miRNA异构体：miRNA序列多样性

微RNA（microRNA,miRNA)是一类抑制基因表达的调控分子,在多种生物学进程中扮演重要角色。近来,基于新一代测序技术获得的小RNA测序数据发现,对于某一miRNA来说,它并不是单一的序列,而是由一系列长度/序列及表达不同的异构微RNA (isomicroRNA, isomiRNA/isomiR)所组成。这些isomiR表达多样且序列多样,甚至引入多样的5′端及种子区域。特定miRNA位点在疾病组织中可具有异常的表达模式,现已证实,部分isomiR具有重要的生物学功能。所关注的经典miRNA序列,其实仅是多重isomiR序列中的1条特殊序列,仅从miRNA角度的研究已不足以揭示小RNA的奥秘,全面的研究应同时在miRNA和isomiR中开展,由此可进一步拓宽miRNA的研究思路。本文主要从isomiR的生物学特点、表达及功能等方面进行介绍。     

miRNA研究进展

近年来,在许多真核生物中发现了一类内源性的、长度约22个核苷酸的单链非编码RNA-微RNA,研究发现它与基因表达、细胞周期及个体发育过程都有关系,因此,微RNA的研究可能对基因功能研究、人类疾病防治及生物进化探索具有重要意义。就近几年来对微RNA的研究作简要概述。     

植物 miRNA

植物RNA家族中最近发现和研究的一个新种类miRNA,它与动物体内的miRNA有相似点,但也有不同。它参与指导mRNA的剪切,影响转座子,目前在拟南芥中发现了19种miRNA,由Dicer酶和Argonaute蛋白作用下产生的,通过与目标序列的互补影响mRNA剪切和DNA甲基化,引起相关生理过程的发生。     

捕获miRNA

MicroRNA的发现打开了药物研究的新天地.现在,研究者用各种工具对调控RNA分子进行深入研究.     

肝癌相关miRNA

微RNA(microRNA,miRNA)是一类长度约为21～23个核苷酸的内源性小分子RNA,可在转录和转录后水平参与基因表达、细胞分化、增殖与凋亡、生物体发育等多种生物学过程的调控。肝癌是一种常见的恶性肿瘤,严重威胁着人类健康,但其具体发病机制尚不清楚。就miRNA与肝癌的发生、发展、转移的关系及miRNA在肝癌诊治中的应用进行综述。     

miRNA及其功能

microRNA(miRNA,微RNA)是近年来才引起广泛关注的在真核生物中发现的一类5′端带磷酸基团,3′端带羟基长度为22nt左右的内源性非编码调控RNA。新的miRNA的寻找以及它们的生物起源、作用机制以及功能等研究工作正处于积极的进展之中。     

miRNA的研究进展

近来,人类发现了一些不同种类的小RNA分子,其中miRNA是人类新发现的一类小RNA,它在进化上具有保守性,在数量、序列、结构、表达和功能上具有多样性.目前,大约已发现了100多种miRNA,它们存在于不同的生物中,从四膜虫、线虫、植物、动物到人都已发现了不同的miRNA.miRNA的主要功能是调节内源基因表达,它在基因活动调控网络中扮演了重要的角色.miRNA与siRNA关系密切,它们既具有相似性,又具有差异性.小RNA分子研究将是今后分子生物学的研究热点之一.     

昆虫miRNA研究进展

微小RNA(microRNA,miRNA)广泛存在于不同的生物体内,是一类长度为19～24 nt的内源性单链非编码小RNA,主要通过其种子区域与靶基因的开放阅读框(open reading frame,ORF)和3'非翻译区(untranslated region,UTR)进行结合,进而在转录后水平调控基因表达,miR...     

miRNA的研究进展

微小RNAs(microRNAs,miRNAs)是一类长度在22nt左右、能调节mRNAs表达的非编码RNA基因产物。miRNAs最初在线虫体内被发现,广泛存在于真核生物体内,对于生物体的发育等诸多方面有调节作用,并在进化中保守。miRNAs作用机制尚不完全清楚,但已知其能通过与mRNAs的3′非翻译区结合而影响翻译水平。部分miRNAs可以行使类似siRNAs的作用。本文就miRNAs的生物发生、作用机制、应用方向等研究进展作一综述。相信对miRNAs的深入认识将为基因功能研究提供新思路,同时也将为基因操作技术提供新的手段。     

miRNA–miRNA interaction implicates for potential mutual regulatory pattern

Background

Natural or endogenous sense/antisense miRNAs, located on sense and antisense strands in the same genomic region, respectively, are detected recently. However, little is known about these miRNA pairs, especially for their distributions in different animal species. We herein present systematic analysis of them in human, mouse and rat miRNAs, and their expression patterns based on deep sequencing datasets.

Methods and results

The phenomenon of miRNA–miRNA interaction could be detected in different animal species. The common miRNAs pairs were found across species. These miRNA pairs could form miRNA:miRNA duplex with complete complementary structure, and were prone to be located on specific chromosomes. They might be homologous miRNA genes (especially in human), or clustered in a gene cluster (especially in rat), or simultaneously detected in different genomic regions due to multicopy pre-miRNAs. Remarkably, some miRNA pairs, located in different genomic regions, also showed complementarity as well as endogenous sense/antisense miRNAs. Based on published deep sequencing datasets, one member of miRNA pairs always was abundantly expressed, whereas another was quite rare. Rare common target mRNAs of these miRNA pairs were predicted.

Conclusions

Interaction between miRNAs and significant expression divergence implied complex potential mutual regulatory pattern in the miRNA world. The study would enrich miRNA regulatory network.     

c-MYC–miRNA circuitry

MYC (c-Myc) deregulation has been frequently associated with aggressive lymphomas and adverse clinical outcome in B-cell malignancies. MYC has been implicated in controlling the expression of miRNAs, and MYC-regulated miRNAs affect virtually all aspects of the hallmarks of MYC-driven lymphomas. Increasing evidence has indicated that there is significant cross-talk between MYC and miRNAs, with MYC regulating expression of a number of miRNAs, resulting in widespread repression of miRNA and, at the same time, MYC being subjected to regulation by miRNAs, leading to sustained MYC activity and the corresponding MYC downstream pathways. Thus, these combined effects of MYC overexpression and downregulation of miRNAs play a central regulatory role in the MYC oncogenic pathways and MYC-driven lymphomagenesis. Here, we provide biological insight on the function of MYC-regulated miRNAs, the mechanisms of MYC-induced miRNA repression, and the complicated feedback circuitry underlying lymphoma progression, as well as potential therapeutic targets in aggressive B-cell lymphomas.     

植物逆境miRNA研究进展

包括生物和非生物在内的多种逆境胁迫是植物正常生长和作物产量提高的重要限制性因素。植物在长期的进化过程中, 通过诱导表达某些抵御或防卫途径的关键基因来实现对胁迫的响应。研究表明, 逆境胁迫不仅会诱导植物蛋白质编码基因的表达, 也会诱导一些非蛋白质编码基因的表达, 这类非蛋白质编码基因的表达产物在植物的生长、发育和应对逆境胁迫等过程中起到重要的调控作用。miRNA(小分子RNA)就是这类非蛋白质编码基因产物中的重要类群, 研究发现, 多种逆境均会诱导miRNA的产生, 其作用是通过引导目的基因mRNA的降解和阻止翻译过程来调控靶基因, 最终通过形态或生理上的变化达到对逆境的适应。文章主要对植物逆境胁迫下miRNA的研究, 特别是逆境胁迫诱导miRNA的产生、靶基因调控以及miRNA在植物适应逆境胁迫过程中的作用进行了综述, 同时, 文章还对在逆境胁迫下植物miRNA的研究方法进行了初步的探讨。     

真菌miRNA的发现

microRNAs (miRNAs)在植物和动物中大量存在,但是否在真菌中存在一直是个未解之谜.本研究组在担子菌新型隐球酵母Cryptococcus neoformans中发现了miRNA.两个miRNA,miR1和miR2,长度分别是22nt和18nt,前体是70nt,和动物miRNA相近.通过报告基因,证实miRl/2具有沉默功能.真菌miRNA的发现为研究其进化、功能等提供有用知识.     

病毒miRNA的研究进展

MicmRNA（miRNA）是指一组由多细胞生物产生的小片段非编码RNA,是真核生物基因调控重要的组成成分。近些年来有研究者在病毒中也同样发现编码产生的miRNA,其可通过RNA干扰途径参与调节感染过程以及促进癌症的发生。因此阻止病毒小RNA生成有望成为治疗病毒相关疾病的新方法。     

植物miRNA的进化

鉴于miRNA在植物基因表达调控中的重要作用, 人们已经开展对植物miRNA的预测、鉴定、功能和进化等方面的研究。随着许多模式植物基因组测序的完成, miRNA的基因组学和进化信息的整合为miRNA的起源和进化研究提供了越来越多的证据和假说, 然而尚未见关于植物miRNA进化方面的系统报道。文章从miRNA的起源以及相应的几种假说、miRNA的产生和消亡、miRNA的功能进化等几方面来分析和综述植物miRNA进化的研究进展。     

miRNA可抑制肿瘤细胞生长

《科技日报》消息：美国耶鲁大学和奥斯瑞根（Asuragen）公司研究人员发现,一种名为let-7的微小核糖核酸（miRNA）分子,能够持续减缓多种患有不同类型肺癌小鼠模型中的肿瘤生长。这项成果刊登在最近的《细胞周期》（Cellcycle）杂志上。研究人员称,这是关于微小RNA分子可有效治疗包括最致命的肺癌在内的任何癌症的第一篇报道。     

癌症的miRNA基因治疗

MiRNAs是一种内源非编码小RNA,具有进化上的保守性,在各物种中广泛分布.MiRNAs的作用是反向调节其靶基因的mRNA,研究发现在所有的人类癌症细胞中,miRNA的表达都有异常,即miRNA在肿瘤的形成、生长和扩散过程中发挥重要的作用.本文重点介绍了几种癌症的miRNA治疗方法,为将来的miRNA基因治疗奠定了基础.此外,还简要介绍了相关的基因传递系统及目前面临的挑战.     

miRNA与涡虫再生

miRNA是一类具有调节功能的非编码小分子RNA,参与调节多种细胞功能。涡虫具有强大的再生能力,逐渐成为干细胞功能和再生研究的良好的动物模型。本文对miRNA在动物再生中的功能,尤其是miRNA与涡虫再生的关系进行综述。     

冠心病相关循环miRNA

冠心病诊断中最主要的挑战就是从常规的血液样本中鉴定出可靠的临床生物标志物.循环miRNA是一种可以稳定存在于体液中的小分子RNA,具有较高的组织、疾病特异性及敏感性,具有作为新的冠心病非侵入性生物标志物的潜力.通过综述血液样本（全血、血浆、血清、外周血单核细胞（PBMC）、内皮祖细胞（EPC）及血小板）中冠心病相关循环miRNA,及探讨循环miRNA研究中存在的一些问题,为未来筛选出真正具有临床应用价值的循环miRNA生物标志物奠定基础.