核蛋白体上结合位点的三点模型

核蛋白体上有３个ｔＲＮＡ的结合位点，Ａ位、Ｐ位和Ｅ位。蛋白质合成过程中，核蛋白体移位，脱氨酰ｔＲＮＡ只从Ｐ位点移到Ｅ位点，而不脱落，只有当Ａ位点与新的氨酰ｔＲＮＡ结合后，脱氨酰ｔＲＮＡ才与Ｅ位点脱离。如果错误的氨酰ｔＲＮＡ进入Ａ位，则结合不稳定，就会脱落下来，这样保证蛋白质合成的准确性。     

RNA在翻译中的功能

ＲＮＡ在翻译中的功能关键词ＲＮＡ,翻译ｍＲＮＡ翻译为蛋白质需要氨酰ｔＲＮＡ与ｍＲＮＡ上的相应密码子相互作用。密码子和反密码子间的Ｗａｔｓｏｎ－Ｃｒｉｃｋ碱基配对的稳定性不足以保证有效、准确的解码,而要有核糖体的帮助。这种功能是由核糖体蛋白还是核糖体Ｒ...     

第二类肽链释放因子

生物体内蛋白质合成过程中 ,当核糖体遇到ｍＲＮＡ上的终止密码时 ,新合成的多肽链从肽酰 ｔＲＮＡ上释放出来 ,释放因子在这个过程中起着重要的作用 .释放因子有两类 ,第一类为密码子特异性因子 ,原核生物有ＲＦ1和ＲＦ2两种 ,ＲＦ1识别ＵＡＡ/ＵＡＧ ,ＲＦ2识别ＵＡＡ/ＵＧＡ终止密码子 ;真核生物中ｅＲＦ1识别三个终止密码子 .第二类释放因子为密码子非特异性因子 ,原核生物中为ＲＦ3,真核生物中为ｅＲＦ3.第一类释放因子识别终止密码子 ,并促进肽酰 ｔＲＮＡ酯键的水解 ,但要使这个反应进行得更有效 ,并使ＧＴＰ水解 ,还需要第二类释放…     

大肠杆菌tRNA~(Leu)的提取、纯化及性质研究

采用高表达大肠杆菌ｔＲＮＡＬｅｕ菌株提取、纯化了亮氨酸等受体转移核糖核酸ｔＲＮＡＬｅｕ１和ｔＲＮＡＬｅｕ２．利用稳态动力学手段研究了ｔＲＮＡＬｅｕ１及脱镁ｔＲＮＡＬｅｕ１在不同稀土离子作用下与纯化亮氨酰－ｔＲＮＡ合成酶的氨酰化作用．ｔＲＮＡＬｅｕ１与亮氨酰－ｔＲＮＡ合成酶的结合及催化效率均受参与稀土离子的影响,表观Ｋｍ值有较明显的变化．结果表明,亮氨酰－ｔＲＮＡ合成酶催化的ｔＲＮＡＬｅｕ１氨酰化反应所需Ｍｇ２＋能够被稀土离子取代,但亲合性能不同．     

封面说明

色氨酰ｔＲＮＡ合成酶 (ＴｒｐＲＳ)在蛋白质合成系统中具有非常重要的地位。通过蛋白质同源模建得到了枯草杆菌 (Ｂａｃｉｌｌｕｓｓｕｂｔｉｌｉｓ)色氨酰ｔＲＮＡ合成酶的三维结构。模建结果对色氨酰ｔＲＮＡ合成酶可能与ｔＲＮＡＴｒｐ结合的方式给出了预测。ｔＲＮＡＴｒｐ是跨亚基与ＴｒｐＲＳ相互作用的。一个ｔＲＮＡＴｒｐ分子的反密码环和氨基酸接受茎分别与一个ＴｒｐＲＳ的两个亚基相互作用。图中所示 ,红色和黄色分别代表两个ｔＲＮＡＴｒｐ分子 ,绿色和蓝色分别代表ＴｒｐＲＳ的两个亚基。　　ＴｈｅＦｒｏｎｔＣｏｖｅｒＳｈ…     

tRNA个性研究进展

ｔＲＮＡ参与蛋白质生物合成中至关重要的两个功能上相连的生物化学事件。一种是由氨基酰－ｔＲＮＡ合成酶（ａａＲＳ）催化的ｔＲ－ＮＡ的氨基酰化（ｔＲＮＡ的个性）,通过ａａＲＳ对ｔＲＮＡ的序列和结构元件的专一识别和氨基酰化,使ｔＲＮＡ转化为氨基酰ｔＲＮＡ。另...     

Gene Cloning, Overproduction and Purification of Escherichia coli tRNA_2~(Arg)

合成的编码大肠杆菌ｔＲＮＡＡｒｇ２的基因,嵌入受ＩＰＴＧ诱导启动子控制的质粒ｐＴｒｃ９９Ｂ中。用上述含目的基因的质粒转化大肠杆菌ＭＴ１０２,得到ｔＲＮＡＡｒｇ２基因序列正确的克隆。诱导表达后,与受体菌相比,转化子中的ｔＲＮＡＡｒｇ的含量高出１０倍,ｔＲＮＡＡｒｇ２的含量高出３０倍,占总ｔＲＮＡ的７０％。ＤＥＡＥＳｅｐｈａｃｅｌ柱层析后,ｔＲＮＡＡｒｇ２的纯度即可达到８８％。再用ｂｅｎｚｙｌＤＥＡＥｃｅｌｕｌｏｓｅ柱层析可得到纯度为９９％、精氨酸接受活力为１６００ｐｍｏｌｅ／Ａ２６０单位的ｔＲＮＡＡｒｇ２。从４升过夜培养液中得到的４０ｍｇ总ｔＲＮＡ。从中可得到１８ｍｇ纯ｔＲＮＡＡｒｇ２,产率为６２％。首次精确地测定了精氨酰ｔＲＮＡ合成酶催化ｔＲＮＡＡｒｇ２时的动力学常数。     

蛋白质的豆蔻酰化

蛋白质的豆蔻酰化许正平李伯良（浙江大学生物科学与技术系,杭州３１００２７）（中国科学院上海生物化学研究所,上海２０００３１）蛋白质豆蔻酰化是指真核细胞中豆蔻酰基在豆蔻酰ＣｏＡ：蛋白质Ｎ端豆蔻酰转移酶（ＭｙｒｉｓｔｏｙｌＣｏＡ：ｐｒｏｔｅｉｎＮｍｙｒ...     

tmRNA的结构和功能

ｔｍＲＮＡ是细菌体内一种代谢上稳定的ＲＮＡ［１、２］。它的结构独特,其５′和３′末端序列有一个类似丙氨酰ｔＲＮＡ的结构,中间序列编码标记肽（ｔａｇｐｅｐｔｉｄｅ）。与其独特的结构相适应,ｔｍＲＮＡ兼有ｔＲＮＡ和ｍＲＮＡ的双重功能,在细胞中参与一种特殊...     

线粒体tRNA^Trp的原核起源

构建了３种来源于水稻、人和啤酒酵母的线粒体ｔＲＮＡ＾Ｔｒｐ基因。实验表明这些线粒体ｔＲＮＡ＾Ｔｒｐ的体外转录产物具有被枯草杆菌色氨酰－ｔＲＮＡ合成酶（ＴｒｐＲＳ）氨酰化的能力,但是不能被鼠肝来源的氨酰ｔＲＮＡ合成酶粗酶所催化。动力学资源常数测定表明枯草杆菌ＴｒｐＲＳ对线粒体ｔＲＮＡ＾Ｔｒｐ的亲和力为野生型ｔＲＮＡ＾Ｔｒｐ的一半,而在催化效率上,水稻和啤酒酵母线粒体ｔＲＮＡ＾Ｔｒｐ的色氨酰化能力比野     

色氨酸tRNA个性元件的研究

ｔＲＮＡ在相应的氨酰合成酶（以下简称合成酶）的催化作用下与其对应的氨基酸发生特异性连接是保证蛋白质正确翻译的首要前提。这种特异性主要是由ｔＲＮＡ上的一个或几个非连续的碱基或碱基对所组成的个性元件（ｉｄｅｎｔｉｔｙｅｌｅｍｅｎｔ）决定的。这些个性元件是...     

RNA催化肽键生成的实验证据

ＲＮＡ催化肽键生成的实验证据祁国荣（中国科学院上海生物化学研究所,上海２０００３１）关键词ＲＮＡ肽键生成氨酰－ｔＲＮＡ合成酶肽基转移酶当今生物界,从氨基酸到蛋白质的总步骤已基本阐明,示意图如下：图中ＩＦ、ＥＦ和ＲＦ分别为参与蛋白质合成的起始因子、延伸...     

固定化枯草杆菌色氨酰tRNA合成酶(英文)

为研究ｔＲＮＡＴｒｐ 与色氨酰ｔＲＮＡ合成酶（ＴｒｐＲＳ） 的相互识别及其结构、功能关系, 纯化了枯草杆菌ＴｒｐＲＳ并用溴化氰活化的Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ ４Ｂ 将ＴｒｐＲＳ固定化, 固定化ＴｒｐＲＳ的蛋白质回收率为９５ ．５ ％ , 活力回收率为３１．３％ 。研究了固定化ＴｒｐＲＳ的酶学性质, 其热稳定性和贮存稳定性方面均比液相ＴｒｐＲＳ有了较大的提高, 最适温度、最适ｐＨ 均有一定程度的增大, 工作稳定性良好。以固定化ＴｒｐＲＳ为亲和层析介质, 对含有２０ 个核苷酸随机序列、长度为５６ 个核苷酸的单链ＲＮＡ 随机库进行了３ 轮筛选,ＲＮＡ 群体亲和固定化ＴｒｐＲＳ的比例从４ ．３ ％ 上升至１４ ．７ ％ 。筛选得到了与ｔＲＮＡＴｒｐ 氨基酸接受茎类似的ＲＮＡ二级结构。实验结果表明固定化ＴｒｐＲＳ可以作为ＳＥＬＥＸ 亲和层析介质, 进行模拟ｔＲＮＡＴｒｐ 分子的ＲＮＡ 随机库的ＳＥＬＥＸ 筛选。     

膜上tRNA结合蛋白的分离与初步鉴定

用ＴｒｉｔｏｎＸ－１１４分相法分离啤酒酵母的膜总蛋白,经过酵母ｔＲＮＡ分子交联的Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ４Ｂ亲和层析,用０－０．８ｍｏｌ／Ｌ（ＮＨ４０２ＳＯ４梯度缓冲液洗脱ｔＲＮＡ结合的蛋白质。凝胶阻滞电泳实验室鉴定出两种主要的与ｔＲＮＡ分子特异性结合的蛋白质。     

精胺对牛肝tRNA^lle氨基酰化的刺激作用

本实验用纯化的牛肝异亮氨酸ｔＲＮＡ（ｔＲＮＡ＾Ｉｌｅ）和异亮氨酰ｔＲＮＡ合成酶,研究了精胺对Ｉｌｅ－ｔＲＮＡ复合物形成及ＩｌｅＲＳ活性的作用。结果表明：精胺能特异地促使牛肝ｔＲＮＡ＾Ｉｌｅ氨基酰化反应;对ＩｌｅＲＳ活性无影响;能明显地增加形成Ｉｌｅ－ｔＲＮＡ复合物反应的Ｖｍａｘ和ｔＲＮＡ＾Ｉｌｅ的Ｋｍ值。     

内质网区蓖麻毒素的逆向转运

蓖麻毒素是植物来源的核糖体失活蛋白。蓖麻毒素必须通过细胞的内膜系统到达内质网,然后转位至胞质,才能作用于胞质内的核糖体。在内质网中毒素的两条链分离,具有催化活性的A链被内质网上的蛋白质识别,并被转位到胞质内催化核糖体失活。现对内质网在参与蓖麻毒素胞内转运过程中的作用进行综述。     

磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶在真菌和细菌的研究进展

磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶(phosphopantetheinyl transferases,PPTase)可催化脂肪酸合酶(fatty acid synthases,FAS)、聚酮合成酶(polyketide synthases,PKS)以及非核糖体肽合成酶(non-ribosomal peptide syntethases,NRPS)的酰基载体蛋白(acyl carrier protein,ACP)及肽酰载体蛋白(peptidyl carrier protein,PCP)等的翻译后修饰反应,将辅酶A(coenzyme A,CoA)上的磷酸泛酰巯基乙胺基转移到ACP及PCP的保守丝氨酸残基上,从而激发ACP及PCP的活性,由此脂肪酸、聚酮、非核糖体肽得以合成。在大部分真菌及细菌中都存在着PPTase,且其在生物代谢中起到重要的作用。现对其研究进展进行阐述。     

人酪氨酰-tRNA合成酶释放两种不同的细胞因子

人酪氨酰ｔＲＮＡ合成酶(ＴｙｒＲＳ)在蛋白质合成时能催化酪氨酸共价结合到相应的ｔＲＮＡ分子上。新近美国Ｓｃｒｉｐｐｓ研究所的Ｗａｋａｓｕｇｉ和Ｓｃｈｉｍｍｅｌ证明,ＴｙｒＲＳ能被断裂成两种具有不同细胞因子活性的片段,从而揭示了ＴｙｒＲＳ的新功能[1]。人ＴｙｒＲＳ在正常情况下存在胞浆里,不能分泌到胞外,但能从凋亡细胞里释放出来,保持完整长度。胞外弹性蛋白酶能激活人ＴｙｒＲＳ使之断裂成两个片段:Ｃ末端片段或Ｃ末端结构域和Ｎ末端片段或催化Ｎ末端结构域(小ＴｙｒＲＳ)。羧端结构域与人内皮单核细胞活化多肽ＩＩ(ＥＭＡ…     

大鼠肝tRNA^Ile基因的克隆与体外转录

采用ＰＣＲ扩增出大鼠肝ｔＲＮＡ＾Ｉｌｅ基因,构建了重组质粒ｐＧＷＩＷ,并用Ｔ７ＲＮＡ聚合酶／启动子系统对其进行了体外表达。经过对转录产物片段大小及运用Ｎｏｒｔｈｅｒｍｂｌｏｔ鉴定,证明了获得了不含修饰核苷酸的大鼠肝ｔＲＮＡ＾Ｉｌｅ。生物学活性检测显示：合成基因体外转录产物氨基酰经活性是天然ｔＲＮＡ的４０％,提示修饰核苷酸在哺乳动物Ｉｌｅ－ｔＲＮＡ合成酶的识别过程中起重要作用。     

tDNA^Trp识别位碱基的研究

识别位碱基Ｇ７３,为ｔＲＮＡ＾Ｔｒｐ的主要个性元件之一,ｔＤＮＡ＾Ｔｒｐ－ＮＣＣｒＡ的氨酰化活力测定及圆二色谱均表明在相同的ｐＨ条件下,识别位碱基的改变将影响到ｔＲＮＡ３′端的构象,而具有同一识别位碱基的ｔＤＮＡ＾Ｔｒｐ在不同ｐＨ条件下,亦显示出不同的构象及氨酰化活力,ｔＤＮＡ＾Ｔｒｐ的研究表明,是ｔＲＮＡ的构象而不是碱基本身决定了ｔＲＮＡ与其相应合成酶之间的精确识别。