上海部分地区戊型肝炎病毒（HEV）基因型的分析

为了解戊型肝炎病毒 (HEV)在上海部分地区流行的基因型 ,采用RT nPCR的方法检验 35例急性散发性戊型肝炎患者中HEVRNA ,并对阳性产物进行克隆测序 ,然后对其基因型进行分析。结果显示在 35例急性散发性戊型肝炎患者中PCR阳性为 9例 ,测序证实 8例为HEV的基因序列 ;其中 1例为HEV 1型 ,7例为HEV 4型。提示在上海部分地区的急性散发性戊型肝炎中以HEV 4型感染为主     

南京地区戊型肝炎病毒基因型鉴定和变异分析

为了解南京地区戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)基因型的分布以及变异状况,本研究采用逆转录套式聚合酶反应(RT-nPCR)的方法检测南京地区40份急性散发性戊型肝炎患者的粪便标本,对PCR产物进行测序,利用生物信息学软件比较核苷酸的同源性、遗传距离,进行基因分型和变异分析。40份粪便标本中检测到14份阳性HEV、RNA,检出率为35%,基因分型均为HEV IV型,且分属2个不同的亚型;利用生物信息学软件对国内I型和IV型毒株加以比较,发现HEV IV型毒株比I型变异程度高,不同年份的HEV IV型毒株变异更大,有新的亚型出现,且变异有随时间推移而增大的趋势。     

南京地区戊型肝炎病毒基因型鉴定和变异分析

为了解南京地区戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)基因型的分布以及变异状况,本研究采用逆转录套式聚合酶反应(RT-nPCR)的方法检测南京地区40份急性散发性戊型肝炎患者的粪便标本,对PCR产物进行测序,利用生物信息学软件比较核苷酸的同源性、遗传距离,进行基因分型和变异分析.40份粪便标本中检测到14份阳性HEV、RNA,检出率为35%,基因分型均为HEV Ⅳ型,且分属2个不同的亚型;利用生物信息学软件对国内Ⅰ型和Ⅳ型毒株加以比较,发现HEV Ⅳ型毒株比Ⅰ型变异程度高,不同年份的HEV Ⅳ型毒株变异更大,有新的亚型出现,且变异有随时间推移而增大的趋势.     

不同基因型戊型肝炎病毒存在多种类型抗原表位

以戊型肝炎病毒(HEV)ORF2重组蛋白p166Us为免疫原制备单克隆抗体(McAbs),采用间接ELISA和免疫印迹法,检测McAbs与不同基因型和亚型HEV重组蛋白p166Bur(Ⅰa型)、p166Pak(Ⅰb型)、p166Mor(Ⅰc型)、p166Mex(Ⅱ型)、p166Us(Ⅲ型)、p166Nz(猪HEV,Ⅲ型)和p166Chn(Ⅳ型)的反应性,采用抗原或抗体竞争ELISA分析p166蛋白与天然HEV颗粒之间抗原表位的关系。结果获得4D3、2E3、11E11、12H5、3A3和1F16株稳定分泌McAbs的杂交瘤细胞株。4D3分泌的McAb与7种p166均发生反应,其与免疫原p166Us的结合可被Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ或Ⅳ型天然HEV颗粒或病人血清竞争抑制。2E3、11E11和12H5分泌的McAbs只与p166Us、p166Nz和p166Chn发生反应,它们与p166Us的结合仅能被Ⅲ和IV型病毒或血清所抑制。3A3分泌的McAb只与p166Us及p166Nz结合,1F1分泌的McAb只与p166Us结合,两者均能被Ⅲ型美国株竞争抑制,而Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ型不能抑制它们与p166Us的结合。由此可见,不同基因型和亚型HEV ORF2编码蛋白p166上存在多种类型抗原表位,其中包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ基因型共同的,Ⅲ、Ⅳ基因型共有的和第Ⅲ基因型特异的等,这些表位与天然HEV颗粒上的抗原表位具有相同的免疫学特征。     

福建省2000～2003年戊型肝炎病毒分离株的分子流行病学研究

为研究福建省2000～2003年急性散发性戊型肝炎病毒（HEV）分离株的分子流行病学特征,采用RT—PCR方法扩增HEV ORF2的基因片段,经纯化、克隆、测序后,对其序列用Neighbor-Joining法和Bootstrap法进行基因进化分析。从158例急性散发性戊型肝炎的血清标本中扩增出72份HEV RNA,经基因进化树分析,这72株HEV均属于HEV基因Ⅳ型,且被明显地分为A、B、C、D共4个组群。A群的同源性最高,群内同源性为93．3％～100％;D群的同源性最低,群内同源性在86．6％～100％之间。A群和B群流行株所占比例没有差异;C群流行株所占比例由2002年的7．1％逐渐增加到2003年的26．3％（x^2=10．553,P=0．014）;D群则由85．7％逐渐减少到44．7％（x^2=8．136,P=0．043）。引起福建地区急性散发性戊型肝炎流行的HEV均属于HEV基因Ⅳ型,基因型内存在不同的组群,其中D群的变异较大。     

戊型肝炎病毒(HEV)合成肽及基因重组抗原免疫反应性研究

用ＯＲＦ２、ＯＲＦ３合成肽抗原（１～１０号）及基因工程重组的ＯＲＦ２抗原（１和２号）分别建立了酶联免疫方法（ＥＩＡ）,检测６０份戊型肝炎病人血清中ＨＥＶＩｇＧ及ＩｇＭ１０个合成肽抗原（Ｓｐ１－Ｓｐ１０）及２个重组抗原（Ｒｅ１、Ｒｅ２）,均和ＨＥＶ阳性血清发生特异反应,但阳性率和反应强度差别很大。以Ｒｅ１（ＯＲＦ２,４０２～６６０）检测的抗体阳性率最高,为９６．７％（５８／６０）;Ｓｐ６（ＯＲＦ３,８８～１２３）次之,为９３．３％（５６／６０）;以上两种抗原混合使用阳性率为１００％（６０／６０）。Ｓｐ６、Ｒｅ１及这两种抗原混合使用检测抗ＨＥＶＩｇＭ,阳性率分别为１８．３％（１１／６０）、６６．７％（４０／６０）和６６．７％（４０／６０）。研究结果表明：合成肽６号（Ｓｐ６）及重组抗原１号（Ｒｅ１）是制备戊肝抗体诊断试剂的理想抗原。     

戊型肝炎病毒(HEV)开读框架2中1.3 kb cDNA的克隆与序列分析

以戊型肝炎(Hepatitis E)病人高热期血清为原材料,设计特定引物,经RT-PCR扩增获得开放阅读框2(ORF2)1.3 kb基因片段,用EcoR I和BamH I插入克隆载体pUC18,测定了该克隆基因片段的核苷酸序列并进行了比较分析.其片段长度为1 309 bp,其A=249(19.2%),G=318(24.29%),T=339(25.9%),C=403(30.79%);与印度株和缅甸株的同源性在92%以上,而与乍得和墨西哥株的同源性分别为90.7%和77.4%.     

中国西藏部分地区猪戊型肝炎病毒流行病学调查

戊型肝炎病毒(Hepatitis E Virus,HEV)感染是一个重要的全球公共卫生问题,而猪被认为是HEV的天然宿主。HEV可以跨种间传播,且已经证实生吃感染的猪肉会导致人感染。在中国西藏许多地区仍然有生吃猪肉、猪肝等的习惯,且不同种家畜混合饲养,极易造成HEV感染和传播。然而中国西藏地区猪HEV流行情况报道甚少。文中对中国西藏5个地区市(拉萨、日喀则、山南、那曲和昌都)猪血清进行HEV Immunoglobulin-M(Ig M)和Ig G抗体检测,并通过逆转录巢氏PCR(RT-n PCR)进行HEV RNA检测和定量RT-PCR(q RT-PCR)进行病毒拷贝计算,首次报道了藏猪血清HEV RNA阳性率。结果显示,在西藏猪中HEV有较高的流行趋势。猪血清HEV Ig M抗体阳性率高达7.6%(26/340),HEV Ig G抗体阳性率为1.8%(6/340),HEV RNA阳性率高达7.6%(26/340),血清中病毒拷贝高达1.7×107 copies/m L,而且5个地区有不同的流行趋势。结果表明西藏猪HEV感染情况严重。有关部门应加强管理,以避免人与动物之间的交叉感染和暴发。     

新疆猪粪便戊型肝炎病毒RNA的检测及序列分析

从戊型肝炎病毒(Hepatitis Evirus,HEV)IgG检测阳性的新疆某猪场采集70份猪粪便,利用逆转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测HEV RNA,其中13份为阳性,阳性率18．57％。将PCR扩增产物克隆到pMD18-T载体上,构建成重组质粒并测序,结果表明,13株猪源HEV分离株在HEV ORF2 348bp核苷酸序列的同源性为97．1％～100％,为同一基因型;与HEVⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ的同源性分别为74．1％-77．6％,71．6％-74．1％,73.3％～78．2％和82．8％-91.4％,与ⅣA亚型的同源性同源性最高达89．4％-91．4％。以该核苷酸片段绘制的基因进化树显示13株猪源HEV与HEV Ⅳ T1株在同一分支上,属基因Ⅳ型;与国内其他猪源HEV分离株该片段核苷酸序列的同源性为82．6％-91．3％,提示中国猪源HEV的基因型比较一致,同属HEV Ⅳ型。     

新疆猪粪便戊型肝炎病毒RNA的检测及序列分析

从戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)IgG检测阳性的新疆某猪场采集70份猪粪便,利用逆转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测HEV RNA,其中13份为阳性,阳性率18.57%.将PCR扩增产物克隆到pMD18-T载体上,构建成重组质粒并测序,结果表明,13株猪源HEV分离株在HEV ORF2 348bp核苷酸序列的同源性为97.1%～100%,为同一基因型;与HEV Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ的同源性分别为74.1%～77.6%,71.6%～74.1%,73.3%～78.2%和82.8%～91.4%,与ⅣA亚型的同源性同源性最高达89.4%～91.4%.以该核苷酸片段绘制的基因进化树显示13株猪源HEV与HEVⅣT1株在同一分支上,属基因Ⅳ型;与国内其他猪源HEV分离株该片段核苷酸序列的同源性为82.6%～91.3%,提示中国猪源HEV的基因型比较一致,同属HEVⅣ型.     

戊型肝炎病毒细胞分离株部分核苷酸序列分析

用抗原捕获／多聚酶链反应（ＡＣ／ＰＣＲ）对戊型肝炎病毒（ＨＥＶ）细胞分离株ＭＪ９０和Ｒ２５基因组的部分核苷酸序列进行扩增,获得了与ＨＥＶ缅甸株ＥＴ１·１相同的ｃＤＮＡ扩增带。该ｃＤＮＡ扩增带纯化后用双脱氧核苷酸ＤＮＡ链末端终止法测序,ＣＪ９０、Ｒ２５株的核苷酸和氨基酸序列与ＥＴ１·１克隆的同源性分别为９９．６％、１００％和９９％、９９％,从而证明ＭＪ９０和Ｒ２５毒株为ＨＥＶ．     

新型戊肝病毒ORF3和部分ORF1基因的序列分析

用RT－PCR方法对2例感染新型HEV的样品进行了检测,并对PCR产物进行了克隆及测序。检测结果显示用常规PCR检测易造成ORF3中GC丰富区的缺失,但不同于已报道的HEVⅠ型、Ⅱ型和Ⅲ型,为一新的基因型。T1和T11与Ⅰ型在该区的核苷酸同源性为79％－82％;与Ⅱ型的同源性为80％－81％;和Ⅲ型的同源性为83％－85％。     

Laboratory-based Surveillance and Clinical Profile of Sporadic HEV Infection in Shanghai,China

The study aimed to describe the epidemiological, virological and clinical features of sporadic HEV infection in eastern China. A total of 6112 patient sera were tested for anti-HEV IgG or anti-HEV IgM during one consecutive year(between August 2018 and July 2019). HEV RNA presence was evaluated by RT-PCR and HEV sequences were phylogenetically analyzed. Clinical features of confirmed HEV-infected patients were delineated. The sero-positivity rate of anti-HEV IgG maintained stable around 40%, while an obvious winter spike of anti-HEV IgM prevalence was observed. A total of 111 patients were confirmed of HEV viremia by molecular diagnosis. Subtype 4 d was predominant. Phylogenetic analyses suggest that certain strains circulate across species and around the country. Subjects with confirmed current HEV infection had a high median age(58 years) and males were predominant(62.2%). Most patients presented with jaundice(75.7%) and anorexia(68.0%). Significantly elevated levels of liver enzymes and bilirubin were observed. Remarkably, the baseline bilirubin level was positively correlated with illness severity. Pre-existing HBV carriage may deteriorate illness. The clinical burden caused by locally acquired HEV infection is increasing. Surveillance should be enforced especially during the transition period from winter to spring. Patients with higher level of bilirubin at disease onset had slower recovery from HEV infection.     

Research on Hepatitis B virus Genotypes and Subgenotypes among Bai Nationality in Dali, Yunnan Province

To investigate the distribution of hepatitis B virus （HBV） genotypes and subgenotypes among the Bai nationality in Dali, a total of 100 serum samples from patients with chronic HBV-infection were collected for the detection of HBV genotypes and subgenotypes by genotype-specific primers and restriction fragment length polymorphism （RLFP）, respectively. Among the 100 samples, the proportions of genotype B, C and mixed genotype （B＋C） were 41%, 25% and 34%, respectively. All the genotype B strains belonged to subgenotype Ba In genotype C, 84% were Subgenotype Cs and 12% were subgenotype Ce. The distribution of genotypes B, C and B＋C showed no significant difference between male and female patients （P=0.182） and among the age groups of patients （P=0.812）. The rates of HBeAg/HBeAg positivity were no significantly different among genotypes B, genotype C and mixed genotype （B＋C） （P=0.077/P=0.663）. In Dali, genotypes B, B＋C and C existed among Bai nationality with chronic HBV-infection, and genotype B was the major genotype. Subgenotypes Ba and Cs were the predominant strains in patients with HBV genotype B/C infection. The most prominent characteristic was the higher prevalent rate of mixed genotype （B＋C） in patients.     

广州地区急性散发性HEV毒株基因特征和生物学性状的研究

利用ＲＴ－ＰＣＲ技术对我国广州地区急性性戊型肝炎病毒细胞培养分离株Ｇ９３－１、Ｇ９３－２、Ｇ９３－３和Ｇ９３－４基因组聚合酶区部分核苷序列进行检测,ＰＣＲ阳性产物经纯化、克隆后测定。结果Ｇ９３－１、Ｇ９３－３和Ｇ９３－４株病毒的这段序列完全相同,且与我国新疆暴发流行的ＨＥＶ８７Ａ株及ＨＥＶ代表株的同源性为１００％;而Ｇ９３－２株与它们的差异较大,同源性只有７９．９％;但是,它与１９９７年厦门地区急