鲜叶保存方法对茶树基因组DNA提取效果的影响

探讨一种简便有效的鲜叶保存方法,对克服茶树DNA研究中远距离采样的困难具有重要意义．为此,以槠叶齐品种的鲜梢为材料,分别采用-20℃、-70℃、硅胶脱水干燥3种方法保存样品,采用改进的CTAB法与SDS法分别对3种方法保存的样品及对照样(鲜叶)进行基因组DNA的提取与纯化,对所得DNA的质量进行多重检测的结果表明,硅胶脱水干燥法保存的样品与其他几种方法保存的样品一样,都提取获得了高质量的DNA,因此,硅胶脱水干燥法可作为远距离采样制备茶树DNA的一种较好的鲜叶保存方法,具有操作简单、经济实用、不受时空等条件限制的特点,该方法同样适用于其他植物．     

一种适用于植物居群遗传分析的组织干燥与保存方法

DNA的有效提取是分子生物研究工作的前提,野外采集时大多采用将新鲜叶片用变色硅胶快速干燥,防止细胞死亡过程中次生物质释放和DNA降解.我们在野外采样时,将新鲜材料压制成干标本,成功地应用于芨芨草居群的RAPD分析.这种植物组织干燥与保存的方法比硅胶快速干燥法更简单、方便,非常适用于采集地点多,相距远,野外采集时间长,所采样品的种类和数目又多的遗传多样性研究.     

一种提取动物基因组总DNA的野外样品保存方法

为了确定一种方便的野外动物样品保存方法,以新鲜材料作对照,从-20℃冰箱、70%乙醇、含50mmol/L EDTA的70%乙醇、95%乙醇、液氮处理的高原鼠肌肉和肝脏组织中提取基因组总DNA。通过琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计对提取的基因组总DNA质量进行检测。结果显示:相同处理的肝脏DNA产量大,肌肉组织提取的DNA质量好;各种保存方法提取的DNA降解程度依次为,-20℃冰箱、70%乙醇>含50mmol/L EDTA的70%乙醇、95%乙醇>液氮>新鲜。选择新鲜肌肉和95%酒精处理的肌肉样品提取的总DNA作模板,进行微卫星PCR扩增,均可获得清晰的电泳带。将该方法用于高原鼢鼠,进行线粒体12S rRNA、Cytb和D-loop区测序,结果显示该方法保存的样品与新鲜样品没有差别。因此,在野外用95%乙醇固定肌肉样品是一种可行的样品保存方法。     

不同保存方法对柽柳基因组总DNA产量和质量的影响

通过比较不同保存方法对柽柳(Tamarix chinensis)基因组总DNA提取效果的影响,确定合适的野外采集植物样品的保存方法。采用改良CTAB法提取了室温风干、4℃、-20℃、-80℃和硅胶干燥5种保存方法分别保存24 h、1周和1月后的柽柳基因组总DNA,结果表明:4℃保存1月后DNA产量最低,为60.35μg/g,-80℃条件下保存24 h的材料中提取的DNA产量最高,为246.92μg/g,保存效果最好。但在野外仪器条件不具备的情况下,柽柳可采用室温风干或硅胶干燥保存的方法,1月内材料中DNA降解程度较轻,可以扩增出所需目的片段。     

改良CTAB法提取番石榴叶片总DNA

目的:从番石榴叶片中快速提取高质量的总DNA。方法:改良CTAB法。主要改进之处在于不用液氮,而是直接研磨硅胶干燥样品;用高浓度CTAB、低浓度乙醇与NaCl盐析相结合等方法去除多糖。结果:应用改良后的方法可以快速提取番石榴叶片总DNA,有效去除组织中的多糖、蛋白质,抑制提取过程中的组织褐变。提取的DNA可用于限制性内切酶酶切和PCR扩增。结论:传统CTAB法经过改良,可用于快速提取番石榴高质量DNA。     

不同保存方法对川金丝猴粪便DNA提取效果的影响

目的:川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)是我国特有珍稀物种,其粪便作为一种非损伤性样品,为珍稀濒危动物的种群数量调查、遗传多样性评价、亲缘关系、系统进化等研究带来了很大便利,本研究试图建立高效、简便的粪便样品保存方法。方法:在现有珍稀濒危动物粪便样品保存方法的基础上,分别使用干燥法、冷冻法和干燥-冷冻法保存川金丝猴的粪便样品,比较了不同保存方法的DNA提取效果,以及对mtDNA控制区片段的PCR扩增成功率和微卫星基因的PCR扩增效率。结果:干燥法、冷冻法和干燥-冷冻法三种不同保存方法保存粪便1周时间后,提取的粪便DNA样本扩增mtDNA片段的成功率均为92%,微卫星基因的扩增成功率分别为79%、78%、80%;保存2个月后,mtDNA片段扩增成功率分别为80%、76%和80%,微卫星基因扩增成功率分别为65%、61%、67%;保存6个月后,mtDNA片段扩增成功率分别为56%、52%和64%,微卫星基因扩增成功率分别40%、34%、46%。因此,随着保存时间的增长,三种方法的保存效率都将明显降低,但干燥-冷冻法得到的DNA样本扩增成功率相对较高。结论:粪便样品能够为川金丝猴的遗传多样性评价等相关研究提供有效信息,干燥-冷冻法保存能够更为有效的保证DNA的提取和基因扩增效率。     

不同固定液及保存温度、时间对小鼠组织DNA的影响

比较10％甲醛、95％乙醇、Saccomanno3种固定液及不同保存温度、保存时间对小鼠肝、肺组织DNA的影响。取材后将标本分为无固定液组、甲醛组、乙醇组和Saccomanno组,不同温度保存至一定时间后提取DNA进行比较。结果无固定液时,保存3d后,室温且与低温组差别不大。甲醛固定时,对不同保存温度、时间、不同组织的DNA影响不同。乙醇、Saccomanno法室温放置1个月后DNA仍保存良好。短时间室温保存对DNA影响不大。10％甲醛使DNA降解,95％乙醇、Saccomanno法固定则可以保护DNA的完整性。     

不同保存方式下蝗虫组织DNA的提取及RAPD分析

为了开展蝗虫分子系统学研究,分别对冷冻、乙醇浸泡(100%、乙醇、70％乙醇)和干制蝗虫标本用饱和NaCl法进行了基因组DNA的提取,并用随机引物进行扩增,结果表明：70％乙醇固定的标本和部分干标本提取的总DNA得率较低,在琼脂糖凝胶电泳检测中大音琏分有明显降解,导致PCR扩增中信息缺失,甚至无扩增条带;而保存完好的干标本、-20℃冷冻标本和100%,乙醇浸泡标本提取的总DNA带型整齐,无拖尾,PCR扩增结果的稳定性好,成为蝗虫分子系统学研究中首选的三种保存方式。     

濒危物种胡杨和灰叶胡杨总DNA提取及RAPD体系优化

以濒危物种胡杨和灰叶胡杨硅胶干燥的叶片为材料,研究其总DNA提取方法及RAPD-PCR体系优化条件。结果表明,用改良CTAB法提取的DNA适用于胡杨和灰叶胡杨的RAPD分析。优化的胡杨和灰叶胡杨RAPD-PCR体系为:20μL的反应体系中含Mg2+2.5 mmol·L-1、dNTP 0.15 mmol·L-1、引物0.2μmol·L-1、模板DNA100 ng和1.5 U Taq DNA聚合酶。用6条多态性引物对优化体系的稳定性进行检测,结果显示扩增结果稳定,多态性丰富。该优化体系为在分子水平开展胡杨和灰叶胡杨的保护生物学研究提供了技术支持和参考。     

不同方法保存的蜜蜂基因组DNA提取的比较

目的:找出适合DNA提取的昆虫标本保存方法。方法:用几种常用的昆虫标本保存方法对蜜蜂处理不同时间后,用蛋白酶K法对其基因组DNA进行提取和纯化,然后对提取产物做琼脂糖凝胶电泳及紫外吸收分析。结果:75%乙醇及冻存处理材料的基因组DNA得率较高,为7.13～8.85μg/g,电泳条带较亮;甲醛处理材料的基因组DNA得率较低,为1.50～3.21μg/g。结论:用75%乙醇及冻存处理蜜蜂较适合于其基因组DNA的提取,不宜用甲醛。     

保存方法和保存时间对竹子核DNA含量 （2C-值） 检测的影响

竹子核DNA含量（2C 值）的检测对竹资源的科学研究具有重要意义,而大部分野外采集的样本,通过不同方法保存后,均使用流式细胞仪技术进行核DNA含量检测。本文选取麻竹（Dendrocalamus latiflorus）、筇竹（Chimonobambusa tumidissinoda）和毛花酸竹（Acidosasa purpurea）三种竹子样本,使用硅胶保存法和Sample protector试剂保存法分别保存4d、8d、12d、16d后,采用流式细胞术检测样品2C 值。CV值可以用来反映数据检测结果质量,是对检测结果准确性以及精确性的评价标准,我们通过样品CV值的大小和2C 值的变异率来评价保存方法和保存时间对竹子2C 值检测的影响。方差分析显示,保存时间对CV值具有显著性影响（P < 0001）,随着保存时间增大,CV值增大;保存方法对2C 值变异率有显著性影响(P < 0001)。硅胶保存法保存后的样品,测量值比新鲜材料大;Sample protector试剂保存法保存后,测量值比新鲜材料小。因此,随着保存时间的增加,样品CV值增大,引起检测结果质量降低。研究发现,硅胶保存法和Sample protector试剂保存法会影响竹子样本2C 值大小,但2C 值大小的变化小于10%。     

木根麦冬（Ophiopogon xylorrhizus）干叶提取DNA用于RAPD分析

木根麦冬（Ｏｐｈｉｏｐｏｇｏｎｘｙｌｏｒｒｈｉｚｕｓ）是我国珍稀濒危植物,分布仅限于云南西双版纳雨林,在植物系统学和保护生物学研究中具有独特的意义。随机扩增多态ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）方法是揭示群体遗传多样性的高效、简便方法,但一般均以新鲜材料提取总ＤＮＡ,对一些分布边远地区物种难以采用此法。本文研究从木根麦冬干叶片中提取总ＤＮＡ,进行ＲＡＰＤ分析。样品取自４个居群、４９个个体。选取生长旺盛的叶片,在野外用硅胶快速干燥保存样品。采用高盐低ｐＨ值法提取总ＤＮＡ,每克鲜重所得的干叶可得８０～１６０μｇ。通过对模板ＤＮＡ的各种处理和ＰＣＲ扩增程序的调整,解决了扩增片段边缘弥散、界线模糊、产率低等问题,获得了理想的扩增带型。这一成果对其它从野外直接采样的干叶提取ＤＮＡ进行ＲＡＰＤ研究具有指导意义     

保存方法和保存时间对竹子核DNA含量（2C-值）检测的影响

竹子核DNA含量（2C-值）的检测对竹资源的科学研究具有重要意义,而大部分野外采集的样本,通过不同方法保存后,均使用流式细胞仪技术进行核DNA含量检测。本文选取麻竹（Dendrocalamuslati—florus）、筇竹（Chimonobambusatumidissinoda）和毛花酸竹（Acidosasapurpurea）三种竹子样本,使用硅胶保存法和Sampleprotector试剂保存法分别保存4d、8d、12d、16d后,采用流式细胞术检测样品2c．值。CV值可以用来反映数据检测结果质量,是对检测结果准确性以及精确性的评价标准,我们通过样品CV值的大小和2c-值的变异率来评价保存方法和保存时间对竹子2c-值检测的影响。方差分析显示,保存时间对CV值具有显著性影响（P〈0．001）,随着保存时间增大,CV值增大;保存方法对2c-值变异率有显著性影响（P〈0．001）。硅胶保存法保存后的样品,测量值比新鲜材料大;Sampleprotector试剂保存法保存后,测量值比新鲜材料小。因此,随着保存时间的增加,样品CV值增大,引起检测结果质量降低。研究发现,硅胶保存法和Sampleprotector试剂保存法会影响竹子样本2c．值大小,但2c-值大小的变化小于10％。     

一种适用于RAPD分析的微量山茶DNA提取方法的建立

为建立一种满足RAPD-PCR分析的简便且高产率微量山茶基因组DNA提取方法,探索了在无液氮条件下,采用简化试验步骤的改良CTAB、SDS和Triton X-100方法分别提取山茶新鲜和干燥叶片DNA,通过光谱扫描和测定DNA在波长230 nm,260 nm和280 nm时的吸光度,比较不同DNA提取方法、材料保存方法以及材料用量对DNA提取效率的影响。结果表明,干燥叶片比新鲜叶片更适合作为DNA提取材料,改良CTAB法在提取干燥山茶DNA时纯度和产率较理想,其A260/A280值为1.595-1.736,每克叶片可得到230-295μg DNA,高质量DNA经RAPD-PCR扩增可获得清晰扩增条带。100 mg干燥山茶叶片适合获得高纯度和高产率的DNA,增加材料用量可增大DNA总量,但也增加了DNA中杂质含量。     

松墨天牛成虫标本保存及其DNA提取质量比较

【目的】探讨适合DNA提取的天牛成虫标本保存方法。【方法】采用SDS-蛋白酶K消化法对液氮中冷冻保存、无水乙醇-20℃冷冻保存、无水乙醇室温保存和干标本室温保存且保存时间在2年以上的松墨天牛Monochamus alternates Hope成虫标本基因组DNA进行提取,并对不同保存方式提取的DNA样本进行了质量比较和分析。【结果】在上述常见的松墨天牛成虫标本4种保存方式中,以液氮中冷冻保存效果最佳,其次为无水乙醇-20℃冷冻保存,插针干标本室温保藏效果最差。利用昆虫线粒体基因CO I和CO II的通用引物从上述DNA中均能够成功扩增出目的片段,测序结果证实扩增片段符合预期。【结论】液氮和无水乙醇-20℃冷冻保存适合松墨天牛成虫标本长期保存,且不影响后续的PCR扩增和测序。     

高质量甘蔗基因组DNA的简便快速提取方法研究

甘蔗是世界上重要的糖料作物和能源作物。目前,甘蔗分子生物学研究已成为甘蔗研究的热点之一。基因组DNA的提取是进行甘蔗分子生物学研究的基础。本研究设计含一系列SDS浓度的提取液,同时设加液氮和不加液氮研磨的对比试验,提取甘蔗不同部位叶片的基因组DNA并进行产量和纯度检测以及分子生物学分析。结果表明,所有提取液提取的甘蔗基因组DNA纯度均很高,A260/A280在1.8-2.0之间,A260/A230大于2,但提取液I(0.75%SDS)提取的甘蔗基因组DNA产量较低;加液氮与否对甘蔗基因组DNA的提取产量和纯度没有影响;以提取的甘蔗基因组DNA为模板,分别用一对扩增SPS(蔗糖磷酸合成酶)基因部分片段的引物和一对ISSR引物进行PCR扩增,所有DNA均能扩增出预期的条带;用不同的限制性内切酶对所提取的甘蔗基因组DNA进行酶切,所有DNA样品均能完全酶切。本研究得出最佳甘蔗基因组DNA提取方法如下:磨碎甘蔗叶片后,加DNA提取液(SDS:1.5%;Tris:100 mM;EDTA:20 mM;NaCl:500 mM)于65℃裂解30 min,经酚∶氯仿和氯仿各抽提一次,可获得高产量高质量的甘蔗基因组DNA,能满足后续分子生物学研究的要求。     

一种适合野外使用的被子植物分子标本干燥方式

该研究通过比较不同干燥方式对被子植物分子标本的影响,试图得到一种野外采集过程中可以替代硅胶干燥法的更为便捷的植物分子标本的干燥方法。选取40、80和150℃烘干和吸水纸压制干燥、硅胶干燥法对日本晚樱(Prunus serrulatavar.lannesiana)和山麦冬(Liriope spicata)两种植物的新鲜叶片进行干燥处理,提取各种处理样品的DNA,并将DNA进行电泳检测、分光光度计检测及PCR扩增,以此评价不同的干燥方式对植物基因组DNA的影响。分光光度计检测及总DNA电泳结果显示,经40℃烘干或硅胶干燥处理的样品总DNA浓度及长片段DNA浓度较其他干燥方式高;PCR产物浓度统计学分析显示,40℃烘干处理的样品PCR产物浓度高于其他干燥方式。基于以上结果,建议在野外采集被子植物分子标本时,使用40℃烘干干燥法对分子标本进行干燥处理,避免分子标本快速降解以及硅胶干燥法的污染问题,同时可节省携带、更换大量硅胶材料所耗费的人力。     

DETs缓冲液对肠道微生物DNA的保存效果

方便高效的保存方法是开展动物肠道微生物研究的重要前提,用T-RFLP（末端限制性片段长度多态性）结合16S rDNA分析评估了野外采样常用的DETs（20%DMSO,0.25 M sodium-EDTA,100 mM Tris,pH 7.5,and NaCl to saturation）缓冲液对不同保存时间（24h,7天,30天,90天）粪便样品肠道微生物DNA的保存效果。结果表明,DETs保存在30天保存时间内微生物群落结构无显著变化,95.6%的T-RFs仍然存在,能效好的保护肠道微生物DNA。     

一种快速提取葱属植物 DNA 的方法

目的：针对分子育种工作的繁琐性及葱属植物次生代谢物较多的特点,研究一种利用普通试剂及简单仪器高效快速提取葱属植物DNA的方法。方法：对碱处理法稍加改进,在碱性环境中高温裂解细胞,将释放的DNA保存在Tris缓冲液中,用PCR检测提取质量并分析DNA的保存时间。结果：与用试剂盒提取的DNA相比,扩增产物无显著差异,利用此方法提取DNA并分析了13个洋葱品种的细胞质雄性不育类型;保存时间分析显示,DNA在常温下只能保存5d,在4℃或-20℃可至少保存2个月。结论：该方法方便快速、成本低、适于田间操作,得到的DNA可满足分子生物学实验的基本要求,可用于以PCR为基础的分子标记辅助育种。     

药用植物艾纳香基因组DNA提取方法研究

以药用植物艾纳香为研究对象,以-20℃保存、4℃保存、室温自然干燥和硅胶干燥四种样品保存方式,并采用SDS法、CTAB法、SDS-CTAB法和改良CTAB法4种不同的基因组DNA提取方法进行了对比试验,以期建立艾纳香的较好的样品保存方法和基因组DNA提取方法。结果表明,-20℃保存是艾纳香的较理想的样品保存方式;改良CTAB法是艾纳香基因组DNA提取较适宜的方法,该方法提取的DNA经紫外检测,其A_(260)/A_(280)为1.8左右,明显优于SDS法(1.1～1.5)、CTAB法(1.2～1.5)和SDS-CTAB法(1.4～1.6),琼脂糖凝胶电泳、酶切检测和PCR扩增也得出了同样的结论。