《细胞研究》：研究发现新的肺癌致病基因突变

2月21日。《细胞研究》（Cell research）在线发表了中科院上海生科院生化与细胞所季红斌研究组与复旦大学肿瘤医院合作的最新研究成果”Identification of RET genefusion by exonarrayanalysesin”pan-negative”lungadenocarcinomasfromneversmokers”。该工作通过对Affymetrix外显子芯片的分析及实验验证,在非吸烟肺腺癌患者中寻找到一个新的致病基因融合CCDC6-RET。     

从碱基到人造生命——基因组的从头合成

人工方法合成基因可通过DNA化学合成,这也是基因获取的手段之一,是密码子优化、蛋白质工程、代谢工程及基因组工程等方面不可缺少的技术。本文从寡核苷酸的合成开始,对短片段DNA的合成、基因长度的DNA合成、基因组长度的DNA合成、长片段及基因组水平的DNA组装、基因组DNA的移植等方面的技术和问题进行了阐述。     

《胸肿瘤学期刊》：研究揭示中国肺腺癌人群热点基因突变谱

近日,国际肺癌研究协会举办的专业学术期刊《胸肿瘤学期刊》（Journal of Thoracic Oncology）在线发表了中科院生化与细胞所季红斌研究组与复旦大学肿瘤医院合作开展的最新研究成果,报道了中国肺腺癌人群中热点基因LKB1、EGFR和KRAS的突变谱。     

肽核酸及其应用

我们大家都熟知“合成寡核苷酸”是指人工制造的一小段DNA,它严格复制了天然DNA,每段寡核苷酸由5′-OH起始,以3′-OH终止。这种“合成寡核苷酸”已作为探针、引物、连接子和基因片段等广泛用于分子生物学研究。而谈及肽核酸(Peptide Nucleic Acids,PNA)就不如“合成寡核苷酸”那么熟悉了,PNA是由     

真核基因启动子非依赖的功能转录延伸复合物的体外组装

真核生物RNA聚合酶Ⅱ的持续合成能力对基因转录过程中每一个阶段,包括启动子脱离、转录暂停、转录终止以及转录偶联DNA损伤修复过程的调节至关重要.在RNA聚合酶Ⅱ介导的转录延伸过程中,其和模板DNA及转录产物RNA紧密结合,形成一个非常稳定的延伸三维复合物(elongationcomplex,EC).此特征性“泡”状结构的形成是RNA聚合酶Ⅱ持续合成能力所必需的.在不依赖启动子及众多转录起始因子的条件下,利用人工合成的RNA与DNA寡核苷酸,在体外组装形成具有功能转录活性的延伸复合物.结果表明,长度为9个核苷酸的RNA与模板DNA形成的杂合分子对转录延伸复合物的形成是必需的,而非转录模板DNA链的加入导致最终活性转录“泡”状复合物的形成,并可转录形成与模板相关的转录产物,进一步通过在模板DNA的特定位置引入一个乙酰氧乙酰氨基芴修饰基团,可特异性地阻断转录延伸过程,从而显示该系统在研究真核基因转录及转录偶联DNA损伤修复机制中的潜在应用价值.     

关于色氨酸操纵子的概念

关于色氨酸操纵子,在杨颐康先生主编的《微生物学》一书中是这样叙述的:“在色氨酸操纵子里,由调节基因产生的调节蛋白,本来不具阻遏蛋白活性,但与色氨酸结合后,由于构象变化,就具有与DNA的亲和力,而结合在DNA上,这样就使结构基因关闭,不可能产生色氨酸”。又如《基础微生物学专题选》(复旦大学“基础微生物学专题选”编写组)一书中用     

我国科学家在家蚕基因组研究中取得重大成果

由西南农业大学与中科院北京基因组研究所合作的研究论文“家蚕基因组框架图”在近日出版的SCIENCE(306卷5703期)上发表。研究人员在基因组框架图的基础上,通过对家蚕的DNA信息进行分析,共获得了18510个基因,其中97％为新发现的基因,在发现的基因中,有五大类重要功能基因对蚕业发展至关重要。83个基因(包括41个母性基因)参与生长和发育调控;     

遗传的物质基础

1知识点评“遗传的物质基础”是“遗传和变异”一章的单元课题之一,主要阐述遗传物质及其作用原理,即基因的本质与遗传信息的传递和表达。复习本单元知识应注意如下问题:1)本单元的主干知识包括:染色体是DNA的主要载体、DNA是遗传物质的实验证据、DNA的分子结构、基因与遗传信息、DNA的复制及基因控制蛋白质的合成等。上述知识中,既有事实性知识和方法性知识,又有命题性知识,复习时要作好对基础知识的分类,从而做到心中有数。2)本单元知识结构的主线是:配子→染色体→DNA→基因→遗传信息→性状,在有性生殖过程中,配子是亲体的产物,子…     

植物细胞器分子生物学讲座学习情况

6月22日至7月18日复旦大学生物系举办了“植物器胞分子生物学”讲座。由美藉孔宪铎教授主讲,复旦的盛祖嘉教授等也作了题为“基因的新概念”,“超速离心技术”,“同位素技术”,“雄性不育”等报告。孔教授讲座的内容非常丰富,关于细胞的基本结构、叶绿体、细胞器母体遗传、RuDP 羧化酶、农业现代化与遗传工程、叶绿体基因的进化、植物瘤与激素、细胞核基因与细胞器基因的合作、叶绿体基因的构造与表达等,他着重讲了叶绿体 DNA 与 RuDP 羧化酶两个问题。这些内容是他的实验室中所做过的或正在做的     

国家自然科学基金委员会生命科学部1991年度资助青年科学基金项目一览表(142项)

根瘤菌共生质粒携带的噬菌体抗体基因的研郭俊中国科学院武汉病毒所生物料半信息1991究黄亦存陈坚李晓林中国科学院微生物所无锡轻工业学院北京农业大学上海医科大学复旦大学清江卫钟外生菌根的分类研究厌氧颗粒污泥形成机制的研究VA菌根菌丝吸收土壤养分机理研究乙型肝炎病毒核心基因突变株的基因分析棉铃虫SNPV基因组结构功能及杀虫力增强 的遗传工程研究乙型肝炎病毒超螺旋DNA复制机制及阻断 的研究用免疫电镜研究番木瓜蛋白酶合成部位的结 构及发育大豆种子中贮藏蛋自质在子叶细胞内运输机 制的研咒斜翼属的亲缘关系及系统演化研究…     

国外科技简讯

“废弃”DNA 可能具有重要功能 据美国Biotech Reporter1994年8月报道:美国衣阿华州立大学的分子生物学家施纳贝尔及其同事,现正在定位玉米DNA中频繁地进行重组的区域或热点。他们不仅研究染色体中基因的构建和行为,而且也研究处于基因与基因之间的DNA。施纳贝尔说:“在植物中,基因与基因之间存在着大量的DNA,有人把这些DNA称之为废弃DNA。鉴于在进化的历史长河中,这些DNA并未被自然选择所淘汰,因此我们认为,它们可能具有重要的功能。”     

基因合成技术研究进展

基因合成是生物学中一项最基本的、最常用的技术.对DNA调控元件、基因、途径乃至整个基因组的合成是验证生物学假设和利用生物学为人类服务的有力工具.合成生物学的快速发展对基因合成能力提出了日益迫切的需求.近年来,基于微芯片基因合成技术取得了很多令人振奋的新进展,正在向着高通量、高保真、自动化的方向发展.文中综述了DNA化学合成和基因组装及相关技术的最新研究进展和发展趋势,这些新技术正在推动着合成生物学向着更高的水平发展.     

合成生物学：从科学内涵到工程实践——访中国科学院院士赵国屏

赵国屏,分子微生物学家。中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所研究员,中科院合成生物学重点实验室主任。1948年出生于上海。1982年获复旦大学微生物学学士,1990年获美国普度大学生物化学博士。     

人恶性疟杂合多肽抗原基因化学合成及克隆

本文报道用固相亚磷酰胺法合成人恶性疟杂合多肽抗原基因。基因全长为216bp,分为10个寡聚核苷酸片段分别合成,然后经T4 DNA连接酶按设计顺序连接成完整的杂合抗原基因,重组到噬茵体M13 mp 18 RF DNA内,转染大肠杆菌JM109。用分子杂交和酶切分析筛选出重组克隆体。经序列分析,证明所合成的人恶性疟杂合多肽抗原基因与所设计完全一致。     

基因合成与基因组编辑

合成生物学被认为是继"发现DNA双螺旋"和"人类基因组测序计划"之后的又一次生物技术革命,有望在工业制造、医药、农业、环境和能源等诸多领域带来变革。DNA合成和基因编辑是合成生物学的基石,其技术进步也是推动合成生物学快速发展的主要动力。该文重点介绍了DNA合成和基因编辑领域的主要技术及其研究进展,包括利用芯片oligo池的高通量基因合成技术和CRISPR介导的第三代基因组编辑系统等。     

'99生物医学光学国际会议总结

１９９９年１０月２５～２７日在华中理工大学召开了“工业激光与生物医学光学国际会议”,共有一百余人参加了本校生物医学光子学研究所主办的生物医学光学分会,其中国外代表３０人,主要来自美国、俄罗斯、日本、澳大利亚,加拿大等,国内代表主要来自清华大学、东南大学、华南师范大学、中科院上海光机所、中科院安徽光机所、南开大学、天津大学、复旦大学、北京理工大学、昆明理工大学、福建师范大学、中国科技大学、南京理工大学、云南师范大学、中科院生物物理所、中国药科大学等,参加生物医学光学分会的国外著名学者有：美国宾夕法…     

植物DNA条形码研究项目2010年度会议在昆明成功召开

中国科学院大科学装置开放研究项目——“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”2010年度会议于2010年8月12～13日在中国科学院昆明植物研究所成功召开。来自中科院昆明植物研究所、中科院植物研究所、中科院华南植物园、中科院武汉植物园、江苏省中科院植物研究所、广西植物所、中科院西双版纳热带植物园、     

基于PCR的长片段DNA精确合成及应用

长片段DNA的组装及基于PCR的长片段DNA的精确合成(PAS)是基因异源表达时简单快速合成长片段DNA的方法,适于合成含有较高GC含量、重复序列和复杂二级结构的长片段DNA分子(5～6 kb)。简要综述了PAS技术用于长片段DNA序列精确合成的基本原理、操作步骤、常见问题和解决方法,以及该技术的应用。     

研发动态

水稻产量相关功能基因研究取得重大进展,中科院上海药物所成立“常州研发中心”,华人学者研发出功能基因检测芯片,欧盟第七框架计划正式启动。支持生物技术研究与开发     

教后感

选修内容比必修深 ,教学有难度 ,要显效 ,宜兼顾两者。如第 5 3页 ,乳糖代谢基因表达调控图解 ,若让学生记住结构基因的左边先是操纵基因 ,接着是启动子 ,最末是调节基因 ,这未免枯燥 ,也不宜用“书读百遍其义自见”来勉励学生。应回顾必修本上的“基因是有遗传效应的 DNA片段”的含义。结构基因与其表达的蛋白质相对应 ,如基因 1ac Z编码半乳糖苷酶 ,学生对此易理解 ,这是所谓一对一的关系。而结构基因左侧的 DNA片段是什么 ?和结构基因一样 ,有遗传效应 ,是合成多肽链所不可缺少的。好比说 ,结构基因是某门学科的课任教师 ,操纵基因则…