中国兽类资源数据库管理信息系统的建立与应用

本文阐明了建立兽类资源管理系统的意义,然后详细介绍系统的设计目标、数据结构及系统软件的设计。介绍了标本、物种分布名录及文献库管理的功能,并对本系统创建及应用的物种、地名代码体系作了介绍。最后介绍了已经用此系统建立的昆明动物研究所兽类标本及中国兽类分布名录等基础数据库的概况。     

一个猕猴桃种质资源管理信息系统的初步建立

栽培植物的计算机管理已成为植物园管理的中心任务之一。我们根据中国科学院武汉植物园猕猴桃资源圃管理和国内外植物资源信息交流的需要,运用Ｖｉｓｕａｌ Ｂａｓｉｃ５．０编程语方及Ｍｉｃｒｏｓｏｆｔ Ａｃｃｅｓｓ９７数据库软件,初步建立了一个猃猴桃种质资源管理信息系统。本文简要介绍了该系统的结构、功能和使用特点。     

贵州省安顺市土地资源信息空间数据库的建立与应用

1　引　　言要制订不会危及环境的土地资源开发和保护计划 ,必须首先掌握可靠的、较新的有关土地资源的时空信息[3 ] .近年来 ,以ＧＩＳ和遥感技术为主的现代信息科学技术在土地覆盖/利用调查与填图[2 ,6] 、土地资源动态变化监测[13 ] 、土地质量退化与土壤侵蚀监测[5,8] 、土地资源评价[12 ] 与管理[10 ] 中得到了广泛应用 .这些技术可以较好地解决以往传统方法在获取、分析和处理大量、复杂土地信息中的众多限制 ,使我们得以动态地、综合地分析土地资源环境信息[4,7] .贵州省安顺市地处我国西南岩溶山区 ,生态环境脆弱 ,土地资源相对不足…     

根瘤菌资源数据库（RRDB）的建立

在总结我室多年对根瘤菌资源调查与分类研究的基础上,建立了根瘤菌资源数据库（ＲＲＤＢ）。此库依据根瘤菌研究特点而设计,包括：基本信息、采集信息、保藏信息、回接信息、参考文献、性状信息、菌株说明等七个子库。目前收录了来自国内２１个省或地区及国外部分研究单位提供的;并经全面性状分析与分类研究的２８６个菌株的信息,每个菌株设有寄主来源、固氮酶活性、碳源、氮源的利用等３２１个数据项。该库具有数据维护、查询检索、数据统计、输出打印等功能,引入并连接了聚类分析软件包－ＭＩＮＴＳ系统,可以满足当前研究的需要。     

NCBI的数据库资源及其应用

NCBI是美国的一个大型生物信息学系统,它主要通过NCBI网站为全世界的科学家服务,它拥有GenBank,RefSeq,UniGene,dbSNP等等多种大型生物学数据库,并且提供了多种数据库查询工具,如：Entrez,PubMed,LocusLink,TaxonomyBrowser等等,以及多种数据库分析资源,对于我们查询文献,人类基因组信息、基因表达、蛋白质结构、肿瘤遗传信息,以及不同种属遗传信息等等有非常大的帮助。是一个非常重要的生物医学资源。     

根瘤菌资源数据库的更新和应用

对原有根瘤菌资源数据库进行扩充和更新。在原有7类信息子库的基础上增添了DNA同源性、全细胞蛋白电泳、多位点酶电泳、16SrRNA基因序列和付里叶变换红外光谱等5个新信息子库;并增加了图象功能和更换了新工作平台,使之运行更加灵活、快速和简便。目前库内存贮了已研究过的700余株的有关信息。     

长白山野生经济植物数据库建立与应用研究

通过资源调查,实地拍摄,全面收集长白山野生经济植物的相关资料,用现代信息发展的数据管理技术,研究设计软件,组织构建整个检索系统,为研究长白山植物提供了第一手材料,对合理开发利用长白山资源,保护生态环境和植物物种基因起到了重要作用。     

中国微生物资源数据库(MRDC)

中国微生物资源数据库MRDC是以中国的微生物资源为数据源的大型综合数据库,包括目前已建成的微生物性状库、微生物产品市场信息库、微生物名称库、微生物名词库、国际交流用RKC代码库及一个微生物学数值分类软件包MINTS。     

长青自然保护区的兽类资源

对长青国家自然保护区的兽类资源进行了为期三年多的调查,结果表明保护区内已知兽类52种,隶属于7目23科46属,其中,国家I级保护动物5种,II级保护动物9种。     

广东内伶仃岛兽类资源与保护

经过１年多对内伶禁仃岛兽类资源和保护等方面的调查研究,结果表明,该岛有兽类１９种,隶属６目７科,其优势种有猕猴、穿山甲、普通伏翼、褐家鼠、小家鼠等。列为国家二级保护兽类有猕猴、穿山甲和水獭等３种。阐述了该岛兽类区系组成、特征和水獭种群的分布及保护,并提出了内伶仃岛兽类资源管理和保护建议。     

生物数据库建立与应用的研究

生物信息学是一门在生命科学的研究中计算机科学与生物学及应用数学等多学科相互交叉而形成的综合性学科。主要介绍了生物信息学数据库的分类和生物信息学数据库的特点及其应用,同时对生物信息学数据库的未来发展作了进一步的展望。     

mRNA研究的数据库资源

mRNA的功能除了指导蛋白质合成外,在其5′和3′端非翻译区包含的序列元件对基因表达和调控起着非常重要的作用,介绍了Transterm、UTR、ARED和TRSIG等研究mRNA结构和功能的数据库,并对其特点和使用作了介绍。     

四川栗子坪自然保护区的兽类区系与资源

2005年3~11月和2006年7~8月对四川栗子坪自然保护区的兽类区系和资源进行了调查,结合历史文献统计,表明保护区内共有兽类76种,隶属7目27科,其中,属国家Ⅰ级重点保护的兽类有5种,国家Ⅱ级重点保护的有12种,中国特产兽类19种。区系组成以东洋界种类为主(60种),占全区兽类种数的78.95%,古北界种类(11种)和广布型种类(5种)分别占14.47%和6.58%。     

野生经济植物资源数据库技术研究

本文对野生经济植物资源数据库技术的必要性、建库内容、技术路线、建库目标和系统维护进行了阐述。     

根瘤菌资源数据库的更新和应用*

对原有根瘤菌资源数据库进行扩充和更新。在原有7类信息子库的基础上增添了DNA同源性、全细胞蛋白电泳、多位点酶电泳、16SrRNA基因序列和付里叶变换红外光谱等5个新信息子库;并增加了图象功能和更换了新工作平台,使之运行更加灵活、快速和简便。目前库内存贮了已研究过的700余株的有关信息。     

四川喇叭河自然保护区的兽类资源

2002年7～9月对四川喇叭河自然保护区的兽类资源进行了初步调查,结果统计保护区共有兽类76种,隶属7目23科.保护区内有国家I级保护兽类5种,国家II级保护兽类16种.在76种兽类中,古北界种类14种,占18.4%;东洋界59种,占77.6%;3种为广布种,占4.0%.保护区兽类种类丰富,种群数量大.数量最多、分布最广的是牛羚、水鹿,其次有藏酋猴和金丝猴.兽类主要集中分布在保护索索棚一带.     

微生物酶数据库的发展与应用

可数据化是现代生命科学研究,尤其是合成生物学的一项关键特性。酶作为生命体内催化生化反应的关键分子,其数据化对推动生命科学的基础研究和实际应用都有重要意义。当下商品化的酶大都来源于微生物,建立微生物酶资源数据库不仅可以为酶的分类提供标准参考,还可以指导新型催化元件的挖掘、改造与从头设计。本综述对国际上已有的酶资源数据库建设与发展作了简要介绍,并对基于数据库的微生物酶资源利用作出展望。     

上海农作物种质资源数据库的设计和构建

随着农作物种质资源数量的不断增加,种质资源交流的日益频繁以及种质资源利用的逐步深入,农作物种质资源数据库的建设对农作物的应用研究和基础性研究至关重要。上海市农业生物基因中心借助于本中心保存的近21万份种质资源的信息,开发了一套上海农作物种质资源数据库,本文主要阐述了该数据库设计和构建的目的、原则和数据库的架构、运行环境以及主要功能模块。上海农作物种质资源数据库采用了B/S结构,平台系统利用多层逻辑架构实现了对农作物种质资源数据信息的收集、存储、查询、统计分析等功能。外部用户通过浏览器即可访问平台系统,浏览查询种质资源信息。内部管理员可使用平台的受限功能,需要认证成功后才可使用后台管理功能,实现对整个平台数据的管理。注册用户还可通过基因资源数据库提交引种申请,管理员结合管理信息系统实现对外供种全流程的网络化,借此可提高工作效率,增加工作流程的透明度。     

黄龙寺自然保护区兽类资源的初步调查

对黄龙寺自然保护区的兽类资源进行了初步调查和研究,报道兽类共635肿,分属6目23科,其中北方类型的兽类与南方类型的比例为38．1：53．97,保护区内有我国特产兽类30种,属国家重点保护动物19种,四川省缓重点保护动物5种,最后,还对区内兽类资源的保护提出了建议。     

宁夏野生食用植物资源的调查与信息数据库的建立

通过野外调查与室内工作相结合,对宁夏野生食用植物资源进行调查与统计,建立宁夏野生食用植物资源数据库,并提出了宁夏野生食用植物资源开发和利用存在的问题。结果初步调查到宁夏野生食用资源植物共计74科186属348种10类,其中饮料及野果类植物与野菜植物具有一定的开发潜力,应该在这些野生食用资源植物中进行进一步的筛选,最终主要集中于人工驯化与栽培上。此外针对宁夏野生食用植物资源开发和利用面临的问题,需加强对宁夏野生食用植物资源状况的调查,并进行深入的研究,在前面所做的基础研究上,筛选特色的野生食用资源植物进行合理的开发和利用,之后对筛选出的野生食用资源植物进行人工栽培等工作,在土地可持续利用的前提下,研究野生食用资源植物与其他栽培作物间作的模式,同时在发展过程中通过收集珍贵濒危野生植物资源植物的种质资源,而对其加以保护。