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水稻功能基因组学研究 总被引:4,自引:0,他引:4
水稻是迄今为止第一个被测序的农作物。随着水稻基因组测序计划的完成,以功能基因组学研究为标志的后基因组时代已经到来。综述了水稻功能基因组学的工作进展与方法,主要包括:表达序列标签(EST)c、DNA微阵列和DNA芯片、蛋白质组学、生物信息学和反向遗传学等新方法。 相似文献
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Ac/Ds标签系统与水稻功能基因组学 总被引:7,自引:0,他引:7
自2002年水稻基因组测序完成后,水稻功能基因组学研究正在成为水稻研究的重要内容.构建突变体库是研究功能基因组学的一条重要而有效的途径.利用外源的Ac/Ds (Activator/Dissociation)标签系统是构建插入突变体库较为理想的方法,经过多年发展完善,其在水稻中已有广泛的应用,但仍面临着一些需要解决的实际问题.文章对Ac/Ds标签系统的转座行为及其构建突变体库的问题和优点进行了综述,总结了近年来Ac/Ds标签系统在水稻中的研究进展,分析了利用Ac/Ds标签系统进行功能基因组学研究所面临的挑战. 相似文献
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插入突变在水稻功能基因组学中的研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
构建饱和的基因突变体库是最直接、有效的分析鉴定基因功能的方法.根据插入突变源不同可分为T-DNA插入突变、转座子插入突变等.主要介绍这两种方法的原理及其在水稻功能基因组学研究中的应用和进展,并分析和讨论了插入突变在水稻功能基因组学研究中存在的困难和发展趋势. 相似文献
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小麦的比较基因组学和功能基因组学 总被引:12,自引:1,他引:11
小麦是异源多倍体植物,具有大的染色体组,并且基因组中重复序列所占比例较高,这些特征限制了小麦基因组研究的进展。比较基因组学方法为运用模式植物进行小麦基因组学研究提供了一个操作平台。功能基因组学的研究集中于基因组中转录表达的部分,基因功能的确定是功能基因组学研究的主要内容。对比较基因组学在小麦基因组研究中的应用和小麦功能基因组学的研究内容和方法进行了综述。 相似文献
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基因组学相关概念及其研究进展 总被引:36,自引:1,他引:35
20世纪以来,生命科学得到了空前的发展,大量新的概念不断涌现并相应产生了许多新兴学科,本文试图对当今研究的热点领域-基因组学,包括结构基因组学,比较基因组学,功能基因组学和较新兴的蛋白质组学、功能蛋白质组学及其相关概念、营养基因组学、生物信息学及其相关概念和近期进展做一介绍。 相似文献
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黄曲霉(Aspergillus flavus)是一种常见的腐生真菌和条件致病菌,其次生代谢产物黄曲霉毒素(Aflatoxin,AFT)具有高度的致癌性和致畸性,严重危及人类和动物健康。近年来,功能基因组学研究发展迅速,在真菌生长发育、挖掘真菌次级代谢产物以及研究包括黄曲霉毒素在内的真菌毒素等方面得到了广泛的应用。功能基因组学在研究黄曲霉与宿主之间的相互作用以及黄曲霉与其他曲霉之间的相互作用方面具有巨大的潜力。然而,黄曲霉功能基因组学受到细胞壁难以破除、耐药性高、筛选标记少、缺陷型菌株构建费力耗时等因素的影响而发展缓慢。概述了黄曲霉的选择标记、遗传转化方法和黄曲霉毒素以及环匹阿尼酸(cyclopiazonic acid, CPA)生物合成的研究进展,并讨论了在提高黄曲霉基因操作效率方面的潜在策略。例如,构建缺乏非同源末端连接(NHEJ)途径的菌株、Cre-loxP重组系统、CRISPR-Cas9等方法,为深入开展黄曲霉遗传学研究提供参考。 相似文献
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EU-OSTID: A Collection of Transposon Insertional Mutants
for Functional Genomics in Rice 总被引:3,自引:2,他引:1
van Enckevort LJ Droc G Piffanelli P Greco R Gagneur C Weber C González VM Cabot P Fornara F Berri S Miro B Lan P Rafel M Capell T Puigdomènech P Ouwerkerk PB Meijer AH Pe' E Colombo L Christou P Guiderdoni E Pereira A 《Plant molecular biology》2005,59(1):99-110
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Reverse Genetic Approaches for Functional Genomics of Rice 总被引:7,自引:0,他引:7
T-DNA and transposable elements e.g., Ds and Tos17, are used to generate a large number of insertional mutant lines in rice.
Some carry the GUS or GFP reporter for gene trap or enhancer trap. These reporter systems are valuable for identifying tissue-
or organ-preferential genes. Activation tagging lines have also been generated for screening mutants and isolating mutagenized
genes. To utilize these resources more efficiently, tagged lines have been produced for reverse genetic approaches. DNA pools
of the T-DNA tagged lines and Tos17 lines have been prepared for PCR screening of insertional mutants in a given gene. Tag
end sequences (TES) of the inserts have also been produced. TES databases are beneficial for analyzing the function of a large
number of rice genes. 相似文献
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An introduction to the China Rice Functional Genomics Program 总被引:2,自引:0,他引:2
The China Rice Functional Genomics Program (CRFGP) was initiated in 1999 by the Ministry of Science and Technology of China under the National Basic Sciences Initiative and was expected to last for an initial period of five years. The CRFGP involves 20 research groups from the Chinese Academy of Sciences and some major universities and focuses on the identification of genes controlling flowering, plant architecture, fertility, reproduction, metabolic controls and stress responses in rice through a combinatorial approach based on genetics, molecular biology and functional genomics as well as the generation of intellectual properties related to crop breeding and improvements. We will briefly describe the mission of the CRFGP as well as its recent progress. 相似文献
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Recent highlights of the China Rice Functional Genomics Program 总被引:17,自引:0,他引:17