人新基因hbrp的染色体定位及其对TPK活性的抑制作用（简报）

hbrp(Human BSP-Related Protein)是我们实验室最近在睾丸组织中克隆的一个人与BSP（bovine seminal plasma)蛋白相关的新基因。为了将有关该新基因信息与现有人类基因组转录图相整合,我们应用荧光原位杂交(fluorescent in situ hybridizationFISH)法进行了该基因的人染色体基因定位,结果成功地将hbrp基因定位在人19号染色体长臂1区3带上。hbrp基因是在对BSP蛋白功能的研究过程中发现并克隆的,其同源性分析发现,与其序列最相近     

基因在染色体上的定位

概述了染色体的发现和基因在染色体上定位的荧光原位杂交技术,放射杂交体法,重叠群拼接和染色体步移及基因定位克隆的常用方法以及基因定位的应用。     

Bmrbp1基因在家蚕染色体上的定位(简报)

果蝇是生物性别调控的重要参考模式生物之一,其性别决定是由X染色体与常染色体的比值（X：A）所决定。此性别决定初级信号通过下游基因sex-lethal（sxl）、transformer（tra）、doublesex（dsx）等选择性拼接的级联调控作用,最终使果蝇发育为雌性或雄性。rbp1是参与果蝇雌特异性拼接的一个重要拼接因子,属于丝氨酸精氨酸富集蛋白家族,是常染色体上的单拷贝基因,它通过调节dsx前体mRNA的选择性拼接来调控果蝇的性别。[第一段]     

人细胞生长相关5个新基因的染色体定位及其基因结构

基因的染色体定位对我们研究基因相互关系、基因的组织与进化及理解基因与疾病关系具有重要的意义。本文采用RH-PCR方法及生物信息学方法对PP3898、PP1158、PP753、SP260、HC56等5条人细胞生长相关新基因进行染色体定位,并分析了其基因结构。PP3898及PP1158定位于19p13.3,PP753及SP260定位于1q21.1,HC56定位于17p13.3。PP3898含有19个外显子和18个内含子,可读框为2565bp;PP1158含有7个外显子和6个内含子,可读框为1218bp;SP260含有10个外显子和9个内含子,可读框为690bp;HC56为单外显子,可读框为3141bp。另外,对染色体定位获得的信息进行了分析。 Abstract:Five novel human genes related to cell growth control were newly isolated and identified by high-throughput functional screening.In this paper,the chromosomal localization of these five genes is reported.Radiation hybrid mapping and in silico mapping,and their genomic organization were analyzed respectively.PP3898 and PP1158 were assigned to chromosome 19p13.3,SP260 and PP753 to chromosome 1q21.1,and HC56 to chromosome 17p13.3.PP3898 contains nineteen exons and eighteen introns,PP1158 seven exons and six introns,SP260 ten exons and nine introns,and HC56 only one exon.The implications of chromosomal localization are discussed.     

ZFX基因同源序列在黄鳝基因组中的检出及其染色体定位

以大熊猫锌指蛋白基因Zfx为探针 ,在黄鳝基因组DNA中检测到一条长约 9 5kb的杂交带。依据哺乳类和爬行类动物锌指蛋白基因 (ZFX/Zfc)编码第 7～ 13个锌指结构的DNA序列保守性设计引物 ,在黄鳝基因组DNA中仅扩增到一条 5 12bp的DNA片段。将此片段克隆至载体 pBS中 ,从雌性、雄性个体中分别挑选 4个含有插入片段的白色克隆进行测序。测序结果表明 ,这些克隆中插入片段的核苷酸序列一致。该DNA片段在核苷酸水平上与人类ZFX和ZFY分别具有 88%和 87%同源性 ,但其与美洲鳄鱼Zfc的同源性可达 90 % ,而在氨基酸水平上则分别存在 95 9%、95 9%和 93 5 %的同源性 (170个氨基酸 )。该基因命名为黄鳝锌指蛋白基因Zfa ,并运用FISH将其定位于黄鳝 1号染色体 ,距离着丝粒的相对位置为 6 0 1± 0 38。通过进一步研究证明 ,黄鳝 1号染色体上存在有真兽类哺乳动物X染色质同源的保守片段 ,该保守片段有可能就是哺乳动物X染色体起源和进化的原始物质基础之一。应用哺乳动物X染色体连锁的其他基因在鱼类开展染色体比较定位研究 ,将有望促进脊椎动物性染色体进化的深入研究     

人类GABARAPL2基因的染色体定位

为了确定人类GABAA受体相关蛋白相似蛋白2基因在染色体上的位置,根据该基因cDNA的3′非翻译区序列设计一对RH定位引物,以人／鼠体细胞腹辐杂种板Genebridge4(GB4)panel和G3panel试剂盒中的杂种细胞株基因组DNA为模板,在一定的条件下进行PCR扩,琼脂糖凝胶电泳结果分别插入Sanger和Stanford网站的RH定位分析系统进行统计学分析。结果PCR法在一些杂种细胞株中扩增出特异的目的片段,并经测序验证了其准确性。凝胶电泳结果在Sanger网站统计分析表明该基因与16号染色体上的AFM340ye5,AFM292xh5,AFM320wf1,AFMa066xd5,AFM249xc5位标紧密连锁;在Stanford网站统计分析表明该基因片与16号染色体上的SHGC－1457,SHGC－53415,SHGC－6782,SHGC－2228,SHGC－14629位标紧密连锁,LOD值均大于3。整合分析该染色体区带的物理图、遗传图及细胞图谱后,最终将基因定位在染色体16q22.3区带的D16s3016和D16s515位标之间。结论放射杂交定位法是一种新颖便捷的基因定位的方法,通过此法成功地进行了人类GABAA受体相关蛋白相似蛋白2基因的定位。     

转基因猪外源基因染色体定位的研究

转基因猪外源基因染色体定位的研究ＥＸＯＧＥＮＯＵＳＧＥＮＥＬＯＣＡＬＩＺＡＴＩＯＮＯＮＣＨＲＯＭＯＳＯＭＥＳＯＦＴＲＡＮＳＧＥＮＩＣＰＩＧ关键词基因定位染色体原位杂交转基因猪ＫｅｙｗｏｒｄｓＧｅｎｅＬｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ,Ｉｎｓｉｔｕｈｙｂｒｉｄ...     

用染色体畸变品系对果蝇调控基因E(ω~a)的定位

在果蝇中,杏黄色眼基因w~a和它的野生型白眼等位基因w的区别在于前者的转录单位中插入了反转录病毒样转座因子copia。半显性突变基因E(w~a)以反式方式降低w~a的活性。对多余翅脉基因px,E(w~a)和翅腋具黑点基因sp的遗传重组分析进一步确定了E(w~a)与sp的重组图距为0.2图距单位,并将E(w~a)定位于第二染色体右臂的2—106.8处。为了对E(w~a)进行细胞学的基因定位,4个Y;2易位品系,1个1;2易位品系和3个2R缺失品系与适当的E(w~a)品系进行杂交,并对其雄性子代进行复眼眼色和翅腋黑点的检查。结果表明E(w~a)位于第二染色体右臂60B的端粒端。 我们用r射线诱变获得了一个E(w~a)突变体和两个sp的突变体,并检查了它们的唾腺染色体。前者为E(w~a)的回复子,一段来源不明的染色体片段插入在6085—13的位置,很可能在60B8—9的位置上。这个位置就是E(w~a)的座位。后者在60C1—2的位置上都看到了染色体的断裂点,表明该位置为sp的基因座位。 综合细胞学基因定位和遗传重组基因定位的资料,E(w~a)被定位于6085—13的位置,很可能在60B8—9的位置,它位于sp基因的左侧,二者相距很近。     

转基因猪染色体原位杂交外源生长激素基因定位

近些年来随着原位杂交技术的不断改进,该技术已广泛用于染色体的基因定位。非放射性标记探针的应用使基因定位变得更加简单易行,从而有可能对动物的转基因进行定位研究。本文首次采用胶体金标记药盒（Anti-digoxigenin-gold)和银加强试剂（Silver enhance-ment reagents)的非同位素原位杂交技术对转基因猪外基因进行了定位研究。如Fig.1所示：表达质粒pSMTPGH含有载体pUC19,羊启动子MT011和猪生长激素PGH基因。选5头带有pSMTPGH的转基因猪,分别制备含有染色体DNA的杂交膜。用BglII和Smai对pSMTPGH进行完全酶切,收集0．9kb片段作为探针,以dig-11-dUTP进行标记。探针与DNA杂交后,用光学显微镜检查。选择分散良好、显影银颗粒清楚的玻片进行摄影记录（Fig.2)。对染色体上的显影银颗粒进行统计分析,参照家猪的染色体标准带型,确定外源PGH基因整合位点。Fig.3为4104号转基因猪染色体上的银颗粒分布情况。对5头转基因猪外源PGH基因定位的结果见Table1。探针的合理设计是外源基因定位研究成功的关键。本实验所用探针必须地与外源PGH基因杂交,而不受内源PGH基因的影响。我们设计的探针符合这一要求。采用dig11－dUTP标记探针,抗体金显色,银加强试剂放大杂交信号,在光学显微镜下可以直接观察杂交位点处的显影银颗粒,但于对实验进行统计分析。估计数据表明：转基因猪的外源PGH基因随机整合在所有染色体上,但在13号染色体上的机率略高。     

转pGH基因猪外源基因染色体定位研究

应用地高辛标记探针对转pGH基因(猪生长激素基因)猪染色体进行原位杂交,经胶体金抗体、银增强放大系统检测外源pGH基因在染色体上的整合位点。研究表明,转基因阳性个体间外源基因整合位点存在差异,但对个体而言,外源基因总是集中分布于某一特定的染色体上。本研究将为探究外源基因整合位点与其表达效率的关系及今后定点整合的研究提供理论指导。     

人类新基因cegl cDNA的克隆及表达研究

CLECT and EGF-1ike domain contained Gene 1(cegl)基因是用电子克隆的方法获得的人类新基因.该基因定位在人类的第14号染色体上,是一个单一外显子的基因.cegl基因的cDNA长度为2050bp,通过生物信息学方法预测它包含一个1340bp的完整阅读框架,编码一个490个氨基酸的蛋白,含有CLECT、EGF-like结构域各一个.以cegl基因全长编码区为探针的整体原位杂交结果显示该基因的小鼠和鸡的同源基因在各自早期胚胎头部中特异表达,并且在不同时期胚胎神经系统增殖迅速的部位中有大量的表达.RT-PCR结果显示该同源基因在小鼠成体各组织中广泛分布.这提示cegl基因可能与头部生长发育有密切关系,并且对维持成体各组织的正常功能起到重要的作用.对cegl基因在胚胎发育的时间和空间表达模式的研究将有助于进一步深入地揭示它在人脑的正常生长发育中的作用.     

大麦细胞核及染色体肌球蛋白免疫细胞化学定位

对去除DNA、组蛋白和大部分非组蛋白的大麦(Hordeum vulgare)细胞核和染色体间接免疫荧光标记实验结果表明:抗肌球蛋白抗体的荧光标记弥散分布在整个细胞核和染色体上;进一步应用免疫胶体金技术分析肌球蛋白在细胞核和染色体的分布情况,发现在染色体中散布着大量的胶体金颗粒;间期细胞核中胶体金颗粒主要分布在核仁和染色质中。上述实验结果表明:肌球蛋白是细胞核及染色体非组蛋白组成成分。本文还对肌球蛋白在细胞核和染色体中的分布规律进行了讨论。     

氢化可的松对人白细胞趋化移动的抑制

应用改良的 Boyden 小室法发现人白细胞的随机移动和趋化移动(GhtM)呈明显的昼夜节律,0∶00移动最快,8∶00移动最慢,两者相差P<0.01。氢化可的松(F)对 GhtM 有明显的抑制作用,生理浓度 F10~(-9)—10~(-7)mol/L 之间,抑制效应呈剂量依赖性强,糖皮质激素受体(GR)的竞争性拮抗剂 RU38486可完全逆转这抑制效应。超过10~(-5)mol/L 以上的药理剂量F 对 GhtM 的抑制更为明显,这种抑制可部份地被 RU38486所逆转。本实验结果提示,糖皮质激素(GG)对白细胞功能存在着受体介导的生理调节,药理剂量 GG 对 ChtM 的明显抑制是这种激素抗炎机制之一,这种作用有可能部分地通过低亲和力 GC 特异结合部位所介导。     

固氮酶结构基因在联合固氮菌Klebsiellaplanticola19—1细胞中的定位

用Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍ ｏｎｉａｅｎｉｆＨＤＫ 为探针与Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ １９－１ ＤＮＡ Ｓｏｕｔｈｅｒｎ 杂交表明,Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ １９－１ 中存在与ｎｉｆＨＤＫ 同源的片段。用凝胶内溶菌及电场倒转技术检测在Ｋ．ｐｌａｎｔｉｃｏｌａ １９－１ 中存在一大质粒。用Ｋ．ｐｎｅｕｍ ｏｎｉａｅ ｎｉｆ ＨＤＫ 探针与大质粒ＤＮＡＳｏｕｔｈｅｒｎ 杂交证明固氮酶结构基因定位于大质粒     

东莨菪碱抑制呼吸效应及其机制

本文给兔侧脑室、犬椎动脉以及静脉注射东莨菪碱，从呼吸频率、潮气量、通气量及血气分析多项指标皆观察到东莨菪碱有明显抑制作用，且存在剂量依赖关系。东茛菪碱尚能拮抗毛果靶香碱的呼吸效应，但不能拮抗６β－乙酰氧基去甲托烷呼吸抑制效庆，反而起协同作用。上述结果提示示东莨菪碱引起呼吸抑制可能与民呼吸中枢Ｍ１受体有关。     

正丁酸钠对人胃腺癌细胞染色体数目和DNA含量的影响

培养的人胃腺癌MGc 80-3细胞经过正丁酸钠处理7天后,生长抑制率达50.7%,约有90%的细胞形态发生分化,其超微结构亦有显著改变。而且,在染色体数目上,超二倍体细胞由对照组的78%增加到实验组的96%,超三倍体和超四倍体细胞则分别从6%和14%下降至2%。同时应用~3H-TdR放射自显影和福尔根细胞光度法测定未标记细胞(G_1期)DNA含量,结果显示实验组比对照组降低了。而且在实验组的同一制片中,未分化细胞DNA含量平均为超六倍体值(DI=3.67和3.56),其中90%的细胞超过6C;分化细胞DNA含量则平均为近四倍体值(DI=2.03和1.99),其中近60%的细胞少于4C。两者差异统计显著,表明形态分化的人胃腺癌细胞的遗传物质含量明显减少,但这些细胞并非就是正常二倍体细胞。     

人白血病抑制因子基因在巴斯德毕赤酵母中的表达

将 575bp的人白血病抑制因子基因克隆到表达载体pPICZαA上 ,构建成重组质粒pPICZαA hLIF。pPICZαA hLIF经SacI酶切使之线性化后转化到巴斯德毕赤酵母细胞X 33中。转化子经Mut表型筛选和PCR分析鉴定后 ,利用甘油增菌和甲醇诱导 ,实现了hLIF基因在毕赤酵母系统中的表达。SDS PAGE检测和Westernblot分析结果表明表达产物的分子量约为58 5kD ,与天然hLIF大小相近 ,并且具有免疫原性。凝胶薄层扫描分析显示 ,重组hLIF约占上清总蛋白的 32 8%。生物活性测定结果表明 ,表达产物能够抑制小鼠畸胎瘤细胞F9克隆的形成     

PATTERNS OF PUFFING ACTIVITY AND CHROMOSOMAL POLYMORPHISM IN DROSOPHILA SUBOBSCURA. IV. EFFECT OF INVERSIONS ON GENE EXPRESSION

We have observed that, contrary to a common assumption, the puffing patterns manifest in the salivary chromosomes of Drosophila subobscura are modified by chromosomal inversions as well as by genic content. An inversion effect is apparent in the E and A chromosomes of five strains coming from four different natural populations. An effect due to the geographical location of the populations is also detected in the J and O chromosomes. The chromosomal and geographic effects are distinguishable but not contradictory. Indeed, a statistical test using the DK² coefficient of distance shows that, for a given chromosomal arrangement, strains of different geographic origin exhibit puffing patterns significantly different; these patterns are, however, more similar to each other than they are to those of strains carrying different chromosomal arrangements of the same chromosome.     

TIME-DEPENDENT INHIBITORY EFFECT OF LIPOPOLYSACCHARIDE INJECTION ON PER1 AND PER2 GENE EXPRESSION IN THE MOUSE HEART AND LIVER

Lipopolysaccharide (LPS) is a pathogen-associated large molecule responsible for sepsis-related endotoxic shock, and the heart is one of the most common organs adversely affected. LPS is reported to increase serum TNFα levels and reduce Per1 and Per2 gene expression. Therefore, in this experiment, we determined the time-dependent effects of LPS on heart rate (HR) and circadian gene expression in the mouse heart and liver. HR of the LPS group was significantly elevated 2 and 8 h after injection compared to the control group. A significant percent increase in HR was observed at ZT6, 12, and 18. LPS increased Tnfα mRNA expression in the heart and liver at ZT6, 18, and 24. A time-dependent effect of LPS on reduction of Per1 and Per2 gene expression was also observed in the heart and liver. In order to examine the effect of LPS on cell damage, we examined apoptosis-related gene expression after LPS injection. Bax mRNA expression level of the LPS group was higher than that of the control group 8 and 26 h after injection. On the other hand, Bcl2 mRNA expression level of the LPS group was lower than that of the control group 2 and 26 h after injection. Dexamethasone strongly attenuated the LPS-induced increase of serum TNFα without significant change in Per1 and Per2 gene expression in the heart. In conclusion, the present results demonstrated that LPS exerts a time-dependent inhibitory effect on Per1 and Per2 gene expression in the heart and liver. The chronopharmacological lethal effect of LPS may be related to the time-dependent increase of serum TNFα level and simultaneously high level of Per2 gene expression in the heart and liver between ZT12–18. Taken together, chronopharmacological effect of LPS may be related to not only sickness behavior syndrome and mortality, but also circadian rhythm systems. (Author correspondence: shibatas@waseda.jp)