贵州地区茯砖茶“金花菌”的分离和分子鉴定

本研究对贵州地区茯砖茶中的"金花菌"进行了分离鉴定。通过PCR扩增及测序技术获得转录间隔区序列及部分核糖体大亚基(ITS+LSU)、β-微管蛋白(β-tubulin)、钙调蛋白(Ca M)和RNA聚合酶Ⅱ(RPB2)4个基因的序列,然后构建多基因系统树,并对其形态特征进行观察,将其鉴定为冠突曲霉Aspergillus cristatus。     

泾阳茯砖茶中“金花菌”的分离、鉴定及抗氧化酶活性

目的分离鉴定泾阳茯砖茶中的金花菌,探讨其发酵产物的抗氧化酶活性。方法采用涂布平板法分离纯化泾阳茯砖茶中的"金花菌",通过其ITS序列分析进行分子鉴定。利用抗氧化酶试剂盒测定不同时期"金花菌"发酵液的抗氧化酶活性。结果从茶叶中分离出1株"金花菌"J17,通过ITS序列分析初步确定其为赤散囊菌(Eurotium rubrum)。在J17菌株发酵后第1、7、10、14和21天,其发酵液中过氧化物酶(POD)活性(U/mL)分别为0.22±0.11、1.22±0.13、2.46±1.64、7.35±2.77和45.19±1.54;过氧化氢酶(CAT)活性(U/mL)分别为0.06±0.00、0.45±0.00、1.52±0.20、2.35±0.20和2.75±0.37;总超氧化物歧化酶(T-SOD)活性(U/mL)分别为25.55±10.12、50.90±3.72、76.77±6.75、89.07±3.33和36.34±12.32。发酵14d左右,3种抗氧化酶活性均较高,与茶砖在发花车间的发花时间一致。茯砖茶沸水冲泡液和沸水冲洗液中POD和CAT活性差异无统计学意义,而沸水冲泡液的T-SOD活性显著高于沸水冲洗液。结论泾阳茯砖茶的抗氧化酶活性与茶砖发花期产生的赤散囊菌有关,泾阳茯砖茶适用于热水冲泡或煮沸后饮用。     

一个被子植物“目”的新分类系统简介

去年,我们在本刊[36(2):178～192(1998)]介绍了Ｔａｋｈｔａｊａｎ的被子植物系统,若这个系统基本上是基于形态学(包括植物化学、染色体、解剖学等资料)的一个代表,那么今天我们乐意介绍一个基于吸取大量分子资料的系统。近20年来,分子系统学的飞速发展,足以能提出一个被?..     

分类学中的新生长点——植物分子系统学

１９８１年，美国加利福尼亚大学Ｒｉｖｅｒｓｉｄｅ分校的迈克尔·克莱格ＭｉｃｈａｅｌＣｌｅｇｇ博士利用他的休假期到澳大利亚堪培拉ＣＳＩＲＯ的一个实验室访问，并提出了一项研究计划，即利用叶绿体ＤＮＡ的ＲＦＬＰ分析探讨现代和古代大麦栽培型之间的关系。与克莱格在同一个实验室作访问学者的杰拉德·佐拉斯基（ＧｅｒａｒｄＺｕｒａｗｓｋｉ）也来自加州，他刚刚完成了对菠菜的ｒｂｃＬ基因测序，而下一个材料是豌豆。在非常偶然的一次谈话中，佐拉斯基向克莱格建议：“ＲＦＬＰ分析固然不错，但何不尝试比较一下大麦叶绿体基…     

茯砖茶生产过程中“金花”菌的检测

茯砖茶生产过程中"金花"菌出现的时期,一直是茯砖茶生产者和研究者关注的问题,也是进行茯砖茶生产工艺改良必备的前提条件。本研究从已测序的"金花"菌基因组中分析获得29个特异性基因,对这些特异性基因进行引物设计和筛选,最后在SI-02588和SI-02863基因上获得引物OEC-6和OEC-10,2对引物表达效率高、特异性好,2对引物可用于全程监控"金花"菌动态变化。运用2对引物检测茯砖茶生产流程中"金花"菌,结果显示在茯砖茶生产过程中萎调至第一次渥堆均为阴性,第二次渥堆至发花11 d均为阳性,这表明"金花"菌最早出现的时期是第二次渥堆前,之后至茯砖茶成品都含有"金花"菌。本研究的开展说明了"金花"菌在茯砖茶中最早出现的时期,为茯砖茶生产工艺的改良提供了理论基础和指导。     

国产耳草属长节耳草及其相似种的分类研究

我国耳草属中具有茎四棱和头状花序特征的植物常常被鉴定为长节耳草(Hedyotis uncinella),并且这一名称还包括了基于不同模式的3个分类学异名。由于这一类植物在叶片形态、叶柄长短、花序着生式样以及花梗长度等形态特征方面存在着明显的不同,因此将这一类植物笼统地鉴定为长节耳草并不合理。为清晰区分这类植物,通过模式比对、居群形态特征变异式样的野外观察以及分子系统学分析等方法进行研究,结果表明,以前被鉴定为“长节耳草”的植物实际上包括了6个分类实体,即被归并的丰花耳草(H. borrerioides)、垦丁耳草(H. kuraruensis)和新组合种——团花耳草(H. cephalophora)均应独立成种,而长节耳草本种、被忽略的线叶耳草(H. linearifolia)和我国新记录种——球花耳草(H. multiglomerulata)各自也应得到承认。同时,为了便于进行分类鉴定,也提供了这些种类的分种检索表。     

青藏高原裸裂尻属鱼类两个疑难种的分子系统学

裸裂尻鱼属[Schizopygopsis（Steindachner）]鱼类广泛分布于青藏高原各河流上游干支流及其湖泊之中,由于其广泛的分布域和特殊的生态环境而被生物学家视为青藏高原隆升过程中淡水鱼类物种起源、进化的模式物种。然而,该属鱼类种间具有非常相似的形态特征,致使大渡软刺裸裂尻鱼（Sp．malacanthus chengi）和前腹裸裂尻鱼（Sp．anteroventris）的分类学地位一直存在争议。本文采用聚合酶链式反应（PCR）和直接测序的方法,获得了裸裂尻鱼属两个分类疑难种和5个指名种（n=17）以及5个近缘种（n=5）共23个个体的细胞色素b（Cytb）基因的全序列（1140bp）,并以同亚科的齐口裂腹鱼（Schizothorax cprenanti）作为外群构建了ML、MP和Bayesian进化树。序列差异和分子系统学分析表明,Sp．malacanthus schengi和软刺裸裂尻鱼（Sp．malacanthus）间存在较大的差异（2．06％）,两者并不聚在同一枝上;Sp．anteroventris独立成一枝,与其它指名裸裂尻鱼间显示出较大差异（4．38％-5．53％）,综合其它形态差异共同提示,Sp．mnlacanthus chengi应提升为独立种,沿用Sp．chengi的种名,而Sp．anteroventris应该是裸裂尻鱼属的一个独立种。     

生于蔷薇科植物上的链格孢属真菌一新种

报道生于蔷薇科植物枇杷Eriobotrya japonica叶片上的链格孢属一新种,对该种结合形态描述及分子系统学分析明晰其分类地位。命名为枇杷链格孢Alternaria eriobotryae。研究标本保藏于贵州大学植物病理学实验室（HGUP）和中国科学院菌物标本馆（HMAS）。     

基部藓类分子系统学研究

基部藓类是稳定地处于藓类系统发育树基部的类群.它包括7纲,2亚纲,10目,10科,34属,637种.基部藓类虽然只占藓类种类的5％,但由于其内部各类群孢子体形态极为丰富,因此对于理解整个藓类植物的系统发育具有重要意义.通过对48个种(36个藓类、4个维管植物、2个角苔、4个苔类和2个藻类)的9个DNA片段(NU:26S,18S; MT:nad5,cox1; CP:rbcL,rps4,cp-LSU,cp-SSU,atpB)进行分子系统学分析,综合最大似然法(maximum likelihood)、最大简约法(most parsimony)和贝叶斯分析(Bayesian inference)方法的建树结果,理清了前人研究中存在冲突的类群之间的关系并为已确定的关系提供了更高的支持率.研究结果如下:(1)藻苔纲和泥炭藓纲互为姐妹类群,处于整个藓类的最基部;(2)黑藓纲与黑真藓纲互为姐妹类群(3)长台藓纲和具齿藓类组成单系;(4)四齿藓纲是所有具齿藓类的基部类群;(5)烟杆藓亚纲处于真藓纲的最基部,其次是短颈藓亚纲.以上结论在分子系统树上得到了很高的支持率.     

黑茶中“金花菌”线粒体基因组序列测定及系统发育分析

本研究对黑茶中优势微生物“金花菌”线粒体基因序列进行测定与生物信息分析,并探究其与近缘种微生物的系统发育关系。结果表明,“金花菌”线粒体基因组是一条全长77 649bp的环状DNA分子,其ATCG 4种碱基所占比例分别为34.14%、37.64%、15.61%、12.61%,具有显著的A-T偏向性。基因组共编码42个基因（15个蛋白质编码基因,2个rRNA基因和25个tRNA）,与近缘种相比缺失了trnT-TGT且多了1个trnM-CAT拷贝,排列顺序上则较为保守。蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为Leu、Ile、Ser、Phe和Val;RSCU频率最高的4个密码子依次是UUA、AUA、UUU和AAU。25个tRNA基因均可形成典型三叶草结构,并存在有35处G-U错配。系统发育分析表明：与“金花菌”分类地位上最密切是Aspergillus pseudoglaucus。依据菌株形态学与系统发育分析的结果,本研究支持将“金花菌”归类于Aspergillus属并使用A. cristatus这一名称的分类观点。     

引起蓝莓茎溃疡病的葡萄座腔菌属Botryosphaeria二新种

在我国华南地区发现了两个引起蓝莓茎溃疡病的Bofryosphaeria新种,即B.dolichospermatii和B.fujianensis,本研究对这两个物种进行了详细的形态学描述,并制作了图版.基于/TS、LSU、tef1-α 和TUB等4个基因片段的综合系统学分析,B.dolichospermatii和B.fu...     

拟棘壳孢属的一新种及本属已知种的检索表

本文报道分离自贵州省土壤的拟棘壳孢属Pyrenochaetopsis真菌一新种,对该种结合形态特征及分子系统学分析明确其分类地位,命名为土栖拟棘壳孢Pyrenochaetopsis terricola;编制了该属13个已知种的分种检索表。研究标本保存于贵州大学植物病理学实验室（HGUP）和中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心（CGMCC）。     

类开费曲霉Aspergillus keveioides——曲霉属焦曲霉组一新种

报道分离自中国山东泰山土壤的曲霉属焦曲霉组的一个新种——类开费曲霉Aspergillus keveioides.基于形态学及钙调蛋白、β-微管蛋白基因部分序列和核糖体DNAITSl-5.8S-ITS2序列分析的证据支持新种的建立.     

中国甘肃省狭义丝盖伞属二新种

依据形态学和分子系统学研究结果,描述了产自中国甘肃省的狭义丝盖伞属2个新种,即拟黄囊丝盖伞Inocybe muricellatoides和甘肃丝盖伞I. gansuensis。对新种的ITS、LSU和rpb2片段进行了测序和分析,并提供了详细描述、线条图、生态照片及与相似种的区别。拟黄囊丝盖伞以菌盖翘起的鳞片、菌柄纤维状、孢子光滑和厚壁的侧生囊状体为主要识别特征。甘肃丝盖伞具有粗壮的子实体、较大的孢子和厚壁侧生囊状体。基于LSU和rpb2联合数据的分子系统发育分析显示这两个新种隶属于狭义丝盖伞属且分别占据独特的分支。     

中国云南省间座壳属两个新种

我国间座壳属真菌种类繁多,但对其分类研究滞后。通过对云南省间座壳属标本采集,基于形态学和核糖体内部转录间隔区、β微管蛋白基因、翻译延伸因子基因、钙调蛋白基因和组蛋白基因的DNA序列数据比较进行物种鉴定,描述了分别采集自八角黄皮和可可患病叶片上的间座壳属2个新种——八角黄皮间座壳和可可间座壳,并讨论了其与间座壳属物种的形态和系统发育关系。     

中国南方两个革菌新种：中国丝皮革菌和棉絮丝皮革菌（丝皮革菌科,多孔菌目）

依据形态学和分子系统学研究结果,描述了产自中国云南省的丝皮革菌属2个新种,即中国丝皮革菌Hyphoderma sinense和棉絮丝皮革菌H. floccosum。中国丝皮革菌以光滑子实层体表面、被结晶和念珠状的囊状体及圆柱形至腊肠状的担孢子（8-11.5×3-5μm）为主要识别特征。棉絮丝皮革菌具有棉絮状至粉状子实层体表面、管状和分隔状囊状体及椭圆形至腊肠状担孢子。对新种的ITS和nLSU片段进行了测序和分析,采用最大似然法、最大简约法和贝叶斯推断法对研究样本的ITS+nLSU nrRNA基因序列进行系统发育分析,结果显示两个新种隶属于丝皮革菌属,其中,中国丝皮革菌与变形丝皮革菌聚在一起;棉絮丝皮革菌与松生丝皮革菌、丝皮革菌和拟丝皮革菌聚为一类。本研究提供了两新种的详细描述、线条图、生态照片及与相似种的区别,同时编写了我国丝皮革菌属23个种的检索表。     

Tsukubamonas globosa n. gen., n. sp., a novel excavate flagellate possibly holding a key for the early evolution in "Discoba"

We report the ultrastructure and phylogenetic position of a free-living heterotrophic flagellate, Tsukubamonas globosa n. gen., n. sp. This flagellate was isolated from a pond in the University of Tsukuba, Japan. Under light microscopy, the spherical vegetative cells were naked and highly vacuolated, and always swam with rotating motion. Electron microscopic observations revealed that T. globosa possessed a ventral feeding groove, which is one of the hallmark characteristics of the supergroup Excavata. The position of T. globosa was unresolved in the small subunit ribosomal RNA phylogeny. On the other hand, a multigene phylogeny using α-tubulin, β-tubulin, actin, heat shock protein 90, and translation elongation factor 2 robustly united T. globosa with members of the "Discoba" clade of Excavata, composed of jakobids, euglenozoans, and heteroloboseans, although the precise position of T. globosa in this clade remained unresolved. Our detailed morphological comparisons elucidated that T. globosa possessed a novel set of morphological features, and could not be classified into any taxa in the Discoba clade. Instead we classified T. globosa into Tsukubamonadidae n. fam. under Tsukubamonadida n. ord.     

Taxonomic study of the genus Niwaella (Cypriniformes:Cobitidae) from East China,with description of four new species

Four loaches,Niwaella brevipinna Chen & Chen,sp.nov.,N.fimbriata Chen & Chen,sp.nov.,N.nigrolinea Chen & Chen,sp.nov.and N.qujiangensis Chen &Chen,sp.nov.,are described based on specimens collected from Zhejiang and Anhui Provinces,East China.The mitochondrial cytochrome b gene of 28 individuals of seven species from seven locations collected from Zhejiang,Anhui and Jiangxi Provinces were amplified and analyzed.Morphological and molecular data showed that N.fimbriata Chen & Chen,sp.nov.and N.nigrolinea Chen & Chen,sp.nov.,N.brevipinna Chen& Chen,sp.nov.and N.laterimaculata (Yan & Zheng),N.qujiangensis Chen & Chen,sp.nov.and N.longibarba Chen & Chen are closely related.The seven Chinese Niwaella species,N.brevipinna Chen & Chen,sp.nov.,N.fimbriata Chen & Chen,sp.nov.,N.laterimaculata,N.longibarba,N.nigrolinea Chen & Chen,sp.nov.,N.qujiangensis Chen & Chen,sp.nov.,and N.xinjiangensis are clearly distinguished by the combination of the color patter,mental lobes,suborbital spine,caudal peduncle,body shape,and subdorsal scales.