菌属、粪球菌属、双歧杆菌属等;COPD组粪便样品富集菌群主要包括紫单胞菌科、Selenomonadaceae、巨单胞菌属和韦荣球菌属。物种多样性分析与对照组相比,COPD组多样性更低,差异有统计学意义（W = 87,P = 0.0039）。物种相关性网络图分析显示与其他门类菌群相比,拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门与其他物种的关联性最强（size = 52.07、18.87、14.01）。组间差异基因进行GO功能显著性富集分析,差异基因均富集在如细胞学过程、刺激应答、生物学黏附及调节、代谢过程及信号通路等。KEGG功能显著性富集分析显示差异基因主要富集途径包括代谢途径、次生代谢物合成、淀粉和蔗糖的合成、抗生素的合成等。

COPD患者肠道内存在菌群及基因功能失调。

     

Phylogenetic diversity of the intestinal bacterial community in the termite Reticulitermes speratus.

The phylogenetic diversity of the intestinal microflora of a lower termite, Reticulitermes speratus, was examined by a strategy which does not rely on cultivation of the resident microorganisms. Small-subunit rRNA genes (16S rDNAs) were directly amplified from the mixed-population DNA of the termite gut by the PCR and were clonally isolated. Analysis of partial 16S rDNA sequences showed the existence of well-characterized genera as well as the presence of bacterial species for which no 16S rDNA sequence data are available. Of 55 clones sequenced, 45 were phylogenetically affiliated with four of the major groups of the domain Bacteria: the Proteobacteria, the spirochete group, the Bacteroides group, and the low-G+C-content gram-positive bacteria. Within the Proteobacteria, the 16S rDNA clones showed a close relationship to those of cultivated species of enteric bacteria and sulfate-reducing bacteria, while the 16S rDNA clones in the remaining three groups showed only distant relationships to those of known organisms in these groups. Of the remaining 10 clones, among which 8 clones formed a cluster, there was only very low sequence similarity to known 16S rRNA sequences. None of these clones were affiliated with any of the major groups within the domain Bacteria. The 16S rDNA gene sequence data show that the majority of the intestinal microflora of R. speratus consists of new, uncultured species previously unknown to microbiologists.     

三联益生菌对便秘小鼠肠道推进功能改善及其对小鼠肠道菌群调节作用的研究

目的 研究新型嗜酸乳杆菌NCFM‒乳双歧杆菌Bi-07‒鼠李糖乳杆菌NH001三联益生菌制剂对便秘小鼠小肠蠕动的促进作用,以及其对小鼠肠道菌群构成比例的调节作用。方法 小肠推进率实验：将50只KM小鼠适应性饲养后随机分为空白对照组、模型对照组和低中高三个剂量组。空白对照组和模型对照组给予蒸馏水,低中高剂量组每天分别给予0.165、0.330、0.990 g/（kg•bw）益生菌制剂,灌胃14 d后使用复方地芬诺酯建立小鼠便秘模型观察小肠墨汁推进率;肠道菌群调节作用实验：将42只BALB/c小鼠中随机抽取10只作为自身对比空白组,适应性饲养后将所有小鼠随机分为空白对照组和低中高三个剂量组,空白对照组给予蒸馏水,各剂量组以相同剂量给予益生菌制剂灌胃。自身对比空白组于灌胃前无菌采集小鼠直肠粪便,所有小鼠灌胃30 d后无菌采集直肠粪便,使用16S rDNA基因测序对粪便中菌群DNA进行多样性及各水平菌群物种测定。结果 高剂量组便秘小鼠小肠推进率显著高于模型对照组（P<0.05）;各剂量组肠道菌群多样性、双歧杆菌属、乳杆菌属数量较灌胃前显著增加（P<0.05）,大肠埃希菌属、梭菌属、肠球菌属较灌胃前显著降低（P<0.05）。结论 三联益生菌能够有效促进便秘小鼠肠道蠕动能力,改善便秘症状;同时对小鼠肠道菌群结构有调节作用。     

茶多酚对ApoE~(-/-)小鼠肠道菌群多样性的影响

目的以高脂饲料饲养的SPF级C57 BL/6 ApoE-/-小鼠作为动物模型,研究茶多酚采食对其肠道菌群多样性的影响。方法通过随机饮水的方式给予ApoE-/-小鼠0.4、0.8和1.6 g/L的茶多酚,处理14 d时用PCR-DGGE分析对照组(CK)和茶多酚组小鼠新鲜粪便中肠道菌群的相似性和多样性。结果 UPGMA聚类分析表明,低剂量茶多酚组(LTP)、中剂量茶多酚组(MTP)这两组与对照组(CK)、高剂量茶多酚组(HTP)聚为两大簇。PCA分析显示,LTP组与CK组、MTP组、HTP组分别聚集在不同位置,有明显界限;多样性数据分析显示:CK组DGGE图谱的丰富度和Shannon-Wiener指数(H')与茶多酚组差异无统计学意义(P0.05);CK组与MTP组的均匀度(E)差异存在统计学意义(P0.05,P=0.015),说明中剂量茶多酚作用14 d后与对照组肠道菌群的菌群分配相比均一性显著下降。结论连续处理14 d时CK组与LTP组、MTP组小鼠肠道菌群差异有统计学意义,即茶多酚对ApoE-/-小鼠肠道菌群多样性有显著影响。     

抗生素和高脂饮食对大鼠肠道乳杆菌多样性的影响

【目的】对正常、高脂、抗生素处理大鼠肠道内乳杆菌进行定性和定量分析,比较不同处理组大鼠肠道乳杆菌的多样性。【方法】应用纯培养和非培养技术(16S r RNA基因序列分析、变性梯度凝胶电泳、实时荧光定量PCR)对大鼠肠道乳杆菌进行分离鉴定和多样性分析。【结果】16S r RNA基因序列同源性分析结果显示,正常组大鼠肠道内分离出的乳杆菌包括约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)、鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus)、嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)、罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)、植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)、肠道乳杆菌(Lactobacillus intestinals)、动物乳杆菌(Lactobacillus animalis)和阴道乳杆菌(Lactobacillus vaginalis);但L.animalis在高脂处理组大鼠肠道内未分离到,L.intestinals和L.vaginalis在抗生素处理组大鼠中未分离到。DGGE结果显示3个组别大鼠肠道中乳杆菌构成差异明显,同一组内样品间相似性较高;相较于正常组和高脂组,抗生素组的丰度较差;且正常组大鼠肠道内乳杆菌的多样性高于高脂组和抗生素组。q-PCR结果显示正常组大鼠肠道乳杆菌的数量明显高于高脂组和抗生素组,高脂组的数量也明显高于抗生素组,且3个组别之间存在显著差异(P0.01)。【结论】高脂饮食及抗生素的使用会减少肠道内乳杆菌多样性。