A modified high-efficiency thermal asymmetric interlaced PCR method for amplifying long unknown flanking sequences

<正>Rapid and efficient isolation of unknown flanking DNA sequences adjacent to known regions is important for molecular biology research.For this purpose,several PCR-based methods have been reported,including inverse PCR(Uchiyama and Watanabe,2006),ligation-mediated PCR(Yan et al.,2003;Ballester et al.,2005;Wang et al.,2007;Trinh et al.,2012)and randomly primed PCR(Liu and Whittier,1995;Liu et al.,1995;Antal et al."2004;Liu and Chen,2007;Reddy et al.,2008;Wang     

神农架川金丝猴粪便和尿液中类固醇激素的检测

灵长类动物类固醇激素的研究已经在很多物种间展开(Cariso et al.,1999;Lutz et al.,2000;He et al.,2001;Yan and Jiang,2006;Brandon et al.,2008;Lu et al.,2010;Kim et al.,2012)。特别是对于没有明显发情特征的灵长类动物,类固醇激素的变化可以为它们的繁殖状态提供更多可靠的评估(Fujita et al.,2001)。自然状态下野生动     

Engrafted newborn neurons could functionally integrate into the host neuronal network

The limited capability to regenerate new neurons following injuries of the central neural system (CNS) still remains a major challenge for basic and clinical neuroscience.Neural stem cells (NSCs) could nearly have the potential to differentiate into all kinds of neural cells in vitro.Previous studies verified that exogenous transplanted NSCs are capable of differentiating into neurons and projecting onto the host neurons in the rat brain (Tabar et al.,2005;Dong JR et al.,2012),which could lead to behavioral recovery from neuronal damages such as spinal cord injury (McDonald et al.,1999),Parkinson's disease (Gonzalez et al.,2015;Kim et al.,2002;Lindvall,2001),and stroke (Zhang et al.,2016).     

大鳞副泥鳅雄核单倍体的早期发育

目前,有关鱼类雄核发育的研究已见于川鲽(Platichthys flesus)、马苏大麻哈鱼(Oncorhynchus masou)、虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、红点溪鳟(Salvelinus fontinalis)、鲤鱼(Cyprnus carpio)、尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)、斑马鱼(Danio rerio)等(Purdom,1969;Arai et al., 1979; Scheerer et al., 1991; May et al., 1988; Bongers et al., 1994;Grunina et al., 1990; Meyers, 1995; Masaoka et al., 1995; 赵振山等,1998;Corley-Smith et al., 1996).     

Resolving the Activation Site of PositiveRegulators in Plant PhosphoenolpyruvateCarboxylase

Dear Editor, Phosphoenolpyruvate carboxylase （PEPC; EC 4.1.1.31） islocated at an important branch point in the carbohydratemetabolism of plants. The enzyme is a homotetramer andcatalyzes the addition of bicarbonate to phosphoenolpyru-vate （PEP） to form oxaloacetate and phosphate. PEPC isregulated by metabolites and phosphorylation. AIIostericfeedback inhibition is mainly regulated by L-malate andL-aspartate which bind to a site separated from the activecenter （Kai et al., 1999; Paulus et al., 2013）. Structure analy-sis of PEPC from Escherichia coli （Kai et al., 1999; Matsumuraet al., 2002）, Zea rnays （Matsumura et al., 2002）, Flaveria trin-ervia, and F. pringlei （Paulus et al., 2013） revealed that thesubstrate PEP and the feedback inhibitors bind to separatesites within each monomer.     

十种海洋寡毛类纤毛虫:形态学及分类学修订

利用活体观察和蛋白银染色技术对近年来采自青岛、大亚湾、湛江沿岸水体的10个海洋寡毛类纤毛虫种:侧扁急游虫Strombidium apolatum Wilbert & Song,2005、具头急游虫Strombidium capitatum (Leegaard,1995) Kahl,1932、广东急游虫Strombidium guangdongense Liu,et al.,2016、拟卡氏急游虫Strombidiumparacalkinsi (Lei,et al.,1999) Agatha,2004、拟楔尾急游虫Strombidium parastylifer Song,et al.,2009、铃木急游虫Strombidium suzukii Song,et al.,2009、束腰旋游虫Spirostrombidium cinctum (Kahl,1932) Petz,et al.,1995、杨科夫平游虫Parallelostrombidium jankowski (Song,et al.,2009) Song,et al.,2018、卡尔平游虫Parallelostrombidium kahli (Song,et al.,2009) Song,et al.,2018、最小拟盗虫Strombidinopsis minima (Gruber,1884) Song & Bradbury,1998的形态学开展了比较研究,补充和厘定了有关形态特征、纤毛图式以及性状变异等分类学新信息。     

Structural basis of AimP signaling molecule recognition by AimR in Spbeta group of bacteriophages

Dear Editor,Quorum sensing(QS)is a widespread phenomenon in bacteria which enables them to participate in cell-to-cell communication by producing and responding to small signal molecules,thus synchronously altering their behavior depending on population density(Singh et al.,2000;Miller and Bassler,2001).Through QS,bacteria coordinate processes such as expression of virulenee factors(Slamti and Lereclus,2002),biofilm formation(Parashar et al.,2011),sporulation(Perego et al.,1996),conjugation(Kozlowicz et al.,2006),antibiotic synthesis(Miller and Bassler,2001;Whiteley et al.,2017)etc.     

喀麦隆塞玛岭地区溪流中的水生丝孢菌区系

Aquatic hyphomycetes on submerged fallen leaves and deadwoods have been numerously reported in fast running streams in temperate countries(Ingold,1976;Ingold,1979;Chauvet,1990;Barlocher & Rosset,1987;Barlocher et al.,1995;Descals et al.,1995).However,documented information is considerably limited in African countries(Ingold,1956;Dixon,1959;Le-John,1965;Ferreira et al.,1981),and unavailable in Cameroon,a country mostly covered with heavy tropical forests(Loung,1980).This paper is to present a list of aquatic and aeroaquatic hyphomycetes identified from foam samples collected in Cameroon during a two-year survey.     

A Truncated F-Box Protein Confers the Dwarfism in Cucumber

正Dwarfism is an important plant architecture trait in crop breeding(Peng et al.,1999;Sasaki el al.,2002).In cucurbits.the compact plant type was proposed to develop new varieties for the once-over mechanical harvest for concentrated fruit set and higher densities(Li et al.,2011;Mondal et al.,2011).Several recessive genes in cucurbits have been reported to confer the phenotype of short internodes or bushy plant habits,such as compact,cp-2,and dw in cucumber(Cucumis sativus     

Identification of a novel strain of influenza A (H9N2) virus in chicken

<正>Dear Editor,Avian Influenza virus(AIV)H9N2 subtype viruses circulate widely in domestic fowl,and usually cause mild clinical signs in poultry(Li et al.,2005).Occasionally,avian H9N2 can infect humans and cause mild clinical symptoms(Peiris et al.,1999;Lin et al.,2000).Genetic analysis indicates that the H9N2 genotype viruses exist in major poultry species(such as duck and chicken)and in minor poultry species(such as quail,partridge,chukar,pheasant,and guinea fowl)(Guan et al.,2000;Li et al.,2005).Meanwhile,frequent reassortment events among     

高原鼠兔胃与结肠内容物食性分析方法的比较

小哺乳动物的食性是种群生态学的重要组成部分。本研究于2018年6—7月,在中国科学院海北高寒草甸生态系统定位站地区,通过显微组织分析法对12只高原鼠兔（Ochotona curzoniae）胃及结肠内容物进行了食性比较分析。结果表明：高原鼠兔胃内容物镜检到7科16种（属）植物碎片,主要组分包括垂穗披碱草（Elymus nutans）15.07%、棘豆（Oxytropis spp.）9.07%、嵩草（Kobresia spp.）7.38%、鹅绒委陵菜（Potentilla anserine）7.11%;而结肠内容物只镜检到3科6种（属）植物碎片,主要组分包括嵩草21.99%、垂穗披碱草13.68%、早熟禾（Poa spp.）5.04%、鹅绒委陵菜2.00%。根据高原鼠兔的胃和结肠内容物镜检结果,分别计算其取食植物的Simpson指数、Shannon-Wiener指数、均匀度指数、食物生态位宽度指数,分析高原鼠兔食物组成多样性,结果显示,除了均匀度指数,其它3种指数胃内容物均高于结肠内容物,且胃内容物和结肠内容物的识别率差异极显著（χ²=8.619,df=1,P<0.01）。上述研究结果表明,食性分析中胃与结肠内容物镜检结果显著不同,所得出的食物选择结果也大相径庭,胃内容物显微分析较结肠能更准确地反映高原鼠兔采食的植物种类以及对食物的选择性。     

高原鼢鼠越冬食物选择与营养成分的关系

为了解高原鼢鼠在越冬期的食物选择与营养成分之间的关系,采集了67 个高原鼢鼠的冬季粮仓及环境样方,分析高原鼢鼠对每一种植物的选择指数,将其分成3 种食物类型:喜食、可变和不喜食。通过测定每一种植物的粗蛋白、粗纤维、水溶性糖和粗灰分的含量,比较分析了营养成分含量在3 种食物类型间的差异,及其与各种植物选择指数的相关关系。结果显示,高原鼢鼠储存的食物种类多达67 种,本文选取含量较高且样本量大于5 的39 种植物(占粮仓和样方总生物量的99% 以上其中喜食12 种、可变16 种、不喜食11 种)进行分析。在3 种食物类型之间,粗蛋白、粗纤维和水溶性糖含量均有极显著差异(P < 0. 001),粗灰分含量则无明显差异(P = 0.800)。喜食和可变类型的粗蛋白和水溶性糖含量显著高于不喜食类型(P < 0.01);喜食和可变类型的粗纤维含量则显著低于不喜食类型(P < 0. 01);喜食和可变类型之间这3 个指标差异都不显著(P >0. 05)。Spearman 相关分析显示,粗蛋白(R = 0.547,P < 0.001)和水溶性糖(R = 0.617,P < 0. 001)含量与选择指数显著正相关,粗纤维与选择指数显著负相关(R = - 0. 707,P <0. 001),粗灰分与选择指数则无显著相关关系(R = 0.032,P =0. 846)。结果表明,高原鼢鼠总体上偏好粗蛋白和水溶性糖含量高、粗纤维含量低的植物,对无机盐的含量则不敏感。     

高原鼠兔冬季的食物选择

本文采用胃内容物镜检分析法,对高原鼠兔在矮嵩草草甸、垂穗披碱草草甸和杂类草草甸三种类型栖息
地中的主要食物组成进行了比较分析,旨在探讨三类栖息地不同食物资源状况对高原鼠兔食物组成的影响,以
及高原鼠兔在食物匮乏的冬季的觅食对策。研究结果表明:高原鼠兔在冬季主要选食弱小火绒草和铺散亚菊,
甘肃棘豆、垂穗披碱草和长茎藁本也是冬季食物主要组成部分。在冬季食物资源较为匮乏的情况下,高原鼠兔
选食的主要植物种类相对较多,且不同植物比例变化明显,说明高原鼠兔对食物具有一定的选择性。在矮嵩草
草甸中,其食物组成依次为铺散亚菊(16. 2% ) > 弱小火绒草(11. 5% ) > 甘肃棘豆(11. 3% ) > 大籽蒿
(9. 7% ) > 早熟禾(7. 6% ) > 长茎藁本(7. 5% ) > 垂穗披碱草(5. 5% )等7 种,占其食物的69. 3% ;在垂
穗披碱草草甸,其主要食物组成依次为垂穗披碱草(15. 8% ) > 甘肃棘豆(14. 7% ) > 弱小火绒草(14. 5% )
> 铺散亚菊(14. 2% ) > 早熟禾(7. 8% ) > 长茎藁本(6. 9% ) > 锥果葶苈(6. 2% )等7 种,占其食物的
80. 1% ;在杂类草草甸中,其主要食物组成依次为铺散亚菊(20. 8% ) > 长茎藁本(20. 6% ) > 大籽蒿
(9. 9% ) > 弱小火绒草(9. 8% ) > 锥果葶苈(6. 5% ) > 圆齿狗娃花(5. 5% )等6 种,占选食食物的73. 1% 。
不同栖息地之间食物组成比较分析结果表明,在冬季食物资源匮乏的情况下,栖息地类型不同对高原鼠兔食物
组成的影响较小,杂类草构成了它们的主要食物,这可能是由食物质量决定的,而不同栖息地中喜食植物可利
用量是决定鼠兔食物组成的主要因子,进一步验证了食物可利用量和质量决定植食性小哺乳动物食物选择模式
的假设。     

基于红外相机技术对帚尾豪猪活动节律和时间分配初步观察

2012年8月至2013年7月,采用红外相机技术对广西弄岗国家级自然保护区15 hm^2森林动态监测样地及其周边区域内的帚尾豪猪(Atherurus macrourus)进行观察,采用活动强度指数分析其活动节律和时间分配,探讨月相和环境因子对其活动节律和时间分配的影响。结果表明,不同时间段内帚尾豪猪的活动强度存在极显著差异(t=4. 666,df=23,P=0. 001),活动峰值出现在20:00~21:00和05:00~06:00;夜间主要以移动(63. 2%)和觅食(23. 6%)为主。帚尾豪猪各月份间的时间分配存在极显著差异(t=8. 581,df=11,P=0. 001),旱、雨季间的时间分配存在显著差异(Z=-2. 166,P=0. 03)。各月相间帚尾豪猪出现的频次存在显著差异(χ~2=5. 00,df=1,P=0. 025),以新月期和满月期活动最为频繁,上弦月活动最少。相关性分析表明,活动强度指数与月降雨量、月最高温度及最低温度(R^2=0. 440,R^2=0. 435,R^2=0. 457)都存在显著的负相关,帚尾豪猪最适的活动温区为10℃~26℃。本研究初步掌握了帚尾豪猪在弄岗保护区的活动节律和时间分配,有助于后期理解栖息地和气候变化对其活动的影响。     

贮存温度和时间对大熊猫粪便样品皮质醇浓度的影响

通过非损伤性取样比如粪便样品监测野生动物受胁迫的水平已成为一个重要的手段,然而针对从野外采集的样品,其运输和贮存温度条件是否干扰分析结果,尚未有过报道。为评估不同贮存温度和天数对野生动物粪便样品中皮质醇浓度的影响,我们将大熊猫的新鲜粪便置于3 种模拟条件(0℃ 、10℃ 和22℃ ),并进行连续6 d的检测分析。结果表明,贮存天数对粪样中皮质醇浓度有显著影响(F _5,107 = 7.501,P = 0.001),但温度则无显著影响(F _2,107 = 1.094,P = 0.366)。粪样在0℃ 、10℃ 和22℃ 条件下贮存6 d,皮质醇浓度与贮存前的基准值之间均不存在显著差异(0℃ :F _6,41 = 1.274,P = 0.290;10℃ :F _6,41 = 2.027,P = 0.084;22℃ :F _6,41 =1.009, P = 0.434)。结果提示在室温条件下短期运输和贮存(不超过6 d),不会引起大熊猫粪便样品中皮质醇浓度的显著变化。该结果对于野外所采集的粪便样品运输和贮存具有一定的指导意义。     

环境丰容对笼养川金丝猴日常行为以及粪便皮质醇水平的影响

在笼养条件下,由于有限的空间和单调的笼舍结构,川金丝猴行为和生理指标发生变化,包括出现刻板行为和产生较高的粪便内应激激素。本论文旨在研究环境丰容对笼养川金丝猴日常行为以及粪便皮质醇水平的影响。于2013年8月1日至11月1日对杭州动物园内7只川金丝猴进行环境丰容后的行为观察。采用瞬时扫描法记录上午08:30-10:30和下午14:00-16：00的动物行为,并统计15种行为的发生频率。比较丰容前后每种行为的发生频率,结果表明环境丰容降低了川金丝猴的不活跃行为（P=0.021）和刻板行为（P=0.034）,增加了其活跃行为频率（P=0.018）。环境丰容后,动物表现出更多的攀爬（P = 0.012）、探究（P = 0.014）和环顾行为（P = 0.010）。粪便皮质醇激素的结果表明,除1只雄性个体激素上升外,其余6只个体的粪便皮质醇含量显著下降（P=0.028）。以上结果提示环境丰容可改善川金丝猴的福利状况。     

臭氧处理对圈养大熊猫食用竹笋的保鲜

<正>竹笋是大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)最为喜爱的天然食物。竹笋相对于竹叶和竹茎含水量更丰富,粗纤维含量更低,适口性更好;大宗养分、微量元素、必需氨基酸等含量丰富(周昂等,1996;唐平等,1997;周材权等,1997),而丹宁等具有微毒性的次生代谢物含量却最少(赵晓红等,2001),更利于大熊猫对生活必需营养的吸收     

植物酚类化合物对东方田鼠体重增长和内脏器官发育的作用

在实验室条件下,以含0% 、3% 和6% 植物酚类化合物的食物饲喂东方田鼠,测定了植物酚类化合物对其生长发育和内脏器官发育的效应。结果表明,食物蛋白质为10% 时,含3% 和6% 酚类化合物的食物饲喂的实验个体,其体重在30 d 时较对照组个体分别降低16. 4% 和32.1% (P < 0.05),在60 d时较对照组个体分别降低16.3% 和35.4% (P < 0.05)。摄食含6% 酚类化合物食物的实验个体,其肝脏相对重量在30 d和60 d时分别较对照组个体增加6.8% 和6.2% (P < 0.05),其肾脏相对重量在30 d和60 d时较对照组个体分别增加25.5% 和19.7% (P < 0.05)。食物蛋白质为20% 时,与对照组相比,含6% 酚类化合物食物饲喂的实验个体,其体重在30 d和60 d时分别下降26.7% 和27.1% (P < 0.05),其肾脏相对重量在30 d和60 d时分别增加10.0% 和11. 0%(P <0.05)。由此可见,植物酚类化合物可影响小型植食性哺乳动物生长发育和内脏器官的发育。     

普氏原羚集群的群体决策过程

动物集群的群体行为决策是营集群生活的动物调节其群体活动、而获得集群生活收益的重要手段。受动物自身行为和需求的影响,动物集群的群体决策有不同的外在表现形式和过程。本研究以青海湖湖东地区的普氏原羚种群为对象,于2010 年3 月至2012 年3 月对普氏原羚集群的群体决策过程进行了观察和记录,并对所得数据采用非参数检验方法进行统计与分析,分析结果表明:1. 普氏原羚集群的群体决策类型为不完全民主型,需要有一定比例的个体共同参与群体决策过程才能达成群体决策,而参与群体决策的个体比例随群体规模的增加而降低;2.参与决策的个体因性别不同而有不同的表现,且在决策过程所需时间上存在差异,这可能是导致普氏原羚产生同性聚群现象的原因之一。这是在野外直接对大型有蹄类动物集群的群体决策过程进行的为数不多的研究,还需要更多的野外研究来探究不同类型动物群体决策过程及其与同性聚群产生机理之间的关系。     

高原鼠兔刈割行为与栖息地植物群落的关系

采用观察法和样条法对不同栖息地高原鼠兔刈割植物的行为、相对频次、生物量百分比以及刈割植物与鼠兔冬季食物组成之间的关系进行了分析,并阐述了高原鼠兔刈割植物的生物学意义。结果表明:高原鼠兔刈割植物始于每年的6 月下旬,早于其它草原小型哺乳动物贮草时间。不同栖息地鼠兔对植物的刈割频次和生物量比例并非完全一致。在矮嵩草草甸,鼠兔刈割频次较高的为垂穗披碱草、二柱头藨草、甘肃棘豆、短穗兔耳草、铺散亚菊和鹅绒萎陵菜;这些植物生物量所占比例亦较高,仅短穗兔耳草比例较低;在垂穗披碱草草甸,鼠兔刈割频次较高的为垂穗披碱草和早熟禾;垂穗披碱草生物量较高;而在杂类草草甸,鼠兔主要刈割植物为铺散亚菊、大籽蒿、黄帚橐吾、长茎藁本和圆齿狗娃花,生物量比例较高的主要为铺散亚菊。相似性分析结果表明,不同栖息地间鼠兔刈割植物频次和生物量比例差异较大,相似性系数最大分别为0. 7862 和0. 6100, 最小仅为0.1422 和0. 1035,而同一栖息地间鼠兔刈割植物频次和生物量差异相对较小,相似性系数最高达0. 9203 和0. 8490,最小亦达到0. 6662 和0. 4440,表明栖息地变化对鼠兔刈割植物频次和比例有明显的影响作用。鼠兔刈割主要植物频次和生物量比例与冬季主要食物组成的相关分析结果表明,生物量比例与主要食物组成呈显著的正相关(r =0.8412,df = 6, P <0. 05),而刈割植物频次与主要食物相关不显著。