小熊猫种群遗传结构和地理分化

本文采用分子系统地理学的研究方法 ,对我国小熊猫 (Ailurusfulgens)地理分布格局的形成原因进行了探讨。我们从四个地理单元的 32号样品中成功地扩增出了 371bp的线粒体DNA控制区片段 ,在所有可比较的 35 7bp的序列中 ,发现 2 9个变异位点 ,其中转换和颠换分别为 2 1和 8,没有插入 /缺失。在四个地理单元中 ,共有 16种线粒体DNA单倍型 ,且在各地理单元中都具有较高的单倍型的多态性。进一步分析表明 ,各单倍型之间的遗传距离平均为 1 6 0 % ,76 5 9%的遗传差异发生在地理单元间 ,仅 2 3 4 1%发生在单元内。分子变异分析和系统重建结果也表明 ,各地理单元之间不存在共享的单倍型 ,YN (云南地理单元 )与XL (相岭地理单元 )和QL (邛崃地理单元 )之间存在着显著的遗传分化 ,FST分别为 0 336和 0 35 1(P <0 0 0 1) ,其余地理种群之间分化不明显 (P >0 0 5 ) ,单倍型缺乏比较明显的地理分布格局 ,各地理单元中的单倍型相互散布在不同的分布群中。经Fs检验 (Fs=- 10 12 1) ,并结合化石资料 ,我们认为由于受第四纪气候和环境变化的影响 ,小熊猫种群在进化过程中曾经历种群暴发而不断扩散 ,从而形成今天的分布格局。     

叉尾斗鱼种群遗传变异与亲缘地理

通过分析采自珠江、鉴江、漠阳江、赣江、韩江、黄冈河、九龙江和闽江8个流域23个采样点121尾叉尾斗鱼mtDNA控制区3'端和临近序列共400bp,研究其种群遗传变异和亲缘地理格局。所分析序列只有13个变异位点,共有11个单倍型,碱基序列总的单倍型多样性为0.576,核苷酸多样性为0.00818,均较低。珠江流域存在群体内独有单倍型,有两个广布单倍型H1和H2,分别占所有样品的19%和62%。最小进化网络图显示单倍型没有明显的亲缘地理格局,呈星状发散,H1和H2处于中心。AMOVA分析显示变异主要来自地理区内群体间,歧点分布和中性检测显示叉尾斗鱼并未经历种群扩张。结果表明叉尾斗鱼种群遗传多样性很低且存在地理差异;各流域个体呈混杂分布格局,现有群体可能在珠江流域有东西两个起源;推测种群最近经历严重瓶颈效应。     

黑嘴鸥种群的遗传分化与迁徙模式

用分子生物学方法研究了黑嘴鸥(Larus saundersi)种群的遗传结构和分化.对我国黑嘴鸥现存的3个地方种群50个样本的线粒体DNA控制区部分片段进行了序列测定,结合已公布的的两个韩国样本的序列,比对后所获得的550 bp的序列中,共发现49个变异位点,定义了37种线粒体单元型,其中仅1种为我国3个地方种群间共享单元型,多数为各地方种群内特有.我国3个地方种群内的单元型多样性和核苷酸多态性都很高;4个地方种群合并成一个大种群时, 其线粒体单元型多样性与核苷酸多样性仍很高,分别为0.974%±0.012%和0.510%±0.042%.进一步分析表明,4个地方种群间核苷酸歧异度在0.433%-0.585%之间,种群分化程度FST在-0.03176-0.48063之间,基因流Nm在1.03-33.79之间,平均遗传距离为0.0051±0.0011.UPGMA系统发生树及最大简约网络图表明, 黑嘴鸥的演化关系呈现星状辐射,单元型之间呈现一种混杂的分布格局,地方种群没有形成明显的系统地理结构.同时运用彩色旗标技术,初步掌握了4个地方种群迁徙规律.对比分子研究结果,验证了不同地方种群间的遗传分化与其迁徙模式基本一致,同时认为黑嘴鸥不同地方繁殖种群从越冬地返回繁殖地的过程中会发生交叉.最后,鉴于黑嘴鸥不同地方种群间的遗传分化不显著,其迁徙行为具有差异性,建议在保护和遗传管理中应分别对待.     

中间黄颡鱼群体遗传变异与亲缘生物地理

通过分析81尾采自华南西部12条水系的中间黄颡鱼(Pelteobagrus intermedius)mtDNA控制区435 bp的序列,研究其群体遗传变异及亲缘生物地理格局。结果显示,中间黄颡鱼群体间的遗传分化较小,核苷酸变异只有0.54%。12条水系的群体共有7个单倍型,其中一些现已相互隔离的水系中的群体共享同一个单倍型,提示这些水系曾经有非常密切的联系。根据嵌套进化支序分析,中间黄颡鱼可能起源于峒中河、北仑河、防城河所在的广西与越南交界地区,并通过两条途径向华南沿海西部诸独立水系和海南岛扩散,在演化过程中,曾发生片断化事件,长距离建群和持续的分布区扩张。     

中国柽柳沙鼠线粒体DNA 的地理变异及其亚种分化

柽柳沙鼠广泛分布于中亚荒漠地区,在我国分布于蒙新干旱区西部。本研究采用线粒体Cyt b 基因和D-loop控制区两个片段共1 569 bp作为分子标记,对我国蒙新区西部45 个柽柳沙鼠的核苷酸多样性、单倍型多样性及系统发生进行分析,并探讨其亚种分化。45 个柽柳沙鼠线粒体DNA 共定义33 个单倍型,包含142 个核苷酸变异位点(占全序列的9.05% ),其中单态位点34 个,简约信息位点108 个,未发现碱基插入或缺失的现象。基于单倍型的系统发生树和网络关系图显示,柽柳沙鼠的谱系分为两大支:伊犁盆地的种群聚为独立的一支,准噶尔盆地和额济纳地区的种群聚为一支,两大支的分歧时间为0.24 Ma年前,大约在庐山冰期。通过Beast 模拟,柽柳沙鼠在近15 000年有一次快速的种群衰退,表明柽柳沙鼠种群受到了末次盛冰期的影响。基于Cyt b 基和D-loop 序列的证据,我们认为分布于新疆伊犁盆地的柽柳沙鼠为哈萨克亚种(M. t. jaxartensis),分布于我国新疆准噶尔盆地以及甘肃、内蒙地区的为敦煌亚种(M. t. satchouensis)。     

四川地区猕猴线粒体DNA 控制区遗传多样性及其种群遗传结构

猕猴是最理想的医学实验灵长类动物,并且是国家二级保护动物。四川地区的猕猴数量多、分布广,全面了解其遗传背景对于该地区猕猴资源的保护与合理利用具有重要的意义。本研究对来自四川8 个地理种群的231个不同猕猴个体的线粒体DNA 控制区部分序列进行了测定和群体分析,发现了110 个变异位点(22. 49% ),定义了56 种单倍型,其单倍型多样性(h)平均值为0. 686、核苷酸多样性(π)平均值为0. 01483,种群总体遗传多样性较高;进一步分析表明,8 个地理种群间存在着明显的遗传分化(F_st = 0. 70412,P < 0. 05),种群间基因交流较低(N_m < 1);系统发育树显示,四川猕猴8 个地理种群的单倍型基本上成簇分布在系统树上,与地理位置呈现一定的对应关系,说明四川猕猴具有明显的系统地理分布格局。地理隔离和人类活动可能是促使四川猕猴种群分化的主要因素。     

大壁虎不同地理居群的遗传变异与分化

以线粒体细胞色素b(Cytb)基因作为分子标记,对中国广西12个地区,以及越南和老挝大壁虎(Gekko gecko)进行序列测定,获得Cytb基因424bp的序列片段,共有7个单倍型。以白脊壁虎和沙虎为外群,用邻接法和最大简约法构建了大壁虎不同地理种群的系统发育关系,其结果显示中国广西4个不同单倍型黑大壁虎之间的平均遗传距离为0.20%—1.20%,越南红大壁虎与老挝红大壁虎之间的平均遗传距离为0.50%,广西宁明红大壁虎与越南红大壁虎和老挝红大壁虎之间平均遗传距离分别为1.70%和2.20%。广西黑大壁虎种群与红大壁虎种群之间的平均遗传距离为8.60%—9.50%,达到了亚种或种分化的差异。     

中国大鲵四种群的遗传结构和地理分化

为了确定栖息地的破碎化和片断化引起中国大鲵的地理分化和遗传结构变异,本文测定了来自广西、河南、陕西和湖南4个地理种群的28条大鲵的mtDNAD loop基因全序列。根据这4个地理种群的地理分布,分成珠江单元(广西种群)、黄河单元(河南种群)和长江单元(湖南和陕西种群)。通过ClustalX、MEGA2.0、DnaSP4.0、Arlequin1.1分析发现,全序列长度为771bp,其中64个多态性核苷酸变异位点,占全部碱基数的8.26%。转换和颠换分别为6和2个,插入/缺失11个。27个单倍型间的序列差异平均为1.32%。3个单元的单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数值都偏低,而且珠江单元的这两个指数值都低于长江和黄河两个单元。珠江单元和黄河、长江单元之间分化程度显著(P<0.001),而长江和黄河单元之间差异不显著(P>0.05)。地理单元内分化程度占99.31%,而单元间只有0.69%,表明遗传差异主要发生在单元内,而且各地理单元之间的基因流较频繁。构建的NJ树和MP树显示,27个单倍型呈现一种混杂的分布格局,并未分成代表3个地理单元的聚合群。     

黑眶蟾蜍、黑斑蛙、中国雨蛙不同地理居群的染色体多样性

本文研究温州地区的黑眶蟾蜍、黑斑蛙、中国雨蛙的核型,分析了三个地理居群的黑星期五蟾蜍、四个地理居群的黑斑蛙、三个地理居群的中国雨蛙核型。结果表明不同地理居群的同种蛙有相同的染色体数和核型模式。黑星期五蟾蜍为2n＝22,NF＝44,核模式6＋5;黑斑蛙为2n=26,NF=52,核模式5＋8;中国雨蛙为2n＝24,NF＝48,核模式6＋6。但同一种蛙的不同地理居群之间在SM数目和顺序、次缢痕或随体的位置等有所不同。说明不同地理居群的同种蛙的染色体具有丰富的多样性。     

不同地理种群羊草的遗传分化研究

以不同种群羊草为实验材料（包括内蒙古高原的稆草原类型：荒漠草原,典型草原,草甸草原及吉林盐碱地羊草）,分别从个体（叶长,叶宽,株高,分蘖数,根茎芽数等特征及根茎叶的扫描电镜结构）,生理（在ＰＥＧ胁迫下叶片的电阻电导,ＳＯＤ和ＰＯＤ的活性,脯氨酸和丙二醛的含量等）,细胞（染色体核型）,同工酶及ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）等几个水平较为系统地研究其遗传分化以及对水因子的适应机理,并进行了大量的聚类分析,发现：不     

黄河上游极边扁咽齿鱼种群遗传结构

极边扁咽齿鱼Platypharodon extremus是黄河上游的特有鱼类,近年来由于过度捕捞、环境变迁等因素,其资源量剧减,种群处于濒危状态。研究中采集了分布于黄河上游的3个种群（n=107）,基于线粒体DNA控制区695bp序列,共检测到101个可变位点,占总分析位点的14.5%,其中58个为简约信息位点。3种群共界定了87个单倍型,种群平均单倍型多样性h=0.995,核苷酸多样性π=0.0129。结果表明,极边扁咽齿鱼的种群遗传多样性水平较高。分子方差分析（AMOVA）表明,3群体间总遗传分化系数Fst=0.0528,群体间尚未有显著的遗传分化。系统发生树显示3种群的单倍型混合分布,各进化枝之间分歧度很低,没有形成明显的单倍型组,也没有显示出单倍型与地理位置的对应关系。3个群体共享1个单倍型（Hap₃1）,推测它们来自于共同的祖先。歧点分布和Fu’Fs中性检测显示极边扁咽齿鱼并未经历种群扩张。     

西藏南部白垩纪岗巴群的双壳类及其生物地理意义

描述双壳类化石４２种,建立１０新种：Ｇｒａｍｍａｔｏｄｏｎ（Ｎａｎｏｎａｖｉｓ）ｍｉｎｕｍ ｓｐ．ｎｏｖ．,Ｐｒｏｐｅａｍｕｓｓｉｕｍ（Ｐ．）ｔｉｂｅｔｅｎｓｐ ｅｐ．ｎｏｖ．,Ｐｌｉｃａｔｕｌａ ｈｉｍａｌａｙｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ．,Ｐｓｅｕｄｏｌｉｍｅａ ｄｕｏｄｅｃｉｃｏｓｔａｔａ ｓｐ．ｎｏｖ．,Ｐｙｃｎｏｄｏｎｔｅ（Ｐｈｙｇｒａｅａ）ｇａｍｂａｅｎｓｉｓ ｓｐ．ｎｏｖ．,Ｎｏｔｏｔｒ     

华南地区羽枝藓属（平藓科）和凋叶藓属（薄齿藓科）植物研究

本文研究了华南地区羽枝藓属（Ｐｉｎｎａｔｅｌｌａ）和凋叶藓属（Ｃａｄｕｃｉｅｌｌａ）植物．简要讨论了羽枝藓属和凋叶藓属的系统位置．确认华南地区产羽枝藓属４种,即爪哇羽枝藓（Ｐ．ａｎｂｉｇｕａ）、纤细羽枝藓（Ｐ．ａｎａｃａｍｐｔｏｌｅｐｉｓ）、嵌边羽枝藓（Ｐ．ｉｎｔｒａｌｉｍｂａｔａ）和东亚羽枝藓（Ｐ．ｍａｋｉｎｏｉ）,凋叶藓２种,即广东凋叶藓（Ｃ．ｇｕａｎｇｄｏｎｇｅｎｓｉｓ）和凋叶藓（Ｃ．ｍａｒｉｅｉ）．其中爪哇羽枝藓为广东、贵州、海南岛之新记录,纤细羽枝藓为中国大陆（广东、广西）和海南岛之新记录,东亚羽枝藓为福建、广西和海南岛之新记录,广东调叶藓为海南岛之新记录,暂将Ｐ．ａｌｏｐｅｃｕｒｉｏｉｄｅｓ处理为存疑种。本文还包括分种检索表、各种的简要识别特征、产地及生境资料．     

HISTORICAL BIOGEOGRAPHY OF THE BANANAQUIT (COEREBA FLAVEOLA) IN THE CARIBBEAN REGION: A MITOCHONDRIAL DNA ASSESSMENT

We analyzed mitochondrial DNA (mtDNA) restriction-site variation in bananaquit (Coereba flaveola; Aves, Coerebinae) populations sampled on 12 Caribbean islands and at 5 continental localities in Central America and northern South America. Multiple fixed restriction-site differences genetically defined several regional bananaquit populations. An mtDNA clade representing all Jamaican bananaquits was the most divergent; the estimated average sequence divergence (d_xy) between Jamaican and all other mtDNA haplotypes surveyed was 0.027. Three groups of populations, representing Central America, northern South America, and the eastern Antilles (Puerto Rico to Grenada) were nearly equally differentiated among themselves (average d_xy = 0.014), and may represent a single, recent range expansion. Within the eastern Antilles, three geographically restricted haplotype groups were identified: Puerto Rico, north-central Lesser Antilles (U.S. Virgin Islands to St. Lucia), and Grenada–St. Vincent. The evolutionary relationships of these groups were not clear. Genetic homogeneity of the island populations from the U.S. Virgin Islands to St. Lucia suggested a recent spread of a specific north-central Lesser Antillean haplotype through most of those islands. Haplotype variation across this region indicated that this spread may have occurred in two waves, first through the southernmost islands of St. Lucia, Martinique, and Dominica, and more recently from Guadeloupe to the north. The geographic distribution of mtDNA haplotypes, and of bananaquit populations, suggests periods of invasiveness followed by relative geographic quiescence. Although most genetic studies of bird populations have revealed homogeneity over large geographic areas, our findings provide a remarkable counterexample of strong geographic structuring of mtDNA variation over relatively small distances. Furthermore, although the mtDNA data were consistent with several subspecific distinctions, it was clear that named subspecies do not define equally differentiated evolutionary entities.     

南海北部近海水螅虫总纲四新种和二新纪录研究(刺胞动物门,自育水母纲,水螅水母纲)

记述了南海北部近海水螅虫总纲4新种和2新纪录,即自育水母纲的顶胃穴水母岛Sminthea apicigastrica Xu,Huang et Du,sp.nov.,水螅水母纲的距拟双手水母Codonorchis calcariformis Xu,Huang et Guo,sp.nov.,南海多管水母Aequorea nanhainensis Xu,Huang et Du,sp.nov.,四手多管水母Aequorea tetranema Xu,Huang et Du,sp.nov.,深水拟单手水母Paragotoea bathybia Kramp,1942和母螅镰螅水母Zanclea medusopolypata Boero,Bouillon et Gravili,2000.并讨论了新种与近缘种的区别,模式标本保存在中国水产科学研究院南海水产研究所.     

南海织纹螺属三新纪录(腹足纲,织纹螺科)

在整理分类近年来在海南岛和南沙群岛采集的织纹螺科标本时,鉴定出属于织纹螺属的3个中国新纪录种:1)巴氏织纹螺Nassarius (Zeuxis)barsdelli(Ladd,1976);2)蛛形织纹螺Nassarius(Zeuxis)algidus(Reeve,1853);3)杰克逊织纹螺Nassarius(Niotha)jacksonianus(Quoy & Gaimard,1833).3新纪录种分属于Zeuxis 和Niotha两亚属,它们主要生活于潮间带至浅海或百余米水深的泥质沙或沙质海底.     

GRIESBACHIAN AND DIENERIAN (EARLY TRIASSIC) AMMONOID FAUNAS FROM NORTHWESTERN GUANGXI AND SOUTHERN GUIZHOU (SOUTH CHINA)

Abstract: Intensive sampling of the Luolou (northwestern Guangxi) and the Daye (southern Guizhou) Formations in South China leads to the recognition of a regional Griesbachian and Dienerian ammonoid succession for this key palaeobiogeographical area. The new biostratigraphical sequence comprises the upper Griesbachian ‘Ophiceras beds’ and the lower Dienerian ‘Proptychites candidus beds’, which are separated from the uppermost Dienerian ‘Clypites beds’ by an unfossiliferous interval. These faunas contain some taxa with wide geographic distribution (e.g. Ambites, Pleurambites, Pleurogyronites, Proptychites candidus), thus facilitating correlation with faunal successions from other regions (i.e. British Columbia, Canadian Arctic, Himalayas and South Primorye). Two new genera (Jieshaniceras and Shangganites) and three new species (Anotoceras subtabulatus, Pleurambites radiatus and Shangganites shangganense) are described.     

福建省食螨瓢虫区系及地理分布

食螨瓢虫Stethorus spp.是世界上许多果树和经济作物叶螨的一类重要天敌。本文通过对采自福建省28个县、市约3000号食螨瓢虫成虫标本的整理,解剖雄外生殖器制片标本约800张,共鉴定出福建省食螨瓢虫9种,其中4种是福建新记录,包含1种中国大陆新记录和一未定名种。除福建北部和西北部以深点食螨瓢虫Stethorus punctillum Weise为优势种外,其余全省广大地区,以腹营食螨瓢虫片S.siphonulus Kapur和广东食螨瓢虫S.cantonensis Pang为优势种,本文记述了这9个种的分布和寄主,并对福建省食螨瓢虫区系及地理分布作初步分析。     

华南早-中二叠世(蜓)类分异度变化过程的对比研究

根据复合标准剖面的数据,对华南早-中二叠世鲢类动物群属种分异度的变化过程进行了研究,分析了早、中二叠世动物群属种首现及末现速率的差异。研究结果表明,鲢类动物群属级分异度经历了两次快速上升,一次明显下降,在早、中二叠世出现两个相对独立的高峰,但总体上表现出持续上升趋势,并在中二叠世中期达到最大。早二叠世期间属级分异度的短暂下降主要与鲢类动物本身的演化趋势有关,是动物群属级分类单元更替的结果。物种分异度在二叠纪初急剧增长,至早二叠世Sakmarian期已达到整个早-中二叠世的顶峰。早二叠世的动物群更替事件对物种分异度具有显著影响,并导致物种分异度随后总体呈下降趋势,中二叠世开始物种数虽有所上升,但始终未能恢复到早二叠世鼎盛时期的水平。早二叠世是筵类动物稳定发展时期,动物群中属种首现的总数及速率明显大于中二叠世,属种更替也更为频繁。中二叠世中期开始,筵类动物群属种分异度同时呈现急剧下降的趋势,但是,早、中二叠世华南鲢类动物群中属种末现速率却并无明显差异,表明造成晚期古生代稳定生态系统崩溃的环境变化对筵类动物的成种速率有较大的影响,持续的低成种速率是导致中二叠世筵类动物属种分异度下降的内在因素。