遗传计算中数学模型的构建

关于基因频率的考题中,常遇到已知常染色体隐形基因(a)的频率,需求显性表现的群体(AA和Aa)中携带者(Aa)的频率,常规解法往往利用遗传平衡定律,计算过程复杂,易出错。对此构建数学模型,设常染色体隐形基因(a)的频率为m,则显性表现群体中携带者的频率一定为2/(1+1/m),并用数学方法证明。运用此公式可跳过遗传平衡定律直接计算结果,极大节约时间,提高准确率。     

基因连锁遗传的概率计算及教学反思

依托教材中豌豆杂交实验的分析图解，对“2对基因位于1对同源染色体上”的连锁遗传的概率计算进行原理剖析和推导，夯实学生的计算基础；巧用数学“换元”思想提出“换元-求值-还原”的计算方法，简化完全连锁的遗传概率计算，并加以例题详解，取得了较好的教学效果。     

单基因完全显性遗传一对双亲的n个F1代中显(隐)性性状发生k次的概率

利用n次独立重复试验中事件A发生k次的概率公式,计算单基因完全显性遗传对双亲的n个F1代中显(隐)性性状发生k次的概率.     

Rh系统单倍型在中国人群中的分布

对中国已发表的125个人群Rh血型系统表型分布频率数据进行了收集和整理。用累积计算法（Counting method)重新计算单倍型频率,通过各单倍型的分布差异分析中国不同地区不同种族、人群的遗传差异,分组比较了不同地区汉族和少数民族人群的基因多样度和基因分化度,结果表明南方少数民族和北方少数民族民族亚群体基因多样度有明显差异,用不同方法计算中小组遗传距离并进行聚类分析。最后,计算了除维吾尔族和哈萨克族外的68个人群间的遗传距离并聚类比较,结果表明Rh基因单倍型的分布与地理分布基本相符。     

应用“列表法”解决遗传题

"基因的分离定律和自由组合定律"是高考的热点和难点,尤其是对于概率的计算是高中生的一大障碍。从教材中孟德尔所采用的"棋盘法"出发,进行总结、归纳和提升,并加以延伸,结合3种常见类型的遗传题即随机交配类、遗传方式判断类、遗传病概率计算类等题型,说明如何构建表格巧妙解题。     

中国人群遗传结构分析

本文根据红细胞血型基因频率,用Harpending和Jenkins(1973)方法计算了中国22个人群间的遗传距离,同时在国内首次运用主坐标分析及其排序方法展示了中华民族的遗传结构,反映出中国东西人群与南北人群间的基因流。     

猪几个血清蛋白质位点的等位基因频率在选育中的变化趋势

采用淀粉凝胶电泳测定了杜洛克猪的转铁蛋白(Tf)、前白蛋白(Pa)、血液结合素(Hpx)、铜兰蛋白(Cp)和淀粉酶(Am)多态性,统计和计算了表现型数和等位基因频率,并同1968年测得的基因频率进行了比较,揭示了杜洛克猪几个血清蛋白质位点的等位基因频率在长期选育中的变化趋势,即随着人们有目的地进行选育,这些血清蛋白质位点的等位基因数减少,基因频率向某个等位基因集中,形成优势等位基因。目前的优势等位基因是Tf^B、Pa^A、Hpx^3、Cp^B、Am^8。此外,将杜洛克猪的基因频率同湖南部分地方猪进行了比较,计算了它们的平均杂合度、遗传相似系数和遗传距离系数,并做了聚类分析。     

病理性近视的家系研究

为了探讨我国病理性近视的遗传模式,对90个病理性近视大家系进行了分离分析。简单分离分析采用先验法和SEGRAN-B软件,进行拟合优度卡方检验,比较实际分离比与理论分离比的符合程度;复合分离分析运用SAGE-REGD软件进行孟德尔遗传模型(主基因、显性、隐性、共显性)和非孟德尔遗传模型(非传递、环境、一般)的拟合。结果显示,婚配类型为A*N的家系符合常染色体显性遗传,散发概率为13．8％,婚配类型为N*N的家系符合常染色体隐性遗传,散发概率为16．3％,但常染色体显性遗传不能除外,复合分离分析接受孟德尔遗传的显性、隐性、共显性和主基因模型,共显性模型的可能性最大,基因频率为0．21442999。因此,我国病理性近视存在常染色体显性和隐性遗传模式,并有一定比例的散发病例,具有遗传异质性。     

非一致性水文频率计算的基因途径Ⅰ:水文基因遗传、变异和进化原理

随机水文过程受到随机性和确定性因素的综合影响,其时间序列不仅具有反映遗传特性的纯随机成分,还含有反映变异特性的确定性跳跃、趋势、周期成分和随机性相依成分,使得随机水文过程表现出复杂的变化形态和演变规律.为了对上述复杂的变化形态和演变规律进行统一认识,本文从随机过程模拟和时间序列分析两个角度描述了非一致性水文序列的遗传和变异特性或规律,同时对非一致性水文频率计算途径进行比较,说明非一致性研究面临的主要问题.在此基础上,本文借鉴生物基因概念来定义水文基因,并分别利用常规矩、权函数矩、概率权重矩、线性矩等描述水文基因的构建和表达过程;同时定义跳跃、趋势、周期、相依和纯随机成分为构成水文基因的5种水文碱基,综合考虑非一致性水文序列的遗传成分和变异成分,并阐述其遗传、变异和进化原理,以揭示水文要素概率分布遗传、变异和进化的演变规律.     

遗传分析中的相关计算

遗传概率的计算也许是许多考生头痛的一个问题,花了很长时间,最后计算出来的概率还是不正确,现在我们一起来探讨遗传中的几种计算概率的题型的解题思路和方法。     

遗传平衡定律的推广及应用

生物进化的实质是种群基因频率的改变.介绍了遗传平衡定律的适用范围、表达式、推广及应用,概述了突变、基因重组、自然选择、迁移、遗传漂变等因素对遗传平衡及基因频率的影响.     

对一道遗传概率计算题的剖析

通过对一道典型遗传概率计算题的剖析,为计算遗传概率的基本思路和方法提供参考。     

利用微卫星技术分析不同类群鸡的遗传多样性

利用8个微卫星标记分析了6个生产类群鸡的遗传多样性。计算了各群体在各位点上的等位基因频率,并据此计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)。结果表明:6个鸡群在8个微卫星座位上的基因频率存在明显的差异,其平均基因杂合度为0.7317,平均多态信息含量为0.6815。其中,群体平均杂合度最高的是安卡红鸡,为0.7716;平均杂合度最低的是新罗曼鸡,为0.7073。所选的8个微卫星座位均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于鸡群体遗传多样性的分析。     

自由组合规律的概率分析

自由组合规律的概率分析方炜,吴渝生（云南农业大学农学系昆明６５０２０１）从统计学的观点来看,孟德尔遗传规律实质上是一个概率规律,因此可以用概率原理的计算形式来分析和表示多对非连锁基因的自由组合规律。其基本原理是乘法定理和加法定理。下面通过举例来具体介...     

种子与花粉的随机迁移对植物群体遗传结构分化的影响

将Ｗｒｉｇｈｔ的经典岛屿模型拓广到植物群体上,同时考虑了含有花粉和种子随机迁移的影响。并给出了３种不同遗传方式的基因（双亲遗传,父本和母本遗传）频率的期望均值和方差。理论结果证明花粉或种子的随机迁移可增加基因频率方差,其幅度取决于迁移率和迁移基因频率的方差。同绝对迁移率一样,花粉和种子的迁移率方差及迁移基因频率的方差对群体遗传结构的分化有着同样的重要。一个重要结论就是花粉或种子的随机迁移率和随机迁     

辽宁满族11个Y-STR基因座多态性及遗传关系的分析

调查了辽宁满族群体11个Y-STR基因座的多态性分布, 探讨其群体遗传学及法医学应用价值。应用Powerplex Y System荧光标记复合扩增系统检测203名满族无关男性个体的11个Y-STR基因座, 用ABI310遗传分析仪进行基因分型, 计算等位基因和单倍型频率, 并结合已公开发表的国内其他16个群体相应基因座的遗传学资料, 分析其遗传距离和聚类关系。满族个体中共检出189种单倍型, 单倍型频率多样性0.9991, 基因多样性GD值在0.4594(DYS391)～0.9258(DYS385a/b); 从遗传距离分析发现, 满族和东北汉族的遗传距离最小(0.0015), 与维吾尔族的遗传距离最大(0.1485)。结果表明, 11个Y-STR基因座在满族群体中具有较好的遗传多态性, 适用于当地区的法医学应用。与其他民族群体遗传多样性的研究, 对了解满族的起源、迁移以及相互关系有重要意义。     

版纳小耳猪近交系5家系35个微卫星座位的遗传分析

利用35个微卫星座位对版纳小耳猪近交系5个家系进行了遗传检测。统计各家系的等位基因组成,计算各家系的平均基因纯合率,利用基因频率计算出各家系的平均杂合度及品系间的遗传距离,并进行系统聚类。结果表明各家系的平均基因纯合度均较高,其151家系达到88.79％;PIC（多态信息含量）和平均杂合度均较普通商品猪低;各家系等位基因组成差别较大;各家系间亲缘关系与其近交过程一致,据此认为版纳小耳猪近交系5家系均具有较高的近交程度;其基因多态性和遗传多样性较普通商品猪低;各家系均已构成独立遗传群体。     

涉及两种遗传病的遗传题的解法研究

关于人类遗传病的发病机率 (或正常子女出现机率 )的计算 ,特别是涉及两种遗传病的发病率的计算 ,是高考试卷中常会出现的类型 ,而这类题又是绝大多数考生十分“头疼”的问题。为了帮助学生解题 ,笔者结合自己多年的教学以一道题为例谈一下该类型题的解法 ,供同行们参考。例题　人类多指基因 (T)对正常指基因 (t)是显性 ,白化基因 (a)对正常基因 (A)为隐性 ,且都在常染色体上 ,而且都是独立遗传。一个家庭中 ,父亲是多指 ,母亲正常 ,他们有一个白化病和手指正常的孩子 ,则下一个孩子两种病均患的概率、只患一种病的概率、患病概率及完全正…     

赣南地区汉族人群29个Y-STR基因座的遗传多样性及系统进化分析

研究赣南地区汉族人群29个Y-STR基因座的遗传多态性以及与国内多个民族群体的遗传关系,探讨其在群体遗传学和法医学中的实际应用价值。采用DNATyperTM Y29试剂盒对1532例赣南地区健康男性无关个体进行Y-STR基因座扩增,3730型遗传分析仪进行毛细管电泳检测,运用GeneMapper IDX1.4软件对数据结果进行Y-STR分型,计算29个Y-STR基因座的等位基因频率及单倍型频率等遗传学参数。应用Mega-X软件对选取的群体构建进化树,用YHRD在线工具软件的分子方差分析(AMOVA),计算群体间遗传距离,同时构建多维尺度图(MDS)。经分析,29个Y-STR基因座在赣南汉族人群中的基因多样性(GD)值范围为0.3815~0.8766,除了DYS508、DYS437、DYS391和DYS438基因座外,其余25个基因座GD值均高于0.5,且单倍型多样性为0.999924,表明29个Y-STR基因座在赣南汉族人群中有较高的遗传多态性。与其他地区汉族人群比较,赣南汉族与福建汉族遗传距离最近(遗传距离Rst值是0.0002),与黑龙江汉族遗传距离最远(Rst值是0.0249);与其他地区少数民族人群比较,赣南汉族与云南白族遗传距离最近(Rst值是0.0059),与甘孜藏族遗传距离最远(Rst值是0.4689)。研究表明,这29个Y-STR基因座在赣南汉族人群中具有较好的遗传多态性分布,能够满足家系排查及法医学检案的要求,所得的数据可为该地区的群体遗传学和法医学研究与应用提供基础数据支持。     

中国九个人群耵聍的遗传多态性

报道了九个人群的耵聍位点基因。计算表明中国各族人群在耵聍位点上的遗传分化程度非常大,固定指数F_(ST)=0.22。本文根据耵聍基因频率在我国和邻近地区的分布趋势,认为亚洲东北地区应是干型基因的起源地,目前世界上耵聍位点基因频率分布格局主要是基因扩散的结果,而非选择作用造成的。