ITS序列同源性在苏云金芽孢杆菌分型中的应用研究

ＰＣＲ扩增了苏云金芽孢杆菌９个亚种的１６Ｓ－２３Ｓ ｒＲＮＡ基因转录间隔（ＩＴＳ）片段,它们的长度均为１４４碱基;序列同源性分析结果批出这９个亚种及其它亚种的ＩＴＳ序列高度相似,说明１６Ｓ－２３Ｓ ｒＲＮＡ基因的ＩＴＳ序列不适于苏云金孢杆菌亚种的分型。     

烟曲霉rRNA基因ITS区的克隆测序分析

对烟曲霉ｒＲＮＡ基因内转录间区（ＩＴＳ区）进行了克隆测序,并将之与其他几种常见曲霉的相应序列进行了比较。发现３株烟曲霉的ＩＴＳⅠ区完全相同,而其中１株烟曲霉的ＩＴＳⅡ区与一条已知相应序列仅有２个碱基的变异。提示烟曲霉ｒＲＮＡ基因的两个ＩＴＳ区序列均十分保守,而且与黄曲霉、黑曲霉、土曲霉及构巢曲霉的相应序列相比较,均有一定程度的变异。     

荧光原位杂交法检测双歧杆菌

检验荧光原位杂交法在双歧杆菌属鉴定方面的调途。方法：采用对数生长期的８株双歧杆菌和１０析其他厌氧、需氧杆菌在相同的条件下分别与双歧杆菌属特异性１６ＳｒＲＮＡ寡核苷酸基因探针和细菌界通用１６ＳｒＲＮＡ寡核苷酸基因探针在载玻片上进行原位杂交,在荧光显微镜下观察杂交结果,拍摄同一视野的荧光显微镜照片和相关显微镜照片,计算杂交率。结果所用的双歧杆菌菌株均与两种基因探针杂交,在荧光显微镜下发校菌与黑暗背景对     

厌氧微生物研究的新进展（续）

厌氧微生物研究的新进展（续）凌代文（中国科学院微生物研究所,北京１０００８０）ｒＲＮＡ／ＤＮＡ和１６ＳｒＲＮＡ序列的测定已表明在系统发育上肠球菌和链球菌属、乳球菌属为同等相连群。当今使用反转录酶法分析测定１６ＳｒＲＮＡ全序列指示出肠球菌在系统发育上更...     

蓖麻蚕rDNA基因核骨架结合区在酵母中的自主复制功能

蓖麻蚕核糖体ＲＮＡ基因（ｒＤＮＡ）５′－非转录间隔区有长约１ｋｂ的核骨架结合区ＳＡＲ（ｓｃａｆｏｌｄ－ａｓｓｏｃｉａｔ－ｅｄｒｅｇｉｏｎ）［１］。本文对该ＳＡＲ元件的酵母自主复制功能进一步研究,证明该ＳＡＲ５′端６８８ｂｐ含有１２个ＡＣＳ（ＡＲＳ的核心序列）同源序列,但无ＡＲＳ活性,而其３′端仅３个ＡＣＳ同源序列,但对酵母的转化率比全片段还高４０～５０倍。体外结合实验证明,蓖麻蚕ｒＲＮＡ基因的ＳＡＲ能专一地同酵母核骨架结合,提示ＡＲＳ的功能体现与核骨架结合紧密相关。ｒＲＮＡ基因ＳＡＲ与ＡＲＳ的功能在进化上可能是很保守的。在此基础上可进一步分析ＳＡＲ中与ＤＮＡ复制相关的正调及负调元件。     

16S rRNA序列分析法在大气微生物检测中的应用

随首微生物核糖体数据库的日益完善,１６Ｓ ｒＲＮＡ序列分析技术已应用于海洋、湖泊和土壤等环境微生物多样性的分析,但尚未见其在大气微生物菌群分析中的应用报道。本研究选择５株大气中采集分离的菌株,通过细胞１６Ｓ ｒＲＮＡ通过引物ＰＣＲ扩增其对应序列,直接对ＰＣＲ产物进行测序,分析鉴定其对应细胞的种属,并将该结果同细胞表型鉴定、全自动微生物分析仪以及相色谱分析结果加以比较。结果表明１６Ｓ ｒＲＮＡ序列分     

利用同源重组提高外源GUS基因在植物组织中表达

将１８Ｓ ｒＲＮＡ基因的部分片段,或烟草的核骨架结合序列（ＳＡＲｓ）作为同源序列与外源ＧＵＳ基因作为报告基因构建成用于基因打靶载体,以枪或农杆菌介导转化到拟南芥的根组织中,检测ＧＵＳ基因瞬间表达的结果显示,两种同源基因序列均可提外源ＧＵＳ基因的表达。     

超慢生大豆根瘤菌2062菌株的部分16SrRNA序列测定

采用ＰＣＲ（聚合酶链式反应）的方法扩增并克隆了超慢生大豆根瘤菌（ＥＳＧ,ｅｘｔｒａ－ｓｌｏｗｌｙ－ｇｒｏｗｉｎｇ ｓｏｙｂｅｎ ｒｈｉｚｏｂｉａ）２０６２菌株的１６Ｓ ｒＲＮＡ的部分区段,然后进行核苷酸序列测定和分析。比较了测定的２６４个碱基序列与已经发表的其他相关根瘤菌序列的差异,并通过计算机遗传距离进行聚类分析。结果表明,ＥＳＧ与Ｂｒａｄｙｒｈｉｚｏｂｉｕｍ ｊａｐｏｎｉｃｕｍ、Ｂ．ｅｌｋａｎ     

结核分支杆菌耐链霉素分子机制的研究进展

链霉素（Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｉｎ,ＳＭ）是一线抗结核药物,本文概要地介绍了结核分支杆菌耐链霉素的分子机制。最近的研究认为大多数结核分支杆菌分离株耐ＳＭ是由于核糖体蛋白Ｓ１２编码基因（ｒｐｓＬ）和（或）１６ＳｒＲＮＡ编码基因（ｒｒｓ）突变所致,少数菌株的耐药机制尚需进一步研究     

草鱼(Ctenopharyngodon idellus)线粒体DNA控制区及其两侧tRNA基因的克隆与结构分析

动物线粒体ＤＮＡ控制区是线粒体基因组复制与基因表达的最主要的调控区．采用杂交和测序的方法对草鱼线粒体ＤＮＡ控制区进行定位、克隆并测定了控制区及其旁侧的ｔＲＮＡＰｈｅ、ｒＲＮＡＰｒｏ和ｒＲＮＡＴｈｒ三个基因的序列,与多种脊椎动物的相应序列进行了比较,并进行了结构分析．草鱼线粒体控制区全长９２７ｂｐ,含有与酵母和爪蟾线粒体启动子相似的序列,其ＣＳＢⅠ、ＣＳＢⅡ和ＣＳＢⅢ序列与其他几种动物的ＣＳＢ比较相当保守,ＴＡＳ与其回文基序可形成稳定的茎环结构,成为Ｈ－链复制的终止信号．草鱼线粒体ｔＲＮＡＰｈｅ、ｔＲＮＡＰｒｏ和ｔＲＮＡＴｈｒ可折叠成三叶草形二级结构,其基因具有许多不同于细胞质ｔＲＮＡ基因的结构特点,可能反映了线粒体ｔＲＮＡ与线粒体核糖体具有不寻常的作用方式     

蓖麻蚕rDNA基因核骨架结构区在酵母中的自主复制功能

蓖麻蚕核糖体ＲＮＡ基因（ｒＤＮＡ）５＇－非转录间隔区有长约１ｋｂ的核骨架结合区ＳＡＲ。本文对该ＳＡＲ元件的酵母自主复制功能进一步研究,证明该ＳＡＲ ５＇端６８８ｂｐ含有１２个ＡＣＳ（ＡＲＳ的核心序列）同源序列,但无ＡＲＳ活性,而其３＇端仅３个ＡＣＳ同源序列,但对酵母的转化率比全片段还高４０￣５０倍。体外结合实验证明,蓖麻蚕ｒＲＮＡ基因的ＳＡＲ能专一地同酵母核骨架结合,提示ＡＲＳ的功能体现与核骨架结     

几种腹蛇12S rRNA和Cyt b基因片段序列的初步研究

首次对我国几种腹属蛇类的１２Ｓ ｒＲＮＡ和Ｃｙｔ ｂ基因的部分序列进行了测定。１２Ｓ ｒＲＮＡ基因片段序列结果揭示：中介蝮有较大的种下分化。本文为蝮属蛇类的分子系统学研究提供了一些资料。     

豌豆5SrRNA的cDNA克隆、全序列及结构特征分析

以赤霉素（ＧＡ）处理后的Ｇ２豌豆为材料,构建了一个２．０×１０６的ｃＤＮＡ文库,用随机筛选法从该ｃＤＮＡ文库中得到一个完整的ｃＤＮＡ．其中１１１５ｂｐ全序列分析表明,它编码了豌豆５Ｓ核糖体ＲＮＡ（５ＳｒｉｂｏｓｏｍａｌＲＮＡ,５ＳｒＲＮＡ）,基因内部存在着与核糖体蛋白Ｌ５及５ＳｒＲＮＡ结合蛋白（５ＳｒＲＮＡＢｉｎｄｉｎｇＰｒｏｔｅｉｎ）同源的区段,这些同源区段是蛋白与ＲＮＡ结合的位点．基因内部还存在着大量的重复序列．     

虫草多型现象的5.8S rDNA和ITS2序列测定研究

新定名的甘肃虫草Ｃｏｒｄｙｃｅｐｓ ｇａｎｓｕｅｎｓｉ与冬虫草Ｃｏｒｄｙｃｅｐｓ ｓｉｎｅｎｓｉ形态相似。蛹虫草Ｃｏｒｄｙｃｅｐｓ ｍｉｌｉｔａｒｉｓ具有拟青霉型（Ｐａｅｃｉｌｏｍｙｃｅｓ－ｔｙｐｅ）和轮枝孢型（Ｖｅｒｔｉｃｉｌｌｉｕｍ－ｔｙｐｅ）两类无性型。此研究对５．８Ｓ ｒＲＮＡ基因及ＩＴＳ２间区ＤＮＡ序列的分析结果表明,甘肃虫草和冬虫夏草的ＤＮＡ序列相同,属于同一种;蛹虫草的两类无性型具有     

从ITS序列探讨青藏高原特有植物华福花属的亲缘关系

对青藏高原特有的濒危植物华福花（Ｓｉｎａｄｏｘａ ｃｏｒｙｄａｌｉｆｏｌｉａ Ｃ．Ｙ．Ｗｕ，Ｚ．Ｌ．Ｗｕ ｅｔ Ｒ．Ｆ．Ｈｕａｎｇ）的核糖体ＤＮＡ中的内转录间隔区（ＩＴＳ０序列及５．８ＳｒＲＮＡ基因的序列进行了测定。同川续断目和五加目有关类比较及分支分析表明华福花属与五福花属（Ａｄｏｘａ Ｌ．）近缘，不支持它可能与五加目或败酱科有亲缘关系的假设。尽管形态上它与五福花属分化十分明显，便ＩＴＳ碱基分     

类似S-层蛋白的苏云金芽胞杆菌伴胞晶体蛋白基因的克隆

芽胞杆菌CTC菌被鉴定为苏云金芽胞杆菌,鞭毛血清型H2,幕虫亚种;产生卵圆形伴胞晶体,伴胞晶体蛋白为100kD;测定了该蛋白 N－末端序列,该序列与炭疽芽胞杆菌的细胞表面S－层蛋白具92－93％相似性,根据Southern杂交制作了该晶体蛋白基因ctc所在位置的限制性酶切图谱,分别克隆了该基因5’和3’端所在2．9kb XbaI片段和3．1kb Cla I DNA片段,彼此间具0．6kb重叠,通过拼接获得含完整ctc基因的克隆,含该基因的大肠杆菌与表达S－层蛋白的大肠杆菌具相似生长特征,初步表明CTC菌株的伴胞晶体由细胞表面S－层蛋白组成,苏云金芽胞杆菌区别于蜡状芽胞杆菌和炭疽芽胞杆菌的唯一标准是能形成伴胞晶体,由于S－层是细胞表面的结构成分,本文对CTC菌株鉴定为苏云金芽胞杆菌以及伴胞晶体作为苏云金芽胞杆菌鉴别的唯一标准提出了质疑。     

16S rRNA序列分析法在医学微生物鉴定中的应用

１６Ｓ ｒＲＮＡ序列分析作为微生物系统分类的主要依据已得到了广泛认同,随着微生物核糖体数据库的日益完善,该技术成为细菌分类和鉴定的一个有力工具。本文概述了 １６５ ｒＲＮＡ序列分析法的技术步骤以及该技术在医学微生物研究中的应用,总结了目前文献报导的各种致病微生物种属特异性 １６５ ｒＲＮＡ引物和探针序列,同时分析了该技术在应用中存在的一些问题。     

苏云金芽孢杆菌的特异性结合蛋白研究

用3 2 P分别标记 3 0 8bpcry1A上游和 65 0bpcry1C上游片段 ,并将标记后的DNA与不同苏云金芽孢杆菌菌株的细胞粗蛋白进行凝胶阻滞反应。结果表明 ,cry1A和cry1C上游均能被苏云金芽孢杆菌库斯塔克亚种 (Bacillusthuringinensis subsp .kurstaki)的细胞粗蛋白特异性结合 ,而同一cry1基因上游序列可被不同多肽特异或非特异性竞争结合 ,不同的cry1基因上游序列也能同时被一种蛋白结合。说明苏云金芽孢杆菌某些特异细胞蛋白参与了cry1基因上游序列的转录调控作用 ,而不同的调节因子可能会竞争同一结合位点。库斯塔克亚种和鲇泽亚种 (B .thuringinensis subsp .aizawai)所含特异细胞蛋白在种类和作用上都有差异。     

假单胞菌属的分类现状

随着ＤＮＡ－ｒＲＮＡ杂交与１６ＳｒＲＮＡ测序等技术的使用,原来假单胞菌属的种除少数外,陆续分别转入重新建立的近１２个新菌属中,因此在分类命名上出现较大变动。本文了近１０年来有关种的这些变化。     

苏云金芽胞杆菌杀蚊基团在鱼腥藻中克隆和表达的初步研究

将苏云金胞杆菌以色列亚种的杀蚊晶体蛋白基因ｃｒｙ１１Ａ亚克隆到大肠杆菌－蓝藻的穿梭质粒载体ｐＥＲＬ２５Ｃ然后用三亲本杂交的方法将重组质粒转移到一种具有固氮能力且可被蚊幼虫蚕食的鱼腥藻（Ａｎａｂａｅｎａ）ＰＣＣ７１２０中,Ｓｏｕｔｈｅｒｎｂｌｏｔ及Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ分析表明ｃｒｙ１１Ａ基因在鱼腥藻ＰＣＣ７１２０中得以克隆和表达,但生物测定未能检测到转基因鱼腥藻对库蚊（Ｃｕｌｅｘ）的毒性,可能是因