反基因策略：基因治疗的新方向

合成的富含嘌呤或嘧啶的脱氧寡核苷酸可与双链ＤＮＡ内特定的同聚嘌呤、同聚嘧啶序列结合形成稳定的三螺旋结构（三链ＤＮＡ）。已在体外及体内证实了在靶基因内形成的局部三链ＤＮＡ可抑制其转录,这给肿瘤和病毒感染性疾病的治疗提示了新的方向,人们称之为反基因策略。然而,三链ＤＮＡ的稳定性不够理想和靶序列的选择范围较窄等问题的存在,在一定程度上限制了反基因策略的应用。     

基因治疗新前沿：反基因技术

反基因技术是以脱氧寡聚核苷酸与双链ＤＮＡ分子序餐特异性结合形成三链ＤＮＡ,从而在转录水平上调控基因的一种基因治疗策略。     

分子间三链DNA的应用

自Ｄｅｒｖａｎ等１９８７年首先证实三链ＤＮＡ的形成可介导对靶ＤＮＡ的特异切割以来,有关三链ＤＮＡ的研究进展和奶快。本综述了近几年分子间三链ＤＮＡ在基因表达调控、染色体作图、基因分离及定点诱变等方面的应用,并对三链ＤＮＡ应用中存在的几个问题及相应的解决方法作了简单介绍。     

三链DNA的形成抑制转录因子与乙肝病毒核衣壳启动子的结合

合成的寡核苷酸可缠绕于DNA双螺旋大沟内并以氢键与其相互作用形成三链DNA结构,这类寡核苷酸常简称为TFO(triplex-form-ing oligonucleotide)。通过TFO与靶基因结合形成局部的三链结构来抑制基因转录的技术被称为反基因策略(antigene strategy)。我们选择乙肝病毒(HBV)核衣壳启动子(Cp)内一近似同聚嘌呤·同聚嘧啶序列(1734～1754,ayw亚型,以EcoR Ⅰ切点为 1)为靶序列,以嘌呤     

生命科学 1994年度 第六卷 著者索引

生命科学　１９９４年度　第六卷　著者索引安德荣植物病毒化学防治的研究现状和所胡企铨激光技术在生命科学研究中的应用３：２４面临的问题２：１５胡适宜ＲＦＬＰ技术在植物细胞质遗传研究敖世洲真核基因组结构与功能调控３：５中的应用２：９白春礼三链ＤＮＡ与反基因...     

“三链DNA结构模型和能力学的理论生物学研究”获云南省科学技术一等奖

中国科学院昆明动物研究所刘次全研究员等 ,在中国科学院化学研究所ＳＴＭ实验室首次观察到变性条件下λ噬菌体ＤＮＡ三链辫状结构的直观形貌 ;在此基础上 ,参照ＴＡＴ三碱基体的有关结构参数 ,分别在Ｍ - 2 40 0计算机和ＳＧＩ系统的4Ｄ/ 80ｓ、 4Ｄ/ 2 0Ｇ和ＳＧＩＩｎｄｉｇｏＲ40 0 0上成功的构建了国内外第一个三链辫状结构模型 ;进而就三碱基体模型和能力学 ,ＤＮＡ三链结构模型和能力学 ,以及三链ＤＮＡ碱基配对相互作用三链和三链辫状ＤＮＡ构象比较方面 ,进行了系统的定量和半定量的理论生物学研究。在取得较大进展的基础上 ,又对…     

三链形成寡聚核苷酸的反基因作用机制

1957年Ｆｅｌｓｅｎｆｅｌｄ等发现一条ＰｏｌｙＡ链能跟两条ＰｏｌｙＵ链形成三螺旋 ,这是三链形成寡聚核苷酸 (ｔｒｉｐｌｅ ｆｏｒｍｉｎｇｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ,ＴＦＯ)研究的开始[1] 。随着ＤＮＡ合成技术的进展 ,人们能合成各种序列的寡聚核苷酸。1 987年ＬｅＤｏａｎ等[2 ] 发现聚嘌呤或聚嘧啶寡聚核苷酸能序列特异地结合于同聚嘌呤 /同聚嘧啶ＤＮＡ双链的大沟内 ,识别的机制包括形成Ｈｏｏｇｓｔｅｅｎ和反Ｈｏｏｇｓｔｅｅｎ氢键。现在常用的包括含 (Ｇ、Ａ) ,含 (Ｇ、Ｔ)或含 (Ｃ、Ｔ)的 3种ＴＦＯ以及它们的类似物。…     

四链DNA(loopG4)螺旋结构的计算机模拟

对包含连续鸟嘌呤的寡核苷酸所形成两种反平行四链ＤＮＡ（统称ｌｏｏｐＧ４）的螺旋体部分进行了计算机模拟,给出了各种结构参数,发现ｌｏｏｐＧ４中的磷酸基团呈疏密相间的分布,导致与其抗衡的Ｋ＋亦呈疏密相间的分布。与先前做的平行四链ＤＮＡ相比较,平行Ｇ４的构象能最低,二沟Ｇ４和三沟Ｇ４次之。ｌｏｏｐＧ４中Ｇ四聚体的两种不同堆积方式以背对背的堆积能为低,为实验结果提供了理论支持。还探讨了能量优化过程中Ｇ４－ＤＮＡ的构象变化趋势,提示了金属离子的不同类型或不同浓度可能会导致Ｇ４－ＤＮＡ构象的改变     

三螺旋结构寡核苷酸对特定基因抑制作用的研究进展

三股螺旋结构寡核苷酸９ＴＦＯ）能直接与目标双链ＤＮＡ连接,可阻止ＤＮＡ的延伸、抑制转录因子与基因连结,在ＤＮＡ水平干扰基因表达,ＴＦＯ可分为嘧啶型和嘌呤型两大类,其与目标基因双链形成的三聚体复合物的稳定性受多种理化因素的影响,序列的化学修饰以及“拉链”寡核苷酸和多聚赖氨酸衍生物的协同作用能明显增加ＴＦＯ与目标基因的连接及复合物的稳定,增强对目标基因的抑制作用。     

人IgG Fc基因克隆及人源抗HBsAg全分子抗体在CHO …

利用ｍＲＮＡ提取试直接从健康人外周血白细胞中提取ｍＲＮＡ,逆转寻为 ｃＤＮＡ,合成引物扩增人抗体分子ＩｇＧＩ亚型Ｆｃ基因,克隆到ｐＧＥＭ－Ｔ－Ｖｅｃｔｏｒ中并测序。合成引物扩增人抗体分子轻,重链信号肽序列,分别克隆并测序将轻链信号肽和轻链（ｋａｐｐａ）ＶＬ－ＣＬ基因进行重组形成轻链全分子基因,再将其克隆到哺乳细胞表达载全ｐｃＤＮＡ３．１中。将重链信号肽、重链（ｇａｍｍａ）ＶＨ－ＣＨ１和Ｆｃ基因进行     

基因药物的前沿技术

基因药物的直接体内基因治疗发展迅速,新型基因药物不断产生。本文讨论了效果比较肯定的基因疫苗、反义ＲＮＡ药物、三链ＤＮＡ药物这三种新型基因药物技术的基本方法。分析了它们各自存在的优点和问题,并介绍了它们的应用范围及应用研究进展。     

国内信息

ＤＥＧＣＭ技术中的ＲＤＡ、ＳＳＨ和ＲＳＤＤ差异表达基因分离技术 (ＤＥＧＣＭ )发展很快 ,主要是ＰＣＲ技术的发展和相应新技术的出现为ＤＥＧＣＭ注入了新的活力。ＰＣＲ引入差式筛选之中 ,可提高效力和降低假阳性率。若引入扣除杂交 ,可发展扣除扩增方案 ,并用特异引物结合于ＰＣＲ中选择扩增差异ｃＤＮＡ而形成代表性差式分析法 (ＲＤＡ)。采用抑制性ＰＣＲ选择性扩增差异基因片段 ,用ＤＮＡ链内“退火”优先于链间退火 ,使非目的序列产生“发夹”式互补结构 ,不能与引物配对 ,从而选择性抑制非目的基因片段的扩增 ,以此形成抑制性差…     

草鱼(Ctenopharyngodon idellus)线粒体DNA控制区及其两侧tRNA基因的克隆与结构分析

动物线粒体ＤＮＡ控制区是线粒体基因组复制与基因表达的最主要的调控区．采用杂交和测序的方法对草鱼线粒体ＤＮＡ控制区进行定位、克隆并测定了控制区及其旁侧的ｔＲＮＡＰｈｅ、ｒＲＮＡＰｒｏ和ｒＲＮＡＴｈｒ三个基因的序列,与多种脊椎动物的相应序列进行了比较,并进行了结构分析．草鱼线粒体控制区全长９２７ｂｐ,含有与酵母和爪蟾线粒体启动子相似的序列,其ＣＳＢⅠ、ＣＳＢⅡ和ＣＳＢⅢ序列与其他几种动物的ＣＳＢ比较相当保守,ＴＡＳ与其回文基序可形成稳定的茎环结构,成为Ｈ－链复制的终止信号．草鱼线粒体ｔＲＮＡＰｈｅ、ｔＲＮＡＰｒｏ和ｔＲＮＡＴｈｒ可折叠成三叶草形二级结构,其基因具有许多不同于细胞质ｔＲＮＡ基因的结构特点,可能反映了线粒体ｔＲＮＡ与线粒体核糖体具有不寻常的作用方式     

三链形成寡聚核苷酸的反基因作用机理

1957年Felsenfeld等发现一条Poly A链能跟两条Poly U链形成三螺旋,这是三链形成寡聚核苷酸(triple-forming oligonucleotide,TFO)研究的开始[1].随着DNA合成技术的进展,人们能合成各种序列的寡聚核苷酸.1987年Le Doan等[2]发现聚嘌呤或聚嘧啶寡聚核苷酸能序列特异的结合于同聚嘌呤/同聚嘧啶DNA双链的大沟内,识别的机制包括形成Hoogsteen和反Hoogsteen氢键.现在常用的包括含(G、A),含(G、T)或含(C、T)的3种TFO以及它们的类似物.人们根据TFO能序列特异的识别双螺旋DNA,从而可能影响基因的转录而发展出反基因战略.     

一种快速、简便、高效cDNA合成及克隆策略

以鱼呼肠孤病毒双链ＲＮＡ为模板,建立一种快速、简便、高效的ｃＤＮＡ合成及克隆策略。在一定量模板条件下,采用随机六聚体为引物合成ｃＤＮＡ第一链。以退火方式形成双链ｃＤＮＡ,直接通过琼脂糖凝胶电泳检测其ｃＤＮＡ合成产量。双链ｃＤＮＡ经两端补齐后,平头连接于具有阳性选择标记的载体中,以高效电转化的方式进行快速克隆。     

登革病毒感染性转录体技术

登革病毒 (Ｄｅｎｇｕｅｖｉｒｕｓ)属黄病毒科黄病毒属 ,基因组结构为单股正链ＲＮＡ ,全长约 1 0～ 1 1ｋｂ。登革病毒在复制过程中不形成ＤＮＡ中间体 ,因此要在基因水平研究其特征存在一定困难 ,因为突变、重组、克隆等分子生物学技术都是在ＤＮＡ水平上的操作。体外转录制备感染性ＲＮＡ(感染性转录体 )技术提供了解决这一难题的新途径[1]。该技术是把病毒ＲＮＡ逆转录成ｃＤＮＡ ,并置于ＲＮＡ聚合酶启动子的下游 ,在ＲＮＡ聚合酶的作用下体外转录出全长正链ＲＮＡ ,经转染易感细胞后复制出子代病毒颗粒。由于这种子代病毒来自ｃＤＮ…     

DNA结构的多态性

在生物体内ＤＮＡ不仅能形成多种右旋双螺构象,还能形成左旋双螺旋、三股螺旋和四联体螺构象。目前已证实或推测这睦不同形态的ＤＮＡ结构,都具有重要的生物学意义。对ＤＮＡ结构的进一步深入研究,将促进ＤＮＡ结构学说的发展。     

抗人CD3单抗重,轻链可变区基因的体外扩增,克隆和序列分析

根据免疫球蛋白重链和轻链可变区基因５＇端序列和Ｊ区序列,化学合成适合于体外扩增抗体重、轻链可变区基因的二对引物。从体外培养的ＯＫＴ３杂交瘤细胞中提取总ＲＮＡ,反转录生成ｃＤＮＡ,以ｃＤＮＡ为模板,分别加入合成的重、轻链可变区引物进行ＰＣＲ,扩增出抗体重、轻链可变区基因片段。将扩增产物分别插入ｐＵＣ１９质粒,筛选出阳性克隆,用链终止法进行ＤＮＡ序列测定。所测重链可变区基因全长３５７ｂｐ,编码１１９个     

杆状病毒DNA解旋酶

ＤＮＡ解旋酶 (ｈｅｌｉｃａｓｅ)是ＤＮＡ复制过程中一类重要的酶 ,负责打开ＤＮＡ双链 ,并参与新生链的合成 ,在ＤＮＡ修复和重组过程中都发挥着必不可少的作用。杆状病毒ＤＮＡ解旋酶除了参与ＤＮＡ复制外 ,对于晚期基因的转录、关闭宿主蛋白质合成及决定杆状病毒宿主域方面都有重要的作用。1.杆状病毒解旋酶的结构目前已有 5种杆状病毒的ＤＮＡ解旋酶基因得到克隆并测序 ,分别是苜蓿银纹夜蛾核多角体病毒(ＡｃＭＮＰＶ) ,黄杉毒蛾核多角体病毒 (ＯｐＭＮＰＶ) ,家蚕核多角体病毒 (ＢｍＮＰＶ) ,甜菜夜蛾核多角体病毒(ＳｅＭＮＰＶ)及粉…     

抗人CD3单抗重、轻链可变区基因的体外扩增、克隆和序列分析

根据免疫球蛋白重链和轻链可变区基因５’端序列和Ｊ区序列,化学合成适合于体外扩增抗体重、轻链可变区基因的二对引物。从体外培养的ＯＫＴ３杂交瘤细胞中提取总ＲＮＡ,反转录生成ｃＤＮＡ,以ｃＤＮＡ为模板,分别加入合成的重、轻链可变区引物进行ＰＣＲ,扩增出抗体重、轻链可变区基因片段。将扩增产物分别插入ｐＵＣ１９质粒,筛选出阳性克隆,用链终止法进行ＤＮＡ序列测定。所测重链可变区基因全长３５７ｂｐ,编码１１９个氨基酸,轻链可变区基因全长３２１ｂｐ,编码１０７个氨基酸。