Halwaxiids系统进化研究进展

Halwaxiids是一类体表覆有骨质鳞片的寒武纪后生动物,它包含了在早期后生动物进化中占据关键位置的两个化石动物类群Halkieriids和Wiwaxids.但自1995年以来包含Halkieria和Wiwaxia在内的Halwaxiids进化枝在不断被修正,而近年来,随着新化石和新证据的出现,围绕Halkieria...     

新疆寒武纪早期单壳类软体动物化石分类学与生物地层学

作者系统描述了新疆阿克苏-乌什地区下寒武统玉尔吐斯组中上部单壳类软体动物化石10属10种,其中包括3个新种、3个老种和4个未定种,它们是Shabaktiella multiformis sp.nov.,Ilsanella acuta sp.nov.,Xianfengella yuertusiensis sp.nov.,Parcaconus xinjiangensis,Protostenotheca xinjiangensis,Aldanella attlebo-rensis,Obtusoconus sp.,Yochelcionella sp.,Bemella sp.和Mellopegma sp..上述10个属种基本上代表了玉尔吐斯组单壳类软体动物的面貌特征.文中介绍了本研究区10个属和属级以上分类系统在国际学术界的意见分歧后,重申了以壳的对称性和有无肌痕确定纲级界线的最佳分类原则,提出了应用壳型划分目级分类单元和口缘形状、壳顶与口缘的相对位置划分科级分类单元的可行性和有效性,但是不能接受把所有单板状软体动物化石通常被归入单板纲的做法,因为寒武纪早期一些单板状软体动物化石不一定符合单板纲的真实含义.文中还回顾了近二十年来建立的始单板纲(Eomonoplacophora)(Missarzhevsky,1989),太阳女神螺纲(Helcionelloida),背壳肌纲(Tergomya)(Peel,1991a,b)和似腹足纲(Paragastropoda)(Linsley & Kier,1984)等纲级的新概念.还有一些早期软体动物专家将许多单板状(包括帽状和螺旋状)化石归入单板纲(Runnegar et al.,1976,1985),而另有一些中青年软体动物专家继承传统理念,将它们归入了腹足纲(Parkhaev in.Alexander et al.,2001).钱逸和本格森将早期单壳类软体动物化石分成了五大形态类别,未确定科级以上分类单元名称(Qian & Bengtson,1989).总之,目前纲级分类单元界线不清,目级以下分类单元十分混乱,在没有全面清理早期单壳类软体动物百余个属和属级以上分类单元之前,是难以统一本文研究的早期单壳类软体动物10个属和属级以上分类系统.我们认为在确定属级以上分类系统及其与之密切相关的演化谱系关系时,不是利用理论前提,而是在不间断的剖面上对单壳类软体动物化石进行逐层采集并对其构造要素的详细研究,才能使得出的结论和提出的新分类系统发生错误的几率最小.文中还归纳和总结了本研究区玉尔吐斯组中上部单壳类软体动物群面貌的六大特点,其中二点最重要:1)该动物群与梅树村期微软体动物群的面貌有明显的差别,它缺失了梅树村期微软体动物群中最原始、最特征、最丰富的类群,如笠帽状的马哈螺类化石Maikhanella,Purella等和螺旋状的始旋螺类化石Archaeospira等.但是该动物群面貌却与邻区的哈萨克斯坦Atdabanian期的微软体动物和我国峡区西蒿坪动物群面貌接近,出现了许多相同或相似的属种,如Shabaktiella,Mellopegma,Aldanella,Yochelcionella等.2)该动物群共生有全球分布的相当于筇竹寺期的标准化石,如原牙形类Gapparodus,Amphigeisina,Hagionella等,有口唇并有背腹分异和复杂口盖的软舌螺类Microconus,Pachytheca等,具有肉茎孔和铰合面的有铰腕足类和像Obolus那样的原始无铰腕足类,有各种形态类型的金臂虫Dabashanella,Liangshanella等,还有可疑的三叶虫颊刺等.上述信息足以说明玉尔吐斯组中上部地层时代应属筇竹寺期而非梅树村期,从而解决了长期以来有关玉尔吐斯组时代归属的争议. 玉尔吐斯组单壳类软体动物群的研究,再次证实了寒武纪生命大爆发期间,早期单壳类软体动物与小壳动物群一起经历了三次大发展和三次大绝灭事件.这在早期单壳类软体动物化石分类学、生物地层学和早期演化史上均有较高的科学价值.     

华南寒武纪奥斯坦型化石研究进展

传统的奥斯坦型(Orsten-type)化石是指三维磷酸盐化的、以软躯体保存为主的、微型蜕皮动物化石。它们代表着早寒武世到早奥陶世浅海小型底栖生物群中的蜕皮动物,是其它类型的保存方式(如布尔吉斯页岩型)难以保存的。奥斯坦型化石在西方有近半个世纪的研究历史,但是在中国却起步较晚,直到2005年才首次报道。中国的奥斯坦型化石在四个剖面的相关层位有产出,即湘西王村剖面上寒武统排碧阶、滇北硝滩剖面下寒武统第三阶、陕南张家沟剖面和川北新立剖面的下寒武统幸运阶。报道的化石类群包括丰富的甲壳动物Phosphatocopida,最古老的真甲壳动物,最古老的环神经动物,动吻动物门第一个化石属种,等等。虽然研究历史短,中国的奥斯坦型化石在揭示甲壳动物、环神经动物及蜕皮动物的起源和早期演化方面展现了重要的价值。     

化石数据在生物分类学中的作用

从生物分类学的研究历史来探讨化石在分类学中地位的变化,以及这种变化和思想观念更新的关系。用脊椎动物高级类群关系的变化作例子,说明化石类群在动物系统发育研究中的作用。     

跳虫系统进化的研究进展

跳虫是弹尾纲（Collembola）的俗称,在所有六足动物中化石年代最早,因此跳虫是六足动物起源及进化研究中非常重要的类群。跳虫的起源、分类地位和系统关系等问题,对于阐明六足动物甚至节肢动物各大类群的系统关系非常关键,日益成为相关学者关注和争论的焦点。本文就跳虫形态学和分子系统学方面的研究工作进行了综述。     

寒武纪化石胚胎的解剖学、亲缘关系以及发育序列

Bengtson和Yue首次确定Olivooides和Markuelia为化石胚胎,建立了Olivooides的胚胎和胚后发育序列,并且提出Olivooides的亲缘关系是刺细胞类(Bengtson and Yue,1997;Yue and Bengtson,1999).在过去的10年中,许多论述寒武纪化石胚胎的文章问世,极大地提高了人们的认识.其中,Steiner等识别出Pseudooides为化石胚胎,并且推想了Pseudooides的发育序列(Steiner et al.,2004 a,b).基于在中国湖南西部中、上寒武统发现的许多精美保存的标本,对Mat"kuelia进行了解剖学、亲缘关系和支序分析研究,限定Markuelia的亲缘关系为Scalidophora(动吻动物门、兜甲动物门和曳鳃动物门的统称)的干群.尝试性地建立了Markuelia的发育序列,特别是预孵化阶段的发育序列,即从吻刺形成的最早时期直至即将孵化的最后时期的发育序列.因为最近发现了保存完美的Olivooides预孵化阶段、孵化阶段以及未成年个体阶段(Olivooides和Punctatus之间的过渡类型)的标本,重新建立了Olivooides的胚胎和胚后发育序列.尽管Olivooides的亲缘关系仍然有争议,但多数作者支持其亲缘关系为刺细胞类.然而,迄今所描述的大多数寒武纪化石胚胎的亲缘关系,特别是谜一般的化石胚胎-Pseudooides的亲缘关系仍然不得而知.由于Markuelia孵化后的幼虫、未成年个体或成年个体的标本还未发现,其胚后发育序列则无从谈起,令人信服的原肠胚阶段的化石胚胎也未见报道.今后,可靠的原肠胚阶段的化石的发现很可能要借助于同步加速器辐射X射线层析显微技术.总之,寒武纪化石胚胎的研究还有很多悬而未决的问题.     

七鳃鳗化石的最新发现

马在陆地驰骋，蝙蝠在空中飞翔，一般认为这两种动物不具有相似性。但科学家日前证实，在马、牛、猪这些有蹄类动物中，马拥有独立的起源，它和蝙蝠的亲缘关系反而比同牛、猪等动物的关系更近。     

动物的起源和寒武纪大爆发:来自中国的化石证据

近30年来,中国埃迪卡拉纪—寒武纪发现了包括瓮安生物群和澄江动物群在内一系列重要化石群,为揭示动物的起源和寒武纪大爆发过程提供了全球独一无二的古生物学证据。文中全面而简洁地介绍发现于华南埃迪卡拉纪—寒武纪的所有化石群和重要动物化石发现,总结其中特异化石群保存类型和埋藏环境。其中,陡山沱型磷酸盐化胚胎化石群、庙河型宏体碳质膜化石群和牛蹄塘型海绵动物群,以及陡山沱组硅化的动物休眠胚胎化石和宽川铺动物群中rsten型化石均是全球这一时期华南独有的特异埋藏化石群。从时空两方面对化石群进行综合分析认为,动物可靠的最早化石记录发现于埃迪卡拉纪早期,成冰纪及其以前的动物化石均存在疑问。动物的起源和寒武纪大爆发经历了从浅水逐步向深水迁移,以及阶段性辐射和灭绝的过程。首先动物经历了在埃迪卡拉纪早期的隐形微体动物早期演化阶段,之后经过以埃迪卡拉型生物为代表的大型复杂化演化阶段,在寒武纪初期发生以梅树村动物群为代表的两侧对称动物和生物骨骼矿化的大爆发,并随后又被以澄江动物群为代表的寒武纪动物群所替代,在筇竹寺期达到了动物造型和生态系统复杂化的高峰。     

动物的起源和寒武纪大爆发：来自中国的化石证据北大核心

近30年来,中国埃迪卡拉纪—寒武纪发现了包括瓮安生物群和澄江动物群在内一系列重要化石群,为揭示动物的起源和寒武纪大爆发过程提供了全球独一无二的古生物学证据。文中全面而简洁地介绍发现于华南埃迪卡拉纪—寒武纪的所有化石群和重要动物化石发现,总结其中特异化石群保存类型和埋藏环境。其中,陡山沱型磷酸盐化胚胎化石群、庙河型宏体碳质膜化石群和牛蹄塘型海绵动物群,以及陡山沱组硅化的动物休眠胚胎化石和宽川铺动物群中"rsten"型化石均是全球这一时期华南独有的特异埋藏化石群。从时空两方面对化石群进行综合分析认为,动物可靠的最早化石记录发现于埃迪卡拉纪早期,成冰纪及其以前的动物化石均存在疑问。动物的起源和寒武纪大爆发经历了从浅水逐步向深水迁移,以及阶段性辐射和灭绝的过程。首先动物经历了在埃迪卡拉纪早期的隐形微体动物早期演化阶段,之后经过以埃迪卡拉型生物为代表的大型复杂化演化阶段,在寒武纪初期发生以梅树村动物群为代表的两侧对称动物和生物骨骼矿化的大爆发,并随后又被以澄江动物群为代表的寒武纪动物群所替代,在筇竹寺期达到了动物造型和生态系统复杂化的高峰。     

广西姑婆山野生柑橘资源花粉形态观察及其系统分类学研究

该研究以广西贺州市姑婆山野生皱皮柑、姑婆山野生元橘以及其他柑橘类共28个材料的花粉为实验材料,通过扫描电镜观察花粉的赤道面、极面、外壁纹饰等形态特征,并对姑婆山野生皱皮柑和姑婆山野生元橘的亲缘关系进行分析,以揭示姑婆山野生柑橘资源的分类地位及其系统演化关系。结果表明:(1)姑婆山野生皱皮柑和姑婆山野生元橘花粉都为中等型、形状都为长球形,但姑婆山野生皱皮柑较大,前者极轴长为(35.24±1.94)μm,赤道轴长为(20.39±1.35)μm,后者极轴长为(30.21±1.14)μm,赤道轴长为(22.12±1.97)μm。(2)在外壁纹饰上两者差别比较大,姑婆山野生皱皮柑的网眼较大且多为不规则圆形或多边形,网眼直径为(1.65±0.09)μm,网脊较狭且突起,网脊宽度为(0.51±0.10)μm,与莽山野柑(尖叶)、莽山野柑(圆叶)比较相近;姑婆山野生元橘的网眼较小,多为圆形或近圆形,网眼直径为(0.86±0.08)μm,网脊稍宽突起不明显,网脊宽度为(0.47±0.09)μm,与岑溪酸橘、印度酸橘比较相近。(3)聚类分析结果显示,在遗传距离0.827处将28份试验材料分为9个组群,其中姑婆山野生皱皮柑单独为第Ⅸ组,且在遗传距离0.976处与第Ⅷ组[莽山野柑(尖叶)、莽山野柑(圆叶)]聚为一组;姑婆山野生元橘与其中10份材料聚为第Ⅴ组,且在遗传距离0.07处与岑溪酸橘聚为一组,在遗传距离0.10处又和印度酸橘聚为一组。研究推测,姑婆山野生皱皮柑与莽山野柑(尖叶)、莽山野柑(圆叶)有一定的亲缘关系,且具有原始性和独特性,莽山野柑(含姑婆山野生皱皮柑)应该为柑橘属内独立的真正的种或者是除枳属、金柑属和柑橘属外的一个独立属;姑婆山野生元橘与岑溪酸橘、印度酸橘有一定的亲缘关系,从网脊宽度、网眼直径大小分析,推测姑婆山野生元橘较道县野橘、立花橘原始。     

Phylogeny and taxonomy of the oak powdery mildew Erysiphe alphitoides sensu lato

Phylogenetic analyses of Erysiphe alphitoides s. lat. using sequences of the rDNA ITS region and the D1/D2 domains of the 28S rDNA revealed a complex consisting of several genetically and morphologically distinguished taxa, including the already described Erysiphe alphitoides s. str. and E. hypophylla. The ascomata (chasmothecia) of E. hypophylla are morphologically very similar to those of E. alphitoides, but the two species are easily distinguishable by their symptoms, as well as the shape and size of the conidia. The fungus on Quercus phillyraeoides, distributed in warmer regions in southern Japan, is genetically clearly separated from E. alphitoides s. str., and morphologically characterized by having chasmothecia with appendages consistently shorter than the chasmothecial diameter. This fungus, named Erysiphe quercicola in this paper, is also able to infect some other oak species, and it is genetically identical with anamorphs on some tropical trees of other host genera. Collections of E. alphitoides s. lat. on Quercus acutissima and Q. variabilis, both belonging to Quercus sect. Cerris, are genetically distinct from E. alphitoides s. str., E. hypophylla and E. quercicola. They form two genetically and morphologically differentiated groups. The hypophyllous taxon on Q. acutissima and Q. variabilis, named Erysiphe hypogena in this paper, is characterized by forming distinctive persistent hypophyllous mycelial patches, causing necrotic discolouration of the host tissue. The epiphyllous taxon on these hosts, for which the name E. epigena is proposed, differs in having epiphyllous mycelium, smaller chasmothecia with fewer appendages, and does not cause leaf discolouration.     

Phylogeny and taxonomy of rhizobia

Rhizobia are bacteria that form nitrogen-fixing nodules on the roots, or occasionally the shoots, of legumes. There are currently more than a dozen validly named species, but the true number of species is probably orders of magnitude higher. The named species are listed and briefly discussed. Sequences of the small subunit ribosomal RNA (SSU or 16S rRNA) support the well-established subdivision of rhizobia into three genera: Rhizobium, Bradyrhizobium, and Azorhizobium. These all lie within the alpha subdivision of the Proteobacteria, but on quite distinct branches, each of which also includes many bacterial species that are not rhizobia. It has been clear for several years that Rhizobium, on this definition, is still too broad and is polyphyletic: there are many non-rhizobia within this radiation. Recently, therefore, it has been suggested that this genus should be split into four genera, namely Rhizobium (R. leguminosarum, R. tropici, R. etli), Sinorhizobium (S. fredii, S. meliloti, S. teranga, S. saheli), Mesorhizobium (M. loti, M. huakuii, M ciceri, M. tianshanense, M. mediterraneum), and a fourth, unnamed, genus for the current R. galegae. The evidence and pros and cons are reviewed.     

Phylogeny and taxonomy of Aspicilia and Megasporaceae

Phylogenetic analyses based on nuLSU and mtSSU indicate that Megasporaceae is monophyletic. Aspicilia species were distributed among three main well supported groups and one group with low support that included the type species; a division of the family into five genera is proposed. The old names Circinaria and Sagedia are reintroduced for groups not including A. cinerea, the type of Aspicilia. The monotypic Megaspora is closely related to Circinaria, while Lobothallia is the sister group of the other Megasporaceae genera. Aspicilia recedens and A. farinosa are transferred to Lobothallia. Species of the 'Sphaerothallia group' are nested in Circinaria. Aspilidea is not a member of Megasporaceae but seems to be more closely related to Ochrolechiaceae. Aspilidea myrinii is neotypified, and lectotypes are designated for Aspicilia gibbosa, A. leprosescens and Lecanora gibbosula.     

Phylogeny and taxonomy of the genus Cylindrocladiella

The genus Cylindrocladiella was established to accommodate Cylindrocladium-like fungi that have small, cylindrical conidia and aseptate stipe extensions. Contemporary taxonomic studies of these fungi have relied on morphology and to a lesser extent on DNA sequence comparisons of the internal transcribed spacer regions (ITS 1, 2 and 5.8S gene) of the ribosomal RNA and the ??-tubulin gene regions. In the present study, the identity of several Cylindrocladiella isolates collected over two decades was determined using morphology and phylogenetic inference. A phylogeny constructed for these isolates employing the ??-tubulin, histone H3, ITS, 28S large subunit and translation elongation factor 1-alpha gene regions resulted in the identification of several cryptic species in the genus. In spite of the 18 new Cylindrocladiella species described in this study based on morphological and sequence data, several species complexes remain unresolved.     

米曲霉异源蛋白表达系统研究进展及展望

米曲霉作为一种重要的工业微生物,在异源蛋白表达方面已有广泛应用,受限于被表达蛋白的修饰及分泌过程,目前实际生产使用的基因供体主要局限于其他真菌,尤其是丝状真菌。当外源基因来源于植物、昆虫和哺乳动物时,米曲霉所生产的异源蛋白产量及生物活性往往不尽如人意。本文综述了米曲霉作为宿主表达异源蛋白的研究进展,包括其现有的遗传操作手段及异源表达方面的应用及探索,重点介绍了应用过程中面临的挑战和解决策略,另外,对米曲霉表达异源蛋白的应用前景及发展方向进行了展望。     

Phylogenetic taxonomy in Drosophila: Problems and prospects

The genus Drosophila is one of the best-studied model systems in modern biology, with twelve fully sequenced genomes available. In spite of the large number of genetic and genomic resources, little is known concerning the phylogenetic relationships, ecology, and evolutionary history of all but a few species. Recent molecular systematic studies have shown that this genus is comprised of at least three independent lineages and that several other genera are actually embedded within Drosophila. This genus accounts for over 2000 described, and many more undescribed, species. While some Drosophila researchers are advocating dividing this genus into three or more separate genera, others favor maintaining Drosophila as a single large genus. With the recent sequencing of the genomes of multiple Drosophila species and their expanding use in comparative biology, it is critical that the Drosophila research community understands the taxonomic framework underlying the naming and relationships of these species. The subdivision of this genus has significant biological implications, ranging from the accurate annotation of single genes to understanding how ecological adaptations have occurred over the history of the group.     

瑞香属和荛花属的数量分类研究

瑞香属和荛花属为瑞香科瑞香亚科的落叶或常绿灌木,中国西南部是瑞香属和荛花属的重要分化中心。全世界共有瑞香属95种、荛花属70种,中国分布有瑞香属52种、荛花属49种。瑞香属和荛花属的分类学研究一直存在不同程度的分歧。花盘形状和果实类型在传统分类中一直是区分瑞香属和荛花属的典型特征,而花盘形态和果实类型在2个属中存在交叉和过渡,部分植物分类学家根据这些特征将两个属进行过不同程度的归并。该研究采用数量分类法对瑞香属77种(变种)和荛花属62种(变种)植物,选取32个形态学性状进行聚类分析和主成分分析。结果表明:聚类分析和主成分分析均显示两属均未形成单系类群。在主成分分析中,前3个主成分分析的贡献值为35.56%,传统分类中用来区分两属的花盘形状、叶序及果实类型等特征对前3个主成分贡献相对较小,因此,传统分类学中对这两个属进行区分的性状并没有典型的分类学意义。同时,聚类图和主成分分析得到的散点图均不能将这两个属区分开来。数量分类研究结果显示两属植物存在明显的交叉,支持瑞香属和荛花属不是两个独立自然类群的观点。     

中国互花米草防治措施研究进展及展望

互花米草原产于美国大西洋沿岸，20世纪80年代被引入我国，由于抗逆性和繁殖能力强，在我国沿海地区大肆蔓延，对湿地生态系统生物多样性和社会经济发展产生严重威胁，如何有效防治互花米草已成为学者研究的热点和社会关注的焦点之一。本文在文献分析的基础上，阐明了互花米草在国内的分布现状和入侵态势;总结了物理、化学、生物和综合防治法在互花米草防治中的适用范围及优劣势，指出现有防治技术仍存在防治难度大、成本高、治理后易复发和预警体系不完善等问题，为防控互花米草入侵提供理论支持;并进一步提出了基于遥感的“信息收集+早期预警+分级防控”的防控对策和以防治为主、利用为辅的互花米草“防治+利用”技术体系，为今后互花米草的防治和利用提供了新的研究思路。