ACGA-复旦2005“基因组医学”国际研讨会

为交流“基因组医学”最新的前沿研究成果和探讨“基因组医学”时代的新问题新观点,美国华人遗传学家学会(Association of Chinese Geneticists in America,ACGA)与复旦大学生命科学学院、中国优生优育协会、上海市遗传学会将联合于2005年6月28～30日举办国际基因组医学大会“ACGA International Symposium on Genome Medicine-In honor of Prof．C．C．Tan”。     

哺乳动物的基因组“印记”研究进展

本文综述了哺乳动物的基因组“印记”的最新研究进展。阐述了基因组“印记”的可能机制及一些最新定位的“印记”基因,并论述了基因组“印记”在发育生物学、遗传学和物种进化研究中的生物学意义。 Abstract:This article reviews the recent advance in genome“imprinting”in mammalian.It covers data on mechanisms of gene imprinting,several imprinted genes that were recently identified and the biological significance of genome imprint in development,genetics and Darwinian evolution.     

人类分子遗传学（原书第三版）（Human Molecular Genetics3）（含光盘）

人类基因组计划于2003年发表了人类基因组序列的“完成”版，这是人类科学史上的一个里程碑。根据人类基因组许多新的发现，英国Tom Strachan和Andrew P．Read两位教授对其编著的《人类分子遗传学》第三版进行了全新的修订。     

湖北咸宁地区乙型肝炎病毒基因型的调查

乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)是引起急性和慢性肝炎的最主要的病原[1]。目前根据HBsAg的共同抗原决定簇“α”和两对相互排斥的抗原决定簇将HBV分为ayw1, ayw2, ayw3, ayw4,ayr, adw2, adw2, adw4, adrq 和adrq-9种不同的血清学亚型,1988年Okamoto[2]等根据HBV基因组核苷酸的差异又提出了HBV基因型的概念,并以全基因组核苷酸差异≥8%,定为基因型分型标准。目前从世界不同地区分离的乙型肝炎病毒分离株已被分为A、B、C、D、E、F、G、H等8种不同的基因型[3~5]。包括中国、日本和东南亚在内的亚洲地区主要流行B、C两种基因…     

中英美科学家宣布启动“国际千人基因组计划”

由中国、英国和美国的科学家组成的“国际协作组”，22日在深圳、伦敦和华豆顿同时宣布：国际“千人基因组计划”正式启动。这一宏伟计划将测定选自全世界各地的至少一千个人类个体的全基因组DNA序列，绘制迄今为止最详尽的、最有医学应用价值的人类基因组遗传多态性图谱。     

基于Z曲线的新城疫病毒基因组生物信息分析

Z曲线是DNA序列信息的一种几何学表示形式。利用Z曲线坐标所对应的生物学含义,可以对DNA序列的生物信息进行系统分析。本文对40株自测序和从GenBank下载的新城疫病毒(NDV)全基因组序列,利用网络提供和自开发的Z曲线分析系统,对NDV生物信息进行了比较分析,构建了NDV全基因组的X、Y、Z分量沿序列的分布曲线和三维Z曲线,比较了不同基因型NDV基因组Z曲线的特征。结果显示,在NDV全基因组中A、G碱基或A、C碱基是占优势的,在基因组的前1/3序列中,G、C含量大于A、T的含量。不同基因型NDV全基因组的Z曲线(从ClassI到ClassII的I-VIII型)有向Z轴靠拢的趋势。     

菜豆基因组微卫星DNA的分离与鉴定

从耐高温型菜豆（Ｐｈａｓｅｏｌｕｓ ｖｕｌｇａｒｉｓ Ｌ．）品种“Ｈａｉｂｕｓｈｉ”基因组分离微卫星ＤＮＡ,可以提供与耐热性ＱＴＬ（ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ ｔｒａｉｔ ｌｏｃｕｓ）连锁的多态遗传标记。为此,利用ｌａｍｂｄａ ＺＡＰⅡ载体构建了一个包含４００－８００ｂｐ插入片段的菜豆基因组文库。利用地高辛末端标记寡聚核苷酸（ＧＡ）１０和（ＣＡ）１０作为探针筛选该文库,并对部分阳性克隆进行测序分析,     

An everlasting role of genetics and genomics in public health: a meeting report of ACGA-HKSMG International Conference on Genetic and Genomic Medicine 2008

The Association of Chinese Geneticists in America （ACGA） and the Hong Kong Society of Medical Genetics （HKSMG） held their first joint Conference on Genetic and Genomic Medicine in Hong Kong from June 9-11 in 2008 at the Cheung Kung Hai Conference Center, William MW Mong Block, Li Ka Shing Faculty of Medicine, the University of Hong Kong. Other co-organizers included the University of Hong Kong and Chinese Society of Medical Genetics. A satellite conference ＂ACGA-WZMC International Symposium of Genetics and Translational Medicine＂, co-organized with Wenzhou Medical College and Chinese Society of Medical Genetics, was held from June 12-14, 2008 at Wenzhou, Zhejiang Province of China.     

美国考古学家斯黛娜和库恩应邀访问中国

2008年10月6日,应高星博士的邀请,美国亚利桑那大学著名动物考古学家斯黛娜（Mary C．Stiner）教授和旧石器考古学家库恩（StevenL．Kuhn）教授访问中科院古脊椎所,并分别作了题为“Hunters of the Acheulo—Yabrudian Through Middle Paleolithic in the Eastern Mediterranean Basin”和“The Early Paleolithic of Anatolia”报告。     

第六届全国钙信号和细胞功能研讨会在青岛召开

第六届全国钙信号和细胞功能研讨会“Chinese Symposium on Ca Signaling”（简称CSCS）作为第十次中国生物物理学术大会（htto：／／www．bsc．org．cn／cn／nav2．asp）的“卫星会议”于2006年5月22日青岛召开。原名“全国钙与细胞功能暨细胞信号转导专题学术会议”自1999年在徐州召开第五次会议后因故中断了7年。本次CSCS会议拥有自己独立的征、会议程序和论集。本次CSCS会议由中国生物物理学会、北京大学分子医学研究所（http：／／www．pku．edu．cn）共同主办,北京大学分子医学研究所承办。周专（北京大学）任本次CSCS会议主任,崔宗杰（北京师范大学）任副主任。     

第六届全国钙信号和细胞功能研讨会在青岛召开

第六届全国钙信号和细胞功能研讨会“Chinese Symposium on Ca Signaling”（简称CSCS）作为第十次中国生物物理学术大会（http：／／www．bsc．org．crdcrdnav2．asp）的“卫星会议”于2006年5月22日在青岛召开。原名“全国钙与细胞功能暨细胞信号转导专题学术会议”自1999年在徐州召开第五次会议后,因故中断了7年。本次CSCS会议拥有自己独立的征文、会议程序和论文集。本次CSCS会议由中国生物物理学会、北京大学分子医学研究所（http：／／www．pku．edu．cn）共同主办,北京大学分子医学研究所承办。周专（北京大学）任本次CSCS会议主任,崔宗杰（北京师范大学）任副主任。     

人类基因组上的假基因

假基因是基因组上与编码基因序列非常相似的非功能性基因组DNA拷贝,一般情况都不被转录,且没有明确生理意义。假基因根据其来源可分为复制假基因和已加工假基因。迄今为止,明确鉴定的人类假基因多为已加工假基因,有8000个之多。在Swiss-Prot/TrEMBL收录的编码蛋白质的将近25500个基因序列中,约10％在基因组中有一个或多个近全长已加工假基因。其余的功能基因都没有已加工假基因。核糖体蛋白基因具有最多数量的已加工假基因,约有l700个(占已加工假基因数的22％),少数基因,如cyclophilinA、肌动蛋白(actin)、角蛋白(keratin)、GAPDH、细胞色素C(cytochromec)和nucleophosmin等则有很多份已加工假基因。总体上讲,假基因在人类染色体上的分布与染色体长度成比例,但已加工假基因在GC含量为41％～46％的染色体区域密度最高。已加工假基因的拷贝数和功能基因在生殖器官中的表达高度一致,说明许多假基因发生在胚胎阶段,另外也和基因中GC含量和基因大小密切相关。假基因的准确鉴定对基因组进化、分子医学研究和医学应用具有重要意义。     

生物进化的"溶源菌"关系演变进程

从免疫学角度分析了病毒与噬菌体建立的“溶源菌”关系．提出了生物进化中的“溶源菌”进程观点,对一些生物进化问题做出了新的解释,包括生物在进化历程中如何抵抗疾病危害、保存物种并繁衍后代,寒武纪大爆发,生物进化在一定范围内出现的不连续性,生物间基因组的“C值悖理”及“重复基因序列”的由来等。结合转基因技术的成熟运用,提出了新的生物进化关系式:B=A x．有利于进化理论的深化完善。     

尾状山羊草与硬粒小麦,普通小麦的杂交及外源染色质检测

尾状山羊草（AegilopscaudataL．）具有丰富的抗病虫和高赖氨酸、高蛋白优良性状,是进行小麦（TriticumaestivumL．）遗传改良的重要遗传资源。合成了硬粒小麦（TriticumdurumDesf．）-尾状山羊草双二倍体、进行了普通小麦与双二倍体的杂交。并以作者克隆的尾状山羊草C基因组特异重复序列PAeca212为探针,对上述杂交后代的花粉母细胞进行了染色体原位杂交检测。证实了新合成的双二倍体中有7对C基因组染色体;在F2中检测到C基因组染色体的自发纯合易位,显示出从C基因组向小麦转移外源基因的光明前景。     

丙型肝炎病毒基因分型及core蛋白区的分子演化分析

目前有多种方法对丙型肝炎病毒进行基因分型,但尚无一个“金标准”．为确定丙型肝炎病毒基因分型的最佳区域,从GenBank中筛选出15条对各成熟肽区域有注释,来源于不同国家地区的丙型肝炎病毒全基因组序列,分别对5′UTR区、core区、E1区、E2区及NS5B区建系统进化树．结果发现,以5′UTR区建树基因分型不完全正确,而以core区、E1区、E2区及NS5B区建树,基因分型均完全正确,但同一基因型间的核苷酸演化距离存在差异．计算5条1a型序列的core区、E1区、E2区、NS5B区的核苷酸演化距离并和全基因组序列核苷酸演化距离比较,结果发现,NS5B蛋白区基因分型最能反映病毒株间的演化关系．同时分析各序列的core区的分子演化,为发明针对core区的新的PCR-RFLP基因分型方法提供新思路．     

1%人类基因组DNA元件解译,基因组结构的传统认识受到挑战:变人类基因组“天书”为 “ 百科全书”的重要一步

继“人类基因组计划”后生命科学领域最大的国际合作计划之一——“DNA元件百科全书”计划(Encyclopedia of DNAElements,ENCODE)日前发表了一系列重要文章报告了其示范期完成的1%人类基因组的解码情况.这些成果由来自11个国家的35个小组合作完成,挑战了人们对于人类基因组的传统认识,即人类基因组不是由孤立的基因和大量“无用DNA片段”组成的,基因组本身就是一个复杂的网络系统,有着多层次的精细调控规则.ENCODE计划示范期(1%人类基因组解码)的成果为进一步解译人类基因组这部“天书”开辟了道路,刷新了我们关于基因的概念,成为人类生物学研究史中又一座里程碑.同时,大量的“非编码RNA基因”仍旧是生命科学天空中的“一朵乌云”,其未知的功能尚待探索.     

镰孢属几种植物病原真菌分子核型的研究*

利用脉冲电场凝胶电泳（ｐｕｌｓｅｄ－ｆｉｅｌｄｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ,ＰＦＧＥ）,研究了４株串珠镰孢（Ｆｕｓａｒｉｕｍ　ｍｏｎｉｌｉｆｏｒｍｅ）、１株尖镰孢（F．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、１株茄镰孢（Ｆ．ｓｏｌａｎｉ）和１株Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．的分子核型以及不同地域和寄主来源的串珠镰孢种内菌株间的分子核型差异。以凝胶包埋法（不破除分生孢子细胞壁）制备供试菌株电泳样本,采用３组条件组合进行电泳,分离出供试串珠镰孢完整染色体ＤＮＡ１０～１３条,分子量分布范围０．７Ｍｂ～６．９Ｍｂ,基因组大小为４２．２６Ｍｂ～４７．７５Ｍｂ;尖镰孢８条,分子量分布范围１．２Ｍｂ～６．７Ｍｂ,基因组大小为３２．２５Ｍｂ;茄镰孢６条,分子量分布范围２．４Ｍｂ～６．３Ｍｂ,基因组大小为２５．２Ｍｂ;Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．９条,分子量分布范围０．８Ｍｂ～６．８Ｍｂ,基因组大小为３６．４５Ｍｂ。结果表明,供试４种镰孢菌染色体数目、ＤＮＡ分子量及基因组大小都有较大不同,分子核型差异较大。不同来源的串珠镰孢种内菌株间分子核型亦有明显差异。     

镰孢属几种植物病原真菌分子核型的研究

利用脉冲电场凝胶电泳（ｐｕｌｓｅｄ－ｆｉｅｌｄｇｅｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ,ＰＦＧＥ）,研究了４株串珠镰孢（Ｆｕｓａｒｉｕｍ　ｍｏｎｉｌｉｆｏｒｍｅ）、１株尖镰孢（F．ｏｘｙｓｐｏｒｕｍ）、１株茄镰孢（Ｆ．ｓｏｌａｎｉ）和１株Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．的分子核型以及不同地域和寄主来源的串珠镰孢种内菌株间的分子核型差异。以凝胶包埋法（不破除分生孢子细胞壁）制备供试菌株电泳样本,采用３组条件组合进行电泳,分离出供试串珠镰孢完整染色体ＤＮＡ１０～１３条,分子量分布范围０．７Ｍｂ～６．９Ｍｂ,基因组大小为４２．２６Ｍｂ～４７．７５Ｍｂ;尖镰孢８条,分子量分布范围１．２Ｍｂ～６．７Ｍｂ,基因组大小为３２．２５Ｍｂ;茄镰孢６条,分子量分布范围２．４Ｍｂ～６．３Ｍｂ,基因组大小为２５．２Ｍｂ;Ｆｕｓａｒｉｕｍｓｐ．９条,分子量分布范围０．８Ｍｂ～６．８Ｍｂ,基因组大小为３６．４５Ｍｂ。结果表明,供试４种镰孢菌染色体数目、ＤＮＡ分子量及基因组大小都有较大不同,分子核型差异较大。不同来源的串珠镰孢种内菌株间分子核型亦有明显差异。     

温州医学院生命科学学院

温州医学院生命科学学院实验楼温州医学院生命科学学院下辖生物系、生物医学工程系、海洋科学系,设有细胞与分子医学研究所、微生态学研究所、医学生物信息学研究所、海洋科学研究所等校级研究所,有遗传学、生理学和免疫学三个硕士点,设生物技术、生物科学、生物医学工程、海洋科学四个本科专业。学院拥有一批锐意进取、充满朝气的中青年教学、科研骨干,现有专任教师76人,其中教授12人,副教授16人,博导2人,硕导20人,多人入选浙江省“151”人才工程和享受政府特殊津贴。院长管敏鑫教授担任AmericanJournal of Human Genetics,Human Molecu…     

第二届后基因组高峰会议“基因组时代的医学”

为把握近两年来基因组学研究的最新动态，探讨其在医学和临床实践上的应用，加强中国基因组学家和医学家与国际同行的沟通和交流，在第一届峰会的基础上，中科院北京基因组研究所、中科院心理所行为遗传中心与美国冷泉港实验室特定于2006年5月17-19日举办“第二届后基因组高峰会议——基因组时代的医学”。本次会议着重探讨基因组新技术的前沿进展及其在临床实践和药物研发中的应用。