最优化设计连续的自然保护区

生境破碎是导致生物多样性损失的重要原因之一,避免生境破碎的一个有效方式是建立连续的自然保护区使物种可在保护区内自由移动。不加选择地把大片土地都转为保护区是实现连续的一个途径,但资源是有限的,应当以最优的方式分配。如何最优化设计生态上和经济上都有效的保护区成为生物保护领域一个重要议题。从一组备选地块中选择一部分组成自然保护区,这样的问题主要有两种解法:启发式方法和最优化方法。启发式方法虽然灵活且运算速度快但不能保证最优解因而可能导致稀缺资源的浪费,最优化方法保证得到的解是最优的但建模和运算存在困难。建立一个线性整数规划模型用于设计一个最小的连续保护区,用Dantzig剪切法消除循环确保形成一个连续的树,对应一个连续的保护区,检验了模型的计算效率。结果显示,模型可在合理时间内解决一个包含100个备选地块和30个物种的连续保护区设计问题,计算效率显著优于同类目的的其它方法。以美国伊利诺伊州Cache河流域11种濒危鸟类的保护区设计为例说明了该方法的应用,设计了两种情况下连续的保护区。讨论了模型的局限和数据问题。     

基于序列拓扑和二阶隐马尔可夫模型的跨膜蛋白亚细胞定位预测

现有蛋白质亚细胞定位方法针对水溶性蛋白质而设计,对跨膜蛋白并不适用。而专门的跨膜拓扑预测器,又不是为亚细胞定位而设计的。文章改进了跨膜拓扑预测器TMPHMMLoc的模型结构,设计了一个新的二阶隐马尔可夫模型;采用推广到二阶模型的Baum-Welch算法估计模型参数,并把将各个亚细胞位置建立的模型整合为一个预测器。数据集上测试结果表明,此方法性能显著优于针对可溶性蛋白设计的支持向量机方法和模糊k最邻近方法,也优于TMPHMMLoc中提出的隐马尔可夫模型方法,是一个有效的跨膜蛋白亚细胞定位预测方法。     

用合成的寡脱氧核苷酸作为专一位点诱变剂构建突变型

本文描述产生和分离即使在表型上是沉默的一些特定点突变的一种方法。这种方法是用一个合成的寡脱氧核苷酸(它在给定的位置上与野生型是不同的)作为特定的诱变剂,并在体外把它整合到基因组DNA中。乍看起来,这种方法比其它方法更费劲,因为它需要一个合成的寡脱氧核苷酸。但是,有一种较新的合成方法缩短了取得寡脱氧核     

计算方法在蛋白质相互作用研究中的应用

计算方法在蛋白质相互作用研究的各个阶段扮演了一个重要的角色。对此,作者将从以下几个方面对计算方法在蛋白质相互作用及相互作用网络研究中的应用做一个概述：蛋白质相互作用数据库及其发展;数据挖掘方法在蛋白质相互作用数据收集和整合中的应用;高通量方法实验结果的验证;根据蛋白质相互作用网络预测和推断未知蛋白质的功能;蛋白质相互作用的预测。     

基因治疗将基因缺陷锁定于RNA水平

一个由美国和瑞士人组成的合作研究小组提出了一项可能解决基因治疗中关键性问题的方法：设法锁定引起疾病的单基因突变。该方法与试图导入一个新的、正确的基因或试图改变突变基因本身的作法不同,科学家们找到了一种当信使ＲＮＡ（ｍＲＮＡ）被转录后即将其锁定的方法。...     

分支分类学中和谐性概念与和谐性分析方法

和谐性是分支分类学中的一个基本概念。本文给出一个和谐性的数学定义,称为Kexue和谐性。并在Kexue和谐性的基础上开发出一个新的和谐性分析方法。并对该方法在分支分类研究中的应用进行讨论。     

生物化学反馈反应的研究 Ⅱ.简单系统的热力学特性

如何用不可逆过程热力学的方法来研究一个开放的生物化学反应系统的热力学特性是一个比较困难的问题。这些困难主要在于不可逆过程热力学的方法应用到化学反应上来还有很多限制,例如,热力学流与力的线性要求等等。但是,这类问题对于生物学的研     

糖尿病足的预防和临床护理

近年来随着人们生活水平的提高,糖尿病的患病率也逐年提高,患病者苦不堪言。糖尿病还有一种十分严重的并发症——糖尿病足。糖尿病足也给患者及其家庭带来了巨大的痛苦。本文主要对糖尿病足做了一个简单介绍,并对其预防方法与早期治疗方法做出了一个简介。     

生理科学工作者应切实加强理学素养

生理科学工作者应切实加强理学素养关兵才崔存德（滨州医学院生理学教研室，滨州２５６６０３）一个自然科学工作者的工作水平，除了和科研条件、工作态度等有关外，更重要的是和其思维方法有关。而一个人的思维方法又直接受到其知识结构的影响。作为生理科学工作者，应具...     

拟线性化方法及其在生态学中的应用

本文对于世代重叠的种群相互作用的微分方程模型,采用拟线性化方法进行参数估计。根据Gause对两种酵母种群竞争实验的数据,对一个两种群竞争方程中的六个参数和两个初始条件做了估计。结果很好,而且指出了这种方法估计参数的其它优越性。另外,还对一个在理论生态学上很有意义的具有七个参数的捕食者-猎物系统,用这种方法做了参数估计,说明此方法有着广泛的应用价值。     

渤海对虾( Penaeus orientalis )死亡的估算

本文提供一个估算虾类因交尾雄性个体自然死亡的方法。供参考。     

绿色荧光蛋白的原核表达纯化用于基因工程大实验的设计

目的通过设计基因工程实验为一综合性探究实验,使学生全面掌握并提升基因工程相关实验技能。方法借助于绿色荧光蛋白的原核表达及纯化实验,使学生掌握了基因的克隆与表达、以及蛋白纯化等综合实验性技术方法。结果将以前支离破碎的一个个单个实验环环相扣成为一个整体,最终学生可获得一个肉眼可见的基因工程产物即绿色荧光蛋白。结论通过基因工程实验的改革提高了学生的学习兴趣,得到了良好的学习效果。     

用序列比对设计的茎环结构探针检测金黄色葡萄球菌

基于金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列,采用序列比对设计了一种茎环结构的寡聚核苷酸探针。探针的环序列即为金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列的其中一个片段,同其他菌种的16S rRNA基因序列误配2个以上的核苷酸,因此能高度专一、灵敏的检测金黄色葡萄球菌16S rRNA。根据分子信标技术和酶联免疫分析的原理,评估一个实验方法,即利用能构象转换的、固定化的茎环结构探针酶联检测靶核酸。由于探针的特异性加强,这个检测系统能有效的排除假阳性即不会出现误配一个核苷酸的情况。采用微量浓度测定分析,最低下限可检测出大约4ng的金葡球菌16SrRNA。这种方法的灵敏度比其他常规检测方法高出了至少一个数量级。     

多重检验法在基因芯片研究中鉴定差异表达基因的统计功效

鉴于基因芯片实验的造价,在基因芯片实验设计中,首要考虑的因素是需要多少重复才能检测出一个具有显著差异表达的基因。计算多重检验法要求的重复数（样本大小）或功效可为基因芯片实验设计提供重要的参考。为此,本文基于置换重抽样法构建了一种基因表达噪声混合分布模型。该方法适用各类基因表达数据,即无论是基因表达单噪声源或是多噪声源都可行。应用混合模型和多重检验法并给定统计功效。研究者能在基因芯片实验中获得所需要的最少生物学重复数：或者根据样本大小来确定测定一个显著差异表达的基因所具有的检验功效;或者根据样本大小和统计检验功效,选择最好的统计测验方法。本文以一组在老鼠中与中风有关的3000个基因的基因芯片实验所获得的数据为例,应用该方法拟和后组建了一个单分布模型（即表达单噪声源的分布模型）。根据该模型,我们计算了4种多重检验法在鉴定一个具有表达差异（D）值的基因中所需要的统计功效。结果表明。检测一个小的差异D值,4种多重检验法中B方法的统计功效最低,而BH方法最高。但是,对于鉴定一个具有最大表达差异的基因时,4种方法有相同的鉴定功效。与传统的单个检验法一样,BH方法检测一个小的变化所需要的效率不会随基因数目增加而改变,其他3种多重检验法的检测功效则随基因数目增加而降低。     

广义Lotke-Volterra生态模型的非线性奇摄动近似解

非线性奇摄动问题在国际学术界中是一个重要的研究对象。它涉及到许多学科。在一些生态现象中,原始的研究方法只是采取某些简单观察和统计数据来得到结论。但是它对生态现象的实质的研究达不到效果。近来在国际上提出了研究生态学的动力学方法,即人们首先把它归化为代表它的现象本质的微分方程的模型,然后用数学方法来求解对应的方程,最后研究关于生物和数学理论的动力学方面的规律。目前,非线性摄动问题已经被广泛地研究。许多学者已经研究了一些近似理论。近似求解方法已被发展,包括平均法,边界层法,匹配渐近展开和多尺度法等等。研究非线性广义Lotke-Volterra捕食-被捕食生态模型,一个简单而有效的摄动方法被应用到捕食-被捕食生态模型。提出了捕食-被捕食的一个模型,它是一个微分方程系统,并用小的正参数按幂级数展开未知函数,然后得到关于幂级数的系数的方程,并求出它们的解。于是利用摄动方法得到了原问题解的渐近展开式。得到了它是原模型解是一个好的近似的结论,它是一个解析展开式并且能保持其解析运算。最后,给出了一个对应的例子,它说明得到的解具有很好的精度。     

疟疾的免疫诊断

<正>镜检厚血膜是发现疟疾感染最好的方法,该方法的敏感性通常是每5×10~6个红细胞内有一个疟原虫,一位技术员每天可检查50—60张厚血膜。方法简单,不需要复杂的仪器,是一个令人满意的方法。其最大的不足之处是当有大量标本待检时,需要花费很多时间,并且显微镜诊断的精确性也有限。此外,目前在疟区对氯喹的广泛应用,亦需要有其它的诊断方法。免疫学方法已被广泛应用于各种传染病的实验室诊断。目前已发     

包涵体蛋白复性技术研究进展

本文对原核表达的包涵体蛋白的分离,洗涤,溶解及复性方法做了一个简单的总结。同时就国内外近几年的最新复性方法进行了概述。并分析了各种复性方法的利弊。     

标记辅助导入的原理与应用

标记辅助导入是分子遗传信息应用于动物育种的一个重要方面, 其目的是在标记信息的辅助下将一个品种(供体)中的一个或多个优良基因导入另一个品种(受体), 同时还要尽可能地保持受体群体原有的遗传背景。在标记辅助导入过程中, 标记信息既可用于辅助前景选择, 即对目标基因携带者的选择, 以保证目标基因的正确导入, 也可用于辅助背景选择, 即对受体基因组的选择, 以加快受体遗传背景的恢复。本文介绍了标记辅助导入的原理和基本方法, 综述了目前已提出的不同前景选择和背景选择方法以及消除遗传累赘(与目标基因连锁的不利基因)的方法, 同时列举了标记辅助导入在动物上的一些成功应用。     

堆肥宏基因组柯斯质粒文库的构建和DNA提取技术的改进

堆肥环境中高浓度腐殖酸的存在阻碍了对这个环境中的未培养微生物的宏基因组研究。我们提出了一个确实可行的提取堆肥环境DNA的方法, 这个方法通过使用Sephadex G200＋酸洗PVPP层析柱与电洗脱两步纯化的方法成功地纯化堆肥环境来源的DNA, 用这个DNA成功构建了一个包含约10万个克隆的柯斯质粒文库。从这个文库中筛选到一个新的β-葡萄糖苷酶基因。针对文库低的阳性筛选率问题, 利用分子技术研究了不同的分离速度对提取到的总DNA中真核生物DNA量的影响, 以减少文库中真核生物DNA的污染。     

用纸片影印法检测酵母蔗糖酶

在基因工程克隆技术中,如何建立灵敏的 筛选方法是研究课题中的一个重要组成部分。 采用平皿培养基检测法进行克隆初筛是一种较 为简便的方法。