大鼠脑谷氨酸脱羧酶基因的cDNA克隆及序列分析

胰岛β－细胞自身抗原蛋白之一是脑中谷氨酸脱羧酶（Ｇｌｕｔａｍｉｃａｃｉｄｄｅｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ,ＧＡＤ,ＥＣ４．１．１．１５）同源物,以双链ｃＤＮＡ为模权,用ＰＣＲ方法快速克隆了Ｗｉｓｔａｒ大鼠脑ＧＡＤ基因的ｃＤＮＡ将此包括编码５９３个氨基酸的全长ＤＮＡ片段重组入ｐＵＣ质粒并用双脱的氧末端终止法测定了全部序列,证明其全长为１７７９ｂｐ,经比较发现Ｗｉｓｔａｒ大鼠脑与Ｒｕｓｓｅｌｌ报导的大鼠脑Ｇ     

拟南芥生长素受体基因TIRl启动子的克隆及序列分析

以野生型拟南芥（Arabidopsis Columbia）基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到拟南芥生长素受体基因TIRI启动子2008片段,将该片断克隆到PGM-T载体上。序列分析表明,该启动子大小为2008bp,RNA聚合酶识别序列TATA-box,TIR1特异表达和增强序列CAAT-box皆完整,与已报道的序列比较仅有3个核苷酸发生改变,同源性为99．85％。将该启动子与GUS基因融合,构建成表达载体后,在拟南芥和烟草叶片中做瞬时表达,结果分析显示：拟南芥和烟草叶片中均有GUS酶活性存在。     

大鼠脑α1型甲状腺激素受体基因cDNA克隆及序列分析

使用ＲＴ－ＰＣＲ方法克隆了Ｗｉｓｔａｒ大鼠脑α１型甲状腺激素受体的ｃＤＮＡ,得到包含起始及终止密码子共１２３３ｂｐ、编码４０９个氨基酸的受体全长编码离列,酶切分析后,将此特异ＤＮＡ片段重组入质粒ｐＵＣ系统,得重组质料ｐＴＲＡ。双脱氧末端终止法测定了全部核苷酸顺序。     

人血小板生成素 cDNA 合成、克隆及序列测定

利用ＲＴ－ＰＣＲ方法从中国人胎肝总ＲＮＡ中扩增出人血小板生成素（ｈＴＰＯ）的ｃＤＮＡ。序列分析结果表明,我们所获得的ｈＴＰＯ ｃＤＮＡ与献报道中的基因序列高度同源,其中第４９７ｂｐ、５９５ｂｐ、７６７ｂｐ和７９５ｂｐ位碱基分别由Ｔ、Ｇ、Ｔ和Ｔ代替了献中的Ｇ、Ａ、Ｇ和Ｃ,从而导致了１６６、１６９和２５６位氨基酸由报道中的Ｓｅｒ、Ｌｙｓ和Ｇｌｙ变为Ｐｈｅ、Ｇｌｕ和Ｖａｌ。     

中国人HIV辅助受体CXCR4基因的克隆及序列测定

为了获得ＨＩＶ辅助受体ＣＸＣＲ４基因,进一步探索艾滋病（ＡＩＤＳ）的诊断、防治方法,采用逆转录巢式聚合酶链式反应（ＲＴ－ｎＰＣＲ）从中国人外周血淋巴细胞中克隆了ＣＸＣＲ４　ｃＤＮＡ基因,得到了预期的１　１００ｂｐ左右的片段。将ＰＣＲ产物与Ｔ载体连接,并进行了酶切反应鉴定,获得与Ｔ载体正向连接的克隆。测序结果表明：克隆的片段含有一个开放性阅读框架,编码３５２个氨基酸残基。搜索ＧｅｎＢａｎｋ,目标片段与Ｍ９９２９３、ＸＭ０５１２２３、ＸＭ０５１２２４、　ＸＭ０５１２２５有很高的同源性,比较结果显示：克隆的片段包括完整的编码序列,含两个碱基的差异。     

香蕉果实expansin cDNA克隆及序列分析

华南农业大学广东省果蔬保鲜重点实验室陆旺金博士对香蕉果实expansin cDNA做了研究,他提取成熟香蕉果肉的RNA并分离mRNA,以mRNA反转录合成cDNA,以该cDNA为模板,设计expansin的简并引物,进行RT-PCR圹增,利用退火温度为50℃得到扩增产物纯化后与pGEM-T-Ea-Sy载体连接转化大肠杆菌,任意桃选2个阳性克隆,进行序列分析,结果得到2个序列相同的expansin的cDNA基因片段,命名为MA-EXP3,以示与登录的香蕉MA—EXP1和MA—EXP2相区别。MA—EXP3中存在expansin基因的保守区域即8个半胱氨酸残基和3个色氨酸残基,它编码为177个氨基酸与MA—EXP1的核苷酸同源性为74．2％,与氨基酸的同源性为86．4％。     

烟草花叶病毒运动蛋白基因的cDNA克隆、序列测定及植物转化

植物病毒侵染宿主植物的一个重要过程是通过它在宿主体内的转移和传播,产生病害。植物病毒在宿主体内的转移主要有两种方式,一种是通过植物维管组织进行的系统转移,另一种是植物病毒在宿主细胞之间的转移,这种转移是通过植物细胞的胞间连丝实现的。实验表明,病毒自身编码的一种蛋白参与了这个转移过程,对烟草花叶病毒(TMV)而言,这种蛋白就是分子量为30kDa的运动蛋白。     

中国人HIV辅助受体CXCR4基因的克隆及序列测定

为了获得HIV辅助受体CXCR4基因,进一步探索艾滋病(AIDS)的诊断、防治方法,采用逆转录巢式聚合酶链式反应(RT-nPCR)从中国人外周血淋巴细胞中克隆了CXCR4 cDNA基因,得到了预期的1 100bp左右的片段.将PCR产物与T载体连接,并进行了酶切反应鉴定,获得与T载体正向连接的克隆.测序结果表明克隆的片段含有一个开放性阅读框架,编码352个氨基酸残基.搜索GenBank,目标片段与M99293、XM051223、XM051224、XM051225有很高的同源性,比较结果显示克隆的片段包括完整的编码序列,含两个碱基的差异.     

草莓果实膜联蛋白基因（annfaf）全长cDNA克隆及序列分析

采用RACE技术从草莓（Franaria ananassa Duch)成熟果实中分离克隆了膜联蛋白（annexin)基因的cDNA5'-端未知序列,并通过测序确定了翻译的起始密码位点,终止密码位点及完整的读码框,从而首次获得了草莓果实膜联蛋白基因的cDNA全序列,命名为annfaf9annexin of Fragaria anananssa fruit)基因。     

草鱼出血病病毒基因组的cDNA合成、克隆及部分序列分析

采用差速离心的方法纯化感染草鱼出血病病毒的细胞悬液.提纯的病毒粒子经蛋白酶K处理和酚-氯仿抽提,在1%琼脂糖凝胶电泳条件下分离得到11条dsRNA,利用柱离心式胶回收试剂盒纯化各基因片段.纯化的dsRNA溶于90%的DMSO中,70℃变性15min,然后采用随机引物法反转录合成各基因片段的cDNA,并平头连接于pZErO 2.0载体的EcoRV位点,电转化TOP10感受态细胞.重组质粒经酶切、PCR扩增得到大小不等的插入片段,cDNA-RNA斑点杂交的结果进一步证实其插入为目的基因片段.采用循环PCR测序的方法,对其插入片段进行了序列测定,对其中第11片段的部分序列作了报道.     

草鱼出血病病毒基因组的cDNA合成、克隆及部分序列分析

采用差速离心的方法纯化感染草鱼出血病病毒的细胞悬液。提纯的病毒粒子经蛋白酶Ｋ处理和酚氯仿抽提,在１％琼脂糖凝胶电泳条件下分离得到１１条ｄｓＲＮＡ,利用柱离心式胶回收试剂盒纯化各基因片段。纯化的ｄｓＲＮＡ溶于９０％的ＤＭＳＯ中,７０℃变性１５ｍｉｎ,然后采用随机引物法反转录合成各基因片段的ｃＤＮＡ,并平头连接于ｐＺＥｒＯ２．０载体的ＥｃｏＲＶ位点,电转化ＴＯＰ１０感受态细胞。重组质粒经酶切、ＰＣＲ扩增得到大小不等的插入片段,ｃＤＮＡＲＮＡ斑点杂交的结果进一步证实其插入为目的基因片段。采用循环ＰＣＲ测序的方法,对其插入片段进行了序列测定,对其中第１１片段的部分序列作了报道。     

拟南芥生长素受体基因TIR1启动子的克隆及序列分析

以野生型拟南芥 (Arabidopsis Columbia)基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到拟南芥生长素受体基因TIR1启动子2008片段,将该片断克隆到PGM-T载体上.序列分析表明,该启动子大小为2008bp,RNA聚合酶识别序列TATA-box,TIR1特异表达和增强序列CAAT-box皆完整,与已报道的序列比较仅有3个核苷酸发生改变,同源性为99.85%.将该启动子与GUS基因融合,构建成表达载体后,在拟南芥和烟草叶片中做瞬时表达,结果分析显示:拟南芥和烟草叶片中均有GUS 酶活性存在.     

水稻中编码甘油—3—磷酸转酰酶部分cDNA的克隆及序列分析

参照国外报道的几种双子叶植物的甘油－３－磷酸转酰酶的相对保守的氨基酸序列,设计并合成了一对简并引物,提取抗冷性强的水稻品种“丽梗２号”的ＲＮＡ,采用ＲＴ－ＰＣＲ技术,扩增出３１５ｂｐ的一般ｃＤＮＡ片段。扩增产物经纯化后直接克隆到ｐＧＥＭ－Ｔ载体系统中,经ＰＣＲ法鉴定,所得的重组质粒中含有３１５ｂｐ的片段。     

天蚕卵黄原蛋白cDNA的克隆及序列分析

天蚕卵黄原蛋白cDNA的全碱基序列由5 720个碱基构成,一个开读框有5 334个碱基序列,编码了包括由15个氨基酸组成的信号肽在内的共1 778个氨基酸的蛋白质前体。天蚕和柞蚕卵黄原蛋白的同源性非常高,氨基酸序列达到92.6%,碱基序列达到94%。天蚕、柞蚕和家蚕的卵黄原蛋白的糖链附加位点(N-linkedg-lycosylationsite):柞蚕有4个,家蚕有5个,天蚕和家蚕相同保存着5个。在N-末端区域,天蚕和家蚕有多聚丝氨酸区域和可被胰蛋白酶识别的RSRR部位;柞蚕虽然也具有多聚丝氨酸区域,但没有可被胰蛋白酶识别的RSRR部位。在C-末端区域里,大多数昆虫从G ICG功能部位至C-末端结尾具有7个~10个半胱氨酸(Cys)。鳞翅目的4种昆虫柞蚕、天蚕、家蚕和舞毒蛾(A.pernyi,A.yam am ai,B.m ori,L.dispar)都是7个半胱氨酸。     

中国对虾蜕皮抑制激素全长cDNA的克隆及序列分析

对虾的蜕皮活动由蜕皮抑制激素和蜕皮激素调控,蜕皮抑制激素是甲壳动物CHH家族神经肽的成员之一,通过抑制Y器官蜕皮激素的合成而调节蜕皮,以中国对虾（Fennropenaeus chinensis）眼柄总RNA为材料,采用cDNA末端快速扩增（RACE）方法。首次得到蜕皮抑制激素的全长cDNA（GenBank登录号：AF469187）。该全长cDNA大小为697bp,是由320bp的3′RACE产物和468bp的5′RACE产物拼接而成,Blast搜索结果显示,该全长cDNA与甲壳动物的MIH基因序列具有较高的相似性,用Clustal X进行多序列比较结果表明,由该全长cDNA推导的氨基酸序列与对虾类的MIH的氨基酸序列同源性最高,其中与日本对虾,斑节对虾,刀额新对虾MIH的同源性分别为95.1%,83.1%,79.1%,根据以上数据,推断该697bp的全长cDNA为编码中国对虾MIH前体的cDNA。进一步序列分析表明,编码中国对虾MIH前体cDNA包括312bp的开放阅读框,81bp的3′UTR和302bp的5′UTR;编码103个氨基酸的MIH前体分子包括信号肽和成熟肽,信号肽由28个氨基酸组成,成熟肽由75个氨基酸组成,成熟肽中6个半胱氨酸非常保守。     

河套蜜瓜ACC合成cDNA酶片段的克隆和序列分析

１－氨基环丙烷－１－羧酸（ＡＣＣ）合成酶是高等植物中乙烯生物合成的关键酶。以成熟河套蜜瓜果实的ＲＮＡ为模板,经反转录和ＰＣＲ扩增得到预期大小的ＤＮＡ片段,插入到ＰＵＣ１９的ＳｍａＩ位眯后转化Ｅ．ｃｏｌｉＪＭ１０９,筛选出重组子ＰＨＭＡＳ１。离列分析表明获得了６２７ｂｐ的ＡＣＣ合成酶ｃＤＮＡ片段。与已报道的ＡＣＣ合成酶基因相应离理比较有很高的同源性。     

黑曲霉bgl基因的cDNA克隆及序列分析

通过一步法提取黑曲霉AS3．796的总RNA,利用依据其他黑曲霉β-葡萄糖苷酶（bgl）基因序列设计的一对特异性引物,采用RT-PCR方法扩增得到了该菌bgl基因cDNA片段。将目的片段与pGEM-T载体连接并转入大肠杆菌。序列测定结果表明该cDNA片段大小为2583bp,其基因序列与已公布的其它黑曲霉bgl基因的同源性最高可达99％。蛋白质分析结果表明该β-葡萄糖苷酶属于糖苷水解酶家族3成员。