广东汉族健康人载脂蛋白AⅠ-CⅢl-AⅣ基因簇DNA多态性及其单倍型分布

本文研究了中国广东汉族健康人群apoAI-CⅢ-AIV基因簇DNA限制性内切酶PstI、SstI和EcoRI片段长度多态性。其中等位基因P_1,P_2,S_1,S_2,R_1和R_2的频率分别为0.98,0.02,0.96,0.04,0.90和0.10。经卡方检验符合Hardy-Weinbery氏遗传平衡,与其他种族比较,本文结果显示中国广东汉族人P_2等位基因频率低于日本人、亚洲印第安人和高加索人,S_2等位基因频率低于日本人、菲律宾人、沙特阿拉伯人和亚洲印第安人,而与高加索人相近,R_2等位基因频率稍高于高加索人。不同种族间apoAI-CⅢ-AIV基因簇DNA多态频率无疑存在差异,这种差异可能是由于遗传漂变和自然选择单独或联合作用所致。对P_1、P_2,S_1、S_2和R_1、R_2构成的单倍型和连锁平衡程度进行了分析,结果显示这些单倍型处于连锁不平衡状态。     

AGT基因单倍型与原发性高血压

选取血管紧张素原（angiotensinogen, AGT）基因启动子区 -217, -152, -20, -6, 内含子1 的+31, 第二外显子T174M（3889）和 T235M（4072）共7个位点,对497例的样本（高血压患者298例,血压正常对照199例） 用PCR-RFLP、和最大期望值（expectation maximization,EM）算法为基础的最大似然法(maximum likelihood estimate,MLE)检测和估算,本群体AGT基因A-6G,C+31T,T235M三位点两两存在完全连锁不平衡(D^,=1);G-217A和G-152A位点,G-152A和3889T位点平衡传递。存在7种单倍型,单倍型H2(-217: A, -152: G, -20: A, -6: G, +31: T, 174: T, 235: M) 在正常血压个体中的频率高于高血压组。研究结果提示AGT基因中H2单倍型可能与控制血压的保护性因素连锁不平衡。此外,本研究结果支持基因剂量效应可能存在于单倍型中,而不与单个位点直接关联。     

汉族人线粒体DNA单倍型与散发型帕金森病关系的研究

目的：研究汉族人线粒体DNA（mtDNA）单倍型与散发性帕金森病（PD）的关系。方法：用酚／氯仿法从65例PD患者和50名健康者（对照组）的外周静脉血中提取基因组DNA,通过斑点杂交方法对PD患者和对照组的10个单核苷酸多态性（SNP）位点（G1719A,G4580A,C7028T,G8251A,G9055A,A10398G,A12308G,G13366A,C13708T,G16391A）和单倍型进行检测。结果：PD组G1719A突变5例、G9055A突变2例、C13708T突变4例,对照组G1719A突变1例,2组的突变率无显著性差异（P〉0.05）。PD组H单倍型54例（83.1％）,其他11例（16.9％）;对照组H单倍型49例（98.0％）,其他1例（2.0％）。结论：10398G不是汉族人散发性PD发病的易感因子,也没有保护作用;不宜用H、I、J、K、T、U、V、w和x等9个mtDNA单倍型来评估汉族人散发性PD发病风险。     

福建省马铃薯晚疫病菌线粒体DNA单倍型分析

为明确福建省马铃薯晚疫病菌线粒体DNA单倍型组成和分布情况,采用PCR-RFLP方法分析了2010—2012年从福建省7个地区（福州,长乐,漳州,青口,龙海,霞浦,龙岩）分离的526个马铃薯晚疫病菌株的线粒体DNA单倍型及频率分布。结果表明Ⅰa型为主要单倍型,占72．8％,其次是Ⅱb型,占26．42％,最少的Ⅱa型,占0．76％,没有检测到Ⅰb型。与文献报道历史材料相比较,说明福建省马铃薯晚疫病菌线粒体DNA单倍型的组成发生较大变化,而且福建省马铃薯晚疫病菌线粒体单倍型组成比云南、四川和贵州等地区更为复杂。     

中国牦牛线粒体DNA多态性及遗传分化

用２０种限制性内切酶分析了我国５个牦牛群体９０个个体的限制性片段长度多态性,其中ＡｖａＩ,ＡｖａＩＩ、ＢｇｌＩＩ、ＥｃｏＲＩ．ＨｉｎｄＩＩＩ、ＨｐａＩ６个酶切类型具有多态性,共发现５种ｍｔＤＮＡ单倍型,每种单倍型中检出５０－５５个位点,并利用双酶切制定出其物理图谱。我国牦牛群体ｍｔＤＮＡ多样度ＨＴ为０．１０６５,群体内的平均一致性概率为０．８９６６,表明我国牦牛群体ｍｔＤＮＡ多态性较贫乏,群体间的平均净遗传距离Ｐｅｔ为０．０００２０１,群体基因分化系数Ｇｓｔ为０．０２９１,我国牦牛群体ｍｔＤＮＡ变异只有２．９１％来自群体间的差异,群体间的分化程度较低。并根据报道,比较了牦牛和其他家养牛种的ｍｔＤＮＡ遗传分化,估计出牦牛和普通牛、瘤牛的分化时间大约分别在１．１－２．２百万年和１．０１－１．０２百万年之间。     

恒河猴群微卫星DNA多态性的分析

目的　确立一种对恒河猴群个体的遗传物质进行准确可靠、快速简便的遗传检测方法。方法　利用聚合酶链反应 (PCR)扩增技术对 2 0只恒河猴群个体间进行了DNA多态性的分析。结果　筛选出 9个微卫星DNA位点具有显著多态性 ,4个微卫星DNA位点没有多态性 ,还有 2个位点等位基因数目较少。结论　利用这些多态性微卫星位点建立一种对恒河猴群个体进行有效、准备可靠、快捷简便的遗传背景监测方法。     

一种单核苷酸多态性的单倍型分析技术

运用多步PCR和测序技术,完成基因组中相距较远的单核苷酸多态位点的单倍型构建。通过设计2条等位基因特异性引物,扩增大片段DNA(10kb左右),以此大片段DNA作为下一轮PCR反应的模板,再在该片段中设计待检测区域的PCR引物,进行第2轮PCR。对PCR产物进行测序分析,确定其多态位点处的等位基因。结合第1轮PCR中的等位基因特异性引物,即可确定该大片段DNA中不同单核苷酸多态性构成的单倍型。以脂蛋白脂酶基因为例,应用其启动子区以及第4外显子区的等位基因特异性引物扩增约16kb的DNA片段,然后检测位于该片段中第2、3外显子的多态性。在￡-尸￡-基因第2内含子中发现了 13557G→A多态性。经分析确定出-421G／ 13557G／ 15222A、-421A／ 13557G／ 15222A、-421G／ 13557G／ 15222G、-421G／ 13557A／ 15222A等4种单倍型。等位基因特异性PCR结合小片段测序是一种快捷高效的对相距较远的多个SNP进行单倍型构建的新策略。     

ApoE基因多态性与早发冠心病关系的研究

目的:研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与早发冠心病CHD)的关系。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)基因分析方法,测定92例早发CHD、237例迟发CHD患者和220名对照者的ApoE基因型;血脂水平按常规方法测定。结果:发现的5种ApoE基因型,分别为E3/3、E2/2、E3/2、E4/3及E4/2。早发CHD组和迟发CHD组ApoE 4/3基因型和ε4等位基因频率均高于对照组(P＜0．01);进一步对两组CHD患者的ApoE多态性进行分析,发现早发组ε4等位基因频率较迟发组高(P＜0．05)。ApoE各等位基因型之间,TC和LDL-C水平之间存在统计学差异(P＜0．05)。结论:ApoE基因多态性与早发CHD的发生发展有关。     

用焦磷酸测序技术研究猪线粒体细胞色素B基因单倍型

选择43头大白猪,79头长白猪,66头皮特兰猪和60头清平猪作试验材料,采用焦磷酸测序技术分析猪线粒体细胞色素b(CytB)基因单倍型。研究结果显示CytB基因可分为4种单倍型E1,E2,A1和A2。清平猪仅存在于A1单倍型(100%),大白猪和长白猪存在于E1(49.19%,79.25%)和A1(55.81%,20.25%)单倍型,皮特兰则存在于E1(57.58%)和A2(42.42%)单倍型。 Abstract：To detect porcine mitochondrial cytochrome b (CytB) gene haplotypes, Pyrosequencing, which is a novel DNA sequencing method, has been used to analyze SNPs selected Large White, Landrace, Pietrain and Qingping pigs. The pyrosequencing analysis of CytB gene displayed four distinct haplotypes E1, E2, A1 and A2 respectively. Qingping pigs are only present in haplotype A1, Large White and Landrace pigs are present in haplotype E1 and A1, and Pietrain pigs are present in haplotupe E1 and A2.     

尿微量蛋白联合血凝在冠心病诊断中的检测价值

目的:探讨尿微量蛋白联合血清纤维蛋白原在冠心病的诊断价值。方法:选取同期在我院治疗的24例稳定型心绞痛的患者,36例诊断为不稳定型心绞痛的患者和30例诊断为急性心肌梗死的患者,并选择同期30例来我院体检健康志愿者为对照组。分析以上4组患者发病时尿微量蛋白及血清纤维蛋白原的变化情况。结果:与对照组比,3个冠心病组的尿微量蛋白及血清纤维蛋白原的含量显著升高(P<0.05),与稳定型心绞痛组比,不稳定型心绞痛组的尿微量蛋白及血清纤维蛋白原的含量显著升高(P<0.05);与不稳定型心绞痛组比,急性心梗的尿微量蛋白及血清纤维蛋白原的含量显著升高(P<0.05)。3组病患的尿微量蛋白及血清纤维蛋白原之间呈正相关关系(r=0.852,P<0.05)。结论:心肌梗死和心绞痛患者尿微量蛋白及血清纤维蛋白原含量较健康成人含量高,提示尿微量蛋白及血清纤维蛋白原的含量有助于对心肌梗死和心绞痛的诊断,对急性心肌梗死的诊断价值较高。     

国产雷帕霉素药物洗脱支架在冠心病介入治疗中疗效评价

目的:观察国产雷帕霉素药物洗脱支架在冠心病介入治疗中有效性及安全性。方法:2010年1月至2010年12月我院心血管内科收治并行国产雷帕霉素药物洗脱支架(Firebird支架)置入术患者124例,收治并行进口雷帕霉素药物洗脱支架(Cypher^TM支架)置入术患者167例,于不同支架置入患者中各随机选68例,命名为国产组与进口组。术后1年、5年分别随访两组,观察两组患者支架置入后在不同时间段不良心血管事件发生情况及冠脉造影复查结果。结果:两组患者不良事件比较,国产组术后1年随访结果与术后5年随访结果比较,差异无统计学意义(P0.05);进口组术后1年随访结果与术后5年随访结果比较,差异无统计学意义(P0.05);国产组术后5年随访结果与进口组术后5年随访结果比较,差异无统计学意义(P0.05)。两组患者冠脉造影复查结果比较,差异无统计学意义(P0.05)。结论:国产雷帕霉素药物洗脱支架在冠脉介入治疗中具有安全性和有效性,与进口雷帕霉素药物洗脱支架比较无明显差异,值得临床推广应用。     

含凝血酶敏感素1型基序的解聚素样金属蛋白酶在冠心病中作用的研究进展

含凝血酶敏感素1型基序的解聚素样金属蛋白酶(a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 1,ADAMTS-1)可降解细胞外基质中的多能蛋白聚糖,促进平滑肌细胞的迁移,参与动脉粥样硬化的发生,并能进一步活化粥样斑块,促进斑块破裂;还可抑制血管的新生、参与胶原代谢加速心室重构、心肌纤维化等病理过程的进展,与各种类型的冠心痛如稳定型心绞痛(stable angina,SA)、急性冠脉综合征(acute coronary syndrome,ACS)、缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)均密切相关.研究表明,ADAMTS-1有助于冠脉狭窄程度评估、斑块稳定性判断、ACS的辅助诊断及治疗策略的选择,有望用于冠心病的危险分层和预后评估,并可能成为动脉粥样硬化和各种类型冠心病预防和治疗的新靶点.本文将就ADAMTS-1在冠心病中作用的研究进展进行综述.     

Genetic diversity of Dioscorea dumetorum (Kunth) Pax using Amplified Fragment Length Polymorphisms (AFLP) and cpDNA

We have utilized Amplified Fragment Length Polymorphisms (AFLP) in conjunction with chloroplast DNA (cpDNA) sequence data to study the genetic diversity in 53 accessions of Dioscorea dumetorum from six countries in West and Central Africa. Our results provide a comparison of the two marker systems with regards to their applicability to differentiate intraspecific genotypes and the grouping of the accessions based on localities of collection. A total of 1052 AFLP fragments (of which 94.1% were polymorphic) produced from twelve primer combinations indicate a relatively high level of polymorphism among the accessions. Three major genetic groups that do not strictly follow a geographic distribution pattern were identified using Neighbour-joining and the principal coordinate (PCo) analyses. Accessions from Togo showed higher numbers of private fragments and the highest percentage polymorphism (59.4%). The detection of highest genetic diversity in accessions from Nigeria and Togo and their relationship to other accessions suggest that these countries are the centre of origin and diversity of D. dumetorum. The moderately high genetic diversity (average of 61%) is suggesting great influence on the D. dumetorum germplasms through exchange and transfer of cultivars among local farmers in the sub-region. In contrast, DNA sequence data from the psbA-trnH and the rpoB-trnC chloroplast regions revealed no variation among accessions from the different localities and clearly differentiated by AFLP patterns. The results demonstrate the usefulness of the AFLP marker in generating high polymorphism in the D. dumetorum accessions from West and Central Africa and hence may be used for agronomic purposes.     

DDAH2启动子区-1150C/A多态性与中国汉族人群冠心病的遗传易感性研究

目的:研究DDAH2启动子区-1150 C/A rs805304多态性与中国汉族人群冠心病之间的相关性。方法:应用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)的分析方法,对381例冠心病患者和629例健康人群中DDAH2基因A-1150C rs805304多态进行基因分型。结果:病例组和对照组A-1150C rs805304位点基因型分布均符合Hardy-Wenberg平衡;两组间A-1150C位点基因型间无显著性的差异(P=0.34);病例组和对照组A-1150C位点的等位频率分布也无显著的差别,但是在冠心病病例中,A等位频率有低于C等位频率的趋势(P=0.069)。结论:DDAH2启动子区-1150 C/A rs805304多态性与中国汉族人群冠心病的发病不相关。     

通脉养心丸对冠状动脉粥样硬化性心脏病伴慢性病贫血患者铁调素水平的影响

目的:探讨通脉养心丸对冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)伴慢性病贫血(ACD)患者铁调素水平的影响。方法:于2015年4月-2016年6月在上海交通大学医学院附属仁济医院(南院)接受治疗的患者中选取70例年龄≥40岁的冠状动脉粥样硬化性心脏病伴慢性病贫血患者并随机分成两组,每组各35人,分别服用通脉养心丸(II组)或未服用通脉养心丸(III组)。同时选取冠心病患者不伴有慢性病贫血40人为对照组(I组),该组患者服用通脉养心丸。观察比较三组服药8周前后的血铁调素及血红蛋白、铁蛋白水平的变化。结果:服药前,II、III组的血Hepc水平均明显高于I组(P0.05)。8周治疗后,II组患者血Hepc表达明显下降,Hb水平较治疗前显著升高(P0.05),其余两组血Hepc表达与治疗前相比差异无统计学意义(P0.05);II组、III组血Hepc水平显著高于I组(P0.05),III组的血Hepc水平显著高于II组;III组患者的Hb水平明显低于I组、II组(P0.05)。结论:通脉养心丸能降低冠状动脉粥样硬化性心脏病伴慢性病贫血患者的铁调素水平,提高该类患者的血红蛋白值,对冠状动脉粥样硬化性心脏病伴慢性病贫血患者,尤其是轻度贫血患者有一定的治疗价值。     

动态心电图与常规心电图诊断冠心病患者心律失常的效果比较

目的:分析冠心病(Coronary heart disease,CHD)心律失常(Arrhythmia)患者诊断中常规心电图(ECG)和动态心电图(DCG)两种诊断方式效果。方法:选取我院收治的CHD患者84例作为研究对象,分别使用ECG和DCG两种方式进行诊断,判断2种方法冠心病检测阳性率、心律失常检出率的情况。结果:动态组检测的阳性率为63.10%(53例),常规组为58.33%(49例),数据差异无统计学意义P0.05;8项心律失常指标中房性/室上性早搏早发、方式传导阻滞等检出率差异无统计学意义,P0.05;其余5项检出率差异显著,P0.05。结论:冠心病心律失常患者的诊断时采用动态心电图在冠心病诊断阳性率和心律失常检出率方面均有一定的优势。     

冠心病合并脑梗死患者心率变异性及心律失常的变化分析

目的：研究冠心病合并脑梗死患者的心率变异性情况,和心律失常的发生率,分析它们的变化规律,为患者疾病的治疗及预后提供更好的治疗指导。方法：研究对象为2012年2月~2012年12月我院心内科及神经内科的患者,其中Ⅰ组：冠心病合并脑梗死患者40例、Ⅱ组：单纯冠心病患者40例、Ⅲ组：单纯脑梗死患者40例、以及Ⅳ组：健康成人50例,统计全部患24 h心率变异性及心律失常发生情况,并进行对比分析。结果：Ⅰ组患者的心率变异性和心律失常发生明显高于其它组患者,差异均具有统计学意义（P〈0.05）。且心率变异性时域参数下降,心律失常发生率升高。结论：冠心病合并脑梗死患者的心率变异性和心律失常发生率增高,为避免冠心病合并脑梗死的患者突然心律失常及猝死,应积极改变治疗措施。     

Sources and predictors of resolvable indel polymorphism assessed using rice as a model

The principal sources of genetic variation that can be assayed with restriction enzymes are base substitutions and insertions/deletions (indels). The likelihood of detecting indels as restriction fragment length polymorphisms (RFLPs) is determined by the size and frequency of the indels, and the ability to resolve small indels as RFLPs is limited by the distribution of restriction fragment sizes. In this study, we use aligned sequences from the indica and japonica subspecies of rice ( Oryza sativa L.) to quantify and compare the ability of restriction enzymes to detect indels. We look specifically at two abundant transposable element-derived indel sources: miniature inverted repeat transposable elements (MITEs) and long terminal repeat (LTR) retroelements. From this analysis we conclude that indels rather than base substitutions are the prevailing source of the polymorphism detected in rice. We show that, although MITE derived indels are more abundant than LTR-retroelement derived indels, LTR-retroelements have a greater capacity to generate visible restriction fragment length polymorphism because of their larger size. We find that the variation in the detectability of indels among restriction enzymes can be explained by differences in the frequency and dispersion of their restriction sites in the genome. The parameters that describe the fragment size distributions obtained with the restriction enzymes are highly correlated across the sequenced genomes of rice, Arabidopsis and human, with the exception of some extreme deviations in frequency for particular recognition sequences corresponding to variations in the levels and modes of DNA methylation in the three disparate organisms. Thus, we can predict the relative ability of a restriction enzyme to detect indels derived from a specific source based on the distribution of restriction fragment sizes, even when this is estimated for a distantly related genome.Electronic Supplementary Material Supplementary Material is available in the online version of this article at Communicated by M.-A. Grandbastien