圈养大熊猫肠道乳酸菌分离及益生特性

【背景】大熊猫数量稀少、繁殖困难,在其生长过程中极易感染消化系统疾病甚至死亡。【目的】分析圈养大熊猫肠道可培养乳酸菌的群落结构与功能,筛选具有益生特性的乳酸菌菌株,为大熊猫消化系统疾病的预防和肠道微生物研究提供理论参考及菌种资源。【方法】采用3种培养基分离大熊猫粪便中的乳酸菌,通过革兰氏染色镜检和过氧化氢试验对分离的菌株进行初步鉴定,基于BOXA1R-PCR图谱遗传多样性选取代表菌株进行16S rRNA基因测序分析并进行主成分分析(principal component analysis, PCA),同时分析乳酸菌菌株安全性和益生特性。【结果】通过初步鉴定共分离获得58株乳酸菌,根据BOXA1R-PCR结果挑选20株菌进行测序,结果显示20株菌分属于明串珠菌属(Leuconostoc)、肠球菌属(Enterococcus)、魏斯氏菌属(Weissella)和链球菌属(Streptococcus)这4个属,主成分分析结果表明不同年龄段的大熊猫肠道乳酸菌群落结构存在差异。20株乳酸菌均不溶血,17株乳酸菌对11种抗生素均敏感;11株菌耐pH值2.0酸性条件,14株菌对0.3%的胆盐具有良好...     

大熊猫粪便类固醇激素研究进展

概述了大熊猫粪便样本采集和保存方法,系统总结了大熊猫粪便类固醇激素提取、测定方法和应用研究,对大熊猫粪便类固醇激素的应用进行了展望。     

牙鲆肠道乳酸菌的分离和鉴定

目的：根据微生态学原理,从健康牙鲆的肠道固有菌群中分离乳酸菌。方法：需氧与厌氧培养法。结果：两种方法获得了不同的结果,用LBS（pH6.5）直接分离,从19株分离菌中只获得6株乳酸菌,其中1株P15为乳杆菌;而用LBS（pH5.4）和SL(pH5.4）先富集后分离得到了许多单一的乳杆菌菌落。对所分离的乳杆菌进行生化鉴定,均符合该菌的生化特征。牛津杯抑菌试验显示,乳酸菌对弧菌均有抑制作用,其中乳杆菌P15在pH6.8和pH7.5生长良好,并对弧菌有强力的抑制作用;而在pH8.0和pH8.5时该菌生长不良且无抑菌活性。     

大熊猫粪便中元素的对应分析

采用对应分析方法对中国卧龙大熊猫研究中心圈养的大熊猫粪便中的元素以及体重、年龄等十一个变量进行处理,在二维平面上表达总信息的百分之九十以上,大熊猫粪便可分两大类,每一大类又进一步可分为两小类。     

亚成体大熊猫肠道真菌的分离与鉴定

目的探讨大熊猫肠道真菌菌群结构,为研究肠道真菌对纤维素的降解和控制肠道真菌病奠定基础。方法采用PDA、SDA、高氏3种培养基对8只亚成体大熊猫新鲜粪便进行真菌分离、纯化,经形态学和分子生物学方法进行鉴定。结果经培养获得的真菌主要由4种霉菌(Galactomyces geotrichum占22.74%、Galactomyces reessii占12.37%、Mucor ramosissimus占18.23%和Mucor circinelloides占6.39%)和2种酵母菌(Trichosporon sp.占19.46%和Candida solani strain占20.81%)组成,各样品中真菌所占比例不等。且3种培养基的分离效果显示PDASDA高氏培养基。结论亚成体大熊猫肠道内存在一定比例的可培养真菌。     

大熊猫和小熊猫粪便DNA提取的简易方法

采集了大熊猫和小熊猫的新鲜粪便样品 ,使用 1 0 0 %乙醇保存。通过重复离心富集研究动物的肠道脱落细胞 ,并使用乙醇和双蒸水洗涤以除去抑制物。用 1 %的SDS快速裂解细胞 ,离心除去残渣后 ,向裂解液中加入蛋白酶进行消化。消化结束后使用等体积的酚 /氯仿抽提 ,乙醇沉淀DNA。用双蒸水溶解粪便DNA后 ,使用PCR产物纯化试剂盒对粪便DNA进行纯化。电泳检测结果显示 ,从乙醇保存的大、小熊猫粪便样品中抽提到高质量的粪便DNA。对线粒体控制区、细胞色素b基因、 1 2SrRNA基因的PCR扩增反应以及测序结果也证实了样品保存方法和DNA抽提方法可靠而高效。此方法使用实验室内常用的分子生物学试剂 ,不仅克服了分子粪便学研究中常见的抑制物粪便DNA微量降解严重等障碍 ,与商业化的粪便抽提试剂盒 (QIAampDNAStoolMiniKit,Qiagen)相比还是一种经济的试验方法 (抽提反应成本为试剂盒的 1 / 5 )。文中还对粪便DNA内细菌基因组等背景DNA可能对分子粪便学试验结果的影响进行了探讨。在基于PCR技术的遗传学研究中 ,对于植食性动物而言 ,粪便内的背景DNA对目标动物DNA片断的扩增和序列测定未见影响 ;但对于肉食性动物 ,则必须考虑被捕食者基因组对试验可能产生的影响 ,应谨慎对待     

依赖粪便材料的大熊猫肠道耶尔森氏菌的检测

It is inevitable to develop noninvasive sampling methods to do studies on giant panda even diagnose the diseases since which is so endangered that it's impossible to carry out invasive sampling. A non-invasive sampling method to detect the intestinal pathogen, Yersirda enterocolitica in feces of pandas based designing PCR primers was established in this study. The main procedures are based on bacteria enrichment and cell lysis before binding the pathogen DNA to silica powder at high concentration of Kalium iodide and neutral pH conditions. Before PCR cycles, the binded DNA is washed with 80% ethanol and eluted with diluted EDTA buffer. Restdts showed that the silica-based feces DNA-purification method could remove the inhibitors of PCR so applicable to detect the target pathogen.     

大熊猫粪便宽径与咬节平均长度的关系

粪便咬节是大熊猫数量调查中最常用的指标。然而,大熊猫在主食竹叶的季节有时在粪便中未留下咬节而使数量调查难以进行。为此,本文对大熊猫粪便宽径与咬节平均长度的关系进行了初步探讨。结果表明,大熊猫粪便宽径呈正态分布,同一个体的含咬节粪便与全由竹叶组成的粪便在宽径上无显著差异。大熊猫咬节平均长度与粪便宽径存在显著的回归关系。在不考虑年龄的情况下,粪便咬节平均长度与粪便宽径的回归方程为:Y=0.38X十14.40。成体和亚成体组的粪便咬节平均长度与粪便宽径的回归方程为:Y=0.22 X+22.79。年龄对大熊猫粪便咬节平均长度与粪便宽径的回归关系有显著影响。     

大熊猫幼兽腹泻粪便分离出的轮状病毒鉴定

11 只5 ～ 11 月龄的断奶大熊猫幼兽先后患一种急性传染性、顽固性腹泻病,1 只大熊猫幼兽在发病4 d 后死亡,相同饲养条件下由母兽哺育的同龄大熊猫幼兽未见发病。取发病大熊猫幼兽粪便、血液以及呕吐物进行细菌学和寄生虫学检查,未检出病原;用轮状病毒粪便抗原ELISA 快速诊断,受检的8 只大熊猫幼兽腹泻便都多次检出阳性结果。采集发病大熊猫的病料进行病毒病原分离,从腹泻大熊猫幼兽的粪便中分离出病毒颗粒,通过电镜形态、理化特性和中和试验鉴定,确认分离病毒为轮状病毒。      

一种从大熊猫粪便中提取DNA的改进方法

本研究描述一个改进的方法，使从大熊猫粪便中提取DNA用于PCR扩增变得更加容易。在粪便DNA的提取过程中采用一个新的预处理方法，将粪便用预冷的丙酮洗2～3次，除去粪便中含有的大量PCR抑制物，然后用蛋白酶K裂解、酚氯仿抽提，能提取到纯度很高的DNA供PCR扩增。本实验PCR扩增了大熊猫脑源性神经营养因子(BDNF)基因和线粒体细胞色素6基因片段，并进行测序分析，证实了提取的可靠性。对比本方法和未经丙酮预处理的方法提取的DNA进行PCR扩增，前者的扩增结果明显优于后者。     

大熊猫肠道纤维素分解菌的分离鉴定及产酶性质

【目的】从健康大熊猫新鲜粪便中分离具有纤维素酶活性的菌株,并对其进行菌种鉴定及产酶性质研究。【方法】利用羧甲基纤维素钠培养基分离纯化具有较高纤维素酶活性的菌株,根据形态学特征、生理生化特性以及16S rDNA分析对其进行分类鉴定,研究影响该菌株纤维素酶的产酶条件,以及对不同纤维素底物的降解情况。【结果】分离得到一株纤维素酶产生菌株P2,该菌株为好氧的革兰氏阳性细菌,生长温度范围20-50℃(最适温度37℃),pH范围6.0-9.0(最适pH7.0),NaCl浓度范围0%-15%(最适2%NaCl),培养24h达到产酶高峰。16S rDNA基因序列分析显示,菌株P2与解淀粉芽胞杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)NBRC15535相似性为99.66%。该菌株对四种纤维素底物(滤纸、脱脂棉、秸秆、竹纤维)均有不同程度的降解,内切葡聚糖酶、外切葡聚糖酶、β-葡萄糖苷酶和总酶活具有不同的酶活变化。【结论】本研究首次从大熊猫粪便中分离出了好氧纤维素分解菌,并鉴定为解淀粉芽胞杆菌,对上述四种纤维结构均有一定的破坏和分解作用,为进一步研究大熊猫竹纤维消化机制提供了菌源。     

葡萄藤叶青贮中乳酸菌的分离与鉴定

为了筛选出性状优良的乳酸菌菌株,本试验以实验室纯培养方式从葡萄藤叶自然发酵的青贮中分离鉴定乳酸菌。经过菌落形态、细胞形态、生理生化鉴定和16S r DNA基因序列以及系统发育树的分析,从葡萄藤叶青贮中分离出5株乳酸菌,其中菌株P-1. 2和P-2. 2为戊糖乳杆菌(Lactobacillus pentosus),菌株P-1. 7为戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus),菌株P-2. 1为粪肠球菌(Enterococcus faecium),菌株P-2. 3为短乳杆菌(Lactobacillus brevis)。测定产酸速率和生长速率,发现菌株P-2. 1的产酸能力和生长性能最好。     

猪源乳酸菌的分离、鉴定及其生物学特性

【目的】将分离自猪肠道粘膜、食糜和粪便的乳酸菌,通过产乳酸能力、生长性能、耐酸和耐胆盐性能及抑菌能力评价,筛选适应养猪生产的潜在益生特性的菌株。【方法】共分离获得155株乳酸菌纯菌株,从中筛选出4株产酸能力较强的乳酸菌,结合生理生化试验及细菌16S rRNA测序鉴定其种属,评价候选乳酸菌的生长情况、耐酸、耐胆盐及抑菌特性。【结果】综合变色时间(8 h)、pH值(3.9)和乳酸含量(100 mmol/L),筛选出4株(L45、L47、L63和L79)候选菌株,经鉴定依次为罗伊氏乳杆菌、植物乳杆菌、约氏乳杆菌和粪肠球菌。该4株乳酸菌均可在体外快速生长;L47和L79能够耐受pH 2.5的酸性环境,L47能够耐受0.5%胆盐环境;各乳酸菌上清液与指示菌共培养,发现对E coli K88和沙门氏菌均产生了抑制作用,其中L47上清液对指示菌的抑制作用较强。【结论】L47具有较好的产酸性能与生长性能、可耐受猪胃酸和肠道胆盐环境,对E.coli K88和沙门氏菌具有较好的抑制作用,说明该乳酸菌具有潜在的益生特性。     

泡菜中优良乳酸菌的分离、鉴定及发酵特性

从几种泡菜中分离出86株菌,对其在适温和低温下产酸速率及硝酸盐降解能力进行测定,筛选出5株产酸速率快、硝酸盐降解能力强的菌株。经形态学鉴定及生理生化反应试验,初步鉴定为：植物乳杆菌2株,短乳杆菌1株,戊糖乳杆菌1株,肠膜明串珠菌葡聚糖亚种1株,并对5株菌的发酵性能进行了测定。     

Isolation and identification of lactic acid bacteria from soil using an enrichment procedure

AIMS: To survey, and identify and classify the ecological distribution of lactic acid bacteria from soil in Japan and Taiwan. METHODS AND RESULTS: Acid-producing bacteria were isolated from 68 soil samples, collected from Japan and Taiwan, in the rhizospheres of fruit trees, from the floor of a henhouse and around a horse farm. All isolates were identified by physiological and genetic tests. Thirty-two of the 54 isolates were identified as lactic acid bacteria (LAB), 16 as spore-forming lactic acid bacteria, five as Clostridium and one as Bacillus. These lactic acid bacteria represent five genera: Lactobacillus, Lactococcus, Enterococcus, Leuconostoc and Weissella. CONCLUSIONS: A high rate of isolating lactic acid bacteria was obtained from soil. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: This study suggests that soil may be a common source for the isolation of lactic acid bacteria.     

泡菜、传统腊肠中降胆固醇乳酸菌的筛选及鉴定

摘要：【目的】筛选具有降胆固醇功能的乳酸菌菌株,为乳酸菌体外、体内的降胆固醇生理特性和机理研究奠定基础。【方法】以碳酸钙-MRS选择性培养基(Calcium Carbonate-Man Rogosa and Sharp Medium)从中国传统食品泡菜、腊肠中筛选乳酸菌,应用改良的胆固醇筛选培养基筛选具有较高降胆固醇能力的乳酸菌菌株,并研究其耐酸性,耐胆盐活性,生长曲线及产酸特性;结合菌落形态学、接触酶反应、革兰氏染色、碳水化合物微量鉴定管及16SrRNA寡核苷酸碱基序列分析鉴定菌株。【结果】筛选得到的两     

Sox and Zfx genes in giant panda

ＯｎｅｏｆｔｈｅｒｅｃｅｎｔｂｒｅａｋｔｈｒｏｕｇｈｓｏｆｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌｂｉｏｌｏｇｙｉｓｔｈｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｔｈｅｔｅｓｔｉｓｄｅｔｅｒｍｉｎｉｎｇｆａｃｔｏｒｇｅｎｅｏｎｔｈｅｍａｍｍａｌｉａｎＹｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ[1],ＳＲＹｇｅｎｅ,ｂｙａｌｏｎｇｈｉｓｔｏｒｙｏｆｓｅａｒｃｈｆｏｒｔｈｅｇｅｎｅ,ｆｒｏｍＢｋｍ,ＨＹａｎｔｉｇｅｎ,ＺＦＸ/ＺＦＹｔｏＳＲＹ/ＳＯＸ(ＳＲＹｂｏｘｇｅｎｅｆａｍｉｌｙ).Ｒｅｃｅｎｔｓｔｕｄｉｅｓｓｈｏｗｔｈａｔａｎｕｍｂｅｒｏｆｃｌｏ…     

Composition of captive giant panda milk

Eleven milk samples were collected from three female giant pandas (Ailuropoda melanoleuca) during 23 days after delivery. Concentrations of crude protein (CP), lactose (Lac), and three vitamins (VA, VD, VE) in these samples were tested. Concentration of CP, Lac, VA, VD, and VE of these samples in wet basis averaged 6.77±0.78%, 3.23±0.54%, 0.073±0.043 mg/L, 0.24±0.08 mg/L, and 6.76±1.01 mg/L, respectively. Results demonstrated that nutrients concentrations of milk samples had no significant difference among different pandas (P>0.05). The average content of milk protein between 3–6 days and 7–23 days had significant difference (P<0.01). Results indicate that panda milk is similar to that of other carnivores. It has higher protein but lower lactose than milk in domestic ungulates and humans. Zoo Biol 0:1–6, 2005. © 2005 Wiley‐Liss, Inc.