人代谢网络巨强连通体的复杂网络分析

采用复杂网络理论分析了人代谢网络的巨强连通体。通过对高质量人代谢网络数据的整理,获取了该网络巨强连通体中的所有代谢反应。用代谢物图表示这些反应形成了一个网络,它包含了256个节点和648条连线。选用模拟退火算法对该网络进行社团结构分析,发现得到的模块具备重要的生物学功能。通过多种不同的中心化方法,分析了该网络的关键节点,并讨论了它们的生物学和理疗意义。     

中国巨刺螨属一新种和雷氏巨刺螨的重新描述(中气门目,巨刺螨科)(英文)

记述了采自广西的扁颅蝠Tylonycteris robustula(Thomas,1915)体表的寄生革螨1新种:拟雷氏巨刺螨Macronyssus pararadovskyi Tian,Jin et Zhang,sp.nov..新种与雷氏巨刺螨Macronyssus radovskyi(Domrow,1963)近似,二者的区别在于:新种背毛有27对,具有Z3;雌螨生殖腹板具有3根副毛,或部分标本为1根副毛在板的末端,另1对副毛位于板外;雄螨胸生殖腹板上具有4对胸毛和20根腹毛.而雷氏巨刺螨背毛有26对,不具有Z3.雌螨生殖腹板不具有副毛,即副毛均不在生殖腹板上;雄螨胸生殖腹板上具有4对胸毛和18根腹毛.另外,依据采自广西褐扁颅蝠Tylonycterispachypus(Temminck,1840)体表的标本,对雷氏巨刺螨Macronyssus radovskyi(Domrow,1963)的雌、雄螨成体和第1若螨进行了重新描述.所有标本均保存于贵州大学昆虫研究所标本馆.     

基于Petri网T不变量的PHB新陈代谢建模分析(英文)

从拓扑结构的角度分析生化反应网络是生物信息学研究中的一个热点问题。通过将两种传统的途径分析方法(基元模式和极端途径)与Petri网的T不变量分析进行了比较,结果表明:它们本质上是一致的,但是采用Petri网的T不变量分析更便捷。然后,利用Petri网技术构建了PHB代谢模型。对该模型作了结构分析,将计算得到的23个T不变量进行了分组:I组表示简单的可逆反应,II组表示循环的反应,III组可用于调控ATP/ADP比率,IV组是与PHB生产直接相关的反应,可用于代谢工程以提高PHB的产率。最后讨论了Petri网的T不变量分析在这个领域中的应用。     

烟草细胞乙醇分解代谢能力的离体调控(英文)

报告了一些重要因子对培养在含有乙醇的培养基上的烟草细胞的乙醇分解代谢能力（ＥＣＡ）的调控效果。在供试的５种生长素和２种细胞分裂素中,ＩＢＡ４ｍｇ／Ｌ和Ｋｔ０．０５ｍｇ／Ｌ最有利于促进ＥＣＡ,而ＮＡＡ２ｍｇ／Ｌ和Ｋｔ０．０２５ｍｇ／Ｌ则最有利于支持处在乙醇胁迫下的细胞的增殖。实验中还发现提高维生素浓度有利于细胞的ＥＣＡ。通过将细胞从低乙醇浓度的培养基转移到较高乙醇浓度的培养基中,能够诱导细胞耐受更高浓度的乙醇并增强细胞的ＥＣＡ。研究结果可以应用于制备适合分离乙醇分解代谢途径中的酶的烟草细胞材料。     

临夏盆地早中新世上庄组的巨獠犀门齿化石(英文)

记述了在临夏盆地早中新世地层中发现的兰州巨獠犀(Aprotodon lanzhouensis)的下门齿化石,其特点为非常粗壮并强烈弯曲。新材料的发现使巨獠犀在临夏盆地的延续时代跨越渐新世/中新世界线的推测得到完全证实。巨獠犀分布的地质时代和地理范围与巨犀重合,但巨獠犀的化石地点和个体数量都相当稀少。巨獠犀的下颌形态功能特点指示其生活于晚始新世至早中新世中国西北、南亚和中亚干旱环境地带中镶嵌分布的少量近水环境。巨獠犀在中中新世之前彻底绝灭,其原因可能是气候变化的结果,也说明临夏盆地早中新世的环境特征与晚渐新世的疏林系统相似,而不同于中中新世的茂密森林。     

SlNPV p10基因簇的序列及结构特征分析(英文)

以病毒感染后期的ｃＤＮＡ为探针,将ＳｌＮＰＶｐ１０基因杂交定位于基因组ＤＮＡ的ＢａｍＨＩ－３．０ｋｂｐ片段上。ＳｌＮＰＶｐ１０基因长３１８ｎｔ,编码一１０５ａａ的Ｐ１０蛋白,为目前发现的最长的ｐ１０基因;基因的启动子内含有两个ＡＴＴＧＴＡ模体（ｍｏｔｉｆ）,是目前发现的ｐ１０基因中唯一含有两个Ａ／ＴＴＴＧＴＡ模体者。ＳｌＮＰＶＰ１０蛋白含有１０个七肽重复单元,可形成一个相对较长的卷曲螺旋。ＳｌＮＰＶｐ１０所在的ＯＲＦ５５２－ｐ１０－ＯＲＦ９４５基因簇与ＳｐｌｉＮＰＶ的ＯＲＦ５５２－ｐ１０－ＯＲＦ９４５基因簇各基因座位、方向及对应的氨基酸序列十分相似,表明ＳｌＮＰＶ与ＳｐｌｉＮＰＶ有很近的亲缘关系。     

基于人类信号转导网络研究卵巢癌病变过程的信号转导模式

为了系统地研究卵巢癌病变过程的信号转导模式,综合多种信息构建了完整的人类信号转导网络,发现卵巢癌相关基因在网络中的拓扑学性质与其它基因存在显著差异。将正常、早期卵巢癌和晚期卵巢癌三种状态下的基因表达谱数据映射到信号转导网络中,利用基于共表达改变量的方法,筛选出正常与早期卵巢癌、正常与晚期卵巢癌、早期卵巢癌与晚期卵巢癌间的显著差异模体。通过对显著差异模体进行功能和模式的分析,发现卵巢癌的发生发展主要和信号级联模式的异常相关。另外,还发现AR、PAK6和KPNB1三个基因间信号转导模式的异常和卵巢癌的恶化相关。     

植物冷锻炼对于胁强敏感度的影响(英文)

前文由柑桔枝条在不同低温下、不同冷冻时间的电解质外渗测定,提出胁强(stress)、作用时间与胁变(strain)之间关系的数学模型。在这个模型中共有3个参数:屈服点温度(yield point temperature),胁强敏感度(stress sensitivity)和作用时间敏感度(sensitivity to duration),用以描述植物的抗性。抗性强的植物应表现为屈服点温度较低,胁强敏感度或者时间敏感度较低。为验证此数学模型,本工作以经冷锻炼与未经冷锻炼的盆栽柑桔枝条为材料,作不同温度与时间处理的电解质外渗率的测定,研究了冷锻炼对于上述3个参数的影响。发现胁强敏感度和屈服点温度受冷锻炼影响而下降,时间敏感度未表现明显变化。对于田间柑桔、油桐与毛竹的定期测定,在固定冷冻时间下,得到了类似于盆栽柑桔的结果。入冬时,植物抗冻性提高,3种植物都表现出下列两种变化:1.胁强敏感度的明显下降;2.屈服点温度和/或时间敏感度亦下降。开春时的变化则相反。胁强敏感度的变化与后一种变化有各自的规律,且因植物种类而不同。拐点胁强(stress at inflection point)具有与半致死温度(50％killing point temperature)不同的意义,它的变化是上述两种变化的综合结果。本试验结果表明,冷锻炼对于植物胁强敏感度有明显影响,用本数学模型的3个抗性指标描述     

巨尾阿丽蝇在自由状态下的电击回避学习能力(英文)

蜜蜂和果蝇具有良好的学习记忆能力。利用自主改良的研究装置对另一种具有强大生存本能的双翅目昆虫——巨尾阿丽蝇(Aldrichina grahami)在自由状态下电击回避学习能力进行研究。结果表明,巨尾阿丽蝇具有良好的学习记忆能力,因为当刺激电压范围为5V到45V时,观察到巨尾阿丽蝇有显著的回避电刺激行为,而当电压达到60V时会受到明显伤害。由此推测,巨尾阿丽蝇适合作为神经系统研究的动物模型。本实验所采用的实验范例较以往有所改进,适合作为自由状态下研究昆虫的工具。     

沫蝉的病原真菌新种——巨孢虫疫霉(英文)

在浙江省百山祖自然保护区虫生真菌调查中发现松树上的菱沫蝉(Agrophora sp.)的新病原真菌一种,因其分生孢子远大于任何已知种虫疫霉,故定为新种巨孢虫疫霉(Eryniagigantea Li,Chert et Xu)。其初生分生孢子长倒拟卵形或拟纺锤形,对称或略弯曲,42.6—76.7×l 2.3—26.0μm(平均57.6×l 8.6μm),长径比2.2—4.9(平均3.1);顶稍圆或尖削;基部乳突略钝,有时有孢领。次生分生孢子倒拟卵形至广倒拟卵形;毛管分生孢子未见。假根成束。假囊状体及休眠孢子未见。     

局部刮除肿瘤联合放疗治疗骨巨细胞瘤的临床研究

目的：探讨局部刮除肿瘤联合术中适形固定施源器模型插植放疗和术后外照射治疗骨巨细胞瘤（GCTB）的临床疗效和毒副反应。方法：将2006年2月．2008年2月在湖南省肿瘤医院初次治疗的长骨GCTB患者30例随机分为单纯局部刮除手术组和局部刮除手术联合放疗组,两组患者均行局部肿瘤刮除术,局部刮除手术联合放疗组在此基础上给予术中适形固定施源器模型插植放疗和术后外照射,治疗后比较两组的临床疗效和毒副反应。结果：局部刮除手术联合放疗组1、3、5年均未复发,而单纯局部刮除手术组的1、3、5年复发率分别为9．1％、27．3％、45．5％,3年和5年复发率均显著高于局部刮除手术联合放疗组（P〈0．05）。局部刮除手术联合放疗组中未见严重相关性毒性和死亡,术后两组的关节功能评分比较无明显差剐（P〉0．05）。结论：局部手术刮除病灶结合术中和术后放疗治疗骨巨细胞瘤可显著降低患者的复发率,且不影响关节功能,是一种较为安全的治疗方法。     

大熊猫消化道消化吸收区段游离面的扫描电镜观察

对大熊猫消化道的消化、吸收区段作扫描电镜观察后表明：（１）胃粘膜上皮细胞排列疏松,细胞表面具微绒毛,（２）十二指肠绒毛呈指状,表面凸凹不乎;绒毛表面具丰富的微绒毛,微绒毛表面粗糙,末端膨大。（３）直肠段具丰富的绒毛结构,表面不平滑,具颗粒状物质,但无微绒毛存在：直肠腺丰富。     

应用微卫星标记分析圈养大熊猫遗传多样性

以来源于成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心的34只圈养大熊猫(分为a群体和b群体)和7只圈养野生大熊猫(圈养野生群)作为研究对象,利用AY161177～AY161218、Ame-μ5～Ame-μ70和g001～g905等30个微卫星标记对其遗传多样性现状进行分析,并探讨保持圈养大熊猫遗传多样性的方法.微卫星数据表明,30个微卫星标记多态性好(PIC=0.621～0.640),圈养大熊猫遗传多样性水平(a群体:A=5.48,Ho=0.475,He=0.696;b群体:A=5.24,Ho=0.453,He=0.719;圈养野生群:A=3.80,Ho=0.514,He=0.725)高于6个濒危物种(Ho=0.210～0.390,He=0.150～0.430)但低于3个非濒危物种(Ho=0.620～0.710),圈养大熊猫遗传多样性水平都保持在较高水平,但圈养群遗传多样性水平与圈养野生群相比有所降低.F统计量及基因流Nm分析结果证明,a、b两群体间遗传分化程度不高(Nm=2.610,Fst=0.0874,Fit=0.4116),存在个体交换和一定程度的近交,b群体近交程度高于a群体(a群体Fis=0.3221,b群体Fis=0.3983).因此,现阶段圈养大熊猫的管理重点是避免近交和遗传多样性丧失,将圈养大熊猫种群作为同一管理单元,把纠正大熊猫系谱中的错误、科学选择大熊猫个体进行群体间交流作为关键点,利用微卫星技术保持和提高大熊猫种群的遗传多样性水平.     

基于新一代高通量测序技术开发巨人半边莲Lobelia deckenii的SSR标记

为了开发东非半边莲属特有植物的微卫星分子标记(SSR),本研究基于Illumina-HiSeq 2000测序平台对巨人半边莲Lobelia deckenii的基因组进行高通量测序。利用MISA软件对获得的基因组数据库进行搜索与分析,共鉴别出58 966个SSR位点,并利用Primer软件成功设计出3558对特异性的SSR引物。利用L.deckenii 3个居群的6个样品对随机挑选的40对SSR引物进行扩增效率检验,发现有32对重复性好且可扩增出清晰条带。利用筛选出的32对SSR引物对来自肯尼亚山居群的24株个体进行PCR扩增并采用荧光分型技术检测多态性,结果显示有14对可扩增出稳定的多态性条带,共有86个等位基因,各SSR位点的等位基因数(NA)为4~9个,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.000~1.000和0.625~0.854。本研究结果表明,通过高通量测序技术开发东非特有植物巨人半边莲的SSR标记是一种简单而高效的途径,这些新的SSR分子标记为巨人半边莲的居群遗传多样性、遗传结构以及对其开展保护生物学研究提供了工具。     

复方虎杖高效液相色谱指纹图谱的研究

采用高效液相色谱法,建立了复方虎杖指纹图谱的分析方法。色谱条件为：ZORBAX C18（150mm×4．6mm,5um）,检测波长310nm,柱温：25℃,流动相：甲醇（0～85％）：5％乙酸溶液（100％-15％）,梯度洗脱70min。通过分析,确立了复方虎杖指纹图谱的22个共有峰。10批样不同产地的药材指纹图谱具有较好的相似度。该方法准确可靠,重复性好,可用于复方虎杖药材及其制剂的质量控制。     

Calculation of the Affinity of the λ Repressor-Operator Complex Based on Free Energy Component Analysis

A calculation of the binding free energy of the u repressor-operator complex is described based on free energy component analysis. The calculations are based on a thermodynamic cycle of seven steps decomposed into a total of 24 individual components. The values of these terms are estimated using a combination of empirical potential functions from AMBER, generalized Born - solvent accessibility calculations, elementary statistical mechanics and semiempirical physicochemical properties. Two alternative approaches are compared, one based on the crystal structure of the complex and the other based on the molecular dynamics simulation of the u repressor-operator complex. The calculated affinity is m 19.7 kcal/mol from the crystal structure calculation and m 17.9 kcal/mol from the MD method. The corresponding experimental affinity of the complex is about m 12.6 kcal/mol, indicating reasonable agreement between theory and experiment, considering the approximations involved in the computational methodology. The results are analyzed in terms of contributions from electrostatics, van der Waal interactions, the hydrophobic effect and solvent release. The capabilities and limitations of free energy component methodology are assessed and discussed on the basis of these results.     

Structural Properties of the Human Protease-Activated Receptor 1 Changing by a Strong Antagonist

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大熊猫初生胎儿及幼仔组织器官的病理学研究

To elucidate the cause of prenatal and early postnatal death in giant panda, pathological studies have been carried out on paraffin-fixed tissue sections from two fetuses and four cubs. The fetuses appeared to have classical atrophic changes in lung and hemorrhage in multiple organs, whereas the cubs showed purulent inflmnmation in various organs, most profound in lung and umbilicus. Localized infusion of bacteria and neutrophils were identified in the focus. Acute enteritis and hepatitis were also observed, as well as purulent encephalitis in one case. Variable degrees of congestion, hemorrhage, denaturalization and putrescence were evident in heart, liver, spleen, kidney, intestines, and lymph nodes. The results indicated that the fetuses died from suffocation whereas the cubs died from infection.     

大熊猫冷冻精液解冻速度和解冻液中添加Pentyoxyfilline对其解冻后活力的影响

建立大熊猫的精子库,进行远距离圈养大熊猫种群间的人工授精和遗传物质的转运,维持遗传多样性,是目前大熊猫遗传管理的优先方法。要成为最有效的工具,精子库保存的精子解冻后的活力必须很好。本文对大熊猫冷冻精液的解冻速度和解冻液中添加化学激活剂Pentyoxyfilline(PF)后的精子活力进行了试验。试验用的精液采自11只成年大熊猫,精液冷冻速度为每分钟-40℃～-100℃。试验Ⅰ:将冷冻精液放入3种不同温度的水浴中解冻:(1)22℃(慢速解冻);(2)37℃(中速解冻)(3)50℃(快速解冻)。将冷冻前精子活力(78 1±2 9%)和解冻后的平均精子活力进行比较,快速解冻后的精子活力(57 5±5 4%)显著地降低(P<0 05),而中速解冻的精子活力(67 5±3 1%)和慢速解冻的精子活力(73 33±2 1%)与冷冻前的活力接近。试验Ⅱ:使用中速解冻方法解冻精液后,分别加入最终浓度为0mM、1mM、5mM和10mM的PF,然后分别保温15min和24h。在PF(0mM、1mM、5mM和10mM)中分别孵育15min的解冻精子活力,运动状态,活率和顶体正常率在试验期的90min内都很相似(P>0 05)。在1mMPF中孵育24h的精子活力没有变化(P>0 05)。在5mM和10mMPF中孵育过的精子活力(5mM:24 0±4 7%;10mM19 5±3 6%)比没有加PF的对照组的精子活力(38 3±5 2%)显著地低(P<0 05)。而且,在10mM