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相似文献
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1.
人基因组YAC克隆DNA的Alu—PCR反应条件的系统研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
在人基因组YAC克隆的Alu-PCR指纹分析中要求DNA扩增带具有YAC特征性;在Alu-PCR方法对YAC克隆中的人类基因组DNA片段进行特异的同位素标记时则要求被增标记的DNA序列在插入片段中具有一定弥散性,我们建立了两种不同的Alu-PCR反应体系以满足这一不同要求,并已得到较为满意的结果,根据不同条件下的Alu-PCR结果,分析了多引发位点PCR中的一些现象,并作了解释。  相似文献   

2.
人基因组YAC克隆DNA的Alu-PCR反应条件的系统研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
在人基因组YAC克隆的Alu-PCR指纹分析中要求DNA且扩增带具有YAC特征性;在用AlU-PCR方法对YAC克隆中的人类基因组DNA片段进行特异的同位素标记时则要求被扩增标记的DNA序列在插入片段中具有一定的弥散性。我们建立了两种不同的Alu-PCR反应体系以满足这一不同要求,并已得到较为满意的结果。根据不同条件下的Alu-PCR结果,分析了多引发位点PCR中的一些现象,并作出了解释。  相似文献   

3.
潘幸来 Smil.  DB 《遗传学报》1998,25(3):252-258
16个品种(系)的高分子量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)的等位基因频率分别为Glu-Ala(80%),Glu-Alc(12%),Glu-Alb(8%);Glu-B1b(63%)Glu-Blc(31%)Glu-Ble(6%)Glu-Dla(38%),Glu-Dld(50%)Glu-Dlc(12%),16个品种(系)的低分子量麦谷蛋白亚基(LMW-GS)的等位基因频率分别为:Glu-A3a(38%),G  相似文献   

4.
大豆重复序列的克隆,特性分析及在染色体上的定位   总被引:1,自引:0,他引:1  
惠东威  刘凤华 《遗传学报》1995,22(6):455-462
从大豆栽培品种Union(G.max)基因组pUC18质粒文库中,以基因组DNA为探针,筛选出一个重复序列家族。序列分析表明,此重复序列的重复单位为91bp,拷贝数约为10 ̄5,其序列约占基因组DNA的0.9%。基因组DNA不同限制酶片段Southern杂交分析和染色体原位杂交分析表明此重复序列主要以串联方式集中分布在M2和M11号染色体的臂上,而另外一些则散布于整个M12和Sm7号染色体上。以该序列为探针片大豆属不同亚属13个种的18个品系的Southern杂交结果表明,此重复序列为Soja亚属所特有。这一Soia亚属特异重复序列的发现,从另一个角度支持应把Soja亚属的3个种G.soja、G.gracillis、G.max划分为一个种的观点。  相似文献   

5.
秘晓林  吴淑华 《病毒学报》1999,15(3):212-216
利用带有氯霉素乙酰转移酶报道基因的检测载体,从痘苗病毒基因组DNA中筛选到一个增强子样片段。序列分析表明,该片段长283bp,是痘苗病毒DNA依赖性RNA聚合物的一部分,具有两段24bp长的重复序列。采用带有β-半乳糖甘酶报道基因的载体检测发现,该片段正向可以使报道基因表达增强10.9倍,反向可以增强3.8倍。  相似文献   

6.
根据已发表的序列,分别在鸡贫血病毒(CAV)环形基因组DNA(全长2.3kb)的EcoRI位点和BamHI位点的两侧选择适当序列合成两对引物,用PCR技术,从斑点杂交检测到病毒核酸的CAV感染的MDCCRP1细胞基因组DNA中,分别扩增出包含EcoRI和BamHI分割开的病毒基因组两部分(1.5kb和0.8kb)约1.5kb和约1.25kb的两个片段。再将其中相应序列拼接克隆进pUC18载体,获得包含CAV全基因组序列DNA片段的克隆质粒pCAV2.4。酶切分析表明,该质粒具有预期的BamHI位点、PstI位点、HindⅢ位点,而预期的EcoRI位点消失。重组质粒插入DNA片段的两端序列分析表明,质粒pCAV2.4是包含CAV全基因组序列的重组质粒,插入DNA片段序列中的EcoRI位点序列发生了一个碱基突变。  相似文献   

7.
E和St基因组特异RAPD片段在部分小麦族植物中的分布   总被引:14,自引:2,他引:12  
张学勇  董玉琛 《遗传学报》1998,25(2):131-141
两个E基因组(包括Ee和Eb)特异RAPD片段和两个St基因组特异RAPD片段的序列分析表明,4个片段均为新的DNA克隆片段。染色体原位杂交显示OPD12444为区域化连续高度重复序列,而OPF031296(Eb特异)、OPB08525(St特异)、OPN01817(St特异)为弥散性高度重复序列。研究还显示:大部分DNA高度重复序列在亲缘关系较近的小麦族植物基因组间是共享的,差异可能主要是在重复次数及片段长度上,而能否用RAPD技术扩增主要决定于某一基因组的这些重复序列中有无与特定引物相匹配的区域。文中就这些重复序列在小麦远缘杂交后代外源遗传物质检测、多倍体物种染色体组组成研究中的潜在价值进行了讨论。  相似文献   

8.
茶尺蠖核型多角体病毒(EoSNPV)基因组的polh和egt基因区约14.2kb的酶切图谱被构建.egt基因位于polh基因上游约4.8kb处,但转录方向与polh基因相反.EcoRⅤ-L片段polh基因及其旁侧的1125核苷酸序列被测定.polh基因编码区长738核苷酸,可编码246氨基酸的多肽.起始密码子ATG上游是一个富含AT(AT占71.2%)的启动子区,在-52核苷酸处有杆状病毒晚期基因启动子转录起始基序ATAAG.在终止密码子下游208核苷酸有一个poly(A)信号,AATAAA.但EoSNPVpolh基因起始密码子ATG相邻核苷酸序列为GTAATGT,其-3是个G,这与已知的16种其它杆状病毒polh基因-3位置均是A不相同.在分析了EoSNPV和HaSNPV多角体蛋白基因核苷酸序列的基础上,通过MALIGN程序,比较了目前已发表的26种杆状病毒包涵体蛋白的序列,EoSNPV与黄杉毒蛾核型多角体病毒(OpSNPV)的同源性为最高,核苷酸序列的同源性为83.0%,氨基酸序列达94.7%;与其它20种鳞翅目NPV的同源性也很高,核苷酸序列同源性为72.6%~81.9%,氨基酸序列为83.7%~93  相似文献   

9.
从籼稻(OryzasativaL.spp.indica)“窄叶青”中克隆到了1个重复序列(pOs139)。经分子杂交证明,pOs139为一稻属内AA基因组特异的串联重复序列。序列分析表明,pOs139以355bp为一重复单位。以pOs139为探针对29份中国普通野生稻和43份中国栽培稻的基因组DNA进行的分子杂交表明,籼、粳亚种之间具有明显的差异,籼稻杂交带数明显多于粳稻,普通野生稻与籼稻相似,具有较多的杂交带数。拷贝数测定结果表明,pOs139在普通野生稻和籼稻中丰度均较高,在粳稻中丰度较低。结合pOs139的Southern杂交结果和以前的RAPD结果,认为籼稻和粳稻共同起源于普通野生稻。  相似文献   

10.
中国河南株丁型肝炎病毒全基因组的cDNA克隆和序列分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
从我国河南-抗丁型肝炎病毒抗原(anti-HDAg)及丁型肝炎病毒(HDv)RNA双阳性的HBsAg携带者血清中提取RNA,采用人工合成的引物进行逆转录和聚合酶链反应(PCR),获得了贯穿HDV全基因组的6个相互重叠的cDNA片段。经双脱氧末端终止法进行核苷酸序列分析,得到了长度为1674bp的我国人河南株HDVcDNA全序列。计算机分析表明,该株与我国台湾株(HDVIA型)、美国-1株(HDVIB型)、日本-1株(HDVⅡ型)和秘鲁-1株(HDVⅢ型)的核苷酸同源性分别为的94.3%、86.8%、75.4%和66.3%,氨基酸序列的同源性分别为89.7%、85.1%、71.9%和64.6%,并在核苷酸和推导的HDAg氨基酸序列中分别发现了5个和2个集中保守的区域。这些区域均与HDV的某些重要功能密切相关。  相似文献   

11.
水稻Xa21基因在水稻和玉米中的比较物理定位   总被引:6,自引:0,他引:6  
比较基因组分析证明,禾本科不同种基因组间存在广泛的同线性和共线性。对水稻(OryzasativaL.)这一模式植物与其它禾本科植物基因的原位杂交比较定位可以揭示禾本科植物基因组结构的共同特点和进化规律。利用含Xa21基因的pB822作探针筛选水稻的细菌人工染色体(BAC)文库,建立了一个包含3个BAC克隆的重叠群。用生物素标记其中一个BAC克隆,对水稻“广陆矮4号”和玉米自交系黄早四进行了染色体荧光原位杂交。同时,用pB822也作了原位杂交检测。在水稻第11染色体长臂中间检出了杂交信号,信号与着丝粒的百分距离约为24。在玉米的第1、3和第8染色体长臂观察到杂交信号,表明玉米基因组中具有三个Xa21的同源序列座位。BACFISH的信号检出率达在40%以上,大大高于质粒探针pB822的检出率(15%),而且可在同源染色体和姊妹染色单体上同时检出杂交信号的比例较高,证明了利用BAC克隆荧光原位杂交进行比较物理定位的可行性和优越性。在BACFISH中必须用相应基因组的CotⅠDNA封阻,以排除重复序列的干扰。  相似文献   

12.
水稻重复DNA顺序克隆pRRD3的研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
用DNA复性动力学方法克隆到一个水稻(OryzasativaL.)中度重复DNA顺序。不同限制性内切酶消化和Southern杂交分析显示,这段重复DNA顺序以串联加散布的形式存在于水稻基因组中;序列分析表明在它内部含有一个典型的植物启动子序列TGTATAAATA;以pRRD3克隆片段作探针,对水稻34个品种进行拷贝数测定,在野生稻与栽培稻、籼稻与粳稻之间均存在拷贝数上的明显差异;对AA基因组不同亚型水稻DNA进行Southern杂交分析,得到基因组亚型特异的杂交带谱,说明该重复顺序是研究水稻进化和分类的一个有用探针。  相似文献   

13.
普通小麦三个基因组之间的遗传关系及原位杂交分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
以普通小麦(Triticum aestivumL.)的3个可能的二倍体供体种(乌拉尔图小麦(T.urartuThum.)拟斯卑尔脱山羊草(AegilopsspeltoidesTausch)和粗山羊草(Ae.tauschiiCoss.)的基因组DNA为研究对象,通过它们之间的相互杂交,比较杂交强度以及泳道中带纹的不同,并结合部分DNA重复序列在基因组间含量差异的数据,得出结论:A^u和D基因组的关系  相似文献   

14.
短散在元件(SINE)广布于真核生物,是基因组中的可转移成分,长约100~500bp,拷贝数可达数百至数十万以上,根据序列变异和鉴别位点常可分为若干家族和亚家族,对基因组的复杂化、基因的钝化、新基因的产生、尤其是基因表达的调控都具有重要意义。除了灵长类Alu和小鼠B1家族等少数来源的于7SL RNA,大多为tRNA的衍生物,由tRNA同源区、tRNA无关区和富含AT区等组成。在tRNA同源区含有R  相似文献   

15.
高等植物DNA重复序列的主要类型和特点   总被引:8,自引:2,他引:6  
高等植物核基因组的一个显著特征是其内含有大量的DNA重复序列,因此它们在核基因组结构和功能研究中居于举足轻重的地位。一些DNA重复序列已日趋广泛地作为分子民用于构建遗传图谱、鉴别品种、研究进化和分离目标基因等。主要介绍高等植物几类重要DNA重复序列,如卫星DNA、微卫星DNA、核糖体RNA基因、端粒重复序列和转座子等的若干特点和用途。  相似文献   

16.
柔嫩艾美尔球虫EST序列中SSR的获取及分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
对柔嫩艾美尔球虫EST—SSR进行生物信息学分析,共获取Eimeria tenella EST序列34074条,总长度为16.45Mb,小于12bpSSR的ESTs达7651条,从中获得SSR序列19576条、总长度为0.35Mb,EST—SSRs的频率是48.00%,平均相隔S40bp出现一个长度不小于12bp的SSR。在E.tenella的核苷酸重复基元中,2、3、4、5、6和7bp重复序列在基因组中出现的种类分别有11种472条、49种14710条、31种525条、13种25条、21种43条和15种400条,3碱基重复序列是最丰富的重复单元,占总数的75.14%。各种SSRs中富含G、C碱基的重复单元以GCA出现频率最多(28.63%),次为AGC(17.59%),GCT(8.76%),TGC(7.62%),CTG(7.15%)。  相似文献   

17.
卫星、小卫星和微卫星DNA——真核生物基因组的串状重复序列姜运良(山东农业大学动物科技学院,山东泰安271018)关键词卫星小卫星微卫星串状重复序列真核生物基因组中编码蛋白质(酶)的结构基因只占很少的一部分(10%~20%),其余大部分是重复序列。根...  相似文献   

18.
从籼稻“窄叶青”中克隆到了1个重复序列(pOs139)。经分子杂交证明,pOs139为一稻属内AA基因组特异的串联重复序列。序列分析表明,pOs139以355bp为一重复单位。以pOs139为探针对29份中国普通野生稻和43份中国栽培稻的基因组DNA进行的分子杂交表现,籼、粳亚种之间具有明显的差异,籼稻杂交带数明显多于粳稻,普通野生稻与籼稻相似,具有较多的杂交带数。拷贝数测定结果表明,pOs139  相似文献   

19.
从织锦芋螺中克隆α芋螺毒素序列   总被引:13,自引:0,他引:13  
为了从我国南海产织锦芋螺(Conustextile)中分离新的毒素序列并研究其应用价值,进行了织锦芋螺毒素基因的分离工作.从织锦芋螺毒管中提取mRNA,以A族芋螺毒素的信号肽编码部分和3′端非翻译部分的保守序列为引物,通过RT-PCR扩增和序列分析方法获得新的芋螺毒素序列.结果得到两种不同的α芋螺毒素序列,两者都属于α4/7亚型芋螺毒素,预测其成熟肽序列分别为Pro-Glu-Cys-Cys-Ser-Asp-Pro-Arg-Cys-Asn-Ser-Ser-His-Pro-Glu-Leu-Cys-Gly(C端Gly可能被酰胺化)和Pro-Glu-Cys-Cys-Ser-His-Pro-Ala-Cys-Asn-Val-Asp-His-Pro-Glu-Ile-Cys-Arg.采用传统的生化分离手段尚未从织锦芋螺中获得过α芋螺毒素序列,这两种α芋螺毒素作用的种属特异性、受体类型特异性和在小细胞肺癌的诊断和治疗中的应用价值有待进一步研究  相似文献   

20.
扬子鳄与密河鳄基因组DNA的复性动力学和组织结构的研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
通过DNA复性动力学的分析,测定了扬子鳄和密河鳄基因组的组织结构,两者的复性曲线非常相象,高度重复DNA含量很少,而中度重复DNA序列各占基因组的30%左右。中度重复序列部分能再分成三个组分,虽然每个组分的序列复杂性和拷贝数有差别,但每部分的总复杂性是相似的。我们已测得扬子鳄基因组的单拷贝序列为3.68×10’bp,基因组为5.65×10’bp;密河鳄基因组的单拷贝序列为3.67×10’bp,基因组为5.24×10’bp。根据基因组的组织结构的分析,在分子水平上表明两种鳄鱼是亲缘关系十分相近的种。  相似文献   

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