一个RNA分子二级结构自动绘图系统

本文介绍一个核糖核酸(RNA)二级结构自动绘图系统。它可以把以碱基匹配对表示的RNA分子的二级结构自动转化为直观的图形显示。RNA分子结构图形可以显示在计算机图形终端上,并可进行放大,缩小,平移,旋转等操作;也可以在绘图纸上画出图形。该系统用BASIC语言书写,在IBM PC／XT和IBM 5550微型机上实现。     

IBM PC机上的核酸顺序数据库及其检索方法

我们在微型电脑IBM PC机上开发了一个核酸顺序数据库及其管理和分析系统。该库数据丰富且能更新,管理和分析软件系统功能强,结构设计合理、灵活,检索和管理比较方便。本文介绍了该库的作用及其各种检索方法。分析程序系统NASA(Nucleic Acid Sequence Analysis)将另文发表。     

lBM Pc机上的核酸顺序数据库及其检索方法

我们在微型电脑IBM PC机上开发了一个核酸顺序数据库及其管理和分析系统。该库数据丰富且能更新,管理和分析软件系统功能强,结构设计合理、灵活,检索和管理比较方便。本文介绍了该库的作用及其各种检索方法。分析程序系统NASA(Nucleic Acid Sequence Analysis)将另文发表。     

正弦调制光诱发脑电响应特性的研究

本文介绍了我们研制的正弦调制光诱发脑电系统,该系统由多功能刺激控制器、换能器、脑电信号的采集放大、系统控制部份组成,具有智能化、微机化的特点.我们应用该系统进行了人脑在正弦调制光刺激下诱发电位响应特性的研究,实验结果进行了处理和分析.     

电子显微镜图象处理与分析中的几个问题

在进行细胞的超微结构研究中,有时因操作不慎,使电子显微镜拍摄的照片出现了污染、局部干扰和线条不清晰等问题,致使一些极为珍贵的图象失去了或有损于应有的研究价值。为了解决这些问题,作者根据用户的需求,对上述情况在以IBM/AT为主机的图象采集处理系统上作了处理。得到了满意的效果。     

核酸顺序的计算机辅助分析系统

本文介绍了一个在微机(IBM PC)上实现的、用于核酸顺序分析的计算机程序系统.该系统由三个层次和18个功能块构成,菜单及人机对话使得用户能较快地掌握和使用它.在编程中,采用了树结构、先进后出栈和稀疏矩阵等数据结构技巧,运用了Bayes法等统计分析方法,Kruskal算法和Floyd算法等一系列图论方法也被得到应用,这个软件系统的推出对于分子生物学研究具有一定的积极作用.     

基于ADS8332的生理信号采集系统电路设计

本文介绍了医学生理信号的的特点,根据其特点设计出了针对医学生理信号进行采集的电路。该电路设计实现了基于16位的高精度A/D 转换芯片ADS8332 的医学生理信号采集系统,以基于Cortex-M3 内核的32 位微控制器STM32F103RD作为采集控制芯片,该系统电路可以实现对最多16 个通道的模拟医学生理信号进行采集。此电路设计充分利用了ADS8332 的高精度、低功耗、高采样速率的特点以及片上集成功能,并配合了信号调理电路和相应的抗干扰措施,因此保证了医学生理信号的采集精度和系统的稳定性。     

一个微机通用的数值分类(聚类与排序)系统及其应用

聚类和排序是近20—30年来应用定量方法研究植物群落的重要手段。本文简要报导我们根据多种常用的数学模型为微机编制的一个专用系统。该系统的优点是对非计算机专业的生态学家使用方便：适用于我国较普遍应用的微机如IBM—PC或PC—XT及0520等机型,该系统的程序可独立使用,以数据文件联接,具多功能可供用户选择配置,全过程全自动,最后结果可以直接输出树状图和三张二维座标图。     

三化螟为害水稻的产量损失预测模型

三化螟为害水稻的过程可以看作一个单输入——单输出系统。水稻的产量损失率不仅与蚁螟的为害时间、为害程度有关,而且还与管理措施和气候条件有关。在两个亚系统的二元非线性模式确定以后,给出了产量损失预测模型的一般形式。模型在IBM PC/XT微计算机上实现。     

基于 ADS8332 的生理信号采集系统电路设计 *

摘要： 本文介绍了医学生理信号的的特点, 根据其特点设计出了针对医学生理信号进行采集的电路。该电路设计实现了基于 16 位的高精度 A/D 转换芯片 ADS8332 的医学生理信号采集系统,以基于 Cortex-M3 内核的 32 位微控制器 STM32F103RD 作为采 集控制芯片, 该系统电路可以实现对最多 16 个通道的模拟医学生理信号进行采集。此电路设计充分利用了 ADS8332 的高精度、 低功耗、 高采样速率的特点以及片上集成功能, 并配合了信号调理电路和相应的抗干扰措施,因此保证了医学生理信号的采集精 度和系统的稳定性。     

MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用--系统发生分析(五)

MATLAB 7.X生物信息工具箱为广大用户提供了一个用于系统发生分析的综合环境,它能利用数据库资源,方便获取DNA/蛋白质序列数据,所有操作简单高效,结果可视化程度高。在工具箱提供的开放环境里,用户还可以根据自己的目标来设计和利用分析工具。本文介绍MATLAB7.X生物信息工具箱在构建系统发生树方面的应用,以人科线粒体基因序列作为分子标记构建一株人科系统发生树为例,说明在MATLAB环境下对系统发生树的分析和处理。     

NSA－Ⅱ型生理信号处理系统

介绍一种ＩＢＭ－ＰＣ系列微机生理信号采集、处理系统。该系统信号采集卡集程控放大、脉冲甄别、Ａ／Ｄ、Ｄ／Ａ等电路于一体,可满足各种生理信号的采集需要。采集信号时可长时间显示,动态观察。采样后,按需要给出各种图表与结果。部分处理方法采用独特数学模型,使结果更加精确。     

NSA—Ⅱ型生理信号处理系统

介绍一种ＩＢＭ－ＰＣ系列微机生理信号采集、处理系统。该系统信号采集卡集控放大、脉冲甄别、Ａ／Ｄ、Ｄ／Ａ等电路于一体,可满足各种生理信号的采集需要。采集信号时可长时间显示,动态观察。采样后,按需要给出各种图表与结果。部分处理方法采用独特数学模型,使结果更加精确。     

活体动物全细胞记录技术及其应用

活体动物全细胞记录技术不仅可以用于研究感觉系统对自然刺激（如视觉系统的光刺激、听觉系统的声音刺激等）反应的特性和规律,还可以较准确地记录细胞的突触电位（包括阈下反应）,实现EPSP和IPSP的相对分离,并实现活体细胞内灌流,从而进一步研究感觉信息的处理机制。本文较为详细地介绍了在活体动物上进行全细胞记录的方法,包括一些技术细节和关键仪器设备的选取原则,举例说明了该技术在视觉系统研究和体感系统研究中的应用,并讨论了这一方法在神经科学中的应用前景。     

《生理系统数学和计算机模型》

《Mathematical and computer modeling of physiological systems》(生理系统数学和计算机模型)由Vincent C. Rideout著,1991年美国Prentice-Hall出版社出版,261页。该书向读者介绍在合理价格内,用私人计算机和软件建立生理模型。作者利用IBM/AT和Fortran软件。ACSL,这种微分方程能把系统转换成Fortran解法程序。在附录A里还讨     

体外流动剪切力作用下的白细胞-内皮细胞动态粘附

建立一个用于体外研究特定流动剪切力作用下白细胞和内皮细胞动态相互作用的方法。利用建立的平板流动小室系统可在体外产生特定的流动剪切力。将培养的人脐静脉内皮细胞装入平板流动小室后 ,以 0 .71dynes/cm2 的流动剪切力把含有吖啶橙染色的白细胞的灌流液导入流动小室 ,由此产生了白细胞和内皮细胞的动态粘附过程。整个粘附过程通过OlympusIX70倒置荧光显微系统观察 ,同时通过CCD摄象头录像。然后用图象采集卡将录像采集为数字图象并保存。利用针对实验设计的图象处理和分析方法 ,对采集的数字图象进行处理和测量 ,可以得到粘附白细胞的个数和滚动白细胞的速度。通过研究内毒素脂多糖 (LPS)对内皮细胞粘附功能的促进及地塞米松 (DXM )对该刺激的抑制作用来验证。对于用内毒素脂多糖 (LPS)处理的内皮细胞 ,固定粘附和慢速滚动的白细胞的个数比对照组分别显著增加了 2 3.7倍和 4 .1倍 ,同时白细胞在粘附作用过程中慢速滚动和快速滚动的速度比对照组明显降低了 2 5 .6 %和 2 6 .1%。而对于脂多糖和地塞米松 (DXM)处理过的内皮细胞 ,上述内毒素引起的影响被显著抑制了。该方法可以用于研究不同的化学和物理刺激对内皮细胞功能的影响机制 ,及用来评价各类抑制内皮细胞粘附功能的药物。     

昆虫振动信号监听、记录和重放技术

由固体介质(寄主植株)传递的振动信号是区别于空气传播鸣声的另一类昆虫声信号。本文介绍了笔者用以监听、记录和重放昆虫振动信号的仪器和有关技术。     

CRISPR相关转座元件的研究及应用进展

CRISPR-Cas的基因编辑能力引发了人们对该系统的研究热潮。除了实现基因的敲除和插入,CRISPR-Cas系统还可以被应用于基因簇重组、单碱基编辑和基因转录调控,推动了生物工程领域的发展。然而,有限的同源重组效率使CRISPR-Cas系统的应用受到了一定的限制。与CRISPR-Cas系统相比,移动遗传元件(mobile genetic elements,MGE)在转座酶的调控下,不需要依赖同源重组即可将指定DNA片段定向插入到细胞染色体中。近几年,人们发现了具有转座机制的CRISPR相关的转座元件,它可以介导DNA靶向整合,同时其出色的重编程能力为该领域的研究带来了新的发展。本文主要介绍近年来CRISPR-Cas系统相关转座元件的研究方向和应用进展,以及人工融合的dCas9-transposase系统的应用策略。文中还提出了CRISPR相关转座元件未来的应用前景和潜在挑战,为基因编辑工具的发展方向提供了参考意见。     

视觉假体的研究进展与面临的挑战

人工视觉假体是当今国际上对视网膜色素变性和老年性黄斑病变患者进行视觉修复的研究热点,该人工装置采集外界图像信息,并进行编码处理,通过微电流刺激器将刺激微电流信号加载到微电极阵列,对视觉神经系统进行作用,从而在视觉中枢产生光幻视,实现视觉功能修复。根据目前的国际研究现状,视觉假体可以对视觉通路的任意位置进行电刺激,以期产生视光感。按照植入位置的不同,视觉假体基本上可以分为视皮层假体、视网膜上假体、视网膜下假体和视神经假体。本文着重介绍了中国的C-Sight小组在视神经假体方面的工作进展和面临的挑战。     

FloTrac/Vigileo 系统在围手术期血流动力学监测中的应用

FloTrac传感器和Vigileo监护仪(爱德华生命科学公司)是一个基于动脉压力波形分析技术的微创心排量测定系统,可以连续的计算心排量。除了心排量(心指数),FloTrac/Vigileo系统还可以监测每搏变异量。如果提供中心静脉压数据,则可以计算全身血管阻力及其指数。利用仪器特别设计的中心静脉导管(Precep),可以持续监测中心静脉血氧饱和度。这个设备已由美国食品及药物管理局(FDA)批准应用于成人,目前有大量的文献描述了该设备应用于多种重症疾病的临床治疗中。本文为这一新技术作一综述以及讨论它的临床应用和局限性。