一种简单、快速、有效的PCR产物克隆方法

一种简单、快速、有效的ＰＣＲ产物克隆方法李红卫,涂长春,金扩世,章金刚（长春农牧大学兽医研究所,长春１３００６２）关键词ＰＣＲ,克隆我们实验室在用ＰＣＲ法扩增和克隆病毒ｃＤＮＡ片段过程中,摸索了一种既不需设计酶切位点,也不需要纯化ＰＣＲ产物及特殊载体...     

一种病毒侵染性全长cDNA克隆的快速构建方法

利用ＲＴ－ＰＣＲ技术获得了含烟草花叶病毒蚕豆分离物（ＴＭＶ－Ｂ）的他长基因组ｃＤＮＡ,并克隆ｐＴ７Ｂｌｕｅ载体中。以获得的全长ｃＤＮＡ及其ＰＣＲ产物为模板分别进行体外转录,接种试验发现转录产物均具有侵染活性。比较两种方法发现以ＰＣＲ产物为模板的体外转录物的侵染效率更高。     

一种克隆PCR产物的新方法

一种克隆ＰＣＲ产物的新方法周复春,李学伍,吴斌,陈焕春（华中农业大学牧医系,武昌）基因克隆和分离是分子生物学和细胞生物学研究必不可少的组成部分。ＰＣＲ基因扩增可以产生微克级的特异性刀ＮＡ片段,可以简化从基因组ＤＮＡ克隆单拷贝基因片段的步骤。到达这种数...     

鳜鱼传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)PCR检测方法的建立及虹彩病毒新证据

利用真鲷虹彩病毒（ＲＳＩＶ）核苷酸还原酶小亚单位（ＲＮＲＳ）基因保守区设计的一对引物,建立了鳜鱼传染性脾肾坏死病毒（ＩＳＫＮＶ）特异的ＰＣＲ检测体系。运用该体系检测ＩＳＫＮＶ,具有简便、快速、敏感、特异等特点,为诊断与预防ＩＳＫＮＶ提供了一个重要的手段。通过对ＰＣＲ产物的克隆与序列分析,发现ＩＳＫＮＶ ＰＣＲ扩增产物与ＲＳＩＶ ＲＮＲＳ基因相应序列的同源性很高,达到９２．５％,进一步证明ＩＳＫＮＶ     

噬菌体6肽随机表面表达文库的构建

体外合成编码６肽的随机ＤＮＡ片段以及用于随机ＤＮＡ片段扩增了一对ＰＣＲ引物,再经ＰＣＲ扩增,ＢｇＩＩ酶切扩增产物,获得编码６肽的随机ＤＮＡ克隆片段,并利用已构建的噬菌体表面表达载体,经抗性和插入复活筛选,获得１．６×１０＾８个独立克隆,构成库的克隆经酶切,ＰＣＲ扩增,斑点杂交,序列测定,亲和素富集等方法的综合鉴定和评定,以及６肽随机克隆体外增殖和表达特性观察,结果均表明,我们成功构建了编码６肽的     

人基因组YAC克隆DNA的Alu—PCR反应条件的系统研究

在人基因组ＹＡＣ克隆的Ａｌｕ－ＰＣＲ指纹分析中要求ＤＮＡ扩增带具有ＹＡＣ特征性;在Ａｌｕ－ＰＣＲ方法对ＹＡＣ克隆中的人类基因组ＤＮＡ片段进行特异的同位素标记时则要求被增标记的ＤＮＡ序列在插入片段中具有一定弥散性,我们建立了两种不同的Ａｌｕ－ＰＣＲ反应体系以满足这一不同要求,并已得到较为满意的结果,根据不同条件下的Ａｌｕ－ＰＣＲ结果,分析了多引发位点ＰＣＲ中的一些现象,并作了解释。     

人基因组YAC克隆DNA的Alu－PCR反应条件的系统研究

在人基因组ＹＡＣ克隆的Ａｌｕ－ＰＣＲ指纹分析中要求ＤＮＡ且扩增带具有ＹＡＣ特征性;在用ＡｌＵ－ＰＣＲ方法对ＹＡＣ克隆中的人类基因组ＤＮＡ片段进行特异的同位素标记时则要求被扩增标记的ＤＮＡ序列在插入片段中具有一定的弥散性。我们建立了两种不同的Ａｌｕ－ＰＣＲ反应体系以满足这一不同要求,并已得到较为满意的结果。根据不同条件下的Ａｌｕ－ＰＣＲ结果,分析了多引发位点ＰＣＲ中的一些现象,并作出了解释。     

提高PCR产物及其克隆效率的几点方法与经验

本文介绍了提高ＰＣＲ产物及其克隆效率的方法与经验：如,引物的设计、目的片段的回收、连接体系、利用引物上所设计的酶切位点克隆、通过平末端克隆,以及加快实验进程的技巧、出现问题如何设计查找原因等。     

黑麦B染色体端粒相关序列的克隆

利用显微切割技术,分离了黑麦（ＳｅｃａｌｅｃｅｒｅａｌＬ．）１０个Ｂ染色体短臂端部片段,并利用寡核苷酸引物（ＣＣＣＴＡＡＡ）３及新建立的二级单引物序列ＰＣＲ扩增法,扩增了黑麦Ｂ染色体端粒相关序列。染色体原位杂交实验将ＰＣＲ产物定位于Ｂ染色体短臂末端,多数Ａ染色体末端也显示清晰的杂交信号。部分ＰＣＲ产物克隆到ｐＵＣ１９载体中,对其中一个克隆子ｐｐ３的序列分析结果表明,它与玉米亚端部克隆子ｐＢＦ２６６部分区域的同源性为９２％。就目前资料检索,黑麦、玉米端粒相关序列具有高度同源性还未见报道。对这一实验设计在构建高密度ＲＦＬＰ图谱中的应用进行了探讨     

菰物种专化DNA序列的克隆及其在检测菰DNA导入水稻中的应用

根据两个植物抗病基因Ｎ和ＲＰＳ２中核酸结合位点（ＮＢＳ）和富亮氨酸重复区（ＬＲＲ）中的保守序列设计了一对特异引物,用ＰＣＲ从具有水稻（Ｏｒｙｚａ ｓａｔｉｖａ Ｌ．）改良所需要的许多优良性状的水稻近缘野生种菰（Ｚｉｚａｎｉａ ｌａｔｉｆｏｌｉａ（Ｇｒｉｓｅｂ．）Ｔｕｒｃｚ．ｅｘ Ｓｔａｐｆ）的基因组ＤＮＡ中扩增同源片段。ＰＣＲ产物经克隆后,分别以菰和水稻的基因组ＤＮＡ为探针,通过点杂交对所得克隆进     

t-PA cDNA的克隆及其在毕赤酵母中的表达

应用ＰＣＲ方法,在ｔＰＡｃＤＮＡ５′端引入合适的限制酶位点和酵母分泌信号肽,与酵母表达载体ｐＰＩＣ９重组,构建表达质粒ｐＳＴＥＹ,利用ＬｉＣｌ转化法转化酵母菌ＹＳ１０８,在ＭＭ和ＭＤ平板上筛选表型,ＰＣＲ筛选ｔＰＡｃＤＮＡ与酵母染色体整合而形成的阳性克隆,阳性克隆经甲醇诱导表达后,用ＳＤＳＰＡＧＥ证明表达产物的分子量为６ｋＤａ左右,用酪蛋白板溶圈法测定ｔＰＡ的活性。Ｍｕｔｓ表型菌表达产物活性最高为２５００ＩＵ／ｍｌ,Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ证实表达产物具有天然ｔＰＡ分子的免疫原性。     

细胞内RT－PCR扩增免疫球蛋白重链可变区基因

通常,逆转录ＰＣＲ（ＲＴ－ＰＣＲ）需要高质量的ｍＲＮＡ,操作过程复杂,效率低且易受到ＲＮａｓｅ的破坏,为了简化操作,提高效率,用１０％甲醛盐溶液固定杂交瘤细胞,以ＮＰ－４０渗透化处理细胞后做ＲＴ－ＰＣＲ,获得了大约３５０ｂｐ的特异性免疫球蛋白重链可变区基因片段,与用同一对引物得到的常规ＲＴ－ＰＣＲ扩增产物一致。这项技术可用于获得特定结构基因片段,连结并扩增嵌合蛋白基因及构建多克隆免疫球蛋白文库等。     

PCR和Southern Blot检测土拉弗氏菌气溶胶

为提高检测土拉弗氏菌的特异性和敏感性,建立了土拉菌ＰＣＲ及核酸杂交检测方法。运用平板计数、多聚酶链反应对土拉菌气溶胶稳定性进行了比较,结果表明ＰＣＲ具有较高灵敏度,并且在采样后３小时ＰＣＲ就可以得出定性结果,而平板计数则需要３～７天。采用ＰＣＲ法合成了土拉菌３７６－ｂｐ探针,分别对细菌菌液、５６８－ｂｐＰＣＲ产物和气溶胶样品进行杂交,结果表明菌悬液直接杂交可检出１０５ＣＦＵ左右的细菌,检测ＰＣＲ产物可达４０ｐｇ。ＰＣＲ和Ｓｏｕｔｈｅｒｎ印迹相结合有利于细菌的分离鉴定     

PCR—ELISA在检测血清中丙型肝炎病毒上的应用

建立了一个替代目前使用的套式ＰＣＲ的血清中丙型肝炎病毒ＲＮＡ检测的新方法,该方法只需经过一次ＰＣＲ扩增,即可通过对掺入标记物的ＰＣＲ产物的ＥＬＩＳＡ检测得到与套式ＰＣＲ相同的结果。与套式ＰＣＲ相比,该方法具有耗时少、易操作、较少产生假阳性等特点。     

黑麦1R染色体的微切微克隆研究

显微分离出黑麦（ＳｅｃａｌｅｃｅｒｅａｌｅＬ．）１Ｒ染色体,用ＣｏｈｅｓｉｖｅａｄａｐｔｅｒｓｓｉｎｇｌｅｐｒｉｍｅｒＰＣＲ（ＣＡＳＰＰＣＲ）方法进行体外扩增,以ＤＩＧ１１ｄＵＴＰ标记扩增产物为探针,进行Ｓｏｕｔｈｅｒｎ分子杂交,结果表明扩增产物来自黑麦１Ｒ染色体。用１／１０体积的连接物转化Ｅ．ｃｏｌｉＤＨ５α,获得１００００多个重组菌落。经酶切分析,克隆子的插入片段为２５０～５００ｂｐ,为进一步筛选１Ｒ染色体的分子标记打下了基础     

中国人肥胖基因真核表达载体的构建

为研究肥胖（ｏｂｅｓｉｔｙ）的病因及肥胖基因（ｏｂ）的表达与调控,根据文献报道的ｈｏｂ序列设计引物,经ＲＴ－ＰＣＲ扩增中国人的ｏｂ基因（包括信号肽在内的ｃＤＮＡ全长５４０ｂｐ）,ＰＣＲ产物采用Ｔ－Ａ克隆法首先连接到克隆载体ｐＵＣ１１９,然后定向转移到经改造的真核表达载体ｐＳＶ－β－ｌａｃＺ,酶谱分析表达克隆基因为的人肥胖基因。     

PCR筛选阳性克隆方法的改进

ＰＣＲ筛选阳性克隆具有简便、快速的优点,但常发生假阳性错误。用与载体匹配的引物和目的的基因引物组合进行ＰＣＲ,可以消除假阳性,同时可以判断插入目的基因的方向。     

犬细小病毒中国内蒙株VP2基因克隆及序列分析

从我国内蒙古地区流行的犬细小病毒病病犬的肠溶物中分离提纯犬细小病毒（ＣＰＶ）。提取病毒基因组ＤＮＡ,并以此ＤＮＡ为模板,采用人工合成的引物进行ＰＣＲ扩增,ＰＣＲ产物经ＢａｍＨＩ、ＳａｃＩ双酶切后,克隆于ｐＵＣ１９质粒的ＢａｍＨＩ／ＳａｃＩ位点。重组质粒ｐＵＣＶＰ２经ＰＣＲ鉴定、限制酶切分析和序列分析,结果表明：获得了犬细小病毒内蒙株（ＣＰＶ－ＩＭ）ＶＰ２基因的全长克隆,ＶＰ２基因全长１７５５ｎｔ,     

PCR－ELISA在检测血清中丙型肝炎病毒上的应用

建立了一个替代目前使用的套式ＰＣＲ的血清中丙型肝炎病毒ＲＮＡ检测的新方法。该方法只需经过一次ＰＣＲ扩增,即可通过对掺入标记物的ＰＣＲ产物的ＥＬＩＳＡ检测得到与套式ＰＣＲ相同的结果。与套式ＰＣＲ相比,该方法具有耗时少、易操作、较少产生假阳性等特点。     

在大肠杆菌中分别表达汉滩病毒囊膜糖蛋白G1和G2

利用ＰＣＲ方法扩增了汉滩病毒７６－１１８株囊膜糖蛋白Ｇ１和Ｇ２的编码区基因,并将ＰＣＲ产物克隆了Ｔ－载体中,用限制性内切酶将Ｇ１和Ｇ２的编码区基因切下,并克隆到表达载体ＰＢＶ２２０中构建Ｇ１和Ｇ２的表达质粒,诱导表达后在ＳＤＳ＿ＰＡＧＥ凝胶中未见表达产物带,表达的Ｇ１和Ｇ２能与部分抗Ｇ１和Ｇ２的单克隆抗体发生反应,但用Ｗｅｓｔｅｒｎ－ｂｌｏｔ方法不能检测到表达产物。用表达的Ｇ１和Ｇ２免疫小白鼠能刺