中国汉族apoB 基因EcoRI、XbaI、MspI、Ins/Del 及3'端VNTR 位点的多态性研究

目的:apo B基因多态性对群体遗传学、心血管疾病等研究领域有着重要的价值,本文分析了中国汉族人群中apoB基因EcoRI、XbaI、MspI、Ins/Del及3’端VNTR等5个多态性位点的等位基因频率分布,为相关研究提供基础资料。方法:应用PCR-RFLP技术分析EcoRI、XbaI、MspI等3个位点的多态性分布,应用常规PCR方法分析Ins/Del及3’端VNTR等2个位点的多态性分布。结果:1人群中EcoRI位点有E+及E-两种等位基因,基因频率分别为87.1%和12.9%;XbaI位点有X+及X-两种等位基因,基因频率分别为6.1%和93.9%;MspI位点有M+及M-两种等位基因,基因频率分别为97.1%和2.3%;Ins/Del位点有Ins及Del两种等位基因,基因频率分别为70.7%和29.3%;3’端VNTR位点有16种等位基因,其中以HVE34与HVE36最为常见,频率分别为33.4%与21%。2连锁不平衡分析表明,5个位点间除XbaI与Ins/Del间存在较弱的连锁不平衡(D’=0.911,r2=0.175),其余点位间无显著连锁不平衡。结论:数据比对表明,5个多态性位点的基因型和等位基因频率存在民族、种族差异,因此在apo B基因相关研究中应充分考虑遗传背景造成的影响。     

广东汉族人载脂蛋白B(apoB)基因3′端VNTR的遗传多态性研究

随机抽提100例无血缘关系的广东汉族人的血痕DNA,用PCR法扩增载脂蛋白B(apolipoprotein B apoB)基因3′端的VNTR,共检出19个等位基因,片段大小分布在510～1200bp之间,等位基因频率为0.005—0.195,杂合度为88.80％,父权排除率为0.6395,其等位基因数目及频率分布均与英国白种人的有差异。家系分析表明扩增片段按孟德尔方式遗传。本实验证实了apoB基因3′端VNTR的高度多态性和高度杂合性。     

中国延边朝鲜族和延边汉族apoB,D17S30 VNTR多态性研究

应用聚合酶链反应(PCR) 法对中国延边朝鲜族和延边汉族apoB和D17S30 VNTR研究发现,中国延边朝鲜族和延边汉族等位基因频率总体分布具有显著性差异( P < 0105);apoB和D17S30 位点 VNTR 在中国延边朝鲜族和延边汉族中的观察杂合性、多态信息含量、个体鉴别力均大于017;中国延边朝鲜族和延边汉族中 D17S30 VNTR位点分别以 A3 和 A1 的频率为最高。结果表明,apoB和D17S30 VNTR 位点在中国延边朝鲜族和延边汉族中的等位基因频率分布具有很强的多态性,在研究中国延边朝鲜族起源、变迁以及与其他各民族间亲缘关系等方面具有广泛的应用价值,适用于中国延边朝鲜族和延边汉族的个体识别和亲子鉴定。     

一组中国河南汉族群体血管紧张素转换酶基因多态性与血清酶活性研究

为研究中国汉族群体血管紧张素转换酶(angiotensin-1 converting enzyme,ACE)活性、基因多态性分布及相互关系,用分光光度法检测496例汉族个体血清酶活性,PCR后的限制性酶切片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测血管紧张素转换酶基因启动子区A-5466C、T-3892C、A-240T及编码区T1237C、G2215A、G2350A共6个SNP位点,以及第16内含子的A／u片段插入／缺失(I／D)和3’端4656(CT)。共8个多态位点的分布,同时用最大期望值(expectationmaximization,EM)算法估计基因连锁不平衡状态和单倍型结构。结果发现,上述8个多态存在于常见的9个单倍型中,其中两种最常见的单倍型为A(A-T-A-T-G-I-A-3)和B(C-C-T-C-A-D-G-2),A和B在每个位点都不相同。最大简约法分析提示本群体可被分为3个进化簇,Ⅲ簇最有可能由Ⅰ簇和Ⅱ簇产生。ACE基因各位点多态性在个体中的分布与血清中ACE活性有关,组成单倍型A的各等位位点与血清中ACE低活性有关,单倍型B的各等位位点与血清中ACE高活性有关。研究结果提示,本群体中ACE基因存在连锁不平衡,有两种主要的单倍型,单倍型B可能与导致ACE升高的数量性状(QTL)关联,但确定具体的数量性状位点还需绘制精细物理图谱。     

中国汉族人群CYP4F3基因多态性的研究

目的:研究CYP4F3基因单核苷酸多态性(SNP)在中国汉族人群中的分布,为进一步研究该基因群体遗传学特征及与疾病易感性的相关性提供更为详实的数据。方法:对CYP4F3基因进行重测序,构建连锁不平衡模式,选择标签SNP在192例北京和424例广州汉族个体中进行基因分型。结果:CYP4F3基因重测序共检出30个SNP,连锁不平衡分析显示广州和北京地区人群的连锁不平衡模式不同,但选择的8个标签SNP的等位基因和基因型频率分布在2个人群中的差异无统计学意义。结论:中国北京地区汉族与广州地区汉族人群CYP4F3基因多态性无显著差异,但不同种族间存在差异。     

中国汉族人群MASP2基因单核苷酸多态性的连锁不平衡和单体型分析

目的：探讨中国汉族人群甘露糖结合凝集素相关的丝氨酸蛋白酶（MASP2）基因单核苷酸多态性（SNP）的连锁不平衡和单体型,为相关研究提供更为详实的数据。方法：选取30例广州汉族无关个体,用重新测序的方法进行MASP2基因SNP的发掘,构建连锁不平衡（LD）模式,与HapMap公布的其他4个人群数据相比,并选择4个标签SNP（tagSNP）在232例北京汉族个体和291例广州汉族个体中分析MASP2的多态性和单体型。结果和结论：对MASP2的重测序共检测出16个SNP,LD分析显示来自中国不同地区人群的LD模式基本相同,与来自美国和日本的人群存在差异;北京和广州地区汉族人群tagSNP的等位基因和基因型频率分布不存在显著差异。     

中国汉族人群NLRP3基因多态性与结肠癌的相关性研究

该实验研究NLRP3基因多态性与中国汉族人群结肠癌之间的相关性。采用TaqMan检测法对中国汉族人群2084例结肠癌患者和203名正常对照NLRP3的3个位点（rs4925648、rs10754558、rs10925019）进行关联分析,并使用SPSS软件进行单核苷酸多态性分析,比较病例组和对照组等位基因频率、基因型频率及单倍型的差异。结果发现,NLRP3上三个位点基因频率、基因型频率两组间差异不明显（P〉0．05）。rs4925648与rs10925019的LD分析其D’值较大（D’=0．798）。但进一步对两位点的单倍型分析发现其各种组合均无统计学差异。该研究结果提示,NLRP3基因的三个位点与中国汉族人群结肠癌的发生相关性无统计学意义。     

本土绵羊品种GH与IGF-1基因多态性分析

生长性状是绵羊育种中关注的重要性状.GH和IGF-1基因已被证明是影响动物生长发育的重要候选基因.因此,了解中国本土绵羊GH和IGF-1基因的遗传多样性,将为提高本土绵羊的生产效率、制定遗传育种和品种改良措施奠定基础.本研究以本土绵羊品种呼伦贝尔羊、藏羊、湖羊、阿勒泰羊、小尾寒羊和滩羊为主要研究对象,以澳白羊为参考,通...     

ApoE基因多态性与早发冠心病关系的研究

目的:研究载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与早发冠心病CHD)的关系。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)基因分析方法,测定92例早发CHD、237例迟发CHD患者和220名对照者的ApoE基因型;血脂水平按常规方法测定。结果:发现的5种ApoE基因型,分别为E3/3、E2/2、E3/2、E4/3及E4/2。早发CHD组和迟发CHD组ApoE 4/3基因型和ε4等位基因频率均高于对照组(P＜0．01);进一步对两组CHD患者的ApoE多态性进行分析,发现早发组ε4等位基因频率较迟发组高(P＜0．05)。ApoE各等位基因型之间,TC和LDL-C水平之间存在统计学差异(P＜0．05)。结论:ApoE基因多态性与早发CHD的发生发展有关。     

新疆维吾尔族、汉族阿尔茨海默病Neprilysin基因单核苷酸多态性研究

摘要目的：探讨新疆地区维吾尔族、汉族脑啡肽酶（Neprilysin,NEP）基因单核苷酸多态性与阿尔茨海默病（Alzheimer’SdiseaseAD）的关系。方法：对新疆地区维吾尔族、汉族≥50岁8284名人群进行AD流行病学调查,参照ADRDA．NINCDS的标准,选取散发性阿尔茨海默病（sporadicAlzheimer’s disease,SAD）患者209例（AD组）与正常对照220例（对照组）,应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术（PCR）检测NEP基因多态性,采用病例一对照的关联分析方法对NEP基因rs3736187位点进行基因型和等位基因频率分析。结果：（1）新疆维吾尔族、汉族两民族AD组与对照组间NEP基因基因型频率和等位基因频率分布差异均有统计学意义（P〈0．05）。携带T等位基因个体出现AD的危险性高于携带c等位基因的个体（0R=1．981,P〈0．05）。（2）新疆维吾尔族、汉族不同民族之间比较NEP基因基因型频率和等位基因频率分布差异均无统计学意义（P〉0．05）,而在同一民族中AD组和对照组之间比较NEP基因等位基因频率分布差异均具有统计学意义（P〈0．05）。（3）两个年龄分段（〈65岁及≥65岁）之间NEP基因基因型频率和等位基因频率分布差异均无统计学意义（P〉0．05）,而在同一年龄段内部AD组与对照组间等位基因频率分布差异具有统计学意义（P〈0．05）。（4）男性、女性之间NEP基因基因型频率和等位基因频率分布差异均无统计学意义,而在女性AD组与对照组间等位基因频率分布差异有统计学意义（P〈0．05）。结论：NEP基因rs3736187位点基因型频率和等位基因频率在新疆维吾尔族、汉族两民族间的分布相似;NEP基因的T等位基因是SAD的危险因素,在新疆维吾尔族、汉族两民族及女性SAD的发病中起重要作用。     

雌激素受体α(ESR1)基因PvuⅡ和XbaI位点基因多态性与HBV慢性感染的相关性研究

摘要 目的：探讨雌激素受体ESR1(Estrogen Receptor alpha gene)基因的PvuⅡ(rs2234693)和XbaI (rs9340799)两个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点的基因多态性与乙型肝炎病毒HBV(Hepatitis B Virus)慢性感染的相关性,为控制HBV持续感染提供新的思路和科学依据。方法：选择107例慢性乙型病毒性肝炎患者为病例组及107例同期体检的健康人群为对照组,基于高分辨熔解曲线技术(High Resolution Melting,HRM)建立PCR-HRM分子诊断方法,检测其雌激素受体ESR1基因两个SNP位点rs2234693(T>C)和rs9340799(A>G)的基因多态性,并通过基因测序进一步验证,探讨上述两个SNP位点与HBV慢性感染的相关性。结果：病例组和健康对照组ESR1基因rs2234693(T>C)位点的基因型频率比较差异具有统计学意义(P<0.05),而两组间rs2234693位点等位基因频率比较差异没有统计学意义(P>0.05);病例组和健康对照组间ESR1基因rs9340799(A>G)位点的各基因型频率差异具有统计学意义(P<0.05),慢性乙肝病例组GG基因型明显升高,两组间rs9340799位点等位基因频率差异亦具有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示rs9340799位点的G基因可增加HBV慢性感染的发病风险,A基因可降低HBV慢性感染的发病风险。结论：雌激素受体基因ESR1的rs9340799 (A>G)位点的GG基因型和G等位基因可能是HBV感染慢性化的遗传易感基因,GG基因型与HBV的慢性感染具有一定的相关性。     

应用PCR-SSOP技术研究中国汉族、维吾尔族HLA-A基因座基因多态性

人类白细胞抗原（Human Leukocyte Antigen,HLA)基因复合物位于6p21.3,有220多个不同的功能基因,是人类基因组最复杂的遗传多态系统。HLA等位基因的变异在医学、法医学、人类学等领域具有重要的意义。自从1964年以来,HLA分型一直采用经典的微量淋巴细胞毒实验,但该方法是血清学水平的分,不能识别很多特异性的等位基因,而且高质量的抗体也不易获得。从20世纪90年代起,在国家自然科学基金的资助下,首先开展HLAⅡ类位点基因分研究及大规模群体多态性调查,所获得的中国主要民族基因数据已应用于多个领域。相比之下,HLAⅠ类基因数量更丰富,包含了A、B、C、E、F、G和假基因H、J、K、L等10个位点;基因分子结构更复杂,更具多态性。因此,HLAⅠ类DNA分型比HLAⅡ类分型及行多困难。直至目前中国人群HLA－A基因座基因多态性和分布频率的研究尚未充分进行。而任何DNA标记用于遗传分析、法医鉴定等领域之前,必须先进行群体调查,建立不同民族基因数据库,这是不可逾越的基础工作。鉴于此,采用灵敏而非同位素污染的PCR－SSOP基因分型技术,对165个汉族和162个维吾尔族个体的HLA－A基因座多态性进行调查。结果在汉族群体中发现22种等位基因,频率最高的是HLA－A＊1101（19．7％）,其次是＊201（12．72％）;在维族群体中发现22种等位基因,频率最高的是＊2407（17．90％）,等位基因＊0101、＊0201和＊3301的频率均大于10％;HLA－A＊0203、＊0205、＊0302、＊2403和＊3302仅在汉族群体中检出;HLA－A＊0205、＊0211、＊2301、＊2502、＊68012和＊6802仅在维族群体中检出。按照Hardy-Weinberg平衡定律检验,两个民族各等位基因型频率的预期值与实际观察值相吻合（P＞0．05）,证明了所获得汉族、维吾尔族HLA－A位点基因频率具有可靠性;同时也表明各等位基因的遗传特征符合符合孟德尔规律。经计算机统计分析,汉族群体HLA－A基因座杂合度（Heterozygosity,H)、个体识别率（Discrimination Power,DP)和非父排排率（Proba-bility of Paternity Exclusion,EPP)分别为0．9029、0．9776和0．8592;维族群体H、DP和EEP分别为0．9063、0．9379和0．7885。和其他遗传标记（如VNTR、STR、SNP）的单一位点相比,HLA－A具有高度的杂合率、个体识别率和非父排除率。因此,HLA－A等位基因在法医个体识别、亲权鉴定、基因诊断、人类学等领域具有重要的应用价值。     

中国汉族人群人类白细胞抗原HLA不同基因座位间的基因重组

人类白细胞抗原(human leucocyte antigen, HLA)复合体基因座位间的重组、重组热点、连锁不平衡与疾病易感性的关联性研究已成为免疫遗传学与人类后基因组学等研究领域的研究重点与焦点. 本文报道了在中国汉族人群中发现的10例HLA复合体中的基因重组家系. 采集重组家系的2~3代家庭成员的外周血标本, 首先对其HLA-Ⅰ, Ⅱ类区域的5个经典基因位点进行PCR-SSP低、高分辨率基因分型及SBT分析, 然后再进行遗传家系分析研究, 确定HLA基因重组相关位点, 并对重组家系的单体型进行了群体统计学分析. 结果发现, 在10例HLA重组家系中有8例重组发生在HLA-A/Cw位点之间, 其中4例重组发生在A*02-Cw*03单体型中, 2例重组发生在A*24-Cw*03单体型中; 1例重组发生在HLA-B/DRB1位点之间, 还有1例重组发生在HLA-B/Cw位点之间. 群体统计学分析发现, A*02-Cw*03单体型呈一定程度的连锁不平衡但不是很强(Δ/δ_(Δ) = 3.0, Δ_(r) = 0.30); 另有3个单体型虽呈强连锁不平衡却发生了重组事件, 即A*33-Cw*03 (Δ/δ_(Δ) = 7.22, Δ_(r) = 0.51), A*30-Cw*06(Δ/δ_(Δ) = 10.37, Δ_(r) = 0.93)和 B*13-Cw*03(Δ/δ_(Δ) = 7.69, Δ_(r) = 0.38), 这说明重组可能是打破旧的连锁不平衡来产生新的连锁不平衡的重要原因. 本文绘制了每个重组家系成员的HLA单体型, 并建立了中国汉族人群的HLA重组遗传图谱, 初步定位重组发生的范围并分析了位点间重组与连锁不平衡的关系, 这为更深入地研究HLA重组事件奠定了基础.     

apelin基因rs2235306位点多态性与哮喘的相关性研究

目的:探讨apelin基因rs2235306位点多态性与哮喘的相关性。方法:以外周血全血DNA为模板,应用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS PCR,T-ARMS-PCR)方法对158例哮喘患者(AS)和79例健康个体(NC)apelin基因rs2235306位点基因型进行分析,同时进行肺功能检查(FEV1、FVC、FEV1/FVC)。结果:AS组和NC组apelin基因rs2235306位点等位基因T和C频率分布具有统计学意义(X2=6.906,P=0.009,OR=1.688,95%CI=1.140-2.497),AS组C等位基因频率显著高于健康对照组;AS组和NC组基因型分布具有统计学意义(X2=14.243,P=0.000,OR=3.894,95%CI=1.861-8.149),其中CC基因型患哮喘的风险较高,为TT+TC基因型的3.894倍。AS轻度组和AS中重度组基因型CC和TT+TC频率及等位基因T和C频率比较均无统计学意义。结论:apelin基因rs2235306位点多态性和哮喘的发病具有一定的相关性,C等位基因可能是哮喘的遗传易感基因,CC基因型携带者哮喘的患病风险可能增加,但与哮喘的严重程度无明显相关性。     

TGF-beta1 基因rs200482214 位点多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的相关性研究

目的:探讨转移生长因子β1(transforminggrowth factor beta-l,TGF-β1)位点rs200482214基因多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的易感性的相关性。方法:选取2012年3月至2013年7月在哈尔滨医科大学附属口腔医院牙周科就诊的135例轻、中、重度慢性牙周炎汉族患者(牙周炎组)和108例汉族健康对照者(健康对照组)作为研究对象,基因组DNA来自口腔颊粘膜拭子,采用多重单碱基延伸SNP分型技术(Multiplex SNaPshot technique)对所有受试者TGF-β1基因rs200482214位点进行检测,比较两组间此位点基因型分布和等位基因频率的差异。结果:(1)TGF-β1基因rs200482214位点各基因型(GG、GA、AA)分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05);(2)TGF-β1基因rs200482214位点GG、GA、AA在牙周炎组和健康对照组的分布频率分别为61.5%、30.4%、8.1%和63.0%、28.7%、8.3%,两组人群基因型分布频率差异无统计学意义(P>0.05);等位基因G、A在牙周炎组和健康对照组分布频率分别为76.7%、23.3%和77.3%、22.7%,两组人群的等位基因分布频率差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论:TGF-β1位点rs200482214基因多态性与黑龙江省汉族人群慢性牙周炎的易感性不具有相关性。     

云南傣族、汉族HLA-G基因14bp插入/缺失多态性研究

14bp插入/缺失多态性是指存在于HLA-G基因第8外显子3′非翻译区(3′UTR)的一个插入/缺失多态,因其能影响HLA-GmRNA的稳定性,并进一步影响HLA-G蛋白的翻译而受到广泛关注。文章采用PCR和电泳技术对云南傣族和汉族两个人群进行了HLA-G基因14bp插入/缺失多态性的检测分析,结果显示傣族和汉族人群+14bp等位基因频率分别为31.97%和40.87%,+14bp/+14bp基因型频率分别为8.20%和17.31%,+14bp/-14bp基因型频率分别为47.54%和47.11%。与国内外已报道的其他人群的数据比较表明:云南汉族群体中HLA-G基因14bp插入/缺失的分布与其他群体相似;傣族则有自己独特的基因型和等位基因分布特点,推测其可能受到了遗传漂变的作用,但不排除自然选择作用的影响。     

多基因疾病相关基因定位的研究策略

多基因疾病既是影响世界上多数人生命健康和生活质量的重要因素, 也是长期困惑广大科研人员的难题之一. 对多篇相关文献进行综合比较的结果说明: 研究样本、遗传标记的选择和遗传统计方法是多基因疾病研究中必须优先考虑的三个方面, 它直接决定了实验设计的可能性和结果的合理性. 其中, 样本的选择尤为重要, 不同群体的样本在多基因疾病相关基因定位的不同阶段所起的作用不同, 有的适合于疾病相关基因初步定位, 有的适合于精细定位和疾病的群体关联分析. 遗传标记的选择和遗传统计方法是由实验目的、样本特点和资料的完整情况等决定的. 对不同的统计结果应采 用适当的标准, 以排除假阳性.     

中国成都汉族与泰国人群Nogo蛋白基因遗传多态性研究

轴索生长抑制因子(Neurite growth inhibitor,Nogo)在中枢神经系统中主要发挥抑制轴突再生的作用,其基因TATA和CAA插入缺失多态性与慢性精神分裂症发病风险有关,在不同种族间RTN4基因型及等位基因频率分布的存在差异.该研究将采用聚合酶链反应和聚丙烯酰胺凝胶电泳方法检测205名中国成都汉族人和101名泰国人RTN4基因多态性,比较两组人群RTN4基因TATC和CAA插入缺失多态性分布情况,并与不同种族人群研究结果进行比较.研究发现在中国成都地区汉族人群中,RTN4基因(TATC)2(TATC)2基因型频率为10.2%,明显低于泰国人群(21.8%),差异具有统计学意义(P=0.006);(TATC)2等位基因在成都汉族人群中占34.9%,明显低于泰国人群(45.0%),差异具有统计学意义(P=0.015).CAA插入缺失基因型和等位基因频率在成都汉族人群和泰国人群中差异均无统计学意义(P>0.05).此外,中国成都地区汉族人群等位基因(TATC)2频率(34.9%)明显低于法国加拿大人(45.0%)和突尼斯人(49.0%),差异具有统计学意义(P<0.05);等位基因(CAA)2频率(66.8%)明显高于法国加拿大人(53.0%)和巴西人(37.8%),差异具有统计学意义(P<0.05);结果表明RTN4基因TATA和CAA插入缺失多态性在不同种族间的分布存在明显差异.