癌症病因新进展：更多体细胞突变基因被鉴定

癌症通常是因为基因突变导致细胞的过度增殖而发生。导致癌症发生的突变后基因称为癌基因。通过扫描定位、生物鉴定等方法,目前已经有超过350个癌基因被鉴定。因为技术手段有限,必定存在被漏检基因。人类基因组测序工作的完成使对肿瘤细胞基因组进行系统的重新测序成为可能。由此可发现更多与癌症发生相关的基因突变。蛋白激酶是很多生物调控过程的关键,目前很多已知的癌基因都含有蛋白激酶结构域。抑制蛋白激酶的突变是有效的肿瘤预防治疗措施。最近,科研工作者对至少210种人类癌症相关的518个蛋白激酶基因外显子进行了大规模测序研究,结果新发现了超过1000个体细胞突变基因。它们大多属于“过客”基因而不引起癌症发生。     

科研快讯

正Nature:研究发现胰腺癌发生的新机制近日,刊登在国际杂志Nature上的一篇研究报告中,来自加拿大安大略省癌症研究所等机构的研究人员发表了一项最新研究成果,该成果挑战了当前关于胰腺癌为何如此恶性的常规认知,胰腺癌更趋向于在晚期阶段表现出来,研究者目前并不清楚为何很多胰腺癌患者发现疾病时往往是处于癌症晚期阶段。利用全基因组测序技术,研究小组在100个独立的肿瘤中重建了胰腺癌的发展历程,让研究者不可思议的是,他们发现,很多被认为引发疾     

一种基于基因拓扑重要性的通路识别方法

癌症相关通路的识别是认识癌症发生发展过程机制的生物学基础。已有的通路识别方法很少考虑基因在通路中的拓扑重要性。重叠基因降权(PADOG)方法在基因集分析(GSA)方法的基础上融入了基因特异性的影响,提高了癌症相关通路的识别性能。为进一步提高癌症相关通路的识别性能,首先统计了KEGG通路数据集中基因出度的分布情况,根据基因出度的大小定义了基因的重要性。最后将基因的特异性和重要性融合在一起,提出了一种基于基因重要性和特异性的通路分析方法 PAGIS。在结肠癌、肺癌和胰腺癌3个数据集上的实验结果表明,PAGIS方法比PADOG能够提高很多癌症相关的排名,从而提高癌症相关通路的识别效果。     

SLC2A5基因及其在胰腺癌细胞中作用

胰腺癌是世界上恶劣的肿瘤之一,其存在早期诊断难于被发现,缺乏有效治疗手段以及预后效果较差等问题。近几年研究显示SLC2A5基因的上调、缺失与胰腺癌的发展、迁移相关。SLC2A5基因编码的果糖特异转运体Glut5参与细胞中果糖代谢的过程。果糖是日常生活中常见的糖源,过量摄入导致癌症的发生和迁移。该文总结了SLC2A5基因的来源、生物学功能以及其在胰腺癌中的代谢情况和作用机制,分析认为SLC2A5基因不仅影响胰腺癌生长迁移,而且可能成为胰腺癌治疗的潜在靶向研究。     

引起普通肾癌的基因

国立癌症研究所(NCI) (Bethesda,MD)已经发现了一种突变基因,据信该基因能够引起被称之为散发性明细胞癌这一最普通型的肾癌。象许多其它有疑问的致癌基因一样,该基因在功能正常时具有肿瘤抑制基因的作用。由该基因编码的蛋白似乎能抑制细胞复制。在一组患有肾脏明细胞癌的家族中,NCI发现有57％的患者体内该基因的二种拷贝均失活。     

科学家定位黑素瘤基因

美国麻省理工学院和国家癌症研究所的科学家已定位增大恶性黑素瘤可能性的基因于1号染色体上。虽然研究者尚未鉴定出该基因,但他们用1号染色体的DNA探针与高发病率家族成员的DNA相结合定位出该基因。研究者说,与癌有关的基因也许是与黑素细胞生长有关的正常基因的突变形式。高发病家族的成员也许能遗传这种突变基因,而其他人由于严重     

人类基因疗法的进展

目前对多数人类遗传疾病还没有适当的治疗方法,但现代分子遗传学正在为一个前所未有的新方法提供有力的工具,即通过直接作用突变基因达到治疗疾病的目的。最近,由几种靶器官和基因转移技术得到的结果使“基因疗法”概念的可行性在医学上和科学上得到了广泛的认可,这种“基因疗法”所针对的疾病包括骨髓、肝脏和中枢神经系统的失调;也包括某些癌症,以及循环酶、激素和凝血因子的缺陷。至今最充分发展的模型包括用重组的致病性病毒进行基因转移改变突变基因,以表达新的遗传信息,矫正疾病的表型。这就是使病理学的理论转变成治疗的实践。     

用抗孕酮药物治疗乳腺癌的可能性

1994年发现BRCA1基因.在早期,科学家在诊所里认识到该基因引起癌症.妇女携带该突变基因者,面临着乳癌与卵巢癌的极高风险.研究者难以明白的是,正常的BRCA1基因所编码的蛋白质是如何起作用的.现在,有一项用小鼠的研究提示了一种可能性,即BRCA1蛋白减轻了孕酮对乳腺细胞的作用.该     

S100A4 在胰腺癌中的研究进展

胰腺癌最重要的生物学特性是容易发生转移和侵袭,致使很多患者无法得到根治性治疗。外科手术是胰腺癌惟一可能治愈的手段,但仅有10-20%的患者有机会手术治疗。错过早期诊断、常规疗法普遍不明显及快速肿瘤扩散共同导致患者的预后不良。胰腺癌的发生、发展受多基因调控。S100A4基因是近几年发现的一种具有促肿瘤作用的基因,目前研究认为该蛋白在胰腺癌的侵袭和转移中起重要作用.本文主要就S100A4与胰腺癌的有关研究进展加以综述。     

S100A4在胰腺癌中的研究进展

胰腺癌最重要的生物学特性是容易发生转移和侵袭,致使很多患者无法得到根治性治疗。外科手术是胰腺癌惟一可能治愈的手段,但仅有10-20%的患者有机会手术治疗。错过早期诊断、常规疗法普遍不明显及快速肿瘤扩散共同导致患者的预后不良。胰腺癌的发生、发展受多基因调控。S100A4基因是近几年发现的一种具有促肿瘤作用的基因,目前研究认为该蛋白在胰腺癌的侵袭和转移中起重要作用.本文主要就S100A4与胰腺癌的有关研究进展加以综述。     

Autophagy:利用MIR506诱导胰腺癌细胞死亡

<正>胰腺癌,特别是最为常见的胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC),是所有癌症中最为致命性的和最为侵袭性的。不幸的是,除了外科手术之外,还没有有效的疗效,而且外科手术也并不适合很多胰腺癌病人。为了在分子水平上更好地理解胰腺癌,来自美国威克森林浸会医学中心、德州大学MD安德森癌症中心和中国天津医科大学总医院的研究人员开展一项新     

根据在癌突变谱中的共突变基因对识别癌基因

癌是一种涉及多基因变异的遗传异质性疾病,涉及多种生物学功能通路中不同基因的遗传变异。因此,识别癌基因是一项富有挑战性的工作。提出通过寻找在癌样本中突变显著共发生的基因筛选候选癌基因的方法。应用该方法,通过分析蛋白激酶基因在癌组织中的突变谱数据,发现了167个显著共发生突变的基因对,包含85个基因。分析这167个基因对发现:(1)发生共突变的基因富集已知的癌基因;(2)共突变基因对倾向于共扰动与癌症相关的通路对。以上结果提示,在癌样本中显著共发生突变的基因倾向于候选癌基因;在癌发生过程中起重要作用的基因倾向于协同扰动不同的癌相关细胞生物学过程。     

癌症相关microRNA与靶基因的生物信息学分析

MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性非编码RNA,通过与靶基因转录本互补结合调控基因的表达。近年来,研究发现miRNA与癌症发生密切相关,miRNA可以直接充当癌基因或者抑癌基因而影响肿瘤的发生和生长。为更进一步揭示癌症相关miRNA的特征及靶基因的功能,文章通过数据库搜索及文献检索,在人类基因组中发现了475个癌症相关miRNA,系统地比较了癌症相关miRNA与非癌症miRNA以及基因内和基因间区癌症相关miRNA在保守性、SNP位点分布、癌谱及转录调控等特性。研究发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA保守性要强,发生SNP概率比较低,同时发现miRNA所涉及癌症数目与保守性成正相关。基因组定位分析发现,癌症相关miRNA比非癌症miRNA更倾向于成簇存在。进一步对宿主基因、癌症相关miRNA及作用的靶基因与癌症发生进行关联分析,发现一些非癌症miRNA的宿主基因倾向于被癌症miRNA作用。本研究结果为深入理解miRNA与癌症之间的关系,以及进一步为miRNA作为癌症诊断指示物提供理论依据。     

Science signaling:胰腺癌转移新套路--借力神经实现转移

<正>近日,来自美国约翰霍普金斯Kimmel癌症中心的科学家在胰腺癌细胞中发现一种新的分子关系能够帮助解释胰腺癌转移的原因。美国每年有大约50,000人罹患胰腺癌,并且诊断后的5年生存率只有5%,而这一研究发现的促癌转移关键分子可能为胰腺癌治疗提供新的靶点。Annexin A2是一种参与多种癌症并导致病人生存率低下的蛋白分子。在这项发表在国际学术期刊science signaling的研究中,研究人员发现annexin A2能够引导一种叫做Sema3D的蛋白"逃逸"出胰腺癌细胞,一旦离开细胞,Sema3D能够与另外一种分子联结在一起助力癌细胞转     

英科学家发现控制细胞分裂的基因

英科学家发现控制细胞分裂的基因英国帝国癌症研究基金会的科学家鲁尔斯博士及同事最近在酵母细胞里发现了控制细胞分裂的基因。这种基因名叫鲁米,意即有丝分裂复制分离基因。有丝分裂是细胞正常分裂,在这一过程里母细胞细胞核内的脱氧核糖核酸在分裂产生的每一个子细胞...     

癌细胞转移原因找到新线索

尽管已经发现很多基因与癌细胞的发育有关,但肿瘤细胞为什么会转移到人体新的组织、为什么一些肿瘤细胞可产生生物学上的变化,而另一些则不会,以及肿瘤细胞是如何转移的至今仍很少有人知道。但新的发现已经为期待了解这一细胞癌变过程的研究者打开了窗户。这项研究课题是三年前开始的,当时NCI(国家癌症研究所)的一组研究人员发现一种带有神秘活力的新基因,这种基因能显示出抑制癌细胞转移的能力,但由Patricia.Steeg和Lance.Liotta领导的发现这个基因的小组不知道这个基因是如何工作的,故从那时起,她们一直试图来解开这个谜。感谢科学上偶然的一瞬间,这个谜可以被解开了。根据她们的     

微阵列数据揭示基因在癌样本中广泛表达

癌的发生与发展过程涉及大量基因的异常表达。在目前基因表达谱分析中采用的标准化方法通常假设在疾病中差异表达的基因的比例很小并且差异上、下调的比例大致相等。这个被研究者所广泛采用的标准化的前提假设尚未被充分地论证过。通过分析胰腺癌的两套表达谱数据,我们发现在胰腺癌样本中基因表达的中值显著高于正常样本,提示传统的标准化假设并不适用于胰腺癌表达谱数据。采用标准化数据会导致错误地判断大量的差异下调的基因并失查许多差异上调的基因。采用原始数据分析发现在胰腺癌中的基因表达有广泛上调的特征,为深入研究胰腺癌的发生和发展机制提供了新线索。     

NatGenet:表观遗传变化让远端转移的胰腺癌细胞更具生存优势

正一项多中心研究报告称,对死于胰腺癌的患者肿瘤样本进行的全基因组分析表明DNA上发生的表观遗传修饰能够使一些胰腺癌细胞获得生存优势,据研究人员介绍,这些优势能够让癌细胞在肝脏和肺这样血液供应充足的器官繁荣生长。相关研究结果发表在国际学术期刊Nature Genetics上。癌症转移会让癌症变得非常致命,手术和其他治疗方法无法发现并摧毁每一个癌细胞,     

拟南芥K+转运蛋白AtKup1基因的DNA改组

采用同源重组法制备钾离子转运蛋白TRK1和TRK2缺失的酿酒酵母钾营养缺陷型,通过RNA 反转录PCR方法从拟南芥幼根扩增获得片段长度为2139bp 的Atkup1基因,以此片段为模板,采用DNA 改组技术,经Dnase I降解,Primerless PCR , PrimerPCR,建立Atkup1 基因突变库。将突变库和未经DNA 重排处理的Atkup1基因分别构建酵母穿梭载体导入K+转运蛋白基因TRK1和TRK2缺失的酿酒酵母中,分别在低钾(5.0mM KCl)不含色氨酸的培养基上筛选转化子, 突变基因库酵母转化子中获得2株长势明显好于Atkup1 基因转化子的突变基因转化菌株,菌株质粒上的突变Atkup1基因核苷酸测序结果发现突变基因Atkup1发生2个碱基的置换,造成2个氨基酸的改变,转化烟草烟叶化学成分分析证实突变基因的吸钾活性显著提高。     

microRNA在胰腺癌中的研究进展

胰腺癌是预后很差的恶性肿瘤,其分子机制的研究是治愈胰腺癌的希望.microRNA(miRNA)是一类小分子非编码RNA,通过降解或抑制靶基因mRNA的翻译调节靶基因的功能.近年来,研究发现miRNA在胰腺癌中异常表达,有上调,也有下调.虽然很多miRNA异常表达的机制尚不清楚,但启动子CpG甲基化与在胰腺癌中某些miRNA的下调有关.研究发现miRNA表达谱可用于胰腺癌和单个miRNA表达如miR-21、miR-34、miR-10a、miR-155、miR-196a及miR-200和let-7家族成员等可作为肿瘤标志物用于胰腺癌与正常胰腺、慢性胰腺炎、胰腺内分泌肿瘤等的诊断和鉴别诊断,预测胰腺癌的预后等.研究发现miRNA在胰腺癌中上调或下调参与胰腺癌的增殖、凋亡、侵袭、转移以及对化疗药物的耐药.研究发现miR-34、miR-200c等与胰腺癌干细胞的自我更新有关.这些miRNA研究将为胰腺癌的早期诊断、分子靶向治疗打下坚实的基础.