MALDI-TOF-MS对寡核苷酸的序列分析

通过对几种基质测定含不同碱基的寡核苷酸的灵敏度及精确度的比较,发现用混合基质α－氰基４－羟基肉桂酸（α－Ｃｙａｎｏ）／３－羟基吡啶羧酸（３ＨＰＡ）用于基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱中测定脱氧寡核苷酸,不仅能得到较好的分子离子峰,而且一些金属离子的加合物峰能得到有效的抑制,提高了测定的灵敏度。用３′－和５′－外切酶对脱氧寡核苷酸１２－ｍｅｒ（５′－ＡＴＧＣＡＴＡＴＧＣＡＴ－３′）进行部分降解,再进行ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ－ＭＳ分析,得到了完整的寡核苷酸的序列。     

碎片结构分析在MALDI—TOF—MS法测定多肽序列中的 …

采用基质辅助的激光解吸电离习行时间质谱法碎片结构分析（ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ＴＯＦＭＳ,ＦＡＳＴ）技术,对多肽样品血管紧张肽Ⅱ（ａｎｇｉｏｔｅｎｓｉｎⅡ）和促肾上腺皮质激素（ａｄｒｎｏｃｏｒｔｉｃｏｔｒｏｐｉｃ ｈｏｒｍｏｎｅ,ＡＣＴＨ）１８￣３９肽段进行了测序研究。根据ＦＡＳＴ谱图中典型碎片离子峰的质谱数据,分析得到了多分子的主要氨基酸组成以     

MALDI TOF MS在细菌检测和鉴定中的应用

近年来质谱技术有了快速的发展,新的软电离技术,基质辅助激光解析电离和电喷雾电离使得质谱能够对核酸或蛋白质,多肽等生物大分子进行微量分析,且具有高灵敏度和高质量检测范围,通过串联质谱的分析还可以得到结构信息。MALDI TOF MS能给出微生物多方面的信息,包括分子量和结构信息等,用于微生物的各种研究中,如根据细菌的组成成分获得指纹图谱检测和鉴定细菌,细菌体内含有大量的生物标志分子能用于细菌的化学分类和鉴定。     

双向凝胶电泳银染蛋白质点的肽质谱指纹图分析

对双向凝胶电泳后银染显色的蛋白质点经脱色与原位还原和烷基化处理后,用ＴＰＣＫ胰蛋白酶进行酶解,采用带有Ｃ１８反相载体的ＺｉｐＴｉｐ＾ＴＭ吸头进行脱盐处理,再进行ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ肽质谱指纹纹图分析,然后将肽质数据在ＥＭＢＬ数据库中进行搜寻从而对蛋白南点进行鉴定。结果表明用该实验程序可对银染的单一蛋白南点进行快速肽质谱指纹图ｉｐＴｉｐ＾ＴＭ的应用可以明显增加质谱分析的信噪比,提高分析灵敏度。用以上方     

SELDI—TOF—MS蛋白芯片技术及在筛选肿瘤标记物中的进展

本文介绍了用SELDI—TOF-MS蛋白芯片技术及其在筛选肿瘤标记物中的研究进展。该技术将蛋白质分离技术与质谱技术相结合用于检测蛋白质,其优点是便捷、高通量、高灵敏度及分析简单快捷,在筛选肿瘤标记物方面、肿瘤早期诊断和生物工程、工程制药等方面的研究具有广阔的应用前景。     

家蚕抗BmNPV品系与感性品系血淋巴液蛋白质组的差异分析

利用遗传学的原理, 通过杂交和回交的方法, 建立家蚕抗BmNPV、感BmNPV以及近等基因系模型, 利用2-D电泳和MALDI TOF/TOF MS质谱技术, 从蛋白质组水平上研究家蚕对BmNPV抵抗性。其结果是获得家蚕高抗NB, 高感306, 近等基因系BC8五龄起蚕血淋巴液蛋白质差异表达谱, 分别获得180、190、187个蛋白点, 其中80%的蛋白点集中在等电点5~9范围之内。从三块凝胶上共获得明显差异蛋白点12个, 由质谱鉴定出5种蛋白, 其中氨基酰化酶(Aminoacylase)仅出现在抗性品系NB、近等基因系图谱中, 感性品系没有出现, 初步推测是家蚕抗BmNPV特有蛋白, 这是首次报道结果。     

家蚕抗BmNPV品系与感性品系血淋巴液蛋白质组的差异分析

利用遗传学的原理, 通过杂交和回交的方法, 建立家蚕抗BmNPV、感BmNPV以及近等基因系模型, 利用2-D电泳和MALDI TOF/TOF MS质谱技术, 从蛋白质组水平上研究家蚕对BmNPV抵抗性。其结果是获得家蚕高抗NB, 高感306, 近等基因系BC8五龄起蚕血淋巴液蛋白质差异表达谱, 分别获得180、190、187个蛋白点, 其中80%的蛋白点集中在等电点5~9范围之内。从三块凝胶上共获得明显差异蛋白点12个, 由质谱鉴定出5种蛋白, 其中氨基酰化酶(Aminoacylase)仅出现在抗性品系NB、近等基因系图谱中, 感性品系没有出现, 初步推测是家蚕抗BmNPV特有蛋白, 这是首次报道结果。     

绵羊线粒体DNA控制区5‘端序列PCR—SSCP与序列分析

通过绵羊线粒体DNA控制区功能域（5‘端序列）PCR－SSCP和序列分析,发现小尾羊、乌珠穆沁羊、湖羊、萨福克羊和夏洛来羊以及多赛特公羊与尾寒羊杂交家系共202只绵羊可归纳为两种类型,突变型和野生型,提示现代绵羊品种在起源上存在两种主要的进化途径。     

亚麻中雄性不育基因同源序列MS2-F的克隆和表达分析

用同源序列克隆法从亚麻中克隆了雄性不育基因同源序列MS2-F cDNA(登陆号:EU363493).该cDNA全长1 91lbp,包含一个1 608 bp的ORF,编码535个氨基酸.推导的蛋白质序列中包含2个雄性不育保守区:NAD结合区域和雄性不育C-末端区域.该基因与油菜和拟南芥雄性不育基因的一致性分别为59.65%和59.16%,为花蕾特异表达基因,推测在亚麻花粉发育过程中与脂酰辅酶A还原酶有相似功能.MS2-F cDNA对应的gDNA大小为2 696 bp(登陆号:EU365361),含有8个内含子和9个外显子.     

IL—1预刺激对反义IRAK—1寡核苷酸抑制NF—kB活化的影响

实验分为白介素１（ＩＬ－１）预处理组和非预处理组,脂质体介异反义ＩＬ－１受体相关激酶－１（ＩＲＡＫ－１）寡核苷酸（ＯＤＮ）转染ＨｅｐＧ２细胞,用ｗｅｓｔｅｒｎ杂交分析ＩＲＡＫ－１表达水平,以夹心酶联免疫吸附测定法测定ＮＦ－ｋＢ含量。结果表明,ＩＬ－１非预处理组反义ＩＲＡＫ－１ＯＤＮ不能抑制ＩＲＡＫ－１表达和ＮＦ－ｋＢ活化,而预处理组ＩＲＡＫ－１表达和ＮＦ－ｋＢ活化受到明显抑制,反义ＩＲＡＫ－１ＯＤ     

合子草种子无机元素及脂肪油GC—MS联用分析

本文采用ICP法测定了合子草种子中无机元素含量,共检出20种元素,其中以K元素含量最高为12336．68（ug/g),采用GS－MS联用仪首次分析了合子草种子中脂肪油的组成,共分离鉴定出11种化合物,它们是癸烷,莰醇,月桂酸,肉豆蔻酸,十五烷酸,7－十六（碳）烯酸,软脂酸,十八酸二烯酸,反油酸,硬脂酸及花生酸,其中以不饱和脂肪酸含量最高。为合子草种子资源开发利用提供了实验资料。     

矛尾鱼Hoxa—11基因克隆及5′端序列分析

Hoxa-11基因调节鱼类鳍和四足动物肢的发育,在脊椎动物进化过程中起着重要的作用,利用人和鼠的Hoxa-11基因保守序列设计了两个兼并引物,通过PCR扩增到了矛尾鱼的Hoxa-11基因,经克隆和DNA序列分析,该片段为2065bp,包括绝大部分外显子Ⅰ,内含子和部分外显子Ⅱ,编码204个氨基酸,其氨基酸序列与人、鼠、鸡、蛙和斑马鱼的同源性分别为66.0%、67.6%、74.4%、72.8%和59.7%。外显子Ⅰ的长度从矛尾鱼到蛙、鸡、鼠和人呈现逐步上升趋势,人比矛尾鱼增长了16%,进一步分析,外显子Ⅰ可分为4个区域;两个高度保守区域,1个中度保守区域和1个可变区域,外显子Ⅰ的长度变化主要是由于可变区域内丙氨酸同聚物以及两侧富含甘氨酸和丝氨酸序列的累积。矛尾鱼只有1个由两个丙氨酸组成的同类物,蛙有1个由5个连续丙氨酸组成的同聚物,而鸡、鼠和人有3个丙氨酸同聚物,其中最大的同聚物由7个连续丙氨酸组成,而且在同聚物两侧出现了富含甘氨酸和丝氨酸序列。这表明可变区域可能与脊椎动物进化和鳍-肢转换过程中新功能的获得有关。同源异型盒所在的外显子Ⅱ区和剪接位点是高度保守的。内含子的长度变化较大,但在其内部也发现了两个高度保守的35bp和16bp的DNA片段,这两个片段在人、鼠、鸡、蛙和矛尾鱼中是完全相同的,这些序列的高度保守性提示其功能上的重要性。     

反基因技术中识别多聚嘌呤靶序列嘧啶断点的寡核苷酸

识别CG断点的寡核苷酸包括T^*CG配对的顺向嘧啶（TC）和T^*CG配对的反向嘌呤（G、GA、GT）寡核苷酸,其中以T^*CG配对的反向GT寡核苷酸亲和性最高。识别TA断点的寡核苷酸包括G^*TA配对的顺向嘧啶（TC、TG）和C^*TA配对的反向嘌呤（GA、GT）寡核苷酸,其中以C^*TA配对的反向GA寡核苷酸亲和性最高。识别CG和TA断点的同时存在的寡核苷酸包括T^*CG和G^*TA配对的反向GA和T^*CG和T^*TA配对的反向GT寡核苷酸,以T^*CCG和G^*TA配对反向GA寡核苷酸亲活性较高。     

枯草杆菌启动子—信号肽序列的克隆及序列分析

利用含红霉素抗生基因和缺启动子－信号肽序列的氨苄青霉素抗性基因的双功能质粒ｐＧＰＢ１４为探针载体,克隆了枯草杆菌的启动子－信号肽序列并对克隆的片段进行序列分析。枯草杆菌染色体ＤＮＡ经Ｓａｕ３Ａ酶解后与ＢａｎＨＩ酶切的质粒ｐＧＰＢ１４连接,转化大肠杆菌Ｃ６００,筛选抗氨苄青霉素及抗红霉素的转化子,从双抗性转化子中提取重组质粒并经酶切分析,显示克隆的ＤＮＡ片段在０．２７－１．５ｋｂ之间。用Ｓａｎｇｅｒ     

蛋白质组研究中肽质量指纹谱鉴定方法的建立及应用

建立了用肽质量指纹谱和数据库检索方法鉴定凝胶电泳分离蛋白南的方法。用标准蛋白质对胶上蛋白５质原位酶切制备肽谱的方法进行了讨论。分析了实际细胞蛋白质样品,获得双向电泳分离的人肺癌细胞蛋白质谱中三个蛋白质点的肽指纹谱。并通过数据７库检索分别鉴定为甘油醛－３－磷酸脱氢酶－２,测在蛋白羟基末端水解同工酶和丙糖磷酸异构酶。     

鲜姜化学成分的GC—MS分析

本文采用鲜姜榨汁-过滤的方法提取鲜姜内成分。然后对其化学成分进行GC／MS分析。从鲜姜汁中分离确定了33中成分,其中萜类物质相对含量较高。