《自然－细胞生物学》：发现可抑制乳腺癌转移蛋白质

日本筑波大学一个研究小组发现，人体细胞中的蛋白质“CHIP”可以抑制乳腺癌细胞增殖和转移。这一成果2月9日发表在英国《自然一细胞生物学》（Nature Cell Biolog）r）杂志网络版上。     

丁酸钠对小鼠细胞干扰素基因表达的调节作用

某些核酸和蛋白质大分子合成抑制物是动物细胞干扰紊合成的有效超诱导物,它们在抑制DNA或蛋白质合成的同时,明显地促进其干扰素的合成。丁酸钠能可逆地抑制细胞增殖,并使组蛋白乙酰化,抑制DNA合成。它对人的类淋巴母细胞干扰素的合成     

三十年磨一剑———2006年诺贝尔化学奖得主Roger Kornberg关于真核基因转录机制的研究

2006年的诺贝尔化学奖授予了美国斯坦福大学的科恩伯格（Roger D．Komberg）教授,以表彰他在真核基因转录的分子机制研究方面做出的卓越贡献。在细胞中,DNA的复制、RNA的转录和蛋白质的翻译是生命活动的核心过程。因此,研究遗传信息如何从DNA到RNA再到蛋白质的传递过程一直是分子生物学研究的核心课题。科恩伯格的工作则在分子水平上向我们展示了RNA聚合酶Ⅱ（RNA polymerase Ⅱ）及各种蛋白因子在DNA模板上合成作为蛋白质合成模板的信使RNA（mRNA）的过程,为在转录水平阐明真核基因的表达调控奠定了分子结构基础。     

重组质粒与重组蛋白共免疫诱导HBsAg特异性T细胞免疫抑制

摘要：【目的】为了探索治疗急性乙型肝炎和爆发性乙型肝的新策略,本研究将HBV DNA疫苗和相应抗原的蛋白质分子联合免疫小鼠,旨在探讨联合免疫对小鼠抗原特异性T细胞增殖反应的影响。【方法】我们将HBV DNA疫苗（pcDS2）和相应抗原蛋白质分子(HBsAg)联合免疫BALB/c小鼠;分别在第0、2和4周进行免疫,在第6周用ELISA方法检测抗-HBs IgG效价,MTT和流式细胞仪检测T细胞增殖反应,及流式细胞仪检测细胞因子表达水平。【结果】pcDS2和HBsAg联合免疫组小鼠的抗-HBs水平显著提高;免疫小鼠的T细胞体外经HBsAg刺激后, 联合免疫组刺激指数(SI)明显降低;经流式细胞仪检测进一步证实联合免疫组T细胞增殖反应被显著抑制;联合免疫组T细胞表达IL-10和Foxp3水平显著升高。【结论】pcDS2和HBsAg联合免疫能诱导产生特异性体液免疫应答,但不能诱导产生抗原特异性T细胞增殖反应;T细胞增殖反应被显著抑制可能与T细胞表达IL-10和Foxp3上调有关;本研究为急性乙型肝炎和爆发性乙型肝炎治疗及HBV疫苗的研究奠定了基础。     

DNA展示系统介导的断裂蛋白质内含子体外定向进化方法的研究

蛋白质内含子对于外显子的选择性限制了它的应用范围。目前,已经建立的卡那霉素定向进化系统适用于微小蛋白质内含子,但不适用于断裂蛋白质内含子。为了研究适用于断裂蛋白质内含子的定向进化的方法,我们引入了DNA展示系统。在该系统中,生物素化基因在人工细胞中与其表达的融合蛋白（内含子C端-外显子-生物素结合蛋白）形成DNA 蛋白质连接体。只有能与后续加入的N端蛋白质内含子前体（Flag-内含子N端）发生剪接反应的DNA 蛋白质连接体,才能被加上旗帜标签（Flag）,从而被抗旗帜标签抗体纯化柱（Anti Flag antibody M2 agarose）筛选富集。为了验证该系统的可行性,实验构建了2个基因,即含有具剪接活性的蛋白质内含子的阳性基因IRC和含有不具剪接活性的蛋白质内含子的阴性基因IRCM。实验首先通过Western印迹和琼脂糖凝胶电泳证明,人工细胞中的体外转录翻译系统不仅可高表达500个氨基酸的蛋白质,而且表达的蛋白中内含子仍保持原有的剪接能力。生物素结合蛋白能结合95%的DNA,并且形成的DNA 蛋白质连接体可以被筛选富集,最终证明了该系统用于断裂蛋白质内含子定向进化筛选的可行性。随后,为了检测系统的富集效率,制备了人为的基因“突变库”,即将基因IRC和IRCM以摩尔比1:10的比例混合,经过2轮筛选后,阳性基因IRC可以被10倍富集,进一步证明了体外筛选方法的可行性。该方法为后续针对不同宿主进化出不同的断裂蛋白质内含子提供筛选方法支持,也为断裂蛋白质内含子的在生物技术和研究领域的应用奠定了基础。     

遗传标记及其在作物品种鉴定中的应用

本文评述了用于作物品种鉴定的形态标记（morphological markers）、细胞标记（cytological markers）、生化标记（biochemical markers）、分子标记（molecular markers）的优缺点。重点评述了分子标记在作物品种鉴定中的应用。文中除对蛋白质电泳指纹图谱——同工酶和贮藏蛋白（包括醇溶性蛋白、清蛋白、谷蛋白、球蛋白等）电泳产生的指纹图谱的应用外,较详细地介绍了近年来DNA指纹图谱技术;包括限制片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism,简称RFLP）、随机扩增多态性DNA (random amplified po lymorphic DNA,简称RAPD)、小卫星DNA（minisatellite DNA）、微卫星DNA（microsatellite DNA）,简单重复序列间扩增（intersimple sequence repeats,简称ISSR）,扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism,简称AFLP）以及CAPS (cleaved amplified polymorphic sequences)和SNPS (single nucleotide polymorphisms)对作物品种鉴定和新品种登记,品种纯度和真实性的检验以及品种间亲缘关系的探讨和在分类研究中的贡献等。     

平贝母体细胞胚胎发生中的核酸与蛋白质合成研究

在获得比较理想的平贝母体细胞胚胎发生体系的基础上,我们应用放射性同位素液体闪烁计数技术测定了平贝母体细胞胚胎发生过程中球形胚、心形胚、鱼雷胚、子叶胚和成熟胚等时期的DNA、RNA和蛋白质合成动态,实验表明,从球形胚到子叶胚,核酸与蛋白质的合成速度递增。在子叶胚前期RNA合成达到高峰,在子叶胚期蛋白质合成达到高峰,在子叶胚后期DNA合成达到高峰,核酸与蛋白质合成速度的变化与胚体细胞增殖及器官分化相关联。     

基于氨基酸特征序列对人类Rh血型系统的蛋白质结构分析

利用代数学中同态思想和物理中的“粗粒化”思想,以及HP模型,根据a,t,c,g的化学结构分类,提出了DNA序列的特征序列概念（σ-,τ-,σ∩τ-）并推广到蛋白质序列中,从而给出一种数值刻划,将蛋白质序列简化成一个（0,1）序列,基于上述给出特征序列的方法,根据氨基酸分子量与简并度的关系,提出了另外一种DNA序列的特征序列概念（-）并推广到蛋白质序列中,进而给出了另外一种数值刻划,将蛋白质序列简化成一个（0,1,2）序列,通过比较RHD基因和RHCE基因的特征序列的数值刻划图,得出RHD基因和RHCE基因均偏爱使用低分子量且高简并度的氨基酸。     

Balb/c小鼠增龄过程中不同脏器线粒体DNA损伤及损伤修复相关基因的变化

为探讨Balb/c小鼠增龄过程中线粒体DNA损伤及其修复基因表达与衰老之间的关系,采用逆转录 多聚酶链反应（RT PCR）方法,检测年轻与老年Balb/c小鼠脑、肝脏和脾脏中线粒体自身编码基因细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ基因（coⅠ）和细胞色素氧化酶亚单位Ⅲ基因（coⅢ）及8 氧鸟嘌呤糖基化酶基因（ogg1）、DNA聚合酶γ（DNA polymeraseγ）基因、胸腺嘧啶乙二醇DNA糖基化酶基因（nth1）等碱基切除修复基因在mRNA水平的变化.用Western印迹方法检测小鼠脾脏中COⅢ和OGG1的蛋白质水平的变化.结果发现,老年小鼠脾脏中coⅠ和coⅢ的mRNA水平比年轻小鼠显著增加（P<0.05）,CO Ⅲ的蛋白质水平亦比年轻小鼠显著升高（P<0.05）;老年小鼠脾脏OGG1的mRNA和蛋白水平上均比年轻小鼠显著增加（P<0.05）.老年小鼠肝脏和脾脏DNA聚合酶γ和NTH1的mRNA水平比年轻小鼠显著升高（P<0.05）.提示线粒体DNA自身编码的基因及碱基切除修复基因的表达失衡可能是Balb/c小鼠衰老的原因之     

真核生物中锌指蛋白的结构与功能

真核生物中的许多蛋白质分子包含锌指结构区,这类蛋白称为锌指蛋白.锌指蛋白因其包含特殊的指状结构,在对DNA、蛋白质和RNA的识别和结合中起重要作用.许多锌指蛋白的锌指结构域包含能与DNA特异结合的区域,并与某些效应结构域（如KRAB、SCAN、BTB/POZ、SNAG、SANT和PLAG等）相连,这类锌指蛋白常作为转录因子起作用,可调控靶基因的转录.一些锌指蛋白包含蛋白质识别结构域（如LIM锌指、MYND锌指、PHD锌指和RING锌指等）,它们能够特异地介导蛋白质之间的相互作用,因此被称作蛋白适配器.此外,某些锌指蛋白还可以结合RNA,起转录后调控作用.本文就锌指蛋白与DNA、RNA以及蛋白质分子间的相互作用作一综述.     

用酵母单杂交系统筛选与人ε—珠蛋白基因表达相关的基因

人体胚胎型ε－珠蛋白基因5‘旁侧一个沉默子（－392－－177bp）对关闭该基因在胎儿期的表达起重要作用。DNaseⅠ足谠法分析已表明在沉默子区内存在着一个明显的蛋白质因子结合位点（－278－－235bp）。为了筛选与沉默子DNA特异结合的蛋白质因子,将该保护区域的DNA序列作为靶序列,采用酵母单杂交系统对人胎儿肝cDNA表达文库进行筛选,并对获得的克隆进行序列分析。初步的结果表明,已分离到了人核糖体大亚基蛋白3(ribosomal protein L3,RPL3）的全长cDNA克隆。体外凝胶电泳阻抑分析及竞争实验亦证明该蛋白质与沉默子DNA存在相互作用。提示RPL3可能通过与沉默子DNA的结合参与调节ε－珠蛋白基因的关闭。     

黄瓜二倍体及其同源四倍体果实转录组分析

果形和糖含量分别是与瓜类蔬菜作物外观、营养及风味密切相关的重要品质性状。为探究黄瓜倍性差异导致果形及糖含量变化的分子机制，以果形和糖含量差异显著的黄瓜二倍体（长果/低糖）和四倍体（短果/高糖）为试材，分别取开花当天和花后9 d的果实进行转录组分析。结果表明，在二、四倍体花后9 d果实中共鉴定到1 874个差异表达基因（DEGs），其中上调基因818个和下调基因1 056个；GO分析显示，DEGs显著富集在“DNA复制”（GO:0006260）、“DNA代谢过程”（GO:0006259）、“蛋白质复合体”（GO:0032993）、“染色体”（GO:0005694）、“蛋白质二聚活性”（GO:0046983）等GO条目上；KEGG分析表明，DEGs富集在“植物激素信号转导”（csv04075）、“淀粉与蔗糖代谢”（csv00500）等代谢通路上；参与“植物激素信号转导”相关基因AUX1、DELLA、B-ARR、TCH4上调表达，GH3、GID1、PP2C、CYCD3下调表达，以及参与“淀粉与蔗糖代谢”相关基因SPS、SUSY上调表达，可能与果形指数减小和果实糖含量增加有关。荧光定量PCR(...     

丁酸钠对小鼠细胞千扰素基因表达的调节作用

某些核酸和蛋白质大分子合成抑制物是动物细胞干扰素合成的有效超诱导物[1],它们在抑制DNA或蛋白质合成的同时,明显地促进其千扰素的合成。丁酸钠能可逆地抑制细胞增殖,并使组蛋白乙酸化,抑制DNA合成^[2,4]。它对人的类淋巴母细胞千扰素的合成也有明显的促进作用^[3]。     

胰岛素对鹅原代肝细胞增殖及蛋白合成的影响

通过用不同浓度胰岛素培养天府肉鹅（Ansercygnoides）原代肝细胞探讨胰岛素对鹅原代肝细胞增殖及蛋白合成的影响。结果表明：与对照组相比,0—200nmol／L胰岛素对肝细胞上清液中谷草转氨酶（AST）、谷丙转氨酶（ALT）浓度没有显著影响,表明细胞功能正常;100、150和200nmol／L胰岛素显著增加细胞培养上清液中总蛋白（什）和白蛋白（ALB）浓度;Brdu．ELISA法检测DNA合成实验结果表明经胰岛素处理后显著增加鹅原代肝细胞增殖率。因此,胰岛素能促进鹅原代肝细胞的细胞增殖及蛋白合成。     

“垃圾”基因，垃圾还是宝物？

何谓“垃圾”基因 “垃圾”基因是相对基因而言的。基因是具有遗传效应的特定DNA序列,通俗地讲,基因就是编码某种蛋白质的一段基因。它们就像散落于天幕的星星一样,分散在我们的基因组中。而在这些基因间存在的大片大片的DNA片段是不能编码蛋白质的,即“非编码序列”。由于功能不清,美国加州理工学院的大野·乾于1972年提出用“垃圾基因”（junk DNA）来形容它们。     

大肠杆菌冷休克蛋白CspC的分离纯化及部分性质测定

经Sepharose Q Fast Flow阴离子交换层析和Superdex 30凝胶过滤层析,从大肠杆菌（Escherichia coli）细胞内分离纯化了一种小分子蛋白质，SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)纯度鉴定为单一条带，经质谱分析、N端测序、同源序列比较，确定该蛋白质为大肠杆菌冷休克蛋白CspC.在此基础上，用圆二色光谱测定了其二级结构含量，初步探索了其热稳定性及与单链DNA结合后的构象变化.     

DRE顺式作用元件dsDNA芯片制备

DRE顺式作用元件能与DREB转录因子特异结合,在诱导逆境（干旱、高盐、低温）基因表达过程中起重要作用。dsDNA（double strand DNA）微阵列芯片技术能够有效地检测序列特异性DNA结合蛋白质（转录因子）与大量DNA靶点（顺式作用元件）的特异性结合,可有效分析生物分子结合作用。根据DRE顺式作用元件核心序列设计并化学合成含发夹结构的单链DNA探针,采用Taq DNA聚合酶在片延伸,并对其在片延伸体系的反应温度、Mg^2＋浓度以及单链探针是否变性等条件进行了优化。结果表明,50％的反应温度,2．5mmol／L的Mg^2＋浓度和单链不变性是TaqDNA聚合酶在片延伸的最佳条件。优化方法制备的dsDNA芯片将更有利于DRE顺式作用元件与DREB抗逆转录因子相互作用的研究。     

麦迪霉素产生菌酮基还原酶基因在大肠杆菌中的表达

用PCR法扩增麦迪霉素产生菌酮基还原酶（MKR）基因,得到约0．8kb的DNA片段,扩增片段重组到利用依赖T7RNA聚合酶的高效表达载体pT7－7中,在大肠杆菌中表达出28．9kD的蛋白质。表达的蛋白质具有生物活性。     

核纤层蛋白与细胞增殖

核纤层蛋白与细胞增殖周剑涛（黄冈卫生学校,湖北黄冈４３６１００）关键词核基质核纤层蛋白细胞增殖最近几年,人们逐渐认识到核基质与细胞生物功能的关系,也发现核基质中某些蛋白质与细胞分化和增殖之间有一定联系,为区分正常组织和肿瘤组织中增殖细胞与非增殖细胞提...     

DNA损伤诱导的长链非编码RNA-UCA1促进HeLa细胞增殖

尿路上皮癌抗原1 (UCA1)是一种长链非编码RNA,在多种肿瘤内高表达.然而,其在宫颈癌细胞和组织中的表达报告颇不一致,且功能尚未确定.本文探索UCA1在宫颈癌HeLa细胞中的生物学功能.实时定量PCR（qRT-PCR）结果显示,UCA1、p21和p53 mRNA在阿霉素（doxorubicin,DOX）或γ射线照射的HeLa细胞中表达上调|相反,敲减p53表达则可抑制DOX诱导的UCA1上调.表明DNA损伤诱导的UCA1可能与p53有关.转染结合CCK8检测HeLa细胞增殖活力结果显示,与对照比较,过表达UCA1促进HeLa细胞增殖,干扰UCA1表达则减缓细胞增殖.此外,流式细胞术结果显示,过表达UCA1导致阿霉素诱导的凋亡率下降;siRNA抑制UCA1表达后引起细胞G2/M期比例上升,S期下降,且阿霉素诱导的细胞凋亡率上升.上述结果说明,DNA损伤诱导的UCA1可促进HeLa细胞增殖,减少细胞凋亡.然而,是否DNA损伤诱导的UCA1上调依赖p53尚需进一步实验证明.